207 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_3420 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_3420  hypothetical protein  100 
 
 
159 aa  327  4e-89  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.82049  normal  0.0336552 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6838  protein of unknown function UPF0066  69.39 
 
 
151 aa  223  6e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2421  hypothetical protein  58.82 
 
 
163 aa  198  3e-50  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.11336  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0302  hypothetical protein  54.42 
 
 
155 aa  176  8e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4335  putative transcriptional regulator  52.9 
 
 
156 aa  173  9e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.518263  normal  0.598505 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0545  protein of unknown function UPF0066  48.67 
 
 
154 aa  160  7e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3119  hypothetical protein  45.39 
 
 
157 aa  159  2e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.322422  hitchhiker  0.0000104071 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1630  hypothetical protein  46.71 
 
 
157 aa  158  2e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00729863  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2206  hypothetical protein  44.74 
 
 
157 aa  157  4e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.953877  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1550  protein of unknown function UPF0066  48.67 
 
 
153 aa  157  4e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2068  hypothetical protein  43.42 
 
 
157 aa  155  2e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2008  hypothetical protein  44.08 
 
 
157 aa  155  2e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.120607  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2007  hypothetical protein  44.08 
 
 
157 aa  155  2e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2224  hypothetical protein  43.42 
 
 
157 aa  155  2e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2254  hypothetical protein  44.08 
 
 
159 aa  155  3e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0608346  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2336  hypothetical protein  43.42 
 
 
157 aa  155  3e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.23741  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2049  hypothetical protein  42.76 
 
 
157 aa  153  8e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0141829  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2252  hypothetical protein  42.11 
 
 
157 aa  149  2e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.89628e-27 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1303  protein of unknown function UPF0066  44.59 
 
 
155 aa  112  2.0000000000000002e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3133  putative transcriptional regulator  41.89 
 
 
155 aa  104  4e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.267139 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3087  hypothetical protein  39.82 
 
 
160 aa  92  3e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.245386  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0402  hypothetical protein  38.53 
 
 
182 aa  90.5  9e-18  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3384  hypothetical protein  38.94 
 
 
152 aa  89  2e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.208867  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2292  hypothetical protein  40.29 
 
 
265 aa  85.1  3e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1466  hypothetical protein  38.53 
 
 
182 aa  84.7  5e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  hitchhiker  0.00269022  normal  0.108849 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1519  hypothetical protein  38.32 
 
 
182 aa  84.3  6e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.00122931 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1359  hypothetical protein  30.99 
 
 
147 aa  80.5  0.000000000000009  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1328  hypothetical protein  33.33 
 
 
180 aa  80.1  0.00000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00949818  decreased coverage  0.00397758 
 
 
-
 
NC_002936  DET1613  hypothetical protein  33.94 
 
 
147 aa  78.2  0.00000000000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0760  hypothetical protein  42.31 
 
 
150 aa  78.2  0.00000000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0258  hypothetical protein  38.89 
 
 
163 aa  77.8  0.00000000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0464  hypothetical protein  35.77 
 
 
173 aa  76.6  0.0000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1722  hypothetical protein  39.06 
 
 
160 aa  75.5  0.0000000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.579056 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1495  hypothetical protein  35.24 
 
 
147 aa  75.9  0.0000000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.524483  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1275  hypothetical protein  35.81 
 
 
160 aa  74.3  0.0000000000006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.147453 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1388  hypothetical protein  46.24 
 
 
133 aa  74.3  0.0000000000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0108578  hitchhiker  0.00000533919 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2812  hypothetical protein  44.04 
 
 
251 aa  73.9  0.0000000000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2195  hypothetical protein  42.11 
 
 
138 aa  73.2  0.000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000000150123  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0910  protein of unknown function UPF0066  36.7 
 
 
124 aa  71.6  0.000000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  unclonable  0.00000186983  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1700  hypothetical protein  35.33 
 
 
160 aa  71.6  0.000000000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.03303 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0222  hypothetical protein  42 
 
 
240 aa  71.2  0.000000000005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00354115  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4671  hypothetical protein  33.33 
 
 
131 aa  70.9  0.000000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.199008 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0426  hypothetical protein  36.94 
 
 
162 aa  70.5  0.000000000008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.088537  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0796  hypothetical protein  32.58 
 
 
144 aa  69.7  0.00000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4020  hypothetical protein  43.01 
 
 
231 aa  70.1  0.00000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0012325 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1885  hypothetical protein  37.38 
 
 
167 aa  70.1  0.00000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2411  hypothetical protein  40 
 
 
182 aa  69.3  0.00000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.543009  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1186  hypothetical protein  39.78 
 
 
235 aa  68.9  0.00000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.203291 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1277  hypothetical protein  38.83 
 
 
251 aa  69.3  0.00000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.241962  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1908  hypothetical protein  38.64 
 
 
131 aa  69.3  0.00000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.336096  unclonable  0.00000890078 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4759  hypothetical protein  39.18 
 
 
162 aa  68.9  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.637583  normal  0.317582 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4023  hypothetical protein  41.94 
 
 
239 aa  68.6  0.00000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1388  hypothetical protein  43.01 
 
 
230 aa  68.9  0.00000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.767988  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3464  hypothetical protein  37.86 
 
 
153 aa  68.9  0.00000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1705  hypothetical protein  41.94 
 
 
234 aa  68.2  0.00000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.19397 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0270  hypothetical protein  38.71 
 
 
160 aa  67.8  0.00000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.460305  normal  0.715932 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1338  protein of unknown function UPF0066  40.66 
 
 
172 aa  67.8  0.00000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000553044 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20260  hypothetical protein  41.94 
 
 
231 aa  67.4  0.00000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.675197 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2362  regulator protein  40.37 
 
 
237 aa  67  0.0000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3030  protein of unknown function UPF0066  38.37 
 
 
172 aa  66.6  0.0000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000046144  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3550  protein of unknown function UPF0066  41.3 
 
 
153 aa  66.6  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.410233  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2088  hypothetical protein  34.82 
 
 
183 aa  66.2  0.0000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000161748  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1581  hypothetical protein  31.08 
 
 
145 aa  65.9  0.0000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000000329162  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1742  hypothetical protein  41.94 
 
 
231 aa  66.2  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2886  protein of unknown function UPF0066  39.56 
 
 
196 aa  65.9  0.0000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2403  hypothetical protein  42.86 
 
 
153 aa  65.9  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0181895  normal  0.750924 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1333  hypothetical protein  37 
 
 
181 aa  65.9  0.0000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.481113  normal  0.0143479 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1039  hypothetical protein  44.9 
 
 
235 aa  65.9  0.0000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0011739  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2452  hypothetical protein  39 
 
 
163 aa  65.9  0.0000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4227  hypothetical protein  40.86 
 
 
230 aa  66.2  0.0000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.940222 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1968  hypothetical protein  37.25 
 
 
155 aa  65.5  0.0000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00329257  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1189  hypothetical protein  39.78 
 
 
232 aa  65.1  0.0000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.7243  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3346  hypothetical protein  39.18 
 
 
238 aa  64.7  0.0000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00404428  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38460  hypothetical protein  39.78 
 
 
240 aa  65.1  0.0000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1220  hypothetical protein  39.78 
 
 
230 aa  65.1  0.0000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.420343  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0423  hypothetical protein  35.51 
 
 
158 aa  64.7  0.0000000005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.237616  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1087  Sodium-transporting two-sector ATPase  42.55 
 
 
144 aa  64.7  0.0000000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0843  protein of unknown function UPF0066  36.67 
 
 
235 aa  64.7  0.0000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000863698  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00194  hypothetical protein  39.18 
 
 
235 aa  64.3  0.0000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.043388  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3407  protein of unknown function UPF0066  39.18 
 
 
235 aa  64.3  0.0000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000511594  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0202  hypothetical protein  39.18 
 
 
235 aa  64.3  0.0000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000993842  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0189  hypothetical protein  39.18 
 
 
235 aa  64.3  0.0000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0457219  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1092  hypothetical protein  43.88 
 
 
235 aa  64.3  0.0000000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00193  hypothetical protein  39.18 
 
 
235 aa  64.3  0.0000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0320479  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3409  hypothetical protein  43.88 
 
 
235 aa  64.3  0.0000000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0939148  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0199  hypothetical protein  39.18 
 
 
235 aa  64.3  0.0000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0201514  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0207  hypothetical protein  39.18 
 
 
235 aa  64.3  0.0000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.9755  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3317  hypothetical protein  40.91 
 
 
153 aa  64.3  0.0000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.524788  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0597  hypothetical protein  37.17 
 
 
142 aa  63.9  0.0000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.662069  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3241  hypothetical protein  39.18 
 
 
240 aa  64.3  0.0000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.488613  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1424  hypothetical protein  36.79 
 
 
139 aa  64.3  0.0000000007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.817545  normal  0.0319557 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3464  hypothetical protein  39.18 
 
 
235 aa  63.9  0.0000000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0230966  normal  0.865335 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0206  hypothetical protein  39.18 
 
 
235 aa  63.9  0.0000000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0519396  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1424  hypothetical protein  37.14 
 
 
173 aa  63.5  0.000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.292458  normal  0.69662 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0512  hypothetical protein  41.11 
 
 
151 aa  63.5  0.000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.140743  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4617  protein of unknown function UPF0066  40 
 
 
163 aa  63.2  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.521313 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0874  protein of unknown function UPF0066  38.78 
 
 
235 aa  63.2  0.000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0588086  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0337  hypothetical protein  36.08 
 
 
183 aa  63.5  0.000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0758106  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3757  hypothetical protein  43.3 
 
 
235 aa  63.5  0.000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.0000000742092  normal  0.0834525 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0733  hypothetical protein  39.18 
 
 
235 aa  63.5  0.000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0409036  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>