206 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_0867 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_0867  hypothetical protein  100 
 
 		 153 aa  313  5e-85  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4390  hypothetical protein  64.79 
 
 		 176 aa  191  4e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4617  protein of unknown function UPF0066  61.59 
 
 		 163 aa  171  2.9999999999999996e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.521313 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4759  hypothetical protein  60.43 
 
 		 162 aa  168  3e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.637583  normal  0.317582 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6400  protein of unknown function UPF0066  59.29 
 
 		 174 aa  165  2e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3550  protein of unknown function UPF0066  58.7 
 
 		 153 aa  164  4e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.410233  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0563  hypothetical protein  60.56 
 
 		 145 aa  164  4e-40  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0507088  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1424  hypothetical protein  50 
 
 		 173 aa  160  8.000000000000001e-39  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.292458  normal  0.69662 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2481  hypothetical protein  57.25 
 
 		 182 aa  160  8.000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.35717 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3047  hypothetical protein  56.64 
 
 		 153 aa  159  1e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.429967 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3317  hypothetical protein  57.97 
 
 		 153 aa  158  2e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.524788  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2403  hypothetical protein  55.63 
 
 		 153 aa  157  6e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0181895  normal  0.750924 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2452  hypothetical protein  51.45 
 
 		 163 aa  154  4e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5557  protein of unknown function UPF0066  54.55 
 
 		 162 aa  151  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.233079  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5324  hypothetical protein  53.15 
 
 		 162 aa  150  8e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0617685 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0709  hypothetical protein  50 
 
 		 178 aa  149  1e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.045832  normal  0.207854 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0722  protein of unknown function UPF0066  50 
 
 		 168 aa  148  2e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0604494  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0682  protein of unknown function UPF0066  47.89 
 
 		 167 aa  146  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.225791  normal  0.354835 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1984  hypothetical protein  51.43 
 
 		 164 aa  144  4.0000000000000006e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0453  hypothetical protein  49.65 
 
 		 165 aa  141  3e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.276022  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2198  hypothetical protein  51.85 
 
 		 163 aa  126  1.0000000000000001e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0512  hypothetical protein  53.39 
 
 		 151 aa  114  5e-25  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.140743  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0340  hypothetical protein  47.46 
 
 		 145 aa  108  2.0000000000000002e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.634355  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0276  protein of unknown function UPF0066  41.8 
 
 		 145 aa  105  2e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1936  hypothetical protein  41.73 
 
 		 151 aa  103  9e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0760  hypothetical protein  44.92 
 
 		 143 aa  100  5e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000599137  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0736  hypothetical protein  44.92 
 
 		 143 aa  100  5e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000191321  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1135  hypothetical protein  38.14 
 
 		 138 aa  95.9  2e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00122763  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0248  formylmethanofuran dehydrogenase subunit E region  37.5 
 
 		 311 aa  89.4  2e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2088  hypothetical protein  36.73 
 
 		 183 aa  88.6  3e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000161748  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1885  hypothetical protein  40.34 
 
 		 167 aa  87.4  7e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1908  hypothetical protein  41.13 
 
 		 131 aa  85.9  2e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.336096  unclonable  0.00000890078 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3569  hypothetical protein  38.46 
 
 		 332 aa  84.7  4e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0341  protein of unknown function UPF0066  35.59 
 
 		 150 aa  84.7  4e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1333  hypothetical protein  38.66 
 
 		 181 aa  83.2  0.000000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.481113  normal  0.0143479 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0362  protein of unknown function UPF0066  37.6 
 
 		 155 aa  82.8  0.000000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0217  class II aldolase/adducin family protein  40.16 
 
 		 323 aa  81.6  0.000000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.311562  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1087  Sodium-transporting two-sector ATPase  35 
 
 		 144 aa  80.5  0.000000000000007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1047  hypothetical protein  39.68 
 
 		 272 aa  80.9  0.000000000000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2822  heat shock protein DnaJ-like  35.94 
 
 		 233 aa  78.6  0.00000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000736424 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0024  protein of unknown function UPF0066  32.2 
 
 		 135 aa  78.6  0.00000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1965  class II aldolase/adducin family protein  37.78 
 
 		 385 aa  78.2  0.00000000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1968  hypothetical protein  34.75 
 
 		 155 aa  78.2  0.00000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00329257  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0270  hypothetical protein  35.59 
 
 		 160 aa  77.4  0.00000000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.460305  normal  0.715932 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0552  hypothetical protein  36.89 
 
 		 162 aa  77.4  0.00000000000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0796  hypothetical protein  39.36 
 
 		 144 aa  77  0.00000000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0989  protein of unknown function UPF0066  33.05 
 
 		 164 aa  76.3  0.0000000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000019612  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2065  hypothetical protein  40.16 
 
 		 241 aa  75.9  0.0000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.587882  normal  0.151601 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3497  protein of unknown function UPF0066  44.23 
 
 		 271 aa  75.5  0.0000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2475  protein of unknown function UPF0066  32.64 
 
 		 294 aa  74.7  0.0000000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2195  hypothetical protein  37.5 
 
 		 138 aa  73.9  0.0000000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000000150123  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1018  protein of unknown function UPF0066  37.1 
 
 		 171 aa  73.9  0.0000000000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1228  protein of unknown function UPF0066  34.17 
 
 		 161 aa  73.2  0.000000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1562  protein of unknown function UPF0066  35.59 
 
 		 161 aa  73.2  0.000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1889  protein of unknown function UPF0066  35.43 
 
 		 164 aa  72.8  0.000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2292  hypothetical protein  40 
 
 		 265 aa  72.8  0.000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1090  vacuolar H+-transporting two-sector ATPase, F subunit  35.25 
 
 		 141 aa  72.4  0.000000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1330  protein of unknown function UPF0066  32.52 
 
 		 205 aa  72.4  0.000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.143351  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1519  hypothetical protein  40.86 
 
 		 182 aa  72.8  0.000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00122931 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0993  hypothetical protein  37.7 
 
 		 138 aa  70.9  0.000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1184  hypothetical protein  36.7 
 
 		 139 aa  69.7  0.00000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.545015 
 
 
-
 
NC_002936  DET1613  hypothetical protein  43.02 
 
 		 147 aa  68.9  0.00000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4671  hypothetical protein  33.33 
 
 		 131 aa  68.9  0.00000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.199008 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1908  hypothetical protein  40.43 
 
 		 142 aa  68.9  0.00000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.117769  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1584  protein of unknown function UPF0066  37.82 
 
 		 166 aa  68.2  0.00000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.467198  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2324  hypothetical protein  38.89 
 
 		 321 aa  68.2  0.00000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0188345  normal  0.69843 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0337  hypothetical protein  33.9 
 
 		 183 aa  68.2  0.00000000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0758106  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0258  hypothetical protein  39.58 
 
 		 163 aa  68.2  0.00000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3464  hypothetical protein  41.84 
 
 		 153 aa  67.8  0.00000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0470  hypothetical protein  33.59 
 
 		 166 aa  67.8  0.00000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0817214  normal  0.048877 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1186  hypothetical protein  34.13 
 
 		 235 aa  67  0.00000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.203291 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1048  protein of unknown function UPF0066  36.36 
 
 		 140 aa  67  0.00000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.177831  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2646  hypothetical protein  39.67 
 
 		 167 aa  66.6  0.0000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0597  hypothetical protein  35 
 
 		 142 aa  66.6  0.0000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.662069  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0402  hypothetical protein  40.91 
 
 		 182 aa  66.6  0.0000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3030  protein of unknown function UPF0066  35.94 
 
 		 172 aa  66.2  0.0000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000046144  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1220  hypothetical protein  34.13 
 
 		 230 aa  66.6  0.0000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.420343  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1466  hypothetical protein  40.91 
 
 		 182 aa  66.6  0.0000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  hitchhiker  0.00269022  normal  0.108849 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1495  hypothetical protein  43.02 
 
 		 147 aa  66.2  0.0000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.524483  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2472  class II aldolase/adducin family protein  34.43 
 
 		 324 aa  66.2  0.0000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.480175  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1254  hypothetical protein  38.38 
 
 		 162 aa  65.9  0.0000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1359  hypothetical protein  43.02 
 
 		 147 aa  65.9  0.0000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4020  hypothetical protein  34.13 
 
 		 231 aa  65.1  0.0000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0012325 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4227  hypothetical protein  34.13 
 
 		 230 aa  64.7  0.0000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.940222 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2344  protein of unknown function UPF0066  37.8 
 
 		 231 aa  64.7  0.0000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.183412  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0545  protein of unknown function UPF0066  39.56 
 
 		 154 aa  64.3  0.0000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1550  protein of unknown function UPF0066  39.56 
 
 		 153 aa  64.3  0.0000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0464  hypothetical protein  44.19 
 
 		 173 aa  64.3  0.0000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0760  hypothetical protein  37.76 
 
 		 150 aa  63.9  0.0000000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2810  class II aldolase/adducin family protein  34.88 
 
 		 332 aa  63.9  0.0000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0449  hypothetical protein  29.41 
 
 		 127 aa  63.9  0.0000000008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.160137  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1189  hypothetical protein  33.33 
 
 		 232 aa  63.5  0.0000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.7243  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20260  hypothetical protein  35.71 
 
 		 231 aa  63.5  0.0000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.675197 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1820  protein of unknown function UPF0066  37.36 
 
 		 162 aa  63.2  0.000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.958931  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1052  protein of unknown function UPF0066  35.54 
 
 		 140 aa  63.5  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38460  hypothetical protein  34.13 
 
 		 240 aa  62.8  0.000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1424  hypothetical protein  36.17 
 
 		 139 aa  63.5  0.000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.817545  normal  0.0319557 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1581  hypothetical protein  33.58 
 
 		 145 aa  63.2  0.000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000000329162  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0910  protein of unknown function UPF0066  29.52 
 
 		 124 aa  62.4  0.000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  unclonable  0.00000186983  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2238  protein of unknown function UPF0066  35.07 
 
 		 233 aa  62.4  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>