208 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_1550 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013411  GYMC61_1550  protein of unknown function UPF0066  100 
 
 
153 aa  316  7e-86  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0545  protein of unknown function UPF0066  97.39 
 
 
154 aa  308  1e-83  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3119  hypothetical protein  58 
 
 
157 aa  207  5e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.322422  hitchhiker  0.0000104071 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2068  hypothetical protein  58 
 
 
157 aa  206  9e-53  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2224  hypothetical protein  58 
 
 
157 aa  206  9e-53  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2254  hypothetical protein  57.33 
 
 
159 aa  206  1e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0608346  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2206  hypothetical protein  57.33 
 
 
157 aa  206  1e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.953877  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2008  hypothetical protein  57.33 
 
 
157 aa  205  2e-52  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.120607  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2007  hypothetical protein  57.33 
 
 
157 aa  205  2e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2336  hypothetical protein  57.33 
 
 
157 aa  205  2e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.23741  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2049  hypothetical protein  57.33 
 
 
157 aa  204  4e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0141829  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1630  hypothetical protein  58 
 
 
157 aa  198  1.9999999999999998e-50  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00729863  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2252  hypothetical protein  55.33 
 
 
157 aa  197  3.9999999999999996e-50  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.89628e-27 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6838  protein of unknown function UPF0066  50.34 
 
 
151 aa  165  2e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0302  hypothetical protein  48.99 
 
 
155 aa  159  1e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3420  hypothetical protein  48.67 
 
 
159 aa  157  4e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.82049  normal  0.0336552 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1303  protein of unknown function UPF0066  42.76 
 
 
155 aa  135  2e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4335  putative transcriptional regulator  41.33 
 
 
156 aa  130  1.0000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.518263  normal  0.598505 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2421  hypothetical protein  41.06 
 
 
163 aa  129  2.0000000000000002e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.11336  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3133  putative transcriptional regulator  41.45 
 
 
155 aa  127  4.0000000000000003e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.267139 
 
 
-
 
NC_002936  DET1613  hypothetical protein  42.15 
 
 
147 aa  99  2e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3384  hypothetical protein  40.15 
 
 
152 aa  99.4  2e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.208867  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1495  hypothetical protein  37.24 
 
 
147 aa  98.2  4e-20  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.524483  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1466  hypothetical protein  40.32 
 
 
182 aa  97.8  5e-20  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  hitchhiker  0.00269022  normal  0.108849 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0760  hypothetical protein  41.07 
 
 
150 aa  96.7  1e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3087  hypothetical protein  37.33 
 
 
160 aa  96.7  1e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.245386  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1359  hypothetical protein  39.31 
 
 
147 aa  94.7  4e-19  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3464  hypothetical protein  42.24 
 
 
153 aa  92.8  2e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0464  hypothetical protein  40.91 
 
 
173 aa  92.8  2e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0402  hypothetical protein  40.91 
 
 
182 aa  92.4  2e-18  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1519  hypothetical protein  42.74 
 
 
182 aa  92.8  2e-18  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.00122931 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1328  hypothetical protein  31.76 
 
 
180 aa  84.3  6e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00949818  decreased coverage  0.00397758 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1184  hypothetical protein  31.47 
 
 
139 aa  83.6  8e-16  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.545015 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3030  protein of unknown function UPF0066  33.58 
 
 
172 aa  81.6  0.000000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000046144  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1908  hypothetical protein  32.17 
 
 
142 aa  81.6  0.000000000000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.117769  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2411  hypothetical protein  40.38 
 
 
182 aa  80.9  0.000000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.543009  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1424  hypothetical protein  32.62 
 
 
139 aa  80.9  0.000000000000006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.817545  normal  0.0319557 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0796  hypothetical protein  38.06 
 
 
144 aa  80.1  0.000000000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2292  hypothetical protein  35.71 
 
 
265 aa  80.1  0.00000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1186  hypothetical protein  34.07 
 
 
235 aa  79.3  0.00000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.203291 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0512  hypothetical protein  39.82 
 
 
151 aa  77.8  0.00000000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.140743  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0760  hypothetical protein  42.22 
 
 
143 aa  77.8  0.00000000000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000599137  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0736  hypothetical protein  42.22 
 
 
143 aa  77.8  0.00000000000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000191321  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4759  hypothetical protein  38.78 
 
 
162 aa  77  0.00000000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.637583  normal  0.317582 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1333  hypothetical protein  39.6 
 
 
181 aa  75.5  0.0000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.481113  normal  0.0143479 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1338  protein of unknown function UPF0066  36.28 
 
 
172 aa  75.9  0.0000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000553044 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0222  hypothetical protein  37.78 
 
 
240 aa  75.5  0.0000000000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00354115  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4023  hypothetical protein  31.58 
 
 
239 aa  75.1  0.0000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0258  hypothetical protein  44.09 
 
 
163 aa  74.7  0.0000000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1820  protein of unknown function UPF0066  37.04 
 
 
162 aa  74.3  0.0000000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.958931  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1908  hypothetical protein  32.28 
 
 
131 aa  74.3  0.0000000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.336096  unclonable  0.00000890078 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2195  hypothetical protein  42.22 
 
 
138 aa  74.3  0.0000000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000000150123  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0682  protein of unknown function UPF0066  33.91 
 
 
167 aa  73.9  0.0000000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.225791  normal  0.354835 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1388  hypothetical protein  31.58 
 
 
230 aa  73.6  0.0000000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.767988  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1705  hypothetical protein  32.33 
 
 
234 aa  73.9  0.0000000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.19397 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2886  protein of unknown function UPF0066  35.14 
 
 
196 aa  72.8  0.000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0340  hypothetical protein  40.86 
 
 
145 aa  73.2  0.000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.634355  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4227  hypothetical protein  31.85 
 
 
230 aa  72.4  0.000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.940222 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0722  protein of unknown function UPF0066  37 
 
 
168 aa  72.8  0.000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0604494  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0552  hypothetical protein  35.65 
 
 
162 aa  72.4  0.000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1090  vacuolar H+-transporting two-sector ATPase, F subunit  35.11 
 
 
141 aa  72.8  0.000000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4020  hypothetical protein  31.85 
 
 
231 aa  72.4  0.000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0012325 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1277  hypothetical protein  38.35 
 
 
251 aa  71.6  0.000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.241962  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0426  hypothetical protein  33.11 
 
 
162 aa  71.6  0.000000000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.088537  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1275  hypothetical protein  33.87 
 
 
160 aa  71.6  0.000000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.147453 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1189  hypothetical protein  31.11 
 
 
232 aa  71.6  0.000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.7243  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2812  hypothetical protein  34.62 
 
 
251 aa  71.6  0.000000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0453  hypothetical protein  40.91 
 
 
165 aa  71.6  0.000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.276022  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1885  hypothetical protein  34.65 
 
 
167 aa  71.2  0.000000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1388  hypothetical protein  41.76 
 
 
133 aa  71.2  0.000000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0108578  hitchhiker  0.00000533919 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1968  hypothetical protein  39.45 
 
 
155 aa  71.2  0.000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00329257  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0709  hypothetical protein  36 
 
 
178 aa  70.1  0.00000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.045832  normal  0.207854 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1220  hypothetical protein  31.11 
 
 
230 aa  69.7  0.00000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.420343  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0024  protein of unknown function UPF0066  31.82 
 
 
135 aa  69.3  0.00000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1412  hypothetical protein  38.1 
 
 
244 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0670544 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20260  hypothetical protein  27.41 
 
 
231 aa  68.9  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.675197 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00194  hypothetical protein  40.2 
 
 
235 aa  68.2  0.00000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.043388  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3407  protein of unknown function UPF0066  40.2 
 
 
235 aa  68.2  0.00000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000511594  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0910  protein of unknown function UPF0066  32.56 
 
 
124 aa  68.2  0.00000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  unclonable  0.00000186983  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0189  hypothetical protein  40.2 
 
 
235 aa  68.2  0.00000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0457219  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1700  hypothetical protein  36.7 
 
 
160 aa  68.2  0.00000000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.03303 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0199  hypothetical protein  40.2 
 
 
235 aa  68.2  0.00000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0201514  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0207  hypothetical protein  40.2 
 
 
235 aa  68.2  0.00000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.9755  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0874  protein of unknown function UPF0066  39.25 
 
 
235 aa  68.2  0.00000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0588086  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0202  hypothetical protein  40.2 
 
 
235 aa  68.2  0.00000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000993842  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00193  hypothetical protein  40.2 
 
 
235 aa  68.2  0.00000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0320479  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0989  protein of unknown function UPF0066  36.28 
 
 
164 aa  67.8  0.00000000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000019612  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1742  hypothetical protein  36.36 
 
 
231 aa  67.8  0.00000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1254  hypothetical protein  34.19 
 
 
162 aa  67.4  0.00000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0206  hypothetical protein  40.2 
 
 
235 aa  67.8  0.00000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0519396  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0993  hypothetical protein  36.26 
 
 
138 aa  67.4  0.00000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2542  hypothetical protein  37.27 
 
 
265 aa  67.4  0.00000000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00464055  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3757  hypothetical protein  37.25 
 
 
235 aa  67.4  0.00000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.0000000742092  normal  0.0834525 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39681  predicted protein  31.06 
 
 
336 aa  67.4  0.00000000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0134522  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4617  protein of unknown function UPF0066  38.54 
 
 
163 aa  67.4  0.00000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.521313 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1581  hypothetical protein  32.09 
 
 
145 aa  67  0.00000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000000329162  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5557  protein of unknown function UPF0066  33.91 
 
 
162 aa  67  0.00000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.233079  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2088  hypothetical protein  35.09 
 
 
183 aa  67  0.00000000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000161748  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0423  hypothetical protein  34.65 
 
 
158 aa  66.6  0.0000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.237616  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1330  protein of unknown function UPF0066  37.63 
 
 
205 aa  66.2  0.0000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.143351  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>