253 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A2324 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A2324  hypothetical protein  100 
 
 		 321 aa  656    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0188345  normal  0.69843 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2599  protein of unknown function UPF0066  43.66 
 
 		 158 aa  122  9.999999999999999e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000273401  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3831  protein of unknown function UPF0066  42.75 
 
 		 158 aa  117  3e-25  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1254  hypothetical protein  40.15 
 
 		 162 aa  114  3e-24  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0535  hypothetical protein  34.29 
 
 		 160 aa  95.5  1e-18  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.498449 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0388  hypothetical protein  35.25 
 
 		 127 aa  85.9  9e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0449  hypothetical protein  35.25 
 
 		 127 aa  84  0.000000000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.160137  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0270  hypothetical protein  37.31 
 
 		 160 aa  82.4  0.000000000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.460305  normal  0.715932 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3087  hypothetical protein  37.04 
 
 		 160 aa  81.3  0.00000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.245386  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2475  protein of unknown function UPF0066  33.61 
 
 		 294 aa  79.3  0.00000000000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0340  hypothetical protein  42.45 
 
 		 145 aa  79.3  0.00000000000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.634355  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0760  hypothetical protein  37.39 
 
 		 143 aa  79  0.0000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000599137  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0736  hypothetical protein  37.39 
 
 		 143 aa  79  0.0000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000191321  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1562  protein of unknown function UPF0066  37.29 
 
 		 161 aa  79  0.0000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2088  hypothetical protein  32.64 
 
 		 183 aa  78.6  0.0000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000161748  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0989  protein of unknown function UPF0066  35.45 
 
 		 164 aa  78.6  0.0000000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000019612  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3384  hypothetical protein  35.88 
 
 		 152 aa  77.8  0.0000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.208867  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1471  hypothetical protein  33.61 
 
 		 127 aa  78.2  0.0000000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4082  protein of unknown function UPF0066  33.33 
 
 		 166 aa  76.6  0.0000000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0517  hypothetical protein  33.06 
 
 		 127 aa  75.1  0.000000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6838  protein of unknown function UPF0066  33.77 
 
 		 151 aa  74.3  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0512  hypothetical protein  35.65 
 
 		 151 aa  73.9  0.000000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.140743  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0552  hypothetical protein  35.43 
 
 		 162 aa  73.9  0.000000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0709  hypothetical protein  34.13 
 
 		 178 aa  73.6  0.000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.045832  normal  0.207854 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0276  protein of unknown function UPF0066  36.21 
 
 		 145 aa  72  0.00000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2065  hypothetical protein  34.04 
 
 		 241 aa  72  0.00000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.587882  normal  0.151601 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1135  hypothetical protein  35.14 
 
 		 138 aa  72.4  0.00000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00122763  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0337  hypothetical protein  32.64 
 
 		 183 aa  72  0.00000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0758106  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0722  protein of unknown function UPF0066  34.13 
 
 		 168 aa  72.4  0.00000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0604494  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0362  protein of unknown function UPF0066  34.88 
 
 		 155 aa  70.9  0.00000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0341  protein of unknown function UPF0066  33.64 
 
 		 150 aa  70.5  0.00000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0839  hypothetical protein  32.77 
 
 		 123 aa  70.1  0.00000000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.0000606152  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1364  hypothetical protein  29.86 
 
 		 152 aa  70.1  0.00000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.33275  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0248  formylmethanofuran dehydrogenase subunit E region  31.97 
 
 		 311 aa  70.1  0.00000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1936  hypothetical protein  32.19 
 
 		 151 aa  69.7  0.00000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1228  protein of unknown function UPF0066  31.93 
 
 		 161 aa  69.3  0.00000000008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1968  hypothetical protein  33.59 
 
 		 155 aa  69.3  0.00000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00329257  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0402  hypothetical protein  32.28 
 
 		 182 aa  68.6  0.0000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0682  protein of unknown function UPF0066  34.43 
 
 		 167 aa  68.6  0.0000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.225791  normal  0.354835 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0464  hypothetical protein  37.17 
 
 		 173 aa  68.9  0.0000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0653  transcriptional activator ligand binding domain protein  29.41 
 
 		 158 aa  67.8  0.0000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000130359  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2198  hypothetical protein  36.36 
 
 		 163 aa  67.8  0.0000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2798  transcription activator effector binding  30.13 
 
 		 156 aa  67.8  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0867  hypothetical protein  38.89 
 
 		 153 aa  68.2  0.0000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1018  protein of unknown function UPF0066  36.7 
 
 		 171 aa  68.2  0.0000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3133  putative transcriptional regulator  33.12 
 
 		 155 aa  67.4  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.267139 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1889  protein of unknown function UPF0066  36.08 
 
 		 164 aa  67.4  0.0000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1087  Sodium-transporting two-sector ATPase  35.96 
 
 		 144 aa  67.4  0.0000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5557  protein of unknown function UPF0066  32.8 
 
 		 162 aa  67  0.0000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.233079  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1388  hypothetical protein  34.53 
 
 		 133 aa  66.6  0.0000000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0108578  hitchhiker  0.00000533919 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3497  protein of unknown function UPF0066  33.85 
 
 		 271 aa  66.6  0.0000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1047  hypothetical protein  33.09 
 
 		 272 aa  67  0.0000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4617  protein of unknown function UPF0066  32.77 
 
 		 163 aa  66.2  0.0000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.521313 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1275  hypothetical protein  32.19 
 
 		 160 aa  66.6  0.0000000006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.147453 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1303  protein of unknown function UPF0066  31.58 
 
 		 155 aa  66.2  0.0000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1584  protein of unknown function UPF0066  33.9 
 
 		 166 aa  66.2  0.0000000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.467198  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0345  transcription activator effector binding  29.6 
 
 		 156 aa  65.1  0.000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3550  protein of unknown function UPF0066  33.88 
 
 		 153 aa  65.5  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.410233  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2266  protein of unknown function UPF0066  33.61 
 
 		 167 aa  64.7  0.000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.864742  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1519  hypothetical protein  32.03 
 
 		 182 aa  64.3  0.000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00122931 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2483  protein of unknown function UPF0066  33.64 
 
 		 175 aa  64.3  0.000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.279264 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0453  hypothetical protein  29.6 
 
 		 165 aa  64.7  0.000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.276022  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20260  hypothetical protein  32.14 
 
 		 231 aa  64.7  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.675197 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3241  hypothetical protein  34.51 
 
 		 240 aa  65.1  0.000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.488613  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4759  hypothetical protein  35.58 
 
 		 162 aa  63.9  0.000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.637583  normal  0.317582 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1820  protein of unknown function UPF0066  32.84 
 
 		 162 aa  64.3  0.000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.958931  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3569  hypothetical protein  35.51 
 
 		 332 aa  63.5  0.000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1359  hypothetical protein  31.86 
 
 		 147 aa  63.5  0.000000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2841  hypothetical protein  32.67 
 
 		 248 aa  63.5  0.000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1333  hypothetical protein  31.43 
 
 		 181 aa  63.2  0.000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.481113  normal  0.0143479 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5324  hypothetical protein  32.11 
 
 		 162 aa  63.5  0.000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0617685 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4671  hypothetical protein  33.08 
 
 		 131 aa  63.2  0.000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.199008 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0110  protein of unknown function UPF0066  37 
 
 		 228 aa  63.5  0.000000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3560  MerR family transcriptional regulator  26.97 
 
 		 287 aa  63.2  0.000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.453881 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1908  hypothetical protein  35.14 
 
 		 131 aa  62.8  0.000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.336096  unclonable  0.00000890078 
 
 
-
 
NC_002936  DET1613  hypothetical protein  33.03 
 
 		 147 aa  62.4  0.000000009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3702  transcriptional regulator, AraC type  28.1 
 
 		 308 aa  62  0.00000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2292  hypothetical protein  38.53 
 
 		 265 aa  62  0.00000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1885  hypothetical protein  33.96 
 
 		 167 aa  62  0.00000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1722  hypothetical protein  32.62 
 
 		 160 aa  62  0.00000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.579056 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1700  hypothetical protein  29.66 
 
 		 160 aa  62  0.00000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.03303 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3420  hypothetical protein  36.04 
 
 		 159 aa  61.6  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.82049  normal  0.0336552 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0760  hypothetical protein  34.58 
 
 		 150 aa  61.6  0.00000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1440  hypothetical protein  33.64 
 
 		 241 aa  61.2  0.00000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1742  hypothetical protein  31.43 
 
 		 231 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1581  hypothetical protein  33.85 
 
 		 145 aa  61.6  0.00000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000000329162  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0597  hypothetical protein  30 
 
 		 142 aa  61.6  0.00000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.662069  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1347  hypothetical protein  29.63 
 
 		 244 aa  61.6  0.00000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0192591 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1400  hypothetical protein  29.63 
 
 		 244 aa  61.2  0.00000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.381665 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0258  hypothetical protein  32.73 
 
 		 163 aa  61.2  0.00000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1330  protein of unknown function UPF0066  30 
 
 		 205 aa  61.6  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.143351  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1328  hypothetical protein  30.7 
 
 		 180 aa  60.5  0.00000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00949818  decreased coverage  0.00397758 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38460  hypothetical protein  31.16 
 
 		 240 aa  60.8  0.00000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0470  hypothetical protein  35.25 
 
 		 166 aa  60.8  0.00000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0817214  normal  0.048877 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0426  hypothetical protein  32.65 
 
 		 162 aa  60.5  0.00000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.088537  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2589  hypothetical protein  32.73 
 
 		 245 aa  60.8  0.00000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2238  protein of unknown function UPF0066  32 
 
 		 233 aa  60.5  0.00000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2362  regulator protein  29.86 
 
 		 237 aa  60.5  0.00000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1231  transcription activator effector binding  26.28 
 
 		 155 aa  60.5  0.00000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0816033 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0385  transcription activator, effector binding  37.5 
 
 		 286 aa  60.5  0.00000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>