204 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_3133 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_3133  putative transcriptional regulator  100 
 
 		 155 aa  320  4e-87  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.267139 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1303  protein of unknown function UPF0066  80.52 
 
 		 155 aa  269  1e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2206  hypothetical protein  42.76 
 
 		 157 aa  132  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.953877  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3119  hypothetical protein  42.76 
 
 		 157 aa  132  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.322422  hitchhiker  0.0000104071 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2049  hypothetical protein  42.11 
 
 		 157 aa  130  6e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0141829  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2254  hypothetical protein  41.94 
 
 		 159 aa  128  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0608346  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2008  hypothetical protein  42.11 
 
 		 157 aa  129  2.0000000000000002e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.120607  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2007  hypothetical protein  42.11 
 
 		 157 aa  129  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0545  protein of unknown function UPF0066  40.91 
 
 		 154 aa  129  2.0000000000000002e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2336  hypothetical protein  41.45 
 
 		 157 aa  128  3e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.23741  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6838  protein of unknown function UPF0066  44.97 
 
 		 151 aa  128  3e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2068  hypothetical protein  41.45 
 
 		 157 aa  127  4.0000000000000003e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2224  hypothetical protein  41.45 
 
 		 157 aa  127  4.0000000000000003e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1550  protein of unknown function UPF0066  41.45 
 
 		 153 aa  127  5.0000000000000004e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0302  hypothetical protein  44.67 
 
 		 155 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4335  putative transcriptional regulator  44.59 
 
 		 156 aa  125  2.0000000000000002e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.518263  normal  0.598505 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1630  hypothetical protein  38.82 
 
 		 157 aa  121  4e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00729863  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2252  hypothetical protein  40.13 
 
 		 157 aa  121  4e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.89628e-27 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3087  hypothetical protein  38.96 
 
 		 160 aa  105  2e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.245386  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3420  hypothetical protein  41.89 
 
 		 159 aa  104  4e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.82049  normal  0.0336552 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2421  hypothetical protein  39.87 
 
 		 163 aa  97.1  9e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.11336  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3384  hypothetical protein  37.01 
 
 		 152 aa  96.3  1e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.208867  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0760  hypothetical protein  43.27 
 
 		 150 aa  79.3  0.00000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3464  hypothetical protein  43.12 
 
 		 153 aa  78.2  0.00000000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1466  hypothetical protein  36 
 
 		 182 aa  77.4  0.00000000000007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  hitchhiker  0.00269022  normal  0.108849 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0464  hypothetical protein  37.4 
 
 		 173 aa  76.6  0.0000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1722  hypothetical protein  36.18 
 
 		 160 aa  76.6  0.0000000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.579056 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1328  hypothetical protein  27.54 
 
 		 180 aa  75.5  0.0000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00949818  decreased coverage  0.00397758 
 
 
-
 
NC_002936  DET1613  hypothetical protein  33.56 
 
 		 147 aa  73.6  0.0000000000009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1820  protein of unknown function UPF0066  38.19 
 
 		 162 aa  73.2  0.000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.958931  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1018  protein of unknown function UPF0066  30.61 
 
 		 171 aa  72.8  0.000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0337  hypothetical protein  33.33 
 
 		 183 aa  72.8  0.000000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0758106  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2292  hypothetical protein  37.98 
 
 		 265 aa  71.6  0.000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1700  hypothetical protein  34.25 
 
 		 160 aa  72  0.000000000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.03303 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0426  hypothetical protein  37.24 
 
 		 162 aa  70.9  0.000000000007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.088537  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1495  hypothetical protein  33.83 
 
 		 147 aa  69.7  0.00000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.524483  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0796  hypothetical protein  32.56 
 
 		 144 aa  70.1  0.00000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0552  hypothetical protein  35.56 
 
 		 162 aa  69.7  0.00000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1275  hypothetical protein  34.23 
 
 		 160 aa  70.1  0.00000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.147453 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1359  hypothetical protein  35.34 
 
 		 147 aa  70.1  0.00000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4082  protein of unknown function UPF0066  30.92 
 
 		 166 aa  68.9  0.00000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1562  protein of unknown function UPF0066  37.06 
 
 		 161 aa  68.6  0.00000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1519  hypothetical protein  31.3 
 
 		 182 aa  68.2  0.00000000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00122931 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1186  hypothetical protein  33.33 
 
 		 235 aa  67.4  0.00000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.203291 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2324  hypothetical protein  33.12 
 
 		 321 aa  67.4  0.00000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0188345  normal  0.69843 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1338  protein of unknown function UPF0066  29.52 
 
 		 172 aa  66.2  0.0000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000553044 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0270  hypothetical protein  29.33 
 
 		 160 aa  66.6  0.0000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.460305  normal  0.715932 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5557  protein of unknown function UPF0066  37.86 
 
 		 162 aa  66.6  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.233079  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1908  hypothetical protein  32.62 
 
 		 142 aa  66.2  0.0000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.117769  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0535  hypothetical protein  34.93 
 
 		 160 aa  66.6  0.0000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.498449 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0402  hypothetical protein  32.73 
 
 		 182 aa  66.6  0.0000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4759  hypothetical protein  35.94 
 
 		 162 aa  66.6  0.0000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.637583  normal  0.317582 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0423  hypothetical protein  36.79 
 
 		 158 aa  65.5  0.0000000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.237616  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1228  protein of unknown function UPF0066  33.33 
 
 		 161 aa  65.5  0.0000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2646  hypothetical protein  33.09 
 
 		 167 aa  64.7  0.0000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2411  hypothetical protein  29.75 
 
 		 182 aa  64.3  0.0000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.543009  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1184  hypothetical protein  36.8 
 
 		 139 aa  64.7  0.0000000005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.545015 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1581  hypothetical protein  32.31 
 
 		 145 aa  64.3  0.0000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000000329162  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3030  protein of unknown function UPF0066  28.48 
 
 		 172 aa  64.3  0.0000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000046144  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1889  protein of unknown function UPF0066  31.17 
 
 		 164 aa  63.9  0.0000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1742  hypothetical protein  39.47 
 
 		 231 aa  63.9  0.0000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4023  hypothetical protein  35.34 
 
 		 239 aa  63.9  0.0000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3831  protein of unknown function UPF0066  30.67 
 
 		 158 aa  63.5  0.0000000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1936  hypothetical protein  35.64 
 
 		 151 aa  63.5  0.000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02964  hypothetical protein  31.29 
 
 		 239 aa  63.2  0.000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.888246  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20260  hypothetical protein  38.6 
 
 		 231 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.675197 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0760  hypothetical protein  32.64 
 
 		 143 aa  63.5  0.000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000599137  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1424  hypothetical protein  37.5 
 
 		 139 aa  63.2  0.000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.817545  normal  0.0319557 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1705  hypothetical protein  34.31 
 
 		 234 aa  63.5  0.000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.19397 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0736  hypothetical protein  32.64 
 
 		 143 aa  63.5  0.000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000191321  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5324  hypothetical protein  35.92 
 
 		 162 aa  62.4  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0617685 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1388  hypothetical protein  35.34 
 
 		 230 aa  62.8  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.767988  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4227  hypothetical protein  34.11 
 
 		 230 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.940222 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1087  Sodium-transporting two-sector ATPase  36.15 
 
 		 144 aa  62.8  0.000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1220  hypothetical protein  37.5 
 
 		 230 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.420343  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0281  hypothetical protein  32.41 
 
 		 246 aa  62  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.236696 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1189  hypothetical protein  40.91 
 
 		 232 aa  62  0.000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.7243  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0270  hypothetical protein  33.57 
 
 		 246 aa  62  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0768014 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0284  hypothetical protein  32.41 
 
 		 235 aa  61.6  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0219827  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4020  hypothetical protein  36.36 
 
 		 231 aa  62  0.000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0012325 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0512  hypothetical protein  34.53 
 
 		 151 aa  62  0.000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.140743  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0265  hypothetical protein  32.41 
 
 		 246 aa  62  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.391481  normal  0.222677 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0265  hypothetical protein  32.41 
 
 		 246 aa  62  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.485834  normal  0.889458 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38460  hypothetical protein  35.07 
 
 		 240 aa  62  0.000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1090  vacuolar H+-transporting two-sector ATPase, F subunit  34.38 
 
 		 141 aa  61.6  0.000000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1968  hypothetical protein  29.93 
 
 		 155 aa  60.8  0.000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00329257  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3550  protein of unknown function UPF0066  39.77 
 
 		 153 aa  60.8  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.410233  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4617  protein of unknown function UPF0066  38.24 
 
 		 163 aa  60.8  0.000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.521313 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2886  protein of unknown function UPF0066  28.31 
 
 		 196 aa  60.5  0.000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03251  hypothetical protein  37.23 
 
 		 231 aa  59.7  0.00000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0597  hypothetical protein  33.85 
 
 		 142 aa  60.5  0.00000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.662069  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3346  hypothetical protein  39.36 
 
 		 238 aa  59.7  0.00000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00404428  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1254  hypothetical protein  33.76 
 
 		 162 aa  60.1  0.00000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2088  hypothetical protein  31.34 
 
 		 183 aa  59.3  0.00000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000161748  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0682  protein of unknown function UPF0066  34.31 
 
 		 167 aa  58.9  0.00000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.225791  normal  0.354835 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1330  protein of unknown function UPF0066  28.57 
 
 		 205 aa  59.3  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.143351  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3503  protein of unknown function UPF0066  39.36 
 
 		 238 aa  58.9  0.00000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0149186  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_10437  predicted protein  35 
 
 		 142 aa  59.3  0.00000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002726  hypothetical protein  39.13 
 
 		 234 aa  58.9  0.00000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0430932  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39681  predicted protein  28.28 
 
 		 336 aa  58.9  0.00000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0134522  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>