66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_0345 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_0345  transcription activator effector binding  100 
 
 		 156 aa  318  9.999999999999999e-87  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0318  transcription activator effector binding  65.16 
 
 		 157 aa  219  1.9999999999999999e-56  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.289482 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0304  transcription activator, effector binding  49.68 
 
 		 158 aa  166  9e-41  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1364  hypothetical protein  41.01 
 
 		 152 aa  127  6e-29  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.33275  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0593  transcription activator, effector binding  32.21 
 
 		 153 aa  84.3  5e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0754  transcription activator, effector binding  33.09 
 
 		 156 aa  83.6  9e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.287281  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4131  transcriptional activator ligand binding domain protein  31.94 
 
 		 154 aa  82  0.000000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1231  transcription activator effector binding  32.9 
 
 		 155 aa  78.6  0.00000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0816033 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4810  transcription activator effector binding  30.22 
 
 		 274 aa  77.4  0.00000000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.858088  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2087  transcription activator effector binding  28.57 
 
 		 166 aa  76.6  0.0000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000102768 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3506  transcription activator, effector binding  28.77 
 
 		 274 aa  70.1  0.00000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.771694  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2324  hypothetical protein  29.6 
 
 		 321 aa  65.1  0.0000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0188345  normal  0.69843 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2459  transcriptional activator ligand binding domain protein  28.47 
 
 		 550 aa  65.5  0.0000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000187562  normal  0.0403698 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6173  transcriptional activator ligand binding domain protein  25.68 
 
 		 158 aa  65.1  0.0000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0354767  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1132  transcription activator, effector binding  28.23 
 
 		 164 aa  64.3  0.0000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3611  transcriptional regulator, MerR family  28.76 
 
 		 267 aa  62.4  0.000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6884  transcriptional regulator, AraC family  28.37 
 
 		 301 aa  62  0.000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4799  transcriptional regulator, MerR family  30.94 
 
 		 258 aa  62  0.000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3920  transcription activator, effector binding  29.84 
 
 		 161 aa  60.1  0.00000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1206  transcription activator, effector binding  29.51 
 
 		 132 aa  60.5  0.00000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1237  transcription activator, effector binding  27.42 
 
 		 267 aa  57  0.0000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.516302  normal  0.923656 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4913  transcriptional activator ligand binding domain protein  25.33 
 
 		 164 aa  54.3  0.0000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00232908  normal  0.22679 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0225  putative transcriptional regulator, MerR family  35.56 
 
 		 262 aa  53.5  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0684  MerR family transcriptional regulator  29.08 
 
 		 279 aa  52.8  0.000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1851  transcription activator effector binding  27.68 
 
 		 241 aa  52.8  0.000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.493771 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0358  transcription activator, effector binding  25.9 
 
 		 243 aa  52.4  0.000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.923721  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3560  MerR family transcriptional regulator  32.94 
 
 		 287 aa  51.6  0.000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.453881 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0385  transcription activator, effector binding  30.23 
 
 		 286 aa  50.8  0.000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3847  transcriptional activator ligand binding domain protein  27.01 
 
 		 148 aa  50.4  0.000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1653  transcriptional activator ligand binding domain protein  24.4 
 
 		 173 aa  50.1  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0385055  normal  0.0308654 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2056  transcriptional activator ligand binding domain protein  23.2 
 
 		 160 aa  50.1  0.00001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0611899  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3263  transcription activator effector binding  26.81 
 
 		 151 aa  50.1  0.00001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3161  AraC family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 277 aa  49.7  0.00001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2214  transcriptional activator ligand binding domain protein  32.69 
 
 		 210 aa  49.3  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.307481  normal  0.371698 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4179  transcriptional activator ligand binding domain protein  34.72 
 
 		 279 aa  49.3  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.803381 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3571  hypothetical protein  41.38 
 
 		 203 aa  49.3  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0218579  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4616  transcriptional activator ligand binding domain protein  22.76 
 
 		 153 aa  46.6  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.189304 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7295  AraC family transcriptional regulator  30.15 
 
 		 277 aa  46.6  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.158014  normal  0.567517 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2638  transcriptional regulator, MerR family  32.94 
 
 		 273 aa  46.6  0.0001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1727  hypothetical protein  41.82 
 
 		 214 aa  47  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.360385 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0250  transcription activator effector binding  23.61 
 
 		 260 aa  45.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.495724  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3021  transcription activator effector binding  24.39 
 
 		 219 aa  45.8  0.0002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2777  transcription activator, effector binding  25 
 
 		 242 aa  45.4  0.0003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0772774  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0513  transcription activator, effector binding  23.7 
 
 		 268 aa  44.7  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.482512  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6627  transcriptional activator ligand binding domain protein  26.81 
 
 		 164 aa  44.7  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.787104  normal  0.146802 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4914  hypothetical protein  38.18 
 
 		 207 aa  43.1  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.70965  normal  0.145699 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0360  hypothetical protein  42.86 
 
 		 199 aa  43.1  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0771  AraC family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 288 aa  43.5  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.472166 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0505  hypothetical protein  35.48 
 
 		 208 aa  43.5  0.001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.762727 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1848  MerR family transcriptional regulator  38.6 
 
 		 82 aa  43.9  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3492  transcriptional activator ligand binding domain protein  28.74 
 
 		 155 aa  42.4  0.002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4737  hypothetical protein  36.36 
 
 		 204 aa  42.4  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.889648 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0540  transcriptional regulator, AraC family  32.18 
 
 		 289 aa  42.7  0.002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.516999  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4607  transcription activator, effector binding  22.48 
 
 		 156 aa  42.7  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0684789  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2841  transcription activator effector binding  28.57 
 
 		 249 aa  41.6  0.004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.491142  normal  0.203894 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2808  transcriptional regulator, MerR family  24.11 
 
 		 276 aa  42  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.44001  normal  0.316047 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0140  AraC family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 293 aa  41.2  0.005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.877598  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0126  AraC family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 293 aa  41.2  0.005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.436666  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2929  AraC family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 293 aa  41.2  0.005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2263  transcriptional regulator, MerR family  30.68 
 
 		 281 aa  41.2  0.005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2159  MerR family transcriptional regulator  22.58 
 
 		 265 aa  40.8  0.007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3576  transcription activator, effector binding  22.38 
 
 		 242 aa  40.8  0.007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0331  MerR family transcriptional regulator  26.72 
 
 		 281 aa  40.8  0.008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0371  hypothetical protein  23.28 
 
 		 240 aa  40.8  0.008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.548098  normal  0.611025 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2992  transcriptional regulator, MerR family  26.17 
 
 		 282 aa  40.8  0.008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.663692  normal  0.0173107 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2018  putative transcriptional regulator, MerR family  25 
 
 		 286 aa  40.4  0.009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.253438  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>