24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_4131 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013517  Sterm_4131  transcriptional activator ligand binding domain protein  100 
 
 		 154 aa  312  9.999999999999999e-85  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0593  transcription activator, effector binding  51.32 
 
 		 153 aa  171  2.9999999999999996e-42  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1364  hypothetical protein  41.18 
 
 		 152 aa  113  1.0000000000000001e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.33275  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0318  transcription activator effector binding  32.31 
 
 		 157 aa  86.7  1e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.289482 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0304  transcription activator, effector binding  31.25 
 
 		 158 aa  84.7  5e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0345  transcription activator effector binding  31.94 
 
 		 156 aa  82  0.000000000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3506  transcription activator, effector binding  30.77 
 
 		 274 aa  65.1  0.0000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.771694  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4810  transcription activator effector binding  30.77 
 
 		 274 aa  64.7  0.0000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.858088  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2459  transcriptional activator ligand binding domain protein  31.03 
 
 		 550 aa  63.5  0.0000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000187562  normal  0.0403698 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1231  transcription activator effector binding  27.5 
 
 		 155 aa  60.1  0.00000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0816033 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2324  hypothetical protein  27.81 
 
 		 321 aa  58.5  0.00000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0188345  normal  0.69843 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1206  transcription activator, effector binding  26.77 
 
 		 132 aa  57  0.00000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3611  transcriptional regulator, MerR family  28.85 
 
 		 267 aa  54.7  0.0000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2087  transcription activator effector binding  23.49 
 
 		 166 aa  54.3  0.0000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000102768 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2481  transcriptional regulator, MerR family  43.1 
 
 		 269 aa  50.8  0.000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.564945  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6884  transcriptional regulator, AraC family  25.33 
 
 		 301 aa  50.8  0.000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0754  transcription activator, effector binding  22.48 
 
 		 156 aa  48.5  0.00003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.287281  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4913  transcriptional activator ligand binding domain protein  22.69 
 
 		 164 aa  48.5  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00232908  normal  0.22679 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1361  transcriptional regulator, MerR family  26.49 
 
 		 314 aa  47.4  0.00008  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000000180624  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1132  transcription activator, effector binding  28.18 
 
 		 164 aa  47  0.0001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0010  hypothetical protein  33.01 
 
 		 270 aa  45.1  0.0003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4616  transcriptional activator ligand binding domain protein  23.85 
 
 		 153 aa  43.5  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.189304 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3833  MerR family transcriptional regulator  23.44 
 
 		 270 aa  41.6  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000100059  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4099  transcription activator effector binding protein  35.19 
 
 		 276 aa  41.6  0.004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>