More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apre_1361 on replicon NC_013171
Organism: Anaerococcus prevotii DSM 20548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013171  Apre_1361  transcriptional regulator, MerR family  100 
 
 		 314 aa  645    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000000180624  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3611  transcriptional regulator, MerR family  29.97 
 
 		 267 aa  105  7e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1410  MerR family transcriptional regulator  25.68 
 
 		 277 aa  92  1e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1820  MerR family transcriptional regulator  24.91 
 
 		 270 aa  87.4  3e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.404333  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2780  transcriptional regulator, MerR family  23.34 
 
 		 269 aa  86.7  4e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000880145 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0247  MerR family transcriptional regulator  23.15 
 
 		 287 aa  86.7  4e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2317  MerR family transcriptional regulator  23.61 
 
 		 269 aa  86.7  5e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0566035  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2545  transcriptional regulator, MerR family  23.69 
 
 		 269 aa  85.9  8e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2354  MerR family transcriptional regulator  23.26 
 
 		 269 aa  83.2  0.000000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000403249  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2588  transcriptional regulator, MerR family  23.26 
 
 		 269 aa  83.2  0.000000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.40806e-18 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2638  transcriptional regulator, MerR family  25.95 
 
 		 273 aa  83.2  0.000000000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0098  MerR family transcriptional regulator  27.72 
 
 		 279 aa  82.4  0.000000000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000252188  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1731  MerR family transcriptional regulator  25.32 
 
 		 276 aa  80.9  0.00000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.867101  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2401  MerR family transcriptional regulator  23.61 
 
 		 269 aa  81.3  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.908212  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0331  MerR family transcriptional regulator  28.29 
 
 		 281 aa  81.3  0.00000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2576  MerR family transcriptional regulator  23.61 
 
 		 269 aa  81.3  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.473387  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2598  transcriptional regulator, MerR family  25.44 
 
 		 271 aa  80.9  0.00000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000630559  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3667  transcriptional regulator, MerR family  25.65 
 
 		 276 aa  80.9  0.00000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.372345  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1641  MerR family transcriptional regulator  25.65 
 
 		 276 aa  79.7  0.00000000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1782  transcriptional regulator, MerR family  24.76 
 
 		 276 aa  79.7  0.00000000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.381283  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1485  MerR family transcriptional regulator  25.32 
 
 		 276 aa  79.3  0.00000000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0543962  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1527  MerR family transcriptional regulator  25 
 
 		 276 aa  79.7  0.00000000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1677  transcriptional regulator, MerR family  25.41 
 
 		 276 aa  79.3  0.00000000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.128581  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2630  transcriptional regulator, MerR family  22.95 
 
 		 269 aa  79  0.00000000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00281071  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3825  transcriptional activator ligand binding domain protein  24.25 
 
 		 280 aa  79  0.00000000000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1523  MerR family transcriptional regulator  24.68 
 
 		 276 aa  78.6  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.193632  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1708  transcriptional regulator, MerR family  25.32 
 
 		 276 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3291  MerR family transcriptional regulator  22.15 
 
 		 289 aa  77  0.0000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1495  MerR family transcriptional regulator  25.64 
 
 		 276 aa  76.6  0.0000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00542237  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2895  transcriptional regulator, MerR family  26.12 
 
 		 269 aa  76.6  0.0000000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3830  transcriptional regulator, MerR family  27.68 
 
 		 274 aa  75.9  0.0000000000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3560  MerR family transcriptional regulator  23.08 
 
 		 287 aa  74.7  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.453881 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0385  transcription activator, effector binding  23.99 
 
 		 286 aa  74.7  0.000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1609  MerR family transcriptional regulator  22.6 
 
 		 272 aa  74.3  0.000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.822901  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3205  MerR family transcriptional regulator  25 
 
 		 273 aa  73.2  0.000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.208736  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2529  transcriptional regulator, MerR family  23.43 
 
 		 270 aa  72.8  0.000000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3507  MerR family transcriptional regulator  22.58 
 
 		 292 aa  72.8  0.000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.401792  normal  0.0867153 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0684  MerR family transcriptional regulator  20.88 
 
 		 279 aa  72  0.00000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2735  putative transcriptional regulator, MerR family  21.99 
 
 		 264 aa  71.6  0.00000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0721242  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1701  MerR family transcriptional regulator  36.56 
 
 		 280 aa  70.1  0.00000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.126124  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6982  MerR family transcriptional regulator  22.34 
 
 		 270 aa  69.7  0.00000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.80949  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3623  MerR family transcriptional regulator  25.17 
 
 		 274 aa  68.6  0.0000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0243323  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0373  transcriptional regulator, MerR family  33.09 
 
 		 158 aa  68.2  0.0000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2159  MerR family transcriptional regulator  23.75 
 
 		 265 aa  67.8  0.0000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0543  transcriptional regulator, MerR family  33.09 
 
 		 158 aa  68.2  0.0000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.166066  hitchhiker  0.000000593111 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3506  transcription activator, effector binding  22.07 
 
 		 274 aa  68.2  0.0000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.771694  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3493  transcriptional regulator, MerR family  22.65 
 
 		 273 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2144  transcriptional regulator, MerR family  24.57 
 
 		 272 aa  67  0.0000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5047  MerR family transcriptional regulator  22.38 
 
 		 276 aa  66.2  0.0000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.574995  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4099  transcription activator effector binding protein  22.8 
 
 		 276 aa  65.9  0.0000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0323  transcription regulator family  44.29 
 
 		 253 aa  65.9  0.0000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3503  transcriptional regulator, putative  21.69 
 
 		 273 aa  65.5  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.590051  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2018  putative transcriptional regulator, MerR family  21.95 
 
 		 286 aa  65.5  0.000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.253438  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4810  transcription activator effector binding  21.19 
 
 		 274 aa  63.5  0.000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.858088  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4799  transcriptional regulator, MerR family  21.2 
 
 		 258 aa  63.2  0.000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1352  transcriptional regulator, MerR family  19.45 
 
 		 288 aa  63.2  0.000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0877122  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1595  putative heavy metal regulator HmrR  34.95 
 
 		 137 aa  62.4  0.000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5012  MerR family transcriptional regulator  32.63 
 
 		 289 aa  62.8  0.000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.147011  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1866  transcriptional regulator  33.65 
 
 		 247 aa  62.8  0.000000008  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000190425  hitchhiker  0.000000000849298 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2992  transcriptional regulator, MerR family  35.87 
 
 		 282 aa  62.4  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.663692  normal  0.0173107 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1458  MerR family transcriptional regulator  39.51 
 
 		 161 aa  61.2  0.00000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0168574  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4916  multidrug-efflux transporter 1 regulator  46.03 
 
 		 64 aa  61.2  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1146  transcriptional regulator, MerR family  32 
 
 		 267 aa  60.8  0.00000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0993  MerR family transcriptional regulator  32 
 
 		 267 aa  60.8  0.00000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0978  MerR family transcriptional regulator  32 
 
 		 267 aa  60.5  0.00000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00933333  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0980  MerR family transcriptional regulator  32 
 
 		 267 aa  60.8  0.00000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.812542  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1063  MerR family transcriptional regulator  32 
 
 		 267 aa  60.8  0.00000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1083  transcriptional regulator, MerR family  27.18 
 
 		 254 aa  60.8  0.00000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0124198  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0932  MerR family transcriptional regulator  31.18 
 
 		 290 aa  60.8  0.00000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64500  putative transcriptional regulator  38.46 
 
 		 270 aa  60.5  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3346  transcriptional regulator, MerR family  41.67 
 
 		 252 aa  60.1  0.00000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00536383  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0760  MerR family transcriptional regulator  37.8 
 
 		 267 aa  60.1  0.00000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0248072  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3108  MerR family transcriptional regulator  46.03 
 
 		 154 aa  60.1  0.00000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.798682  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1150  transcriptional regulator, MerR family  37.14 
 
 		 135 aa  59.7  0.00000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00496019 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0535  transcriptional regulator, MerR family  38.78 
 
 		 254 aa  59.7  0.00000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.438553  normal  0.258616 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1079  TipAS antibiotic-recognition domain-containing protein  32.08 
 
 		 252 aa  59.7  0.00000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.23199 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0226  transcriptional regulator, MerR family  37.08 
 
 		 276 aa  59.3  0.00000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000814651  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7229  putative transcriptional regulator, MerR family  28.07 
 
 		 272 aa  59.3  0.00000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.385629 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3393  transcriptional regulator, MerR family  35.87 
 
 		 254 aa  59.3  0.00000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.988274  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3184  transcriptional regulator, MerR family  36.49 
 
 		 142 aa  59.3  0.00000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0445  MerR family transcriptional regulator  37 
 
 		 261 aa  59.3  0.00000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0194713  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3585  MerR family transcriptional regulator  40.3 
 
 		 152 aa  59.3  0.00000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00229473 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2898  transcriptional regulator, MerR family  30.11 
 
 		 282 aa  59.3  0.00000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3239  transcriptional regulator, MerR family  36.71 
 
 		 156 aa  59.3  0.00000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000227315  hitchhiker  0.000316604 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4039  MerR family transcriptional regulator  42.03 
 
 		 130 aa  59.3  0.00000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.576602  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2333  MerR family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 162 aa  59.3  0.00000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00701798  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1915  MerR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 136 aa  58.9  0.0000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4442  putative transcriptional regulator, MerR family  33.96 
 
 		 253 aa  58.5  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00264375  hitchhiker  0.000476994 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03030  predicted transcriptional regulator  21.09 
 
 		 276 aa  58.9  0.0000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0455  MerR family transcriptional regulator  37 
 
 		 261 aa  58.5  0.0000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00278493  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3680  transcriptional regulator, MerR family  33.01 
 
 		 133 aa  58.9  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.446637  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2528  transcriptional regulator, MerR family  23.24 
 
 		 293 aa  58.5  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4898  MerR family transcriptional regulator  31.63 
 
 		 147 aa  57.8  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.627224  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0969  MerR family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 252 aa  57.8  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00256708  hitchhiker  0.0060004 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3790  MerR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 132 aa  58.2  0.0000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0361759  normal  0.548118 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0913  transcriptional regulator, MerR family  31.31 
 
 		 260 aa  57.8  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.251711  normal  0.260144 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3133  MerR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 139 aa  58.2  0.0000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.845727  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0178  MerR family transcriptional regulator  31.86 
 
 		 142 aa  58.2  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0926305  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4066  MerR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 132 aa  58.2  0.0000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3833  MerR family transcriptional regulator  24.19 
 
 		 270 aa  57.8  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000100059  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>