More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_3291 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_3291  MerR family transcriptional regulator  100 
 
 		 289 aa  604  9.999999999999999e-173  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1352  transcriptional regulator, MerR family  52.94 
 
 		 288 aa  309  5e-83  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0877122  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1410  MerR family transcriptional regulator  48.21 
 
 		 277 aa  276  2e-73  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3611  transcriptional regulator, MerR family  28.67 
 
 		 267 aa  92.8  7e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1609  MerR family transcriptional regulator  25.69 
 
 		 272 aa  89.4  6e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.822901  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1495  MerR family transcriptional regulator  27.18 
 
 		 276 aa  79.7  0.00000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00542237  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1641  MerR family transcriptional regulator  27.18 
 
 		 276 aa  79.3  0.00000000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1708  transcriptional regulator, MerR family  27.18 
 
 		 276 aa  79.3  0.00000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1523  MerR family transcriptional regulator  27.18 
 
 		 276 aa  79  0.00000000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.193632  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1485  MerR family transcriptional regulator  26.96 
 
 		 276 aa  78.6  0.0000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0543962  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0331  MerR family transcriptional regulator  28.96 
 
 		 281 aa  77.8  0.0000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2144  transcriptional regulator, MerR family  23.72 
 
 		 272 aa  77.8  0.0000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0010  hypothetical protein  24.37 
 
 		 270 aa  77.8  0.0000000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1782  transcriptional regulator, MerR family  26.6 
 
 		 276 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.381283  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4099  transcription activator effector binding protein  22.81 
 
 		 276 aa  73.6  0.000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1731  MerR family transcriptional regulator  26.95 
 
 		 276 aa  71.6  0.00000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.867101  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3667  transcriptional regulator, MerR family  26.6 
 
 		 276 aa  70.1  0.00000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.372345  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1677  transcriptional regulator, MerR family  26.13 
 
 		 276 aa  69.7  0.00000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.128581  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1527  MerR family transcriptional regulator  26.48 
 
 		 276 aa  69.7  0.00000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1361  transcriptional regulator, MerR family  22.15 
 
 		 314 aa  68.6  0.0000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000000180624  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3623  MerR family transcriptional regulator  21.98 
 
 		 274 aa  67.8  0.0000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0243323  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0684  MerR family transcriptional regulator  25.09 
 
 		 279 aa  66.6  0.0000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4799  transcriptional regulator, MerR family  24.28 
 
 		 258 aa  65.5  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0323  transcription regulator family  31.31 
 
 		 253 aa  64.3  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0838  MerR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 145 aa  64.7  0.000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0225  putative transcriptional regulator, MerR family  22.26 
 
 		 262 aa  62.8  0.000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3103  MerR family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 145 aa  62.4  0.000000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0869  MerR family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 145 aa  62.4  0.000000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1151  MerR family transcriptional regulator  28.03 
 
 		 133 aa  60.5  0.00000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.100669  hitchhiker  0.000000311334 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2317  MerR family transcriptional regulator  22.43 
 
 		 269 aa  60.5  0.00000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0566035  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2797  MerR family transcriptional regulator  29.92 
 
 		 255 aa  60.8  0.00000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3825  transcriptional activator ligand binding domain protein  21.5 
 
 		 280 aa  60.1  0.00000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0080  transcriptional regulator, MerR family  37.88 
 
 		 137 aa  59.7  0.00000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.671013 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2638  transcriptional regulator, MerR family  35 
 
 		 273 aa  60.1  0.00000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1866  transcriptional regulator  33.33 
 
 		 247 aa  60.1  0.00000005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000190425  hitchhiker  0.000000000849298 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00438  DNA-binding transcriptional activator of copper-responsive regulon genes  31.37 
 
 		 135 aa  58.2  0.0000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3123  transcriptional regulator, MerR family  31.37 
 
 		 135 aa  58.2  0.0000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.856714  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2780  transcriptional regulator, MerR family  21.32 
 
 		 269 aa  58.5  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000880145 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3106  regulator of pmrA, putative  29.13 
 
 		 257 aa  58.5  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0273598  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00443  hypothetical protein  31.37 
 
 		 135 aa  58.2  0.0000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0586  DNA-binding transcriptional regulator CueR  31.37 
 
 		 135 aa  58.5  0.0000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.775911 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3129  DNA-binding transcriptional regulator CueR  31.37 
 
 		 135 aa  58.2  0.0000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.943376  hitchhiker  0.0000753695 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0530  DNA-binding transcriptional regulator CueR  31.37 
 
 		 135 aa  58.5  0.0000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0422  DNA-binding transcriptional regulator CueR  31.37 
 
 		 135 aa  58.2  0.0000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0566  DNA-binding transcriptional regulator CueR  31.37 
 
 		 135 aa  58.2  0.0000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2545  transcriptional regulator, MerR family  22.55 
 
 		 269 aa  58.5  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02170  predicted transcriptional regulator  36.92 
 
 		 133 aa  58.5  0.0000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0526  DNA-binding transcriptional regulator CueR  31.37 
 
 		 135 aa  58.2  0.0000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2401  MerR family transcriptional regulator  21.69 
 
 		 269 aa  57.8  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.908212  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1701  MerR family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 280 aa  57.8  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.126124  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2576  MerR family transcriptional regulator  21.69 
 
 		 269 aa  57.8  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.473387  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0098  MerR family transcriptional regulator  23.4 
 
 		 279 aa  57.8  0.0000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000252188  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001159  transcriptional regulator  26.92 
 
 		 145 aa  57.8  0.0000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3105  transcriptional regulator, MerR family  29.51 
 
 		 255 aa  57.4  0.0000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0154295  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3210  MerR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 136 aa  57.4  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.303617  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0705  transcriptional regulator, MerR family  26.44 
 
 		 278 aa  57.4  0.0000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1079  TipAS antibiotic-recognition domain-containing protein  27.37 
 
 		 252 aa  57  0.0000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.23199 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2773  MerR family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 132 aa  57  0.0000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5047  MerR family transcriptional regulator  23.74 
 
 		 276 aa  57.4  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.574995  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3050  transcriptional regulator, MerR family protein  22.84 
 
 		 273 aa  56.6  0.0000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1458  MerR family transcriptional regulator  31.86 
 
 		 161 aa  57  0.0000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0168574  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0895  MerR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 125 aa  56.6  0.0000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0760  MerR family transcriptional regulator  35.64 
 
 		 267 aa  57  0.0000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0248072  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0912  MerR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 125 aa  56.6  0.0000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0385  transcription activator, effector binding  24.23 
 
 		 286 aa  57  0.0000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0901  MerR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 125 aa  56.6  0.0000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0327374 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2841  zinc-responsive transcriptional regulator  31.25 
 
 		 139 aa  56.6  0.0000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0481985  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2354  MerR family transcriptional regulator  22.06 
 
 		 269 aa  56.6  0.0000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000403249  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2588  transcriptional regulator, MerR family  22.06 
 
 		 269 aa  56.6  0.0000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.40806e-18 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1411  hypothetical protein  29.11 
 
 		 250 aa  56.6  0.0000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1781  transcriptional regulator, MerR family  30.53 
 
 		 254 aa  56.6  0.0000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5359  transcriptional regulator, MerR family  32.97 
 
 		 142 aa  56.6  0.0000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4498  MerR family transcriptional regulator  33.96 
 
 		 129 aa  56.6  0.0000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.119505  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0608  zinc-responsive transcriptional regulator  30.19 
 
 		 144 aa  56.2  0.0000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000357731  normal  0.723537 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7266  transcriptional regulator, MerR family  28.35 
 
 		 274 aa  55.8  0.0000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1582  hypothetical protein  29.11 
 
 		 249 aa  56.2  0.0000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0310  zinc-responsive transcriptional regulator  30.19 
 
 		 141 aa  56.2  0.0000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.44406  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2824  transcriptional regulator, MerR family  24.39 
 
 		 251 aa  55.8  0.0000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00132895  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3506  transcription activator, effector binding  21.48 
 
 		 274 aa  56.2  0.0000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.771694  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3888  zinc-responsive transcriptional regulator  30.19 
 
 		 141 aa  56.2  0.0000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00039361  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2018  putative transcriptional regulator, MerR family  20.35 
 
 		 286 aa  55.1  0.000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.253438  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0384  transcriptional regulator, MerR family  28.24 
 
 		 258 aa  55.1  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0450143  decreased coverage  0.00634425 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0373  transcriptional regulator, MerR family  26.19 
 
 		 158 aa  55.1  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0543  transcriptional regulator, MerR family  26.19 
 
 		 158 aa  55.1  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.166066  hitchhiker  0.000000593111 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2331  MerR family transcriptional regulator  28.71 
 
 		 153 aa  55.1  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.324696 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0079  transcriptional regulator  36.84 
 
 		 120 aa  55.1  0.000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4916  multidrug-efflux transporter 1 regulator  39.34 
 
 		 64 aa  55.1  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1160  MerR family transcriptional regulator  34.85 
 
 		 133 aa  55.5  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.392851 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2788  MerR family transcriptional regulator  22.9 
 
 		 127 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.291885  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3237  MerR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 171 aa  54.7  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.839111  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3218  transcriptional regulator, MerR family  28 
 
 		 138 aa  54.7  0.000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2780  MerR family transcriptional regulator  36.92 
 
 		 144 aa  55.1  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.891963  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7229  putative transcriptional regulator, MerR family  23.69 
 
 		 272 aa  54.7  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.385629 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2967  MerR family transcriptional regulator  22.9 
 
 		 127 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0548  DNA-binding transcriptional regulator CueR  28.16 
 
 		 138 aa  55.1  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3830  transcriptional regulator, MerR family  22.83 
 
 		 274 aa  54.7  0.000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1570  transcriptional regulator  37.14 
 
 		 144 aa  54.7  0.000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2895  transcriptional regulator, MerR family  22.76 
 
 		 269 aa  54.3  0.000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0969  MerR family transcriptional regulator  29.11 
 
 		 252 aa  54.7  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00256708  hitchhiker  0.0060004 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3219  MerR family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 147 aa  53.9  0.000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.199693  normal  0.39103 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>