More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_2144 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_2144  transcriptional regulator, MerR family  100 
 
 		 272 aa  553  1e-156  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3667  transcriptional regulator, MerR family  30.4 
 
 		 276 aa  157  2e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.372345  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1485  MerR family transcriptional regulator  29.3 
 
 		 276 aa  155  5.0000000000000005e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0543962  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1527  MerR family transcriptional regulator  29.67 
 
 		 276 aa  155  6e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1731  MerR family transcriptional regulator  29.67 
 
 		 276 aa  155  7e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.867101  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1677  transcriptional regulator, MerR family  30.04 
 
 		 276 aa  155  8e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.128581  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1495  MerR family transcriptional regulator  29.3 
 
 		 276 aa  154  1e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00542237  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1708  transcriptional regulator, MerR family  28.94 
 
 		 276 aa  154  1e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1782  transcriptional regulator, MerR family  29.67 
 
 		 276 aa  154  1e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.381283  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1641  MerR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 276 aa  152  5e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1523  MerR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 276 aa  152  5.9999999999999996e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.193632  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1609  MerR family transcriptional regulator  28.62 
 
 		 272 aa  125  6e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.822901  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0098  MerR family transcriptional regulator  30.57 
 
 		 279 aa  112  4.0000000000000004e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000252188  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4099  transcription activator effector binding protein  27.74 
 
 		 276 aa  97.8  1e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0455  MerR family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 261 aa  95.9  6e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00278493  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0331  MerR family transcriptional regulator  25.69 
 
 		 281 aa  93.2  4e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0445  MerR family transcriptional regulator  30.27 
 
 		 261 aa  93.2  4e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0194713  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3623  MerR family transcriptional regulator  26.12 
 
 		 274 aa  91.3  1e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0243323  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1820  MerR family transcriptional regulator  24.26 
 
 		 270 aa  91.7  1e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.404333  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2545  transcriptional regulator, MerR family  23.62 
 
 		 269 aa  91.7  1e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0705  transcriptional regulator, MerR family  24.64 
 
 		 278 aa  90.9  2e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2780  transcriptional regulator, MerR family  23.62 
 
 		 269 aa  90.9  2e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000880145 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3611  transcriptional regulator, MerR family  24.64 
 
 		 267 aa  88.2  1e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5047  MerR family transcriptional regulator  24.72 
 
 		 276 aa  88.6  1e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.574995  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2401  MerR family transcriptional regulator  26.03 
 
 		 269 aa  86.7  4e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.908212  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2576  MerR family transcriptional regulator  26.03 
 
 		 269 aa  86.7  4e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.473387  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4163  transcriptional regulator, MerR family  25.54 
 
 		 275 aa  86.3  5e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0225  putative transcriptional regulator, MerR family  24.45 
 
 		 262 aa  85.5  8e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2018  putative transcriptional regulator, MerR family  26.33 
 
 		 286 aa  85.5  8e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.253438  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2735  putative transcriptional regulator, MerR family  24.72 
 
 		 264 aa  84.7  0.000000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0721242  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2317  MerR family transcriptional regulator  26.76 
 
 		 269 aa  85.1  0.000000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0566035  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2630  transcriptional regulator, MerR family  23.25 
 
 		 269 aa  83.6  0.000000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00281071  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2354  MerR family transcriptional regulator  25.96 
 
 		 269 aa  83.2  0.000000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000403249  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2588  transcriptional regulator, MerR family  25.96 
 
 		 269 aa  83.2  0.000000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.40806e-18 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4044  transcriptional regulator, MerR family  26.77 
 
 		 271 aa  82.4  0.000000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0218982 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4810  transcription activator effector binding  25.26 
 
 		 274 aa  82  0.00000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.858088  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4799  transcriptional regulator, MerR family  26.47 
 
 		 258 aa  82  0.00000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7229  putative transcriptional regulator, MerR family  25.9 
 
 		 272 aa  80.1  0.00000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.385629 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2529  transcriptional regulator, MerR family  24.91 
 
 		 270 aa  79.3  0.00000000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0247  MerR family transcriptional regulator  28.08 
 
 		 287 aa  79.3  0.00000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0760  MerR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 267 aa  79.3  0.00000000000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0248072  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3205  MerR family transcriptional regulator  25.6 
 
 		 273 aa  79  0.00000000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.208736  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1701  MerR family transcriptional regulator  28.42 
 
 		 280 aa  78.2  0.0000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.126124  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6982  MerR family transcriptional regulator  25.98 
 
 		 270 aa  78.2  0.0000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.80949  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0978  MerR family transcriptional regulator  25.74 
 
 		 267 aa  77.8  0.0000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00933333  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3291  MerR family transcriptional regulator  23.72 
 
 		 289 aa  77.8  0.0000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3506  transcription activator, effector binding  24.15 
 
 		 274 aa  77.4  0.0000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.771694  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1146  transcriptional regulator, MerR family  24.44 
 
 		 267 aa  77.4  0.0000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3507  MerR family transcriptional regulator  23.7 
 
 		 292 aa  77.8  0.0000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.401792  normal  0.0867153 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0993  MerR family transcriptional regulator  24.72 
 
 		 267 aa  77  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2895  transcriptional regulator, MerR family  26.46 
 
 		 269 aa  77  0.0000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1063  MerR family transcriptional regulator  24.72 
 
 		 267 aa  77  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3493  transcriptional regulator, MerR family  24 
 
 		 273 aa  76.6  0.0000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0980  MerR family transcriptional regulator  24.44 
 
 		 267 aa  76.3  0.0000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.812542  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3503  transcriptional regulator, putative  25.1 
 
 		 273 aa  75.5  0.0000000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.590051  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3830  transcriptional regulator, MerR family  25.94 
 
 		 274 aa  75.1  0.000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2808  transcriptional regulator, MerR family  24 
 
 		 276 aa  73.9  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.44001  normal  0.316047 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4179  transcriptional activator ligand binding domain protein  36.17 
 
 		 279 aa  73.2  0.000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.803381 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1410  MerR family transcriptional regulator  21.15 
 
 		 277 aa  72.8  0.000000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0684  MerR family transcriptional regulator  26.38 
 
 		 279 aa  72.4  0.000000000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1866  transcriptional regulator  30.41 
 
 		 247 aa  70.1  0.00000000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000190425  hitchhiker  0.000000000849298 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2598  transcriptional regulator, MerR family  25.76 
 
 		 271 aa  69.7  0.00000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000630559  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7266  transcriptional regulator, MerR family  22.94 
 
 		 274 aa  69.3  0.00000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0331  putative transcriptional activator tipA  35.4 
 
 		 249 aa  69.3  0.00000000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.275925  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2481  transcriptional regulator, MerR family  24.24 
 
 		 269 aa  69.3  0.00000000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.564945  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2638  transcriptional regulator, MerR family  24.04 
 
 		 273 aa  68.9  0.00000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2528  transcriptional regulator, MerR family  26.47 
 
 		 293 aa  68.6  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0065  transcriptional regulator, MerR family  26.44 
 
 		 252 aa  68.2  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1617  putative transcriptional regulator, MerR family  39.81 
 
 		 252 aa  67.8  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.870774 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2109  transcription activator, effector binding  26.02 
 
 		 283 aa  68.2  0.0000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.309412  normal  0.0724645 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0010  hypothetical protein  24.37 
 
 		 270 aa  67.4  0.0000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2992  transcriptional regulator, MerR family  33.33 
 
 		 282 aa  67  0.0000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.663692  normal  0.0173107 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03030  predicted transcriptional regulator  24.48 
 
 		 276 aa  66.2  0.0000000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1458  MerR family transcriptional regulator  34.95 
 
 		 161 aa  65.1  0.000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0168574  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5012  MerR family transcriptional regulator  24.64 
 
 		 289 aa  64.3  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.147011  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1754  transcriptional regulator, MerR family  42.31 
 
 		 257 aa  64.7  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.99712  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20290  predicted transcriptional regulator  37.89 
 
 		 277 aa  64.3  0.000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0400625  normal  0.347976 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3825  transcriptional activator ligand binding domain protein  22.03 
 
 		 280 aa  63.9  0.000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0425  MerR family transcriptional regulator  45 
 
 		 132 aa  63.5  0.000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.321126  normal  0.815952 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64500  putative transcriptional regulator  43.08 
 
 		 270 aa  63.5  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3564  MerR family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 245 aa  62.8  0.000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22860  predicted transcriptional regulator  33.33 
 
 		 224 aa  62.4  0.000000007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0323  transcription regulator family  36 
 
 		 253 aa  62  0.00000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4836  transcriptional activator tipA  37.11 
 
 		 243 aa  61.6  0.00000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3833  MerR family transcriptional regulator  33.96 
 
 		 270 aa  61.6  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000100059  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5109  putative transcriptional activator tipA  37.11 
 
 		 243 aa  62  0.00000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00019726  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5200  transcriptional activator tipA  37.11 
 
 		 243 aa  61.6  0.00000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5071  putative transcriptional activator tipA  37.11 
 
 		 243 aa  61.6  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0932  MerR family transcriptional regulator  21.34 
 
 		 290 aa  62  0.00000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0385  transcription activator, effector binding  23.97 
 
 		 286 aa  62  0.00000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5104  transcriptional activator tipA, putative  36.08 
 
 		 243 aa  61.2  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4678  transcriptional activator  37.11 
 
 		 243 aa  60.8  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4791  MerR family transcriptional regulator  35.51 
 
 		 241 aa  61.2  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5111  putative transcriptional activator tipA  36.08 
 
 		 244 aa  60.5  0.00000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.252328  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0226  transcriptional regulator, MerR family  33.66 
 
 		 276 aa  59.7  0.00000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000814651  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2159  MerR family transcriptional regulator  23.1 
 
 		 265 aa  60.1  0.00000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0129  putative transcriptional activator tipA  36.08 
 
 		 244 aa  60.1  0.00000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.634344  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1781  transcriptional regulator, MerR family  30.28 
 
 		 254 aa  59.7  0.00000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4694  transcriptional activator  36.08 
 
 		 243 aa  59.3  0.00000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3304  MCP methyltransferase, CheR-type  32.56 
 
 		 398 aa  59.3  0.00000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>