More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_2808 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_2808  transcriptional regulator, MerR family  100 
 
 		 276 aa  547  1e-155  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.44001  normal  0.316047 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7266  transcriptional regulator, MerR family  60.58 
 
 		 274 aa  318  7e-86  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5047  MerR family transcriptional regulator  48.88 
 
 		 276 aa  243  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.574995  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2735  putative transcriptional regulator, MerR family  51.52 
 
 		 264 aa  243  3e-63  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0721242  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6982  MerR family transcriptional regulator  52.04 
 
 		 270 aa  234  1.0000000000000001e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.80949  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3507  MerR family transcriptional regulator  49.09 
 
 		 292 aa  232  5e-60  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.401792  normal  0.0867153 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2529  transcriptional regulator, MerR family  51.32 
 
 		 270 aa  224  2e-57  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4163  transcriptional regulator, MerR family  40.44 
 
 		 275 aa  193  3e-48  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0932  MerR family transcriptional regulator  39.85 
 
 		 290 aa  182  6e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4623  transcriptional regulator, MerR family  39.59 
 
 		 297 aa  170  2e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3767  transcriptional regulator, MerR family  34.87 
 
 		 264 aa  114  2.0000000000000002e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.237591  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4810  transcription activator effector binding  30 
 
 		 274 aa  112  9e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.858088  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3506  transcription activator, effector binding  29.63 
 
 		 274 aa  109  4.0000000000000004e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.771694  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4799  transcriptional regulator, MerR family  36.92 
 
 		 258 aa  98.6  1e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2159  MerR family transcriptional regulator  27.92 
 
 		 265 aa  97.8  2e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0247  MerR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 287 aa  86.3  5e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3205  MerR family transcriptional regulator  23.27 
 
 		 273 aa  84.7  0.000000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.208736  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4099  transcription activator effector binding protein  31.67 
 
 		 276 aa  82.8  0.000000000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3503  transcriptional regulator, putative  23.64 
 
 		 273 aa  82.4  0.000000000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.590051  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1820  MerR family transcriptional regulator  22.26 
 
 		 270 aa  81.3  0.00000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.404333  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1424  MerR family transcriptional regulator  30.63 
 
 		 279 aa  80.1  0.00000000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.140644 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4179  transcriptional activator ligand binding domain protein  28.87 
 
 		 279 aa  79.7  0.00000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.803381 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3611  transcriptional regulator, MerR family  23.91 
 
 		 267 aa  79.3  0.00000000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1495  MerR family transcriptional regulator  21.91 
 
 		 276 aa  78.6  0.0000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00542237  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1485  MerR family transcriptional regulator  22.3 
 
 		 276 aa  78.6  0.0000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0543962  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1527  MerR family transcriptional regulator  22.3 
 
 		 276 aa  78.6  0.0000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2144  transcriptional regulator, MerR family  24 
 
 		 272 aa  78.6  0.0000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1641  MerR family transcriptional regulator  21.91 
 
 		 276 aa  78.2  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2780  transcriptional regulator, MerR family  21.03 
 
 		 269 aa  78.2  0.0000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000880145 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2630  transcriptional regulator, MerR family  21.61 
 
 		 269 aa  78.2  0.0000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00281071  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1523  MerR family transcriptional regulator  22.61 
 
 		 276 aa  77.8  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.193632  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1708  transcriptional regulator, MerR family  21.91 
 
 		 276 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2545  transcriptional regulator, MerR family  21.03 
 
 		 269 aa  77  0.0000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7229  putative transcriptional regulator, MerR family  30.5 
 
 		 272 aa  76.6  0.0000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.385629 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0331  MerR family transcriptional regulator  21.46 
 
 		 281 aa  76.6  0.0000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2401  MerR family transcriptional regulator  21.38 
 
 		 269 aa  76.3  0.0000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.908212  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2576  MerR family transcriptional regulator  21.38 
 
 		 269 aa  76.3  0.0000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.473387  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0225  putative transcriptional regulator, MerR family  32.27 
 
 		 262 aa  75.9  0.0000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3493  transcriptional regulator, MerR family  23.25 
 
 		 273 aa  75.1  0.000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2018  putative transcriptional regulator, MerR family  31.47 
 
 		 286 aa  74.7  0.000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.253438  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2895  transcriptional regulator, MerR family  22.55 
 
 		 269 aa  75.1  0.000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5012  MerR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 289 aa  75.1  0.000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.147011  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22770  predicted transcriptional regulator  48.68 
 
 		 284 aa  74.7  0.000000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0455  MerR family transcriptional regulator  19.28 
 
 		 261 aa  74.7  0.000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00278493  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3667  transcriptional regulator, MerR family  22.46 
 
 		 276 aa  75.1  0.000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.372345  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20290  predicted transcriptional regulator  39.34 
 
 		 277 aa  73.2  0.000000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0400625  normal  0.347976 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0385  transcription activator, effector binding  27.6 
 
 		 286 aa  73.2  0.000000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1731  MerR family transcriptional regulator  22.11 
 
 		 276 aa  72.4  0.000000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.867101  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0010  hypothetical protein  23.69 
 
 		 270 aa  72  0.000000000009  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1677  transcriptional regulator, MerR family  22.61 
 
 		 276 aa  71.6  0.00000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.128581  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2317  MerR family transcriptional regulator  17.92 
 
 		 269 aa  72  0.00000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0566035  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0888  transcriptional regulator, MerR family  41.86 
 
 		 270 aa  72  0.00000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00108118  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0445  MerR family transcriptional regulator  18.88 
 
 		 261 aa  71.6  0.00000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0194713  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1782  transcriptional regulator, MerR family  21.75 
 
 		 276 aa  72  0.00000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.381283  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2481  transcriptional regulator, MerR family  25.84 
 
 		 269 aa  72  0.00000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.564945  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22860  predicted transcriptional regulator  35.19 
 
 		 224 aa  71.2  0.00000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0479  MerR family transcriptional regulator  39.66 
 
 		 354 aa  71.2  0.00000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.369084 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03030  predicted transcriptional regulator  25.57 
 
 		 276 aa  70.9  0.00000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2354  MerR family transcriptional regulator  17.92 
 
 		 269 aa  70.1  0.00000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000403249  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2588  transcriptional regulator, MerR family  17.92 
 
 		 269 aa  70.1  0.00000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.40806e-18 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3833  MerR family transcriptional regulator  25.37 
 
 		 270 aa  69.7  0.00000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000100059  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1993  transcriptional regulator, MerR family  40 
 
 		 272 aa  69.3  0.00000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2305  transcriptional regulator, MerR family  41.75 
 
 		 268 aa  68.2  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.643594 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0684  MerR family transcriptional regulator  26.12 
 
 		 279 aa  67.8  0.0000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3825  transcriptional activator ligand binding domain protein  22.02 
 
 		 280 aa  67.8  0.0000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2263  transcriptional regulator, MerR family  31.8 
 
 		 281 aa  67.8  0.0000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2638  transcriptional regulator, MerR family  22.39 
 
 		 273 aa  67  0.0000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2419  protein serine/threonine phosphatase  49.25 
 
 		 355 aa  66.6  0.0000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.111892 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2316  regulatory protein, MerR  47.76 
 
 		 369 aa  66.2  0.0000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.280801  normal  0.123157 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19550  serine/threonine protein phosphatase  37.61 
 
 		 361 aa  65.9  0.0000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.17725  normal  0.381768 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0379  transcriptional regulator, MerR family  38.6 
 
 		 327 aa  65.1  0.000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4563  transcriptional regulator, MerR family  36.94 
 
 		 150 aa  63.5  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1582  hypothetical protein  34.26 
 
 		 249 aa  63.5  0.000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1079  TipAS antibiotic-recognition domain-containing protein  33.03 
 
 		 252 aa  63.2  0.000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.23199 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1785  MerR family transcriptional regulator  36.52 
 
 		 134 aa  63.2  0.000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.370686  normal  0.0498641 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8866  putative transcriptional regulator, MerR family  38.1 
 
 		 279 aa  62.8  0.000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.249264  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3560  MerR family transcriptional regulator  22.89 
 
 		 287 aa  62.8  0.000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.453881 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4044  transcriptional regulator, MerR family  28.83 
 
 		 271 aa  62.8  0.000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0218982 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18550  predicted transcriptional regulator  28.57 
 
 		 244 aa  62.8  0.000000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2831  MerR family transcriptional regulator  37.72 
 
 		 175 aa  62.4  0.000000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.116752 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2173  regulatory protein, MerR  31.85 
 
 		 147 aa  62.4  0.000000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1534  transcriptional regulator, MerR family  36.49 
 
 		 249 aa  62.4  0.000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0334786  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2598  transcriptional regulator, MerR family  25.53 
 
 		 271 aa  62  0.000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000630559  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0323  transcription regulator family  33.98 
 
 		 253 aa  62  0.000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5383  transcriptional regulator, MerR family  47.95 
 
 		 266 aa  61.6  0.00000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.94507 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0384  transcriptional regulator, MerR family  41.46 
 
 		 258 aa  61.6  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0450143  decreased coverage  0.00634425 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1754  transcriptional regulator, MerR family  21.65 
 
 		 257 aa  62  0.00000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.99712  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0969  MerR family transcriptional regulator  33.98 
 
 		 252 aa  60.8  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00256708  hitchhiker  0.0060004 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0464  transcriptional regulator, MerR family  25.66 
 
 		 254 aa  61.2  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1629  transcriptional regulator, MerR family  45.07 
 
 		 306 aa  60.8  0.00000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0882685  normal  0.393491 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4694  transcriptional activator  27.12 
 
 		 243 aa  60.5  0.00000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0088  hypothetical protein  33.33 
 
 		 253 aa  60.5  0.00000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1411  hypothetical protein  32.41 
 
 		 250 aa  60.5  0.00000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2528  transcriptional regulator, MerR family  34.45 
 
 		 293 aa  60.5  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0276  MerR family transcriptional regulator  40 
 
 		 288 aa  60.5  0.00000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000161709  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5109  putative transcriptional activator tipA  27.12 
 
 		 243 aa  60.5  0.00000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00019726  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2992  transcriptional regulator, MerR family  28.37 
 
 		 282 aa  60.1  0.00000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.663692  normal  0.0173107 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2819  transcriptional regulator, MerR family protein  35.78 
 
 		 129 aa  60.1  0.00000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0345  transcriptional regulator, MerR family  35.34 
 
 		 247 aa  60.1  0.00000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0129  putative transcriptional activator tipA  29.25 
 
 		 244 aa  59.7  0.00000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.634344  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>