More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_03030 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013169  Ksed_03030  predicted transcriptional regulator  100 
 
 		 276 aa  558  1e-158  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2263  transcriptional regulator, MerR family  45.71 
 
 		 281 aa  229  4e-59  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22860  predicted transcriptional regulator  45.13 
 
 		 224 aa  218  6e-56  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10620  putative transcription activator  44.94 
 
 		 157 aa  133  3e-30  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.852271  normal  0.072643 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2401  MerR family transcriptional regulator  27.39 
 
 		 269 aa  122  8e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.908212  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2576  MerR family transcriptional regulator  27.39 
 
 		 269 aa  122  8e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.473387  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2780  transcriptional regulator, MerR family  26.97 
 
 		 269 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000880145 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2545  transcriptional regulator, MerR family  26.97 
 
 		 269 aa  120  3e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2317  MerR family transcriptional regulator  26.14 
 
 		 269 aa  116  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0566035  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2354  MerR family transcriptional regulator  26.14 
 
 		 269 aa  115  6.9999999999999995e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000403249  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2588  transcriptional regulator, MerR family  26.14 
 
 		 269 aa  115  6.9999999999999995e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.40806e-18 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1820  MerR family transcriptional regulator  26.97 
 
 		 270 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.404333  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2630  transcriptional regulator, MerR family  26.64 
 
 		 269 aa  112  6e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00281071  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2598  transcriptional regulator, MerR family  28.1 
 
 		 271 aa  112  8.000000000000001e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000630559  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3830  transcriptional regulator, MerR family  27.23 
 
 		 274 aa  108  9.000000000000001e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0385  transcription activator, effector binding  33.1 
 
 		 286 aa  108  1e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4810  transcription activator effector binding  29.41 
 
 		 274 aa  105  1e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.858088  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2638  transcriptional regulator, MerR family  27.27 
 
 		 273 aa  103  3e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3506  transcription activator, effector binding  30.15 
 
 		 274 aa  100  3e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.771694  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3560  MerR family transcriptional regulator  26.69 
 
 		 287 aa  98.2  1e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.453881 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0684  MerR family transcriptional regulator  27.76 
 
 		 279 aa  94  3e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4099  transcription activator effector binding protein  30.45 
 
 		 276 aa  92  8e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7229  putative transcriptional regulator, MerR family  33.92 
 
 		 272 aa  86.7  4e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.385629 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3493  transcriptional regulator, MerR family  23.25 
 
 		 273 aa  86.7  4e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2018  putative transcriptional regulator, MerR family  28.37 
 
 		 286 aa  85.9  7e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.253438  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2992  transcriptional regulator, MerR family  31.58 
 
 		 282 aa  85.5  9e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.663692  normal  0.0173107 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3503  transcriptional regulator, putative  23.62 
 
 		 273 aa  85.5  0.000000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.590051  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3205  MerR family transcriptional regulator  23.53 
 
 		 273 aa  84  0.000000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.208736  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0010  hypothetical protein  26.16 
 
 		 270 aa  84  0.000000000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2159  MerR family transcriptional regulator  29.06 
 
 		 265 aa  83.2  0.000000000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6982  MerR family transcriptional regulator  27.97 
 
 		 270 aa  82.4  0.000000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.80949  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3767  transcriptional regulator, MerR family  28.94 
 
 		 264 aa  79.3  0.00000000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.237591  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4179  transcriptional activator ligand binding domain protein  29.64 
 
 		 279 aa  79.3  0.00000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.803381 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5047  MerR family transcriptional regulator  25.77 
 
 		 276 aa  79  0.00000000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.574995  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2895  transcriptional regulator, MerR family  23.02 
 
 		 269 aa  79  0.00000000000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2528  transcriptional regulator, MerR family  31.58 
 
 		 293 aa  78.6  0.0000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2481  transcriptional regulator, MerR family  28.57 
 
 		 269 aa  78.2  0.0000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.564945  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3611  transcriptional regulator, MerR family  21.15 
 
 		 267 aa  77.4  0.0000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0247  MerR family transcriptional regulator  27.87 
 
 		 287 aa  77  0.0000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7266  transcriptional regulator, MerR family  26.34 
 
 		 274 aa  74.7  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5012  MerR family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 289 aa  75.1  0.000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.147011  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0225  putative transcriptional regulator, MerR family  29 
 
 		 262 aa  73.9  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3507  MerR family transcriptional regulator  25.64 
 
 		 292 aa  73.6  0.000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.401792  normal  0.0867153 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4044  transcriptional regulator, MerR family  28.23 
 
 		 271 aa  73.2  0.000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0218982 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2735  putative transcriptional regulator, MerR family  26.38 
 
 		 264 aa  71.2  0.00000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0721242  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4799  transcriptional regulator, MerR family  29.74 
 
 		 258 aa  71.2  0.00000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4623  transcriptional regulator, MerR family  26.33 
 
 		 297 aa  70.5  0.00000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1754  transcriptional regulator, MerR family  22.69 
 
 		 257 aa  69.7  0.00000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.99712  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2808  transcriptional regulator, MerR family  25.57 
 
 		 276 aa  69.3  0.00000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.44001  normal  0.316047 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1424  MerR family transcriptional regulator  30.59 
 
 		 279 aa  68.2  0.0000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.140644 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4163  transcriptional regulator, MerR family  34.29 
 
 		 275 aa  67  0.0000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2144  transcriptional regulator, MerR family  24.48 
 
 		 272 aa  66.2  0.0000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0932  MerR family transcriptional regulator  22.18 
 
 		 290 aa  66.2  0.0000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1609  MerR family transcriptional regulator  23.85 
 
 		 272 aa  65.5  0.0000000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.822901  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64500  putative transcriptional regulator  25.54 
 
 		 270 aa  64.7  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1993  transcriptional regulator, MerR family  37.5 
 
 		 272 aa  61.6  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1485  MerR family transcriptional regulator  24.6 
 
 		 276 aa  61.6  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0543962  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2529  transcriptional regulator, MerR family  26.12 
 
 		 270 aa  62  0.00000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0323  transcription regulator family  26.67 
 
 		 253 aa  60.8  0.00000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22770  predicted transcriptional regulator  45.71 
 
 		 284 aa  60.5  0.00000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0425  MerR family transcriptional regulator  47.46 
 
 		 132 aa  59.7  0.00000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.321126  normal  0.815952 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1708  transcriptional regulator, MerR family  22.22 
 
 		 276 aa  59.3  0.00000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3564  MerR family transcriptional regulator  32.8 
 
 		 245 aa  59.3  0.00000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2603  transcriptional regulator, MerR family  30.17 
 
 		 274 aa  59.3  0.00000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.241665  normal  0.676341 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1641  MerR family transcriptional regulator  22.22 
 
 		 276 aa  58.9  0.00000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1523  MerR family transcriptional regulator  22.22 
 
 		 276 aa  58.9  0.00000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.193632  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5600  putative transcriptional regulator  26.83 
 
 		 270 aa  58.9  0.00000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3833  MerR family transcriptional regulator  31.93 
 
 		 270 aa  58.5  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000100059  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1731  MerR family transcriptional regulator  23.14 
 
 		 276 aa  57.8  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.867101  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0129  hypothetical protein  35.4 
 
 		 347 aa  57.4  0.0000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.257512  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0653  regulatory protein, MerR  36.79 
 
 		 132 aa  57.8  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19550  serine/threonine protein phosphatase  31.69 
 
 		 361 aa  57.8  0.0000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.17725  normal  0.381768 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1701  MerR family transcriptional regulator  23.13 
 
 		 280 aa  57.8  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.126124  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4791  MerR family transcriptional regulator  30.7 
 
 		 241 aa  57.8  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0420  MerR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 258 aa  57.4  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8866  putative transcriptional regulator, MerR family  36.28 
 
 		 279 aa  57.4  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.249264  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1495  MerR family transcriptional regulator  21.83 
 
 		 276 aa  56.2  0.0000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00542237  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0331  MerR family transcriptional regulator  19.84 
 
 		 281 aa  56.2  0.0000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1021  transcriptional regulator, MerR family  29.41 
 
 		 247 aa  56.2  0.0000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.10693e-29 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0129  putative transcriptional activator tipA  30.7 
 
 		 244 aa  56.2  0.0000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.634344  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0877  MerR family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 247 aa  55.8  0.0000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1137  transcriptional regulator, MerR family  35.51 
 
 		 159 aa  55.8  0.0000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0931  MerR family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 247 aa  55.8  0.0000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1677  transcriptional regulator, MerR family  22.35 
 
 		 276 aa  55.8  0.0000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.128581  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5104  transcriptional activator tipA, putative  30.7 
 
 		 243 aa  55.5  0.0000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3434  MerR family transcriptional regulator  31.62 
 
 		 128 aa  55.5  0.0000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.87421  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0479  MerR family transcriptional regulator  33.06 
 
 		 354 aa  55.5  0.0000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.369084 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5383  transcriptional regulator, MerR family  43.75 
 
 		 266 aa  55.1  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.94507 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0379  transcriptional regulator, MerR family  37.72 
 
 		 327 aa  55.1  0.000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5111  putative transcriptional activator tipA  30.7 
 
 		 244 aa  55.1  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.252328  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6110  MerR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 128 aa  55.1  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.772914  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3667  transcriptional regulator, MerR family  22.35 
 
 		 276 aa  55.5  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.372345  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3825  transcriptional activator ligand binding domain protein  29.41 
 
 		 280 aa  55.1  0.000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5109  putative transcriptional activator tipA  29.82 
 
 		 243 aa  55.1  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00019726  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4579  MerR family transcriptional regulator  35.51 
 
 		 134 aa  54.7  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.923905  decreased coverage  0.00324593 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10060  Cu(I)-responsive transcriptional regulator, MerR family  36.54 
 
 		 138 aa  54.7  0.000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.198613  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0829  MerR family transcriptional regulator  28.93 
 
 		 247 aa  55.5  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4694  transcriptional activator  29.82 
 
 		 243 aa  54.3  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0812  MerR family transcriptional regulator  34.91 
 
 		 143 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0630  MerR family transcriptional regulator  35.51 
 
 		 136 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000318098 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>