More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_0684 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007796  Mhun_0684  MerR family transcriptional regulator  100 
 
 		 279 aa  573  1.0000000000000001e-162  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0385  transcription activator, effector binding  45.49 
 
 		 286 aa  241  1e-62  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3560  MerR family transcriptional regulator  41.7 
 
 		 287 aa  238  8e-62  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.453881 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4810  transcription activator effector binding  33.57 
 
 		 274 aa  139  3.9999999999999997e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.858088  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3506  transcription activator, effector binding  30.66 
 
 		 274 aa  130  2.0000000000000002e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.771694  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4799  transcriptional regulator, MerR family  31.14 
 
 		 258 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2895  transcriptional regulator, MerR family  30.32 
 
 		 269 aa  118  9.999999999999999e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0010  hypothetical protein  30.32 
 
 		 270 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3611  transcriptional regulator, MerR family  27.21 
 
 		 267 aa  110  2.0000000000000002e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0225  putative transcriptional regulator, MerR family  31.8 
 
 		 262 aa  110  3e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5047  MerR family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 276 aa  109  5e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.574995  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1231  transcription activator effector binding  39.6 
 
 		 155 aa  105  1e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0816033 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03030  predicted transcriptional regulator  28.67 
 
 		 276 aa  104  2e-21  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0247  MerR family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 287 aa  101  1e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4099  transcription activator effector binding protein  31.32 
 
 		 276 aa  100  3e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4179  transcriptional activator ligand binding domain protein  31.34 
 
 		 279 aa  98.2  1e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.803381 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3767  transcriptional regulator, MerR family  30.51 
 
 		 264 aa  98.2  1e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.237591  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2598  transcriptional regulator, MerR family  30.18 
 
 		 271 aa  98.2  1e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000630559  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2735  putative transcriptional regulator, MerR family  29.46 
 
 		 264 aa  98.2  1e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0721242  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2159  MerR family transcriptional regulator  27.24 
 
 		 265 aa  98.2  1e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2018  putative transcriptional regulator, MerR family  31.9 
 
 		 286 aa  97.4  2e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.253438  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0331  MerR family transcriptional regulator  30 
 
 		 281 aa  97.1  3e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2263  transcriptional regulator, MerR family  30.72 
 
 		 281 aa  96.3  4e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6982  MerR family transcriptional regulator  26.56 
 
 		 270 aa  93.6  3e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.80949  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2481  transcriptional regulator, MerR family  28.21 
 
 		 269 aa  92  9e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.564945  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2638  transcriptional regulator, MerR family  28.32 
 
 		 273 aa  92  1e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2630  transcriptional regulator, MerR family  25.8 
 
 		 269 aa  89.7  4e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00281071  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1820  MerR family transcriptional regulator  26.79 
 
 		 270 aa  89.7  5e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.404333  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3507  MerR family transcriptional regulator  28.73 
 
 		 292 aa  89  8e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.401792  normal  0.0867153 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7266  transcriptional regulator, MerR family  27.94 
 
 		 274 aa  89  9e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2545  transcriptional regulator, MerR family  25 
 
 		 269 aa  88.2  1e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2780  transcriptional regulator, MerR family  25.36 
 
 		 269 aa  87.4  2e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000880145 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3493  transcriptional regulator, MerR family  28.67 
 
 		 273 aa  86.7  4e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3833  MerR family transcriptional regulator  27.44 
 
 		 270 aa  86.3  5e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000100059  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2529  transcriptional regulator, MerR family  26.48 
 
 		 270 aa  86.3  5e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3503  transcriptional regulator, putative  25.99 
 
 		 273 aa  85.5  0.000000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.590051  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3830  transcriptional regulator, MerR family  28.01 
 
 		 274 aa  84.3  0.000000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2401  MerR family transcriptional regulator  25.44 
 
 		 269 aa  82.4  0.000000000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.908212  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2576  MerR family transcriptional regulator  25.44 
 
 		 269 aa  82.4  0.000000000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.473387  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3205  MerR family transcriptional regulator  26.71 
 
 		 273 aa  81.6  0.00000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.208736  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2588  transcriptional regulator, MerR family  24.73 
 
 		 269 aa  80.5  0.00000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.40806e-18 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2354  MerR family transcriptional regulator  24.73 
 
 		 269 aa  80.5  0.00000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000403249  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2317  MerR family transcriptional regulator  25.35 
 
 		 269 aa  79.7  0.00000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0566035  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1424  MerR family transcriptional regulator  25.87 
 
 		 279 aa  79.7  0.00000000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.140644 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3825  transcriptional activator ligand binding domain protein  25.94 
 
 		 280 aa  77.8  0.0000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7229  putative transcriptional regulator, MerR family  29.08 
 
 		 272 aa  77.4  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.385629 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5012  MerR family transcriptional regulator  26.94 
 
 		 289 aa  77  0.0000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.147011  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2109  transcription activator, effector binding  31.09 
 
 		 283 aa  75.5  0.0000000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.309412  normal  0.0724645 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0296  transcription activator effector binding  40 
 
 		 120 aa  75.5  0.000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.285639 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1206  transcription activator, effector binding  29.91 
 
 		 132 aa  73.9  0.000000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2144  transcriptional regulator, MerR family  26.39 
 
 		 272 aa  73.9  0.000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1708  transcriptional regulator, MerR family  25 
 
 		 276 aa  73.6  0.000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1495  MerR family transcriptional regulator  25.09 
 
 		 276 aa  72.8  0.000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00542237  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1485  MerR family transcriptional regulator  24.83 
 
 		 276 aa  72.8  0.000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0543962  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4163  transcriptional regulator, MerR family  25.18 
 
 		 275 aa  72.4  0.000000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4044  transcriptional regulator, MerR family  27.48 
 
 		 271 aa  71.6  0.00000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0218982 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1523  MerR family transcriptional regulator  24.65 
 
 		 276 aa  71.6  0.00000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.193632  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1641  MerR family transcriptional regulator  24.65 
 
 		 276 aa  72  0.00000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0932  MerR family transcriptional regulator  22.38 
 
 		 290 aa  71.2  0.00000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20290  predicted transcriptional regulator  33.67 
 
 		 277 aa  71.2  0.00000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0400625  normal  0.347976 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1754  transcriptional regulator, MerR family  27.17 
 
 		 257 aa  69.7  0.00000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.99712  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19550  serine/threonine protein phosphatase  41.67 
 
 		 361 aa  69.7  0.00000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.17725  normal  0.381768 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1993  transcriptional regulator, MerR family  25.18 
 
 		 272 aa  69.3  0.00000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2324  hypothetical protein  30.92 
 
 		 321 aa  68.6  0.0000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0188345  normal  0.69843 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1701  MerR family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 280 aa  67.8  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.126124  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1731  MerR family transcriptional regulator  23.47 
 
 		 276 aa  66.6  0.0000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.867101  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3291  MerR family transcriptional regulator  25.09 
 
 		 289 aa  67  0.0000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1361  transcriptional regulator, MerR family  20.58 
 
 		 314 aa  66.6  0.0000000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000000180624  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2209  transcription activator, effector binding  31.68 
 
 		 156 aa  66.2  0.0000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.796256 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1782  transcriptional regulator, MerR family  23.81 
 
 		 276 aa  65.9  0.0000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.381283  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3667  transcriptional regulator, MerR family  23.55 
 
 		 276 aa  65.9  0.0000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.372345  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2992  transcriptional regulator, MerR family  44.83 
 
 		 282 aa  65.9  0.0000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.663692  normal  0.0173107 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1629  transcriptional regulator, MerR family  46.75 
 
 		 306 aa  65.5  0.0000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0882685  normal  0.393491 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2798  transcription activator effector binding  33.97 
 
 		 156 aa  64.7  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2305  transcriptional regulator, MerR family  26.91 
 
 		 268 aa  65.5  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.643594 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8866  putative transcriptional regulator, MerR family  26.7 
 
 		 279 aa  65.5  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.249264  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1677  transcriptional regulator, MerR family  23.67 
 
 		 276 aa  65.5  0.000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.128581  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3702  transcriptional regulator, AraC type  32.93 
 
 		 308 aa  64.3  0.000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2528  transcriptional regulator, MerR family  24.24 
 
 		 293 aa  64.7  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2808  transcriptional regulator, MerR family  25.71 
 
 		 276 aa  64.3  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.44001  normal  0.316047 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1527  MerR family transcriptional regulator  23.59 
 
 		 276 aa  62.4  0.000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4623  transcriptional regulator, MerR family  24.46 
 
 		 297 aa  62  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0323  transcription regulator family  33.96 
 
 		 253 aa  62  0.00000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0379  transcriptional regulator, MerR family  31.3 
 
 		 327 aa  60.8  0.00000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1609  MerR family transcriptional regulator  25.44 
 
 		 272 aa  60.5  0.00000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.822901  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2843  AraC family transcriptional regulator  28.39 
 
 		 296 aa  60.1  0.00000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.538425  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2816  AraC family transcriptional regulator  28.39 
 
 		 296 aa  60.1  0.00000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3057  AraC family transcriptional regulator  28.39 
 
 		 296 aa  60.1  0.00000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.118978  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3161  AraC family transcriptional regulator  30.13 
 
 		 277 aa  60.1  0.00000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3847  transcriptional activator ligand binding domain protein  26.28 
 
 		 148 aa  59.7  0.00000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0479  MerR family transcriptional regulator  28.29 
 
 		 354 aa  59.3  0.00000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.369084 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0019  transcriptional regulator, AraC family  28.48 
 
 		 314 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2316  regulatory protein, MerR  35.25 
 
 		 369 aa  58.5  0.0000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.280801  normal  0.123157 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0593  transcription activator, effector binding  28.03 
 
 		 153 aa  58.2  0.0000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2419  protein serine/threonine phosphatase  39.78 
 
 		 355 aa  58.2  0.0000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.111892 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1956  transcriptional regulator, AraC family  30.38 
 
 		 283 aa  57.8  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0993473  normal  0.479782 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2753  hypothetical protein  27.52 
 
 		 156 aa  57.8  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2836  AraC family transcriptional regulator  29.49 
 
 		 296 aa  57.8  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00254989  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1364  hypothetical protein  34.07 
 
 		 152 aa  58.2  0.0000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.33275  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3069  transcriptional regulator, AraC family  27.92 
 
 		 296 aa  57.8  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>