238 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_4179 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013739  Cwoe_4179  transcriptional activator ligand binding domain protein  100 
 
 
279 aa  536  1e-151  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.803381 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0225  putative transcriptional regulator, MerR family  43.07 
 
 
262 aa  180  2.9999999999999997e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4799  transcriptional regulator, MerR family  41.18 
 
 
258 aa  166  2.9999999999999998e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4810  transcription activator effector binding  38.52 
 
 
274 aa  150  3e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.858088  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3506  transcription activator, effector binding  38.57 
 
 
274 aa  148  1.0000000000000001e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.771694  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3507  MerR family transcriptional regulator  35.87 
 
 
292 aa  118  9.999999999999999e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.401792  normal  0.0867153 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6982  MerR family transcriptional regulator  33.09 
 
 
270 aa  110  3e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.80949  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2735  putative transcriptional regulator, MerR family  34.3 
 
 
264 aa  105  7e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0721242  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5047  MerR family transcriptional regulator  32.25 
 
 
276 aa  103  4e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.574995  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0684  MerR family transcriptional regulator  31.56 
 
 
279 aa  102  7e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4163  transcriptional regulator, MerR family  31.91 
 
 
275 aa  102  9e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2529  transcriptional regulator, MerR family  33.94 
 
 
270 aa  100  4e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2895  transcriptional regulator, MerR family  25.72 
 
 
269 aa  94  3e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3611  transcriptional regulator, MerR family  25.35 
 
 
267 aa  94  3e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7229  putative transcriptional regulator, MerR family  30.14 
 
 
272 aa  93.2  4e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.385629 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1424  MerR family transcriptional regulator  31.09 
 
 
279 aa  92  9e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.140644 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3833  MerR family transcriptional regulator  29.66 
 
 
270 aa  92  9e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000100059  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2144  transcriptional regulator, MerR family  26.62 
 
 
272 aa  90.9  2e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0247  MerR family transcriptional regulator  28.81 
 
 
287 aa  90.9  2e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2780  transcriptional regulator, MerR family  22.7 
 
 
269 aa  90.9  2e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000880145 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4099  transcription activator effector binding protein  32.63 
 
 
276 aa  90.1  3e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2317  MerR family transcriptional regulator  22.94 
 
 
269 aa  89.7  4e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0566035  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3767  transcriptional regulator, MerR family  33.33 
 
 
264 aa  90.1  4e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.237591  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2545  transcriptional regulator, MerR family  22.34 
 
 
269 aa  89.7  4e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1993  transcriptional regulator, MerR family  31.4 
 
 
272 aa  88.6  9e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3503  transcriptional regulator, putative  25.67 
 
 
273 aa  88.6  1e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.590051  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2354  MerR family transcriptional regulator  22.94 
 
 
269 aa  88.6  1e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000403249  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03030  predicted transcriptional regulator  29.79 
 
 
276 aa  88.2  1e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2588  transcriptional regulator, MerR family  22.94 
 
 
269 aa  88.6  1e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.40806e-18 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2638  transcriptional regulator, MerR family  27.24 
 
 
273 aa  87.8  2e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0385  transcription activator, effector binding  29.72 
 
 
286 aa  87  3e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1820  MerR family transcriptional regulator  21.86 
 
 
270 aa  85.5  8e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.404333  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2401  MerR family transcriptional regulator  22.02 
 
 
269 aa  84.7  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.908212  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2576  MerR family transcriptional regulator  22.02 
 
 
269 aa  84.7  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.473387  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4623  transcriptional regulator, MerR family  30.98 
 
 
297 aa  83.6  0.000000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2808  transcriptional regulator, MerR family  30.63 
 
 
276 aa  82.8  0.000000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.44001  normal  0.316047 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2481  transcriptional regulator, MerR family  28.32 
 
 
269 aa  82.8  0.000000000000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.564945  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7266  transcriptional regulator, MerR family  31.23 
 
 
274 aa  82.4  0.000000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0331  MerR family transcriptional regulator  25.46 
 
 
281 aa  80.1  0.00000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3205  MerR family transcriptional regulator  23.46 
 
 
273 aa  79.7  0.00000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.208736  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2630  transcriptional regulator, MerR family  21.63 
 
 
269 aa  79.7  0.00000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00281071  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2528  transcriptional regulator, MerR family  30.8 
 
 
293 aa  79  0.00000000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2159  MerR family transcriptional regulator  28.42 
 
 
265 aa  78.6  0.0000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64500  putative transcriptional regulator  28.03 
 
 
270 aa  78.6  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2305  transcriptional regulator, MerR family  31.65 
 
 
268 aa  77.8  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.643594 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1527  MerR family transcriptional regulator  25.26 
 
 
276 aa  77.8  0.0000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3493  transcriptional regulator, MerR family  22.69 
 
 
273 aa  77  0.0000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0932  MerR family transcriptional regulator  28.1 
 
 
290 aa  77.4  0.0000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20290  predicted transcriptional regulator  31.74 
 
 
277 aa  75.9  0.0000000000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0400625  normal  0.347976 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3830  transcriptional regulator, MerR family  25 
 
 
274 aa  75.9  0.0000000000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1231  transcription activator effector binding  31.68 
 
 
155 aa  75.5  0.000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0816033 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1629  transcriptional regulator, MerR family  54.55 
 
 
306 aa  74.7  0.000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0882685  normal  0.393491 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5600  putative transcriptional regulator  28.74 
 
 
270 aa  74.7  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1523  MerR family transcriptional regulator  25.43 
 
 
276 aa  73.9  0.000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.193632  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1641  MerR family transcriptional regulator  25.68 
 
 
276 aa  73.9  0.000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0010  hypothetical protein  25.09 
 
 
270 aa  74.7  0.000000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1731  MerR family transcriptional regulator  25.52 
 
 
276 aa  73.9  0.000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.867101  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1708  transcriptional regulator, MerR family  25.68 
 
 
276 aa  73.9  0.000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1782  transcriptional regulator, MerR family  25.86 
 
 
276 aa  73.9  0.000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.381283  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2263  transcriptional regulator, MerR family  33.45 
 
 
281 aa  73.6  0.000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1495  MerR family transcriptional regulator  25.68 
 
 
276 aa  73.2  0.000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00542237  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2018  putative transcriptional regulator, MerR family  30.03 
 
 
286 aa  73.2  0.000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.253438  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1485  MerR family transcriptional regulator  23.63 
 
 
276 aa  73.2  0.000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0543962  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3667  transcriptional regulator, MerR family  25.52 
 
 
276 aa  72.8  0.000000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.372345  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1677  transcriptional regulator, MerR family  23.78 
 
 
276 aa  72.4  0.000000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.128581  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3560  MerR family transcriptional regulator  25.35 
 
 
287 aa  70.1  0.00000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.453881 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22860  predicted transcriptional regulator  33.77 
 
 
224 aa  69.7  0.00000000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0455  MerR family transcriptional regulator  22.05 
 
 
261 aa  68.2  0.0000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00278493  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5012  MerR family transcriptional regulator  25.61 
 
 
289 aa  67.8  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.147011  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1701  MerR family transcriptional regulator  25.44 
 
 
280 aa  67.4  0.0000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.126124  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13400  predicted transcriptional regulator  47.83 
 
 
346 aa  67.4  0.0000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1609  MerR family transcriptional regulator  24.04 
 
 
272 aa  67  0.0000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.822901  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22770  predicted transcriptional regulator  46.05 
 
 
284 aa  66.6  0.0000000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0379  transcriptional regulator, MerR family  40.86 
 
 
327 aa  66.2  0.0000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8866  putative transcriptional regulator, MerR family  39.13 
 
 
279 aa  65.5  0.0000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.249264  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2419  protein serine/threonine phosphatase  51.52 
 
 
355 aa  65.1  0.000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.111892 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06160  serine/threonine protein phosphatase  37.5 
 
 
361 aa  64.3  0.000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19550  serine/threonine protein phosphatase  38 
 
 
361 aa  64.3  0.000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.17725  normal  0.381768 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0445  MerR family transcriptional regulator  35 
 
 
261 aa  64.7  0.000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0194713  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2598  transcriptional regulator, MerR family  26.16 
 
 
271 aa  63.5  0.000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000630559  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2992  transcriptional regulator, MerR family  38.32 
 
 
282 aa  63.5  0.000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.663692  normal  0.0173107 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2316  regulatory protein, MerR  47.06 
 
 
369 aa  62.8  0.000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.280801  normal  0.123157 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0425  MerR family transcriptional regulator  60 
 
 
132 aa  62.4  0.000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.321126  normal  0.815952 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2109  transcription activator, effector binding  30.71 
 
 
283 aa  62  0.000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.309412  normal  0.0724645 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2311  putative transcriptional regulator, MerR family  36.78 
 
 
399 aa  61.2  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4044  transcriptional regulator, MerR family  27.78 
 
 
271 aa  61.2  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0218982 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3825  transcriptional activator ligand binding domain protein  23.63 
 
 
280 aa  61.2  0.00000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0479  MerR family transcriptional regulator  35.83 
 
 
354 aa  61.2  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.369084 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1361  transcriptional regulator, MerR family  22.85 
 
 
314 aa  59.3  0.00000006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000000180624  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1754  transcriptional regulator, MerR family  21.48 
 
 
257 aa  58.2  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.99712  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6173  transcriptional activator ligand binding domain protein  41.67 
 
 
158 aa  57.8  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0354767  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2898  transcriptional regulator, MerR family  35.51 
 
 
282 aa  57.4  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0318  transcription activator effector binding  30.2 
 
 
157 aa  57.4  0.0000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.289482 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0888  transcriptional regulator, MerR family  37.84 
 
 
270 aa  58.2  0.0000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00108118  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1866  transcriptional regulator  33.33 
 
 
247 aa  57.8  0.0000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000190425  hitchhiker  0.000000000849298 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5383  transcriptional regulator, MerR family  40.62 
 
 
266 aa  57  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.94507 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1974  transcriptional regulator, MerR family  29.29 
 
 
283 aa  56.6  0.0000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00000269645  unclonable  0.0000000367636 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1206  transcription activator, effector binding  40 
 
 
132 aa  57  0.0000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1582  hypothetical protein  27.68 
 
 
249 aa  55.1  0.000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2868  MerR family transcriptional regulator  32.73 
 
 
129 aa  54.3  0.000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000311414  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>