More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_3507 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008726  Mvan_3507  MerR family transcriptional regulator  100 
 
 		 292 aa  590  1e-167  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.401792  normal  0.0867153 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5047  MerR family transcriptional regulator  75.94 
 
 		 276 aa  413  1e-114  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.574995  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6982  MerR family transcriptional regulator  65.79 
 
 		 270 aa  345  4e-94  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.80949  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2735  putative transcriptional regulator, MerR family  60.84 
 
 		 264 aa  317  2e-85  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0721242  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2529  transcriptional regulator, MerR family  63.53 
 
 		 270 aa  311  4.999999999999999e-84  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2808  transcriptional regulator, MerR family  49.09 
 
 		 276 aa  224  2e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.44001  normal  0.316047 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7266  transcriptional regulator, MerR family  47.78 
 
 		 274 aa  221  9e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4623  transcriptional regulator, MerR family  44.72 
 
 		 297 aa  208  1e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0932  MerR family transcriptional regulator  36.47 
 
 		 290 aa  167  2e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4163  transcriptional regulator, MerR family  35.69 
 
 		 275 aa  147  2.0000000000000003e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3767  transcriptional regulator, MerR family  36.94 
 
 		 264 aa  131  1.0000000000000001e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.237591  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4810  transcription activator effector binding  31.9 
 
 		 274 aa  113  4.0000000000000004e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.858088  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0225  putative transcriptional regulator, MerR family  35.23 
 
 		 262 aa  107  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4179  transcriptional activator ligand binding domain protein  34.41 
 
 		 279 aa  106  5e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.803381 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4799  transcriptional regulator, MerR family  35.41 
 
 		 258 aa  105  7e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3506  transcription activator, effector binding  30.91 
 
 		 274 aa  105  1e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.771694  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2638  transcriptional regulator, MerR family  27.24 
 
 		 273 aa  95.1  1e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4099  transcription activator effector binding protein  31.69 
 
 		 276 aa  93.6  4e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2159  MerR family transcriptional regulator  28.79 
 
 		 265 aa  91.3  2e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3503  transcriptional regulator, putative  23.47 
 
 		 273 aa  89.4  7e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.590051  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0331  MerR family transcriptional regulator  22.86 
 
 		 281 aa  87.4  2e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0684  MerR family transcriptional regulator  28.35 
 
 		 279 aa  86.7  4e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1523  MerR family transcriptional regulator  25.36 
 
 		 276 aa  85.1  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.193632  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1641  MerR family transcriptional regulator  25.36 
 
 		 276 aa  85.5  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1708  transcriptional regulator, MerR family  25.36 
 
 		 276 aa  85.1  0.000000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3493  transcriptional regulator, MerR family  23.3 
 
 		 273 aa  84.3  0.000000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2780  transcriptional regulator, MerR family  22.14 
 
 		 269 aa  83.6  0.000000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000880145 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1495  MerR family transcriptional regulator  24.36 
 
 		 276 aa  82.8  0.000000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00542237  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1485  MerR family transcriptional regulator  25.09 
 
 		 276 aa  82.4  0.000000000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0543962  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2545  transcriptional regulator, MerR family  22.14 
 
 		 269 aa  82.4  0.000000000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3611  transcriptional regulator, MerR family  23.9 
 
 		 267 aa  82  0.00000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3205  MerR family transcriptional regulator  22.46 
 
 		 273 aa  81.6  0.00000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.208736  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1820  MerR family transcriptional regulator  22.81 
 
 		 270 aa  80.9  0.00000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.404333  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3667  transcriptional regulator, MerR family  25.09 
 
 		 276 aa  80.1  0.00000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.372345  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1731  MerR family transcriptional regulator  25 
 
 		 276 aa  79  0.00000000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.867101  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2317  MerR family transcriptional regulator  23.1 
 
 		 269 aa  77.8  0.0000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0566035  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1677  transcriptional regulator, MerR family  25.09 
 
 		 276 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.128581  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2144  transcriptional regulator, MerR family  23.7 
 
 		 272 aa  77.8  0.0000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2401  MerR family transcriptional regulator  22.06 
 
 		 269 aa  76.6  0.0000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.908212  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2576  MerR family transcriptional regulator  22.06 
 
 		 269 aa  76.6  0.0000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.473387  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1782  transcriptional regulator, MerR family  24.29 
 
 		 276 aa  76.3  0.0000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.381283  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1527  MerR family transcriptional regulator  23.38 
 
 		 276 aa  76.3  0.0000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2354  MerR family transcriptional regulator  23.1 
 
 		 269 aa  76.3  0.0000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000403249  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3833  MerR family transcriptional regulator  29.61 
 
 		 270 aa  76.3  0.0000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000100059  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2588  transcriptional regulator, MerR family  23.1 
 
 		 269 aa  76.3  0.0000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.40806e-18 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0385  transcription activator, effector binding  28.16 
 
 		 286 aa  75.9  0.0000000000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2311  putative transcriptional regulator, MerR family  41.12 
 
 		 399 aa  75.1  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1629  transcriptional regulator, MerR family  29.86 
 
 		 306 aa  75.1  0.000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0882685  normal  0.393491 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0247  MerR family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 287 aa  74.7  0.000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64500  putative transcriptional regulator  30.77 
 
 		 270 aa  74.7  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0479  MerR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 354 aa  73.6  0.000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.369084 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03030  predicted transcriptional regulator  25.64 
 
 		 276 aa  73.6  0.000000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3825  transcriptional activator ligand binding domain protein  24.21 
 
 		 280 aa  72.4  0.000000000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2630  transcriptional regulator, MerR family  21.43 
 
 		 269 aa  71.6  0.00000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00281071  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0010  hypothetical protein  24.91 
 
 		 270 aa  71.6  0.00000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1582  hypothetical protein  36.27 
 
 		 249 aa  71.2  0.00000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22860  predicted transcriptional regulator  34.59 
 
 		 224 aa  71.2  0.00000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0445  MerR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 261 aa  71.2  0.00000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0194713  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8866  putative transcriptional regulator, MerR family  42.59 
 
 		 279 aa  70.5  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.249264  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2895  transcriptional regulator, MerR family  24.07 
 
 		 269 aa  70.9  0.00000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0379  transcriptional regulator, MerR family  43.96 
 
 		 327 aa  70.5  0.00000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0455  MerR family transcriptional regulator  34.41 
 
 		 261 aa  70.1  0.00000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00278493  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2481  transcriptional regulator, MerR family  25.81 
 
 		 269 aa  69.7  0.00000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.564945  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2316  regulatory protein, MerR  41.11 
 
 		 369 aa  69.3  0.00000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.280801  normal  0.123157 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0088  hypothetical protein  36.19 
 
 		 253 aa  68.6  0.0000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2419  protein serine/threonine phosphatase  41.11 
 
 		 355 aa  68.2  0.0000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.111892 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1411  hypothetical protein  34.31 
 
 		 250 aa  67.4  0.0000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20290  predicted transcriptional regulator  35.66 
 
 		 277 aa  67.4  0.0000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0400625  normal  0.347976 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1424  MerR family transcriptional regulator  35.07 
 
 		 279 aa  66.6  0.0000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.140644 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1993  transcriptional regulator, MerR family  26.38 
 
 		 272 aa  66.2  0.0000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2018  putative transcriptional regulator, MerR family  28.82 
 
 		 286 aa  66.2  0.0000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.253438  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3675  MerR family transcriptional regulator  34.23 
 
 		 270 aa  65.5  0.000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.325472  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1458  MerR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 161 aa  64.3  0.000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0168574  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2992  transcriptional regulator, MerR family  29.51 
 
 		 282 aa  64.3  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.663692  normal  0.0173107 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13400  predicted transcriptional regulator  45.33 
 
 		 346 aa  64.3  0.000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1701  MerR family transcriptional regulator  26.69 
 
 		 280 aa  64.3  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.126124  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19550  serine/threonine protein phosphatase  40.54 
 
 		 361 aa  63.9  0.000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.17725  normal  0.381768 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0264  MerR family transcriptional regulator  31.62 
 
 		 250 aa  63.2  0.000000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0323  transcription regulator family  29.71 
 
 		 253 aa  63.2  0.000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0888  transcriptional regulator, MerR family  45.07 
 
 		 270 aa  63.2  0.000000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00108118  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3830  transcriptional regulator, MerR family  33.98 
 
 		 274 aa  63.2  0.000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5600  putative transcriptional regulator  30.35 
 
 		 270 aa  63.2  0.000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2598  transcriptional regulator, MerR family  23.94 
 
 		 271 aa  62.8  0.000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000630559  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5012  MerR family transcriptional regulator  25.75 
 
 		 289 aa  62.4  0.000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.147011  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2263  transcriptional regulator, MerR family  28.92 
 
 		 281 aa  61.6  0.00000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2305  transcriptional regulator, MerR family  33.74 
 
 		 268 aa  62  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.643594 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1754  transcriptional regulator, MerR family  21.18 
 
 		 257 aa  61.6  0.00000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.99712  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2528  transcriptional regulator, MerR family  29.93 
 
 		 293 aa  61.6  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1655  MerR family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 237 aa  61.2  0.00000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.112658  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1866  transcriptional regulator  28.67 
 
 		 247 aa  61.6  0.00000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000190425  hitchhiker  0.000000000849298 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1410  MerR family transcriptional regulator  20.74 
 
 		 277 aa  60.5  0.00000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0993  MerR family transcriptional regulator  26.17 
 
 		 267 aa  60.5  0.00000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0978  MerR family transcriptional regulator  26.17 
 
 		 267 aa  60.5  0.00000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00933333  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22770  predicted transcriptional regulator  44.44 
 
 		 284 aa  60.5  0.00000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1063  MerR family transcriptional regulator  26.17 
 
 		 267 aa  60.5  0.00000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1351  transcriptional regulator MerR family CueR domain protein  33.87 
 
 		 142 aa  60.5  0.00000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0980  MerR family transcriptional regulator  26.17 
 
 		 267 aa  60.1  0.00000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.812542  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1146  transcriptional regulator, MerR family  26.17 
 
 		 267 aa  60.1  0.00000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2170  transcriptional regulator, MerR family  32.11 
 
 		 133 aa  60.1  0.00000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000807108 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1361  transcriptional regulator, MerR family  23.32 
 
 		 314 aa  59.7  0.00000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000000180624  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>