More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_1410 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_1410  MerR family transcriptional regulator  100 
 
 		 277 aa  576  1.0000000000000001e-163  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3291  MerR family transcriptional regulator  48.21 
 
 		 289 aa  276  2e-73  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1352  transcriptional regulator, MerR family  44.57 
 
 		 288 aa  233  3e-60  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0877122  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3611  transcriptional regulator, MerR family  27.7 
 
 		 267 aa  90.1  3e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1495  MerR family transcriptional regulator  25.43 
 
 		 276 aa  86.3  6e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00542237  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1523  MerR family transcriptional regulator  26.5 
 
 		 276 aa  85.9  7e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.193632  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1641  MerR family transcriptional regulator  26.5 
 
 		 276 aa  85.5  9e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1485  MerR family transcriptional regulator  25.09 
 
 		 276 aa  84  0.000000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0543962  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1708  transcriptional regulator, MerR family  26.15 
 
 		 276 aa  84  0.000000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1361  transcriptional regulator, MerR family  24.91 
 
 		 314 aa  81.3  0.00000000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000000180624  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1609  MerR family transcriptional regulator  24.56 
 
 		 272 aa  75.9  0.0000000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.822901  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3825  transcriptional activator ligand binding domain protein  23.51 
 
 		 280 aa  75.1  0.000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1677  transcriptional regulator, MerR family  24.75 
 
 		 276 aa  73.9  0.000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.128581  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2144  transcriptional regulator, MerR family  21.15 
 
 		 272 aa  72.8  0.000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0010  hypothetical protein  24.08 
 
 		 270 aa  73.2  0.000000000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1527  MerR family transcriptional regulator  23.18 
 
 		 276 aa  72.8  0.000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1731  MerR family transcriptional regulator  24.38 
 
 		 276 aa  72.4  0.000000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.867101  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3667  transcriptional regulator, MerR family  24.49 
 
 		 276 aa  72.4  0.000000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.372345  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1866  transcriptional regulator  38.18 
 
 		 247 aa  72  0.00000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000190425  hitchhiker  0.000000000849298 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1782  transcriptional regulator, MerR family  23.71 
 
 		 276 aa  70.5  0.00000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.381283  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0098  MerR family transcriptional regulator  24.38 
 
 		 279 aa  69.7  0.00000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000252188  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0323  transcription regulator family  31.31 
 
 		 253 aa  69.3  0.00000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3506  transcription activator, effector binding  21.58 
 
 		 274 aa  68.9  0.00000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.771694  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2018  putative transcriptional regulator, MerR family  21.53 
 
 		 286 aa  67.8  0.0000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.253438  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4099  transcription activator effector binding protein  20.54 
 
 		 276 aa  67.4  0.0000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3503  transcriptional regulator, putative  22.66 
 
 		 273 aa  65.1  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.590051  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4916  multidrug-efflux transporter 1 regulator  42.62 
 
 		 64 aa  64.7  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6982  MerR family transcriptional regulator  21.03 
 
 		 270 aa  63.2  0.000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.80949  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2529  transcriptional regulator, MerR family  22.18 
 
 		 270 aa  63.2  0.000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4810  transcription activator effector binding  21.35 
 
 		 274 aa  63.2  0.000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.858088  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1820  MerR family transcriptional regulator  27.93 
 
 		 270 aa  62.4  0.000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.404333  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2481  transcriptional regulator, MerR family  21.9 
 
 		 269 aa  62  0.00000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.564945  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1458  MerR family transcriptional regulator  38.03 
 
 		 161 aa  60.8  0.00000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0168574  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1287  MerR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 250 aa  60.5  0.00000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.917745  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1070  transcriptional regulator, MerR family  31.31 
 
 		 256 aa  60.5  0.00000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.01274  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2735  putative transcriptional regulator, MerR family  20.36 
 
 		 264 aa  60.5  0.00000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0721242  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3507  MerR family transcriptional regulator  20.74 
 
 		 292 aa  60.5  0.00000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.401792  normal  0.0867153 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0331  MerR family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 281 aa  59.7  0.00000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2354  MerR family transcriptional regulator  23.89 
 
 		 269 aa  59.3  0.00000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000403249  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2588  transcriptional regulator, MerR family  23.89 
 
 		 269 aa  59.3  0.00000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.40806e-18 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2841  zinc-responsive transcriptional regulator  40 
 
 		 139 aa  58.2  0.0000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0481985  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5012  MerR family transcriptional regulator  23.88 
 
 		 289 aa  58.2  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.147011  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3404  MerR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 155 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0760  MerR family transcriptional regulator  42.03 
 
 		 267 aa  58.5  0.0000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0248072  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1079  TipAS antibiotic-recognition domain-containing protein  30.77 
 
 		 252 aa  57.4  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.23199 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0088  hypothetical protein  30.12 
 
 		 253 aa  57.4  0.0000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0445  MerR family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 261 aa  57.8  0.0000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0194713  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0455  MerR family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 261 aa  57.4  0.0000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00278493  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2317  MerR family transcriptional regulator  23.55 
 
 		 269 aa  56.6  0.0000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0566035  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2655  zinc-responsive transcriptional regulator  38.57 
 
 		 133 aa  56.6  0.0000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1098  MerR family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 256 aa  56.6  0.0000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.49269  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3050  transcriptional regulator, MerR family protein  34.26 
 
 		 273 aa  56.2  0.0000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0080  transcriptional regulator, MerR family  34.33 
 
 		 137 aa  55.8  0.0000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.671013 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2316  regulatory protein, MerR  31.82 
 
 		 369 aa  55.8  0.0000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.280801  normal  0.123157 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2780  transcriptional regulator, MerR family  28.09 
 
 		 269 aa  54.7  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000880145 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2545  transcriptional regulator, MerR family  21.99 
 
 		 269 aa  55.5  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0969  MerR family transcriptional regulator  29.49 
 
 		 252 aa  55.5  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00256708  hitchhiker  0.0060004 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2824  transcriptional regulator, MerR family  34.78 
 
 		 251 aa  55.1  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00132895  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0705  transcriptional regulator, MerR family  19.53 
 
 		 278 aa  54.3  0.000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2598  transcriptional regulator, MerR family  22.42 
 
 		 271 aa  54.3  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000630559  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2710  MerR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 156 aa  54.7  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3833  MerR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 270 aa  54.7  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000100059  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3623  MerR family transcriptional regulator  20.29 
 
 		 274 aa  54.3  0.000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0243323  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4350  transcriptional regulator, MerR family  33.33 
 
 		 131 aa  54.3  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3767  transcriptional regulator, MerR family  20.85 
 
 		 264 aa  53.5  0.000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.237591  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3304  MCP methyltransferase, CheR-type  28.23 
 
 		 398 aa  53.9  0.000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2162  transcriptional regulator, MerR family  25.93 
 
 		 338 aa  53.9  0.000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0710491 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1701  MerR family transcriptional regulator  23.05 
 
 		 280 aa  53.5  0.000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.126124  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3493  transcriptional regulator, MerR family  21.25 
 
 		 273 aa  53.5  0.000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6040  MerR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 128 aa  53.5  0.000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0419  MerR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 146 aa  53.1  0.000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000107138  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35600  predicted transcriptional regulator  28.57 
 
 		 319 aa  53.1  0.000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.172761  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2401  MerR family transcriptional regulator  21.95 
 
 		 269 aa  52.8  0.000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.908212  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2576  MerR family transcriptional regulator  21.95 
 
 		 269 aa  52.8  0.000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.473387  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2779  MerR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 180 aa  52.8  0.000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.573882  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4066  MerR family transcriptional regulator  27.08 
 
 		 152 aa  52.8  0.000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001159  transcriptional regulator  28.07 
 
 		 145 aa  52.8  0.000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0548  DNA-binding transcriptional regulator CueR  35.82 
 
 		 138 aa  52.8  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0546  DNA-binding transcriptional regulator CueR  35.82 
 
 		 138 aa  52.8  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0607  DNA-binding transcriptional regulator CueR  35.82 
 
 		 138 aa  52.8  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0553  DNA-binding transcriptional regulator CueR  35.82 
 
 		 138 aa  52.8  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.985745  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2895  transcriptional regulator, MerR family  36.76 
 
 		 269 aa  52.8  0.000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0563  DNA-binding transcriptional regulator CueR  35.82 
 
 		 138 aa  52.8  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.620757  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00438  DNA-binding transcriptional activator of copper-responsive regulon genes  35.82 
 
 		 135 aa  52.4  0.000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3123  transcriptional regulator, MerR family  35.82 
 
 		 135 aa  52.4  0.000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.856714  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0422  DNA-binding transcriptional regulator CueR  35.82 
 
 		 135 aa  52.4  0.000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002186  zinc-responsive transcriptional regulator  35.71 
 
 		 132 aa  52.4  0.000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00879391  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3129  DNA-binding transcriptional regulator CueR  35.82 
 
 		 135 aa  52.4  0.000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.943376  hitchhiker  0.0000753695 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19550  serine/threonine protein phosphatase  29.69 
 
 		 361 aa  52.4  0.000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.17725  normal  0.381768 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0586  DNA-binding transcriptional regulator CueR  35.82 
 
 		 135 aa  52.4  0.000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.775911 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0963  DNA-binding transcriptional regulator CueR  35.82 
 
 		 136 aa  52.4  0.000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.55262  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0526  DNA-binding transcriptional regulator CueR  35.82 
 
 		 135 aa  52.4  0.000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0566  DNA-binding transcriptional regulator CueR  35.82 
 
 		 135 aa  52.4  0.000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0530  DNA-binding transcriptional regulator CueR  35.82 
 
 		 135 aa  52.4  0.000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00443  hypothetical protein  35.82 
 
 		 135 aa  52.4  0.000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2638  transcriptional regulator, MerR family  23.21 
 
 		 273 aa  52.4  0.000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1411  hypothetical protein  28.77 
 
 		 250 aa  52.4  0.000009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2494  transcriptional regulator, MerR family  30.93 
 
 		 148 aa  52  0.000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.453842  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3620  transcriptional regulator, MerR family  30.93 
 
 		 148 aa  52  0.000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49570  transcriptional regulatory protein, MerR family  30.39 
 
 		 133 aa  52.4  0.000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0397848  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>