More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_5012 on replicon NC_009973
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009973  Haur_5012  MerR family transcriptional regulator  100 
 
 
289 aa  589  1e-167  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.147011  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0247  MerR family transcriptional regulator  31.83 
 
 
287 aa  127  1.0000000000000001e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1701  MerR family transcriptional regulator  32.07 
 
 
280 aa  123  3e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.126124  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4099  transcription activator effector binding protein  30.5 
 
 
276 aa  122  9e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2992  transcriptional regulator, MerR family  29.97 
 
 
282 aa  118  9.999999999999999e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.663692  normal  0.0173107 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2630  transcriptional regulator, MerR family  26.95 
 
 
269 aa  118  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00281071  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2528  transcriptional regulator, MerR family  30.03 
 
 
293 aa  117  1.9999999999999998e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2545  transcriptional regulator, MerR family  27.65 
 
 
269 aa  117  3e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2401  MerR family transcriptional regulator  27.27 
 
 
269 aa  117  3e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.908212  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2576  MerR family transcriptional regulator  27.27 
 
 
269 aa  117  3e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.473387  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3611  transcriptional regulator, MerR family  29.64 
 
 
267 aa  116  3e-25  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2780  transcriptional regulator, MerR family  26.95 
 
 
269 aa  116  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000880145 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4044  transcriptional regulator, MerR family  30.71 
 
 
271 aa  114  1.0000000000000001e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0218982 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2588  transcriptional regulator, MerR family  26.95 
 
 
269 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.40806e-18 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2354  MerR family transcriptional regulator  26.95 
 
 
269 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000403249  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2317  MerR family transcriptional regulator  26.6 
 
 
269 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0566035  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2598  transcriptional regulator, MerR family  28.83 
 
 
271 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000630559  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1820  MerR family transcriptional regulator  26.94 
 
 
270 aa  112  6e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.404333  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3830  transcriptional regulator, MerR family  25.7 
 
 
274 aa  110  4.0000000000000004e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7229  putative transcriptional regulator, MerR family  38.24 
 
 
272 aa  105  6e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.385629 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2638  transcriptional regulator, MerR family  26.24 
 
 
273 aa  103  4e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3825  transcriptional activator ligand binding domain protein  26.8 
 
 
280 aa  102  6e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2895  transcriptional regulator, MerR family  28.87 
 
 
269 aa  102  9e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3493  transcriptional regulator, MerR family  28.68 
 
 
273 aa  100  4e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0010  hypothetical protein  27.46 
 
 
270 aa  98.2  1e-19  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3205  MerR family transcriptional regulator  28.88 
 
 
273 aa  97.8  2e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.208736  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2018  putative transcriptional regulator, MerR family  25.94 
 
 
286 aa  97.1  3e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.253438  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2109  transcription activator, effector binding  29.43 
 
 
283 aa  96.7  4e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.309412  normal  0.0724645 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2481  transcriptional regulator, MerR family  29.93 
 
 
269 aa  94.4  2e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.564945  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3503  transcriptional regulator, putative  26.81 
 
 
273 aa  93.2  5e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.590051  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3506  transcription activator, effector binding  25.7 
 
 
274 aa  88.6  1e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.771694  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4810  transcription activator effector binding  25.36 
 
 
274 aa  87.8  2e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.858088  normal 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0331  MerR family transcriptional regulator  23.38 
 
 
281 aa  83.2  0.000000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0425  MerR family transcriptional regulator  45.83 
 
 
132 aa  80.9  0.00000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.321126  normal  0.815952 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0455  MerR family transcriptional regulator  34.51 
 
 
261 aa  81.3  0.00000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00278493  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0445  MerR family transcriptional regulator  34.51 
 
 
261 aa  80.9  0.00000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0194713  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6982  MerR family transcriptional regulator  26.87 
 
 
270 aa  78.6  0.0000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.80949  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7266  transcriptional regulator, MerR family  58.46 
 
 
274 aa  77.8  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0684  MerR family transcriptional regulator  26.94 
 
 
279 aa  77  0.0000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1609  MerR family transcriptional regulator  24.52 
 
 
272 aa  76.6  0.0000000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.822901  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3560  MerR family transcriptional regulator  23.89 
 
 
287 aa  76.3  0.0000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.453881 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4799  transcriptional regulator, MerR family  38.94 
 
 
258 aa  75.1  0.000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03030  predicted transcriptional regulator  28.95 
 
 
276 aa  75.1  0.000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1754  transcriptional regulator, MerR family  25.4 
 
 
257 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.99712  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1866  transcriptional regulator  36.63 
 
 
247 aa  73.6  0.000000000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000190425  hitchhiker  0.000000000849298 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0385  transcription activator, effector binding  27.34 
 
 
286 aa  73.2  0.000000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2263  transcriptional regulator, MerR family  26.77 
 
 
281 aa  72  0.00000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5021  MerR family transcriptional regulator  37.96 
 
 
256 aa  70.9  0.00000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2735  putative transcriptional regulator, MerR family  27.34 
 
 
264 aa  70.9  0.00000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0721242  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5047  MerR family transcriptional regulator  26.76 
 
 
276 aa  70.5  0.00000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.574995  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5003  transcriptional regulator, MerR family  37.96 
 
 
256 aa  70.9  0.00000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0275  transcriptional regulator, MerR family  38.46 
 
 
107 aa  69.7  0.00000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.524855  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2808  transcriptional regulator, MerR family  30.3 
 
 
276 aa  70.1  0.00000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.44001  normal  0.316047 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1458  MerR family transcriptional regulator  36.9 
 
 
161 aa  69.7  0.00000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0168574  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2305  transcriptional regulator, MerR family  25.98 
 
 
268 aa  69.3  0.00000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.643594 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0323  transcription regulator family  35.78 
 
 
253 aa  69.3  0.00000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2529  transcriptional regulator, MerR family  26.39 
 
 
270 aa  68.9  0.0000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64500  putative transcriptional regulator  35.51 
 
 
270 aa  68.6  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4703  MerR family transcriptional regulator  33.59 
 
 
256 aa  67.4  0.0000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.279975  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0379  transcriptional regulator, MerR family  32.14 
 
 
327 aa  66.6  0.0000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22860  predicted transcriptional regulator  29.8 
 
 
224 aa  66.2  0.0000000006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3105  transcriptional regulator, MerR family  33.63 
 
 
255 aa  65.9  0.0000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0154295  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0760  MerR family transcriptional regulator  35.05 
 
 
267 aa  65.5  0.0000000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0248072  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5383  transcriptional regulator, MerR family  41.18 
 
 
266 aa  64.3  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.94507 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2144  transcriptional regulator, MerR family  24.64 
 
 
272 aa  64.3  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3675  MerR family transcriptional regulator  39.22 
 
 
270 aa  64.3  0.000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.325472  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1424  MerR family transcriptional regulator  25.77 
 
 
279 aa  64.7  0.000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.140644 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0331  putative transcriptional activator tipA  34.95 
 
 
249 aa  63.9  0.000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.275925  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2316  regulatory protein, MerR  40.22 
 
 
369 aa  63.9  0.000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.280801  normal  0.123157 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0226  transcriptional regulator, MerR family  35.79 
 
 
276 aa  63.2  0.000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000814651  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0932  MerR family transcriptional regulator  23.05 
 
 
290 aa  63.2  0.000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4623  transcriptional regulator, MerR family  28.37 
 
 
297 aa  62.8  0.000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0129  hypothetical protein  41.18 
 
 
347 aa  62.4  0.000000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.257512  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3507  MerR family transcriptional regulator  25.75 
 
 
292 aa  62.4  0.000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.401792  normal  0.0867153 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0345  transcriptional regulator, MerR family  33.33 
 
 
247 aa  62.4  0.000000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4179  transcriptional activator ligand binding domain protein  29.2 
 
 
279 aa  62.4  0.000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.803381 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3106  regulator of pmrA, putative  32.74 
 
 
257 aa  61.6  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0273598  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0245  transcriptional regulator, MerR family  34.26 
 
 
256 aa  62  0.00000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00512795  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0339  MerR family transcriptional regulator  36.52 
 
 
253 aa  62  0.00000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.841288 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2419  protein serine/threonine phosphatase  47.69 
 
 
355 aa  61.6  0.00000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.111892 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1107  transcriptional regulator, MerR family  33.33 
 
 
247 aa  61.2  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00363233  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2151  transcriptional regulator, MerR family  39.77 
 
 
253 aa  61.6  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.447172 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1527  MerR family transcriptional regulator  35.37 
 
 
276 aa  61.2  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0065  transcriptional regulator, MerR family  48.44 
 
 
252 aa  61.6  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0877  MerR family transcriptional regulator  33.64 
 
 
247 aa  60.5  0.00000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1523  MerR family transcriptional regulator  22.02 
 
 
276 aa  60.5  0.00000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.193632  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1021  transcriptional regulator, MerR family  34.58 
 
 
247 aa  60.5  0.00000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.10693e-29 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1222  transcriptional regulator, MerR family  35.14 
 
 
254 aa  60.5  0.00000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.867665  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0837  MerR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
247 aa  60.5  0.00000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1485  MerR family transcriptional regulator  24.14 
 
 
276 aa  60.5  0.00000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0543962  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3833  MerR family transcriptional regulator  23.47 
 
 
270 aa  60.5  0.00000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000100059  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1708  transcriptional regulator, MerR family  40.32 
 
 
276 aa  60.5  0.00000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5289  transcriptional regulator, MerR family  33.05 
 
 
251 aa  60.5  0.00000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0931  MerR family transcriptional regulator  33.64 
 
 
247 aa  60.5  0.00000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1629  transcriptional regulator, MerR family  44.78 
 
 
306 aa  60.5  0.00000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0882685  normal  0.393491 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5600  putative transcriptional regulator  26.89 
 
 
270 aa  60.8  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3712  MerR family transcriptional regulator  33.63 
 
 
251 aa  60.5  0.00000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0384  transcriptional regulator, MerR family  32.5 
 
 
258 aa  60.1  0.00000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0450143  decreased coverage  0.00634425 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1641  MerR family transcriptional regulator  40.32 
 
 
276 aa  60.5  0.00000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35820  predicted transcriptional regulator  33.93 
 
 
134 aa  60.1  0.00000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>