More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_2316 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_2316  regulatory protein, MerR  100 
 
 		 369 aa  717    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.280801  normal  0.123157 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2419  protein serine/threonine phosphatase  79.6 
 
 		 355 aa  507  9.999999999999999e-143  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.111892 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19550  serine/threonine protein phosphatase  52.09 
 
 		 361 aa  303  3.0000000000000004e-81  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.17725  normal  0.381768 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0067  protein serine/threonine phosphatase  53.59 
 
 		 540 aa  223  3e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0115  Phosphoprotein phosphatase  52.5 
 
 		 441 aa  222  6e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.11266  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0051  protein serine/threonine phosphatase  51.25 
 
 		 426 aa  219  5e-56  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  hitchhiker  0.00361373  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0849  protein serine/threonine phosphatase  49.38 
 
 		 247 aa  202  9e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.102968 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1581  Phosphoprotein phosphatase  45.9 
 
 		 265 aa  197  3e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26950  serine/threonine protein phosphatase  46.22 
 
 		 466 aa  194  2e-48  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.978389  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0049  protein serine/threonine phosphatase  48.74 
 
 		 478 aa  193  3e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.24969 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5250  protein serine/threonine phosphatase  44.3 
 
 		 449 aa  192  6e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.383211 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0044  protein phosphatase 2C domain-containing protein  48.32 
 
 		 482 aa  192  7e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.111894  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0022  protein serine/threonine phosphatases  48.31 
 
 		 421 aa  192  8e-48  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3062  protein phosphatase 2C-like  46.41 
 
 		 474 aa  190  2.9999999999999997e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00558874  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6475  protein serine/threonine phosphatase  47.48 
 
 		 463 aa  187  3e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0121274 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4818  protein serine/threonine phosphatase  46.44 
 
 		 259 aa  187  4e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0039  protein serine/threonine phosphatase  48.1 
 
 		 472 aa  183  4.0000000000000006e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.759123  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0075  Protein phosphatase 2C-like  44.49 
 
 		 463 aa  182  7e-45  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0579215  normal  0.315447 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1591  Phosphoprotein phosphatase  45.96 
 
 		 253 aa  180  2.9999999999999997e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06160  serine/threonine protein phosphatase  39.83 
 
 		 361 aa  180  4e-44  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0138  protein serine/threonine phosphatase  48.48 
 
 		 467 aa  179  4.999999999999999e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.568402  decreased coverage  0.00197643 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0030  protein serine/threonine phosphatase  47.64 
 
 		 462 aa  179  5.999999999999999e-44  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4432  protein serine/threonine phosphatases  47.68 
 
 		 469 aa  179  7e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.35733 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0029  Phosphoprotein phosphatase  43.93 
 
 		 505 aa  176  4e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00220  serine/threonine protein phosphatase  44.07 
 
 		 507 aa  174  1.9999999999999998e-42  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.682874 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0174  protein serine/threonine phosphatase  44.4 
 
 		 500 aa  172  1e-41  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.841118 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0031  protein serine/threonine phosphatase  45.38 
 
 		 477 aa  171  2e-41  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10380  serine/threonine protein phosphatase  47.43 
 
 		 255 aa  171  2e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0515655 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0081  protein serine/threonine phosphatase  44.83 
 
 		 519 aa  169  5e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00400  serine/threonine protein phosphatase  45.41 
 
 		 478 aa  169  8e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.784973 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0025  protein serine/threonine phosphatase  45.37 
 
 		 474 aa  168  1e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0922005  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0027  protein phosphatase 2C domain-containing protein  47.14 
 
 		 517 aa  166  8e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0019  protein serine/threonine phosphatases  46.26 
 
 		 491 aa  165  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.678049  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0027  protein phosphatase 2C domain-containing protein  46.26 
 
 		 491 aa  165  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.308307  hitchhiker  0.00998453 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0019  protein phosphatase 2C domain-containing protein  46.26 
 
 		 491 aa  165  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.888724 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0808  protein phosphatase 2C domain-containing protein  46.7 
 
 		 516 aa  165  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0029  protein serine/threonine phosphatase  45.42 
 
 		 479 aa  164  2.0000000000000002e-39  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.893327  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10018  serine/threonine phosphatase ppp  47.58 
 
 		 514 aa  162  6e-39  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.000837689  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0026  protein phosphatase 2C domain-containing protein  42.74 
 
 		 438 aa  161  2e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.887791  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6203  protein serine/threonine phosphatase  42.62 
 
 		 239 aa  159  5e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00400248  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0035  protein serine/threonine phosphatase  49.41 
 
 		 687 aa  159  9e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4532  protein serine/threonine phosphatase  44.4 
 
 		 239 aa  159  1e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00167554 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1726  protein serine/threonine phosphatase  45.19 
 
 		 241 aa  155  1e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.459048  hitchhiker  0.00271711 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1743  protein phosphatase 2C domain-containing protein  45.23 
 
 		 241 aa  155  2e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.962948  normal  0.902716 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4111  protein phosphatase 2C domain-containing protein  44.12 
 
 		 239 aa  152  5.9999999999999996e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0022  protein serine/threonine phosphatase  45.02 
 
 		 511 aa  149  1.0000000000000001e-34  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4426  protein serine/threonine phosphatase  42.98 
 
 		 364 aa  149  1.0000000000000001e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0345572  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0024  protein serine/threonine phosphatase  40.34 
 
 		 567 aa  146  7.0000000000000006e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00164542 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0034  protein phosphatase 2C  37.66 
 
 		 554 aa  146  7.0000000000000006e-34  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1589  protein phosphatase 2C domain-containing protein  41.53 
 
 		 237 aa  141  9.999999999999999e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00790  serine/threonine protein phosphatase  39.33 
 
 		 571 aa  141  1.9999999999999998e-32  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0024  protein serine/threonine phosphatases  40.34 
 
 		 558 aa  140  3e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1379  serine/threonine protein phosphatase  36.24 
 
 		 564 aa  136  6.0000000000000005e-31  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3041  protein serine/threonine phosphatase  38.03 
 
 		 395 aa  135  9.999999999999999e-31  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1750  protein phosphatase 2C domain-containing protein  32.49 
 
 		 247 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.165871  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27050  serine/threonine protein phosphatase  35.74 
 
 		 425 aa  131  1.0000000000000001e-29  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00220  serine/threonine protein phosphatase  39.74 
 
 		 519 aa  131  2.0000000000000002e-29  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4033  protein serine/threonine phosphatase  41.99 
 
 		 404 aa  129  1.0000000000000001e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1588  protein serine/threonine phosphatase  36.97 
 
 		 267 aa  127  4.0000000000000003e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0014  protein serine/threonine phosphatase  39.22 
 
 		 416 aa  126  6e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0909  protein serine/threonine phosphatases  41.05 
 
 		 236 aa  125  1e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0310722  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2029  regulatory protein, MerR  69.23 
 
 		 178 aa  125  1e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.115977  normal  0.362141 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1343  protein serine/threonine phosphatase  34.91 
 
 		 394 aa  124  2e-27  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00740563 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03320  serine/threonine protein phosphatase  37.23 
 
 		 452 aa  124  2e-27  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0159722  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2307  protein serine/threonine phosphatase  34.45 
 
 		 238 aa  124  4e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0816987  hitchhiker  0.000541845 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0229  protein serine/threonine phosphatases  41.03 
 
 		 348 aa  120  4.9999999999999996e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2392  protein serine/threonine phosphatase  36.36 
 
 		 597 aa  119  6e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.685774  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3050  protein serine/threonine phosphatase  38.14 
 
 		 267 aa  119  9.999999999999999e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2701  protein serine/threonine phosphatase  40 
 
 		 256 aa  119  9.999999999999999e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.312462  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3847  protein serine/threonine phosphatase  34.85 
 
 		 239 aa  118  1.9999999999999998e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000749886  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3111  protein serine/threonine phosphatase  36.13 
 
 		 319 aa  117  3e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0426507 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0160  protein serine/threonine phosphatase  34.58 
 
 		 259 aa  117  3.9999999999999997e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0156  protein serine/threonine phosphatase  34.58 
 
 		 259 aa  116  5e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000223411  normal  0.0165822 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1292  protein serine/threonine phosphatases  33.97 
 
 		 325 aa  116  5e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0472  protein serine/threonine phosphatase  37.3 
 
 		 320 aa  116  6e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2322  Phosphoprotein phosphatase  33.2 
 
 		 455 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.384726 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2766  protein phosphatase 2C domain-containing protein  34.73 
 
 		 611 aa  115  1.0000000000000001e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1155  protein serine/threonine phosphatase  40.61 
 
 		 267 aa  114  2.0000000000000002e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1336  protein serine/threonine phosphatase  36.55 
 
 		 323 aa  114  3e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000324067 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0090  protein serine/threonine phosphatase  38.26 
 
 		 422 aa  114  3e-24  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1325  protein serine/threonine phosphatase  36.44 
 
 		 258 aa  113  5e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.235242  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5893  protein serine/threonine phosphatase  34.65 
 
 		 386 aa  113  6e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.161748  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2083  Serine/threonine protein phosphatase  33.2 
 
 		 258 aa  113  6e-24  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00890  putative phosphoprotein phosphatase  34.44 
 
 		 242 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0335578  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2458  protein phosphatase 2C domain-containing protein  40.15 
 
 		 258 aa  111  2.0000000000000002e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.469461 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1982  protein phosphatase 2C domain-containing protein  46.85 
 
 		 268 aa  110  4.0000000000000004e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0438  protein phosphatase 2C domain-containing protein  30.83 
 
 		 287 aa  110  6e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.285486  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0146  putative phosphoprotein phosphatase  34.02 
 
 		 242 aa  109  9.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0573  protein serine/threonine phosphatases  27.98 
 
 		 245 aa  108  1e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000179403  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1993  transcriptional regulator, MerR family  50 
 
 		 272 aa  108  2e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3731  protein serine/threonine phosphatase  35.08 
 
 		 318 aa  108  2e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00715108 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1464  protein phosphatase 2C domain-containing protein  37.08 
 
 		 322 aa  107  3e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.279788  normal  0.997916 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09950  phosphoric monoester hydrolase  30.25 
 
 		 236 aa  106  5e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3183  protein phosphatase 2C domain-containing protein  35.08 
 
 		 274 aa  106  5e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.07989  normal  0.11146 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3622  protein phosphatase 2C  32.49 
 
 		 250 aa  106  6e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0024  protein serine/threonine phosphatases  37.33 
 
 		 381 aa  106  7e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2314  protein phosphatase 2C domain-containing protein  34.16 
 
 		 243 aa  105  9e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.109306  hitchhiker  0.0000219679 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4042  protein serine/threonine phosphatase  34.54 
 
 		 389 aa  105  1e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20950  serine/threonine protein phosphatase, 2C-like protein  35.47 
 
 		 293 aa  105  1e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0398622  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0386  protein serine/threonine phosphatase  35.24 
 
 		 250 aa  105  1e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.169531  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>