More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_1458 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_1458  MerR family transcriptional regulator  100 
 
 		 161 aa  326  8e-89  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0168574  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4099  transcription activator effector binding protein  33.88 
 
 		 276 aa  85.9  2e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0445  MerR family transcriptional regulator  41.44 
 
 		 261 aa  84.3  6e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0194713  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0455  MerR family transcriptional regulator  40.54 
 
 		 261 aa  82  0.000000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00278493  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1866  transcriptional regulator  36.79 
 
 		 247 aa  81.6  0.000000000000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000190425  hitchhiker  0.000000000849298 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2992  transcriptional regulator, MerR family  29.5 
 
 		 282 aa  78.6  0.00000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.663692  normal  0.0173107 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1701  MerR family transcriptional regulator  35.78 
 
 		 280 aa  78.6  0.00000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.126124  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1617  putative transcriptional regulator, MerR family  35.04 
 
 		 252 aa  75.1  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.870774 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7229  putative transcriptional regulator, MerR family  36.17 
 
 		 272 aa  74.7  0.0000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.385629 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2018  putative transcriptional regulator, MerR family  30 
 
 		 286 aa  73.9  0.0000000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.253438  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0760  MerR family transcriptional regulator  49.35 
 
 		 267 aa  73.9  0.0000000000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0248072  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4044  transcriptional regulator, MerR family  40.26 
 
 		 271 aa  73.2  0.000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0218982 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1820  MerR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 270 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.404333  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2895  transcriptional regulator, MerR family  40.66 
 
 		 269 aa  72.4  0.000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2780  transcriptional regulator, MerR family  30.7 
 
 		 269 aa  72.4  0.000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000880145 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0065  transcriptional regulator, MerR family  37.5 
 
 		 252 aa  72  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0323  transcription regulator family  32.56 
 
 		 253 aa  72  0.000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0247  MerR family transcriptional regulator  40.45 
 
 		 287 aa  72  0.000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2545  transcriptional regulator, MerR family  30.7 
 
 		 269 aa  72  0.000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3611  transcriptional regulator, MerR family  36.03 
 
 		 267 aa  71.2  0.000000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2481  transcriptional regulator, MerR family  45.71 
 
 		 269 aa  70.9  0.000000000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.564945  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2317  MerR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 269 aa  70.5  0.000000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0566035  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2598  transcriptional regulator, MerR family  54.55 
 
 		 271 aa  70.5  0.000000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000630559  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2354  MerR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 269 aa  70.1  0.00000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000403249  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2588  transcriptional regulator, MerR family  31.58 
 
 		 269 aa  70.1  0.00000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.40806e-18 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1609  MerR family transcriptional regulator  34.23 
 
 		 272 aa  69.7  0.00000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.822901  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5012  MerR family transcriptional regulator  36.9 
 
 		 289 aa  69.7  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.147011  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2528  transcriptional regulator, MerR family  24.83 
 
 		 293 aa  68.9  0.00000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3583  zinc-responsive transcriptional regulator  47.56 
 
 		 157 aa  68.9  0.00000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3400  zinc-responsive transcriptional regulator  40.86 
 
 		 156 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64500  putative transcriptional regulator  41.86 
 
 		 270 aa  68.9  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0255  transcriptional regulator, MerR family  34.82 
 
 		 251 aa  68.6  0.00000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2029  regulatory protein, MerR  38.89 
 
 		 178 aa  68.6  0.00000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.115977  normal  0.362141 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0396  zinc-responsive transcriptional regulator  38.71 
 
 		 177 aa  68.2  0.00000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2419  protein serine/threonine phosphatase  38.36 
 
 		 355 aa  67.8  0.00000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.111892 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3408  zinc-responsive transcriptional regulator  41.67 
 
 		 171 aa  67.8  0.00000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0494  zinc-responsive transcriptional regulator  43.9 
 
 		 153 aa  67.8  0.00000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02983  putative transcription regulator protein  33.04 
 
 		 152 aa  67.4  0.00000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.179274  normal  0.643629 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0446  zinc-responsive transcriptional regulator  46.34 
 
 		 157 aa  67.4  0.00000000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0442  zinc-responsive transcriptional regulator  45.12 
 
 		 157 aa  67.4  0.00000000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0443  zinc-responsive transcriptional regulator  39.78 
 
 		 163 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1782  transcriptional regulator, MerR family  33.33 
 
 		 276 aa  67  0.0000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.381283  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4035  zinc-responsive transcriptional regulator  45.12 
 
 		 176 aa  67  0.0000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3667  transcriptional regulator, MerR family  33.33 
 
 		 276 aa  67  0.0000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.372345  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0421  zinc-responsive transcriptional regulator  45.12 
 
 		 176 aa  67  0.0000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3839  zinc-responsive transcriptional regulator  45.12 
 
 		 171 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.231012 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3912  zinc-responsive transcriptional regulator  45.12 
 
 		 171 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2401  MerR family transcriptional regulator  30.7 
 
 		 269 aa  66.2  0.0000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.908212  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0445  zinc-responsive transcriptional regulator  43.9 
 
 		 159 aa  66.2  0.0000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.261357 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3411  zinc-responsive transcriptional regulator  38.71 
 
 		 158 aa  66.2  0.0000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0837  MerR family transcriptional regulator  41.11 
 
 		 247 aa  66.6  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3560  MerR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 287 aa  65.9  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.453881 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2576  MerR family transcriptional regulator  30.7 
 
 		 269 aa  66.2  0.0000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.473387  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1527  MerR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 276 aa  65.5  0.0000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1495  MerR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 276 aa  65.5  0.0000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00542237  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1485  MerR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 276 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0543962  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1641  MerR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 276 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1739  MerR family transcriptional regulator  30.7 
 
 		 141 aa  65.5  0.0000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.784519 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0297  zinc-responsive transcriptional regulator  34.96 
 
 		 159 aa  65.5  0.0000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2144  transcriptional regulator, MerR family  34.95 
 
 		 272 aa  65.1  0.0000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4442  putative transcriptional regulator, MerR family  33.03 
 
 		 253 aa  65.5  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00264375  hitchhiker  0.000476994 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1320  transcriptional regulator, MerR family  33.33 
 
 		 255 aa  65.5  0.0000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1731  MerR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 276 aa  65.1  0.0000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.867101  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1523  MerR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 276 aa  65.1  0.0000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.193632  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6982  MerR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 270 aa  65.1  0.0000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.80949  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1677  transcriptional regulator, MerR family  33.33 
 
 		 276 aa  65.1  0.0000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.128581  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1708  transcriptional regulator, MerR family  33.33 
 
 		 276 aa  65.1  0.0000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2316  regulatory protein, MerR  39.06 
 
 		 369 aa  64.7  0.0000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.280801  normal  0.123157 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2464  transcriptional regulator, MerR family  46.88 
 
 		 137 aa  64.3  0.0000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3507  MerR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 292 aa  64.3  0.0000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.401792  normal  0.0867153 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4916  multidrug-efflux transporter 1 regulator  48.39 
 
 		 64 aa  64.3  0.0000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0010  hypothetical protein  37.37 
 
 		 270 aa  64.3  0.0000000007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3304  MCP methyltransferase, CheR-type  33.59 
 
 		 398 aa  63.9  0.0000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1919  MerR family transcriptional regulator  32.73 
 
 		 268 aa  63.9  0.0000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0931546  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0420  MerR family transcriptional regulator  40.7 
 
 		 258 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0088  hypothetical protein  27.56 
 
 		 253 aa  63.5  0.000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2214  transcriptional regulator, MerR family  32.46 
 
 		 177 aa  63.2  0.000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000011193 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2298  MerR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 343 aa  63.9  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2630  transcriptional regulator, MerR family  31.62 
 
 		 269 aa  63.5  0.000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00281071  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1222  transcriptional regulator, MerR family  32.8 
 
 		 254 aa  63.2  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.867665  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2165  MerR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 343 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.123028  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5434  MerR family transcriptional regulator  28.99 
 
 		 251 aa  63.2  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.736735  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0932  MerR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 290 aa  63.5  0.000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2311  putative transcriptional regulator, MerR family  28.93 
 
 		 399 aa  63.2  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1021  transcriptional regulator, MerR family  40 
 
 		 247 aa  62.8  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.10693e-29 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2322  transcriptional regulator, MerR family  35.4 
 
 		 129 aa  62.8  0.000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4537  Hg(II)-responsive transcriptional regulator  32.74 
 
 		 132 aa  63.2  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2008  transcriptional regulator, MerR family  32.46 
 
 		 191 aa  62.8  0.000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5600  putative transcriptional regulator  43.55 
 
 		 270 aa  62.8  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0433  zinc-responsive transcriptional regulator  39.22 
 
 		 173 aa  62.8  0.000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3830  transcriptional regulator, MerR family  46.15 
 
 		 274 aa  62.8  0.000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2109  transcription activator, effector binding  29.27 
 
 		 283 aa  63.2  0.000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.309412  normal  0.0724645 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0226  transcriptional regulator, MerR family  41.67 
 
 		 276 aa  62.8  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000814651  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3016  MerR family transcriptional regulator  48.39 
 
 		 252 aa  62  0.000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2208  MerR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 190 aa  62.4  0.000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.194329  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0409  TipAS antibiotic-recognition domain protein  29.13 
 
 		 259 aa  62  0.000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1160  MerR family transcriptional regulator  46.88 
 
 		 133 aa  62.4  0.000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.392851 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1781  transcriptional regulator, MerR family  43.66 
 
 		 254 aa  62.4  0.000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1755  MerR family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 342 aa  62  0.000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.581641  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1742  MerR family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 342 aa  62  0.000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>