253 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_5600 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_5600  putative transcriptional regulator  100 
 
 		 270 aa  553  1e-156  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64500  putative transcriptional regulator  87.78 
 
 		 270 aa  491  9.999999999999999e-139  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3983  transcriptional regulator, AraC family  30.73 
 
 		 291 aa  85.9  6e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4053  AraC family transcriptional regulator  30.14 
 
 		 277 aa  83.2  0.000000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1952  AraC family transcriptional regulator  37.67 
 
 		 271 aa  78.6  0.0000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0598764  normal  0.641899 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1216  AraC family transcriptional regulator  29.09 
 
 		 300 aa  75.1  0.000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4799  transcriptional regulator, MerR family  30.45 
 
 		 258 aa  75.1  0.000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3675  MerR family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 270 aa  73.6  0.000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.325472  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0225  putative transcriptional regulator, MerR family  29.29 
 
 		 262 aa  72.8  0.000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0247  MerR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 287 aa  72.4  0.000000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4179  transcriptional activator ligand binding domain protein  28.29 
 
 		 279 aa  72  0.00000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.803381 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1170  transcriptional regulator, AraC family  28.48 
 
 		 300 aa  71.6  0.00000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00906983  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01850  probable transcriptional regulator  30.06 
 
 		 165 aa  71.2  0.00000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.153077  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4171  transcriptional regulator, AraC family  28.48 
 
 		 300 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1014  AraC family transcriptional regulator  27.88 
 
 		 300 aa  70.5  0.00000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.210728  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4099  transcription activator effector binding protein  25.83 
 
 		 276 aa  70.1  0.00000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1021  AraC family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 300 aa  69.7  0.00000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0261  AraC family transcriptional regulator  27.12 
 
 		 281 aa  69.3  0.00000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1036  AraC family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 300 aa  68.9  0.00000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.139629  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1013  AraC family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 300 aa  68.9  0.00000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.126228  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1114  AraC family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 300 aa  68.9  0.00000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1194  transcriptional regulator, AraC family  27.27 
 
 		 300 aa  68.9  0.00000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.926126 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6275  AraC family transcriptional regulator  32.8 
 
 		 279 aa  68.2  0.0000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2797  transcription activator effector binding  29.87 
 
 		 279 aa  68.6  0.0000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.338998 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0088  hypothetical protein  38.53 
 
 		 253 aa  67.4  0.0000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2992  transcriptional regulator, MerR family  27.64 
 
 		 282 aa  66.6  0.0000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.663692  normal  0.0173107 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7229  putative transcriptional regulator, MerR family  28.17 
 
 		 272 aa  66.6  0.0000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.385629 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1919  MerR family transcriptional regulator  35.51 
 
 		 268 aa  65.9  0.0000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0931546  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1271  transcriptional regulator, AraC family  27.27 
 
 		 300 aa  65.5  0.0000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.121916  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4077  transcription activator effector binding  29.53 
 
 		 178 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4044  transcriptional regulator, MerR family  47.69 
 
 		 271 aa  64.3  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0218982 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1582  hypothetical protein  35.19 
 
 		 249 aa  63.9  0.000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1411  hypothetical protein  35.19 
 
 		 250 aa  64.3  0.000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3715  transcriptional regulator, AraC family  32.12 
 
 		 279 aa  63.5  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.424878 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2283  hypothetical protein  29.75 
 
 		 163 aa  63.5  0.000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.539487 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3507  MerR family transcriptional regulator  30.35 
 
 		 292 aa  63.2  0.000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.401792  normal  0.0867153 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1617  putative transcriptional regulator, MerR family  50.79 
 
 		 252 aa  62.8  0.000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.870774 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0760  MerR family transcriptional regulator  30.19 
 
 		 267 aa  63.2  0.000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0248072  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1458  MerR family transcriptional regulator  43.55 
 
 		 161 aa  62.8  0.000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0168574  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1701  MerR family transcriptional regulator  49.23 
 
 		 280 aa  62.8  0.000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.126124  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3417  transcriptional regulator, AraC family  32.12 
 
 		 279 aa  62.4  0.000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.27768  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1866  transcriptional regulator  37.27 
 
 		 247 aa  61.6  0.00000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000190425  hitchhiker  0.000000000849298 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5383  transcriptional regulator, MerR family  35 
 
 		 266 aa  60.8  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.94507 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0425  MerR family transcriptional regulator  50 
 
 		 132 aa  61.2  0.00000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.321126  normal  0.815952 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5047  MerR family transcriptional regulator  30 
 
 		 276 aa  60.8  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.574995  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2481  transcriptional regulator, MerR family  30.91 
 
 		 269 aa  60.8  0.00000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.564945  normal  1 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5012  MerR family transcriptional regulator  26.89 
 
 		 289 aa  60.8  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.147011  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3506  transcription activator, effector binding  25.51 
 
 		 274 aa  61.2  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.771694  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7157  transcriptional regulator, AraC family  26.98 
 
 		 277 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.367426 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22860  predicted transcriptional regulator  30.57 
 
 		 224 aa  60.1  0.00000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0011  transcriptional regulator, AraC family  30.51 
 
 		 285 aa  59.7  0.00000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000871788  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2018  putative transcriptional regulator, MerR family  44.62 
 
 		 286 aa  60.1  0.00000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.253438  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1320  transcriptional regulator, MerR family  33.33 
 
 		 255 aa  59.7  0.00000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2938  AraC family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 279 aa  59.7  0.00000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.487848  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3611  transcriptional regulator, MerR family  28.7 
 
 		 267 aa  59.7  0.00000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2293  transcription activator effector binding protein  29.75 
 
 		 155 aa  59.7  0.00000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.427424  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4810  transcription activator effector binding  24.29 
 
 		 274 aa  59.3  0.00000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.858088  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03030  predicted transcriptional regulator  26.83 
 
 		 276 aa  58.9  0.00000009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3304  MCP methyltransferase, CheR-type  29.52 
 
 		 398 aa  58.9  0.00000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3393  transcriptional regulator, MerR family  33.11 
 
 		 254 aa  58.2  0.0000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.988274  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0409  TipAS antibiotic-recognition domain protein  38.89 
 
 		 259 aa  58.5  0.0000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1083  transcriptional regulator, MerR family  32.11 
 
 		 254 aa  58.2  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0124198  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1781  transcriptional regulator, MerR family  35.71 
 
 		 254 aa  57.8  0.0000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3493  transcriptional regulator, MerR family  27.35 
 
 		 273 aa  57.8  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0148  MerR family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 257 aa  57.4  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.290112  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0065  transcriptional regulator, MerR family  34.33 
 
 		 252 aa  58.2  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6982  MerR family transcriptional regulator  30.18 
 
 		 270 aa  57  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.80949  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2735  putative transcriptional regulator, MerR family  37.82 
 
 		 264 aa  57  0.0000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0721242  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2528  transcriptional regulator, MerR family  34.43 
 
 		 293 aa  57.4  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2895  transcriptional regulator, MerR family  38.46 
 
 		 269 aa  57  0.0000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3667  transcriptional regulator, MerR family  31.11 
 
 		 276 aa  56.6  0.0000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.372345  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2545  transcriptional regulator, MerR family  22.52 
 
 		 269 aa  56.6  0.0000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2780  transcriptional regulator, MerR family  22.52 
 
 		 269 aa  56.6  0.0000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000880145 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2144  transcriptional regulator, MerR family  35.38 
 
 		 272 aa  57  0.0000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1677  transcriptional regulator, MerR family  24.36 
 
 		 276 aa  56.2  0.0000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.128581  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1782  transcriptional regulator, MerR family  31.11 
 
 		 276 aa  56.2  0.0000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.381283  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1527  MerR family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 276 aa  55.8  0.0000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1731  MerR family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 276 aa  55.8  0.0000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.867101  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3503  transcriptional regulator, putative  27.06 
 
 		 273 aa  55.8  0.0000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.590051  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1495  MerR family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 276 aa  55.8  0.0000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00542237  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4332  transcription activator, effector binding  28.57 
 
 		 164 aa  55.8  0.0000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.500299  normal  0.674901 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1708  transcriptional regulator, MerR family  31.11 
 
 		 276 aa  55.8  0.0000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1523  MerR family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 276 aa  55.8  0.0000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.193632  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1485  MerR family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 276 aa  55.8  0.0000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0543962  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1641  MerR family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 276 aa  55.8  0.0000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2603  transcriptional regulator, MerR family  36.7 
 
 		 274 aa  55.5  0.0000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.241665  normal  0.676341 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34160  predicted transcriptional regulator  35.78 
 
 		 278 aa  55.5  0.0000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.153651 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5066  hypothetical protein  27.5 
 
 		 158 aa  54.7  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1820  MerR family transcriptional regulator  26.61 
 
 		 270 aa  55.1  0.000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.404333  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1008  MerR family transcriptional regulator  36.14 
 
 		 253 aa  54.7  0.000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1962  transcriptional regulator, MerR family  31.54 
 
 		 250 aa  55.5  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2401  MerR family transcriptional regulator  22.52 
 
 		 269 aa  54.3  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.908212  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0384  transcriptional regulator, MerR family  29.33 
 
 		 258 aa  54.3  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0450143  decreased coverage  0.00634425 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2638  transcriptional regulator, MerR family  27.27 
 
 		 273 aa  53.9  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5072  hypothetical protein  29.11 
 
 		 158 aa  54.3  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3205  MerR family transcriptional regulator  46.55 
 
 		 273 aa  54.7  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.208736  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2576  MerR family transcriptional regulator  22.52 
 
 		 269 aa  54.3  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.473387  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2529  transcriptional regulator, MerR family  38.05 
 
 		 270 aa  54.3  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0323  transcription regulator family  26.55 
 
 		 253 aa  53.9  0.000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1655  MerR family transcriptional regulator  32.95 
 
 		 237 aa  53.5  0.000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.112658  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>