40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_2293 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013517  Sterm_2293  transcription activator effector binding protein  100 
 
 
155 aa  312  9.999999999999999e-85  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.427424  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64500  putative transcriptional regulator  33.96 
 
 
270 aa  69.3  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6275  AraC family transcriptional regulator  31.11 
 
 
279 aa  68.6  0.00000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5600  putative transcriptional regulator  29.75 
 
 
270 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1216  AraC family transcriptional regulator  25.75 
 
 
300 aa  58.2  0.00000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3417  transcriptional regulator, AraC family  30 
 
 
279 aa  56.6  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.27768  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1170  transcriptional regulator, AraC family  25.75 
 
 
300 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00906983  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4171  transcriptional regulator, AraC family  25.75 
 
 
300 aa  55.1  0.0000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1014  AraC family transcriptional regulator  25.75 
 
 
300 aa  55.1  0.0000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.210728  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1271  transcriptional regulator, AraC family  26.32 
 
 
300 aa  55.1  0.0000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.121916  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3715  transcriptional regulator, AraC family  28.46 
 
 
279 aa  55.1  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.424878 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1021  AraC family transcriptional regulator  25.75 
 
 
300 aa  55.1  0.0000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1194  transcriptional regulator, AraC family  25.75 
 
 
300 aa  53.9  0.0000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.926126 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1114  AraC family transcriptional regulator  25.75 
 
 
300 aa  53.9  0.0000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1036  AraC family transcriptional regulator  25.75 
 
 
300 aa  53.9  0.0000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.139629  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1013  AraC family transcriptional regulator  25.75 
 
 
300 aa  53.9  0.0000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.126228  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2797  transcription activator effector binding  26.92 
 
 
279 aa  51.2  0.000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.338998 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4660  DNA-binding protein  27.89 
 
 
158 aa  50.8  0.000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5072  hypothetical protein  26.43 
 
 
158 aa  50.4  0.000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2199  transcription activator, effector binding  25.81 
 
 
159 aa  50.4  0.000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4053  AraC family transcriptional regulator  26.37 
 
 
277 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2283  hypothetical protein  32.97 
 
 
163 aa  49.7  0.00001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.539487 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4641  DNA-binding protein  27.21 
 
 
159 aa  49.3  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0175  hypothetical protein  28.57 
 
 
158 aa  49.7  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3983  transcriptional regulator, AraC family  30.48 
 
 
291 aa  48.5  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4799  hypothetical protein  27.21 
 
 
159 aa  48.1  0.00004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5039  hypothetical protein  27.21 
 
 
159 aa  48.1  0.00004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1952  AraC family transcriptional regulator  30.15 
 
 
271 aa  48.1  0.00004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0598764  normal  0.641899 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5162  hypothetical protein  27.21 
 
 
159 aa  48.1  0.00004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3099  AraC family transcriptional regulator  28.39 
 
 
326 aa  47.8  0.00005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7157  transcriptional regulator, AraC family  22.96 
 
 
277 aa  47.8  0.00005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.367426 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5068  DNA-binding protein YobU  25.17 
 
 
159 aa  47.8  0.00006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0261  AraC family transcriptional regulator  22.79 
 
 
281 aa  47.4  0.00008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4077  transcription activator effector binding  23.85 
 
 
178 aa  46.6  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4749  transcription activator effector binding  25.17 
 
 
158 aa  46.2  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5066  hypothetical protein  25.85 
 
 
158 aa  45.1  0.0004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0011  transcriptional regulator, AraC family  27.52 
 
 
285 aa  43.9  0.0009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000871788  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2325  hypothetical protein  35.87 
 
 
179 aa  41.6  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0797882  normal  0.650281 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1641  transcription activator effector binding protein  32.18 
 
 
287 aa  40.8  0.007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2178  transcription activator, effector binding  26.22 
 
 
160 aa  40.4  0.008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.44747  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>