68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BCE_5066 on replicon NC_003909
Organism: Bacillus cereus ATCC 10987



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003909  BCE_5066  hypothetical protein  100 
 
 
158 aa  329  8e-90  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4641  DNA-binding protein  94.3 
 
 
159 aa  311  1.9999999999999998e-84  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4660  DNA-binding protein  93.04 
 
 
158 aa  309  9e-84  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4749  transcription activator effector binding  92.41 
 
 
158 aa  308  2e-83  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4799  hypothetical protein  92.41 
 
 
159 aa  304  3e-82  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5162  hypothetical protein  92.41 
 
 
159 aa  304  3e-82  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0175  hypothetical protein  91.14 
 
 
158 aa  303  6e-82  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5072  hypothetical protein  90.51 
 
 
158 aa  302  1.0000000000000001e-81  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5039  hypothetical protein  91.77 
 
 
159 aa  302  1.0000000000000001e-81  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5068  DNA-binding protein YobU  86.08 
 
 
159 aa  290  5e-78  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009726  CBUD_A0019  DNA-binding protein  40.27 
 
 
164 aa  109  2.0000000000000002e-23  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2865  transcription activator effector binding  39.86 
 
 
149 aa  109  2.0000000000000002e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.372254  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1875  hypothetical protein  37.66 
 
 
154 aa  96.3  1e-19  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3688  transcription activator effector binding  33.78 
 
 
153 aa  96.3  1e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1918  transcription activator effector binding  30.82 
 
 
148 aa  92  3e-18  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00982966  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2199  transcription activator, effector binding  34.03 
 
 
159 aa  85.1  3e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7160  transcription activator effector binding protein  27.56 
 
 
155 aa  80.5  0.000000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.46886  normal  0.0205342 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1998  transcription activator effector binding protein  33.1 
 
 
153 aa  80.1  0.00000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000299964  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0171  transcription activator, effector binding  28.93 
 
 
156 aa  78.6  0.00000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.486669  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0189  transcription activator effector binding  28.93 
 
 
156 aa  78.2  0.00000000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.4925  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1170  transcriptional regulator, AraC family  32.53 
 
 
300 aa  77.8  0.00000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00906983  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1216  AraC family transcriptional regulator  31.93 
 
 
300 aa  77.8  0.00000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1014  AraC family transcriptional regulator  32.53 
 
 
300 aa  77.8  0.00000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.210728  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3397  transcription activator effector binding  31.01 
 
 
154 aa  77  0.0000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000497279  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1114  AraC family transcriptional regulator  33.13 
 
 
300 aa  76.6  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1194  transcriptional regulator, AraC family  33.13 
 
 
300 aa  76.6  0.0000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.926126 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4171  transcriptional regulator, AraC family  32.53 
 
 
300 aa  76.6  0.0000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1013  AraC family transcriptional regulator  33.13 
 
 
300 aa  76.6  0.0000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.126228  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1036  AraC family transcriptional regulator  33.13 
 
 
300 aa  76.6  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.139629  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1271  transcriptional regulator, AraC family  31.33 
 
 
300 aa  75.9  0.0000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.121916  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1021  AraC family transcriptional regulator  33.13 
 
 
300 aa  75.9  0.0000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2436  transcription activator effector binding protein  26.92 
 
 
157 aa  75.1  0.0000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.236328  normal  0.052404 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1824  transcription activator effector binding  30.77 
 
 
155 aa  74.7  0.0000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.343494  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0560  hypothetical protein  29.94 
 
 
177 aa  68.2  0.00000000005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.754603  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0711  transcription activator effector binding  31.61 
 
 
155 aa  67.4  0.00000000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1440  transcription activator effector binding subunit  33.33 
 
 
138 aa  66.6  0.0000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.347846  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0763  transcription activator effector binding  37.5 
 
 
146 aa  67  0.0000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000404433  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0548  transcription activator, effector binding  28.66 
 
 
174 aa  65.1  0.0000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.283386 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0165  AraC family transcriptional regulator  27.98 
 
 
298 aa  64.7  0.0000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2928  transcription activator effector binding protein  26.18 
 
 
185 aa  64.3  0.0000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.314738 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0283  CTA2 subfamily 1 protein  30.56 
 
 
158 aa  63.9  0.0000000008  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000189572  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0107  hypothetical protein  28.57 
 
 
153 aa  63.2  0.000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.0580328  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3143  transcription activator effector binding  27.5 
 
 
165 aa  60.8  0.000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2705  transcription activator, effector binding  27.7 
 
 
149 aa  58.9  0.00000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2308  transcription activator effector binding protein  24.85 
 
 
155 aa  58.5  0.00000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.20456 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1952  AraC family transcriptional regulator  28.47 
 
 
271 aa  58.2  0.00000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0598764  normal  0.641899 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6275  AraC family transcriptional regulator  31.25 
 
 
279 aa  58.5  0.00000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2539  transcription activator, effector binding  27.7 
 
 
149 aa  57.8  0.00000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2786  transcription activator, effector binding  26.28 
 
 
146 aa  57  0.0000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2606  transcription activator, effector binding protein  27.52 
 
 
149 aa  57  0.0000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64500  putative transcriptional regulator  29.75 
 
 
270 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5600  putative transcriptional regulator  27.5 
 
 
270 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1757  hypothetical protein  27.03 
 
 
159 aa  54.7  0.0000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06778  hypothetical protein  29.85 
 
 
149 aa  52  0.000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1034  transcription activator effector binding  30.25 
 
 
128 aa  52  0.000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4053  AraC family transcriptional regulator  28.4 
 
 
277 aa  50.8  0.000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1790  transcriptional regulator, AraC family  25 
 
 
282 aa  50.1  0.00001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.191731  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1784  AraC family transcriptional regulator  22.64 
 
 
280 aa  48.5  0.00004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000275244  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3983  transcriptional regulator, AraC family  28.66 
 
 
291 aa  47.8  0.00006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2446  transcription activator, effector binding  26.21 
 
 
146 aa  47.4  0.00009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.88127  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2797  transcription activator effector binding  27.42 
 
 
279 aa  45.8  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.338998 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2293  transcription activator effector binding protein  25.85 
 
 
155 aa  45.1  0.0004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.427424  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3427  transcription activator effector binding  29.55 
 
 
129 aa  44.7  0.0005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1342  CTA2 subfamily 1 protein  30.77 
 
 
125 aa  44.3  0.0006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3138  AraC family transcriptional regulator  27.91 
 
 
281 aa  42.4  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3417  transcriptional regulator, AraC family  27.43 
 
 
279 aa  42.4  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.27768  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0058  hypothetical protein  24.27 
 
 
110 aa  42  0.004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0424  transcriptional regulator, AraC family  22.93 
 
 
281 aa  41.6  0.005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>