73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GBAA_5162 on replicon NC_007530
Organism: Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007530  GBAA_5162  hypothetical protein  100 
 
 
159 aa  329  1e-89  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4799  hypothetical protein  100 
 
 
159 aa  329  1e-89  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5039  hypothetical protein  99.37 
 
 
159 aa  327  4e-89  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4641  DNA-binding protein  94.97 
 
 
159 aa  316  1e-85  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4660  DNA-binding protein  94.94 
 
 
158 aa  313  4e-85  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5066  hypothetical protein  92.41 
 
 
158 aa  304  3e-82  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5072  hypothetical protein  91.14 
 
 
158 aa  304  3e-82  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0175  hypothetical protein  91.14 
 
 
158 aa  304  4.0000000000000004e-82  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4749  transcription activator effector binding  91.14 
 
 
158 aa  303  4.0000000000000004e-82  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5068  DNA-binding protein YobU  88.68 
 
 
159 aa  300  4.0000000000000003e-81  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2865  transcription activator effector binding  39.86 
 
 
149 aa  109  2.0000000000000002e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.372254  normal 
 
 
-
 
NC_009726  CBUD_A0019  DNA-binding protein  39.6 
 
 
164 aa  106  1e-22  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1875  hypothetical protein  38.31 
 
 
154 aa  97.4  7e-20  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3688  transcription activator effector binding  33.11 
 
 
153 aa  97.1  8e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1918  transcription activator effector binding  31.47 
 
 
148 aa  89.7  1e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00982966  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2199  transcription activator, effector binding  34.03 
 
 
159 aa  84.3  6e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0171  transcription activator, effector binding  30.82 
 
 
156 aa  84  8e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.486669  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0189  transcription activator effector binding  30.82 
 
 
156 aa  83.6  9e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.4925  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7160  transcription activator effector binding protein  28.97 
 
 
155 aa  82.8  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.46886  normal  0.0205342 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1998  transcription activator effector binding protein  33.1 
 
 
153 aa  79.3  0.00000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000299964  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1824  transcription activator effector binding  30.82 
 
 
155 aa  77.8  0.00000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.343494  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2436  transcription activator effector binding protein  28.21 
 
 
157 aa  76.6  0.0000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.236328  normal  0.052404 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1170  transcriptional regulator, AraC family  32.52 
 
 
300 aa  75.9  0.0000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00906983  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1216  AraC family transcriptional regulator  31.9 
 
 
300 aa  75.5  0.0000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1014  AraC family transcriptional regulator  32.52 
 
 
300 aa  75.5  0.0000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.210728  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1021  AraC family transcriptional regulator  34.69 
 
 
300 aa  75.1  0.0000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1114  AraC family transcriptional regulator  34.69 
 
 
300 aa  74.7  0.0000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1194  transcriptional regulator, AraC family  34.69 
 
 
300 aa  75.1  0.0000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.926126 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1036  AraC family transcriptional regulator  34.69 
 
 
300 aa  74.7  0.0000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.139629  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1271  transcriptional regulator, AraC family  31.9 
 
 
300 aa  74.7  0.0000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.121916  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1013  AraC family transcriptional regulator  34.69 
 
 
300 aa  74.7  0.0000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.126228  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4171  transcriptional regulator, AraC family  32.52 
 
 
300 aa  74.3  0.0000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3397  transcription activator effector binding  30.38 
 
 
154 aa  73.9  0.0000000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000497279  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0560  hypothetical protein  31.52 
 
 
177 aa  69.7  0.00000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.754603  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1440  transcription activator effector binding subunit  31.41 
 
 
138 aa  69.3  0.00000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.347846  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0107  hypothetical protein  29.11 
 
 
153 aa  68.2  0.00000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.0580328  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0763  transcription activator effector binding  38.41 
 
 
146 aa  67.8  0.00000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000404433  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0165  AraC family transcriptional regulator  28.65 
 
 
298 aa  67  0.00000000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0548  transcription activator, effector binding  28.74 
 
 
174 aa  65.9  0.0000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.283386 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0283  CTA2 subfamily 1 protein  30.87 
 
 
158 aa  64.3  0.0000000007  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000189572  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2928  transcription activator effector binding protein  24.47 
 
 
185 aa  62.4  0.000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.314738 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2705  transcription activator, effector binding  29.05 
 
 
149 aa  61.6  0.000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3143  transcription activator effector binding  28.75 
 
 
165 aa  61.2  0.000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2539  transcription activator, effector binding  30 
 
 
149 aa  60.5  0.000000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2606  transcription activator, effector binding protein  30 
 
 
149 aa  60.1  0.00000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1557  transcription activator effector binding  28.12 
 
 
154 aa  58.2  0.00000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1456  transcription activator, effector binding  28.03 
 
 
154 aa  57.8  0.00000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.259797  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0711  transcription activator effector binding  29.68 
 
 
155 aa  57  0.00000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2786  transcription activator, effector binding  26.28 
 
 
146 aa  56.2  0.0000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2308  transcription activator effector binding protein  26.53 
 
 
155 aa  56.2  0.0000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.20456 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1757  hypothetical protein  27.7 
 
 
159 aa  56.2  0.0000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6275  AraC family transcriptional regulator  30.25 
 
 
279 aa  56.2  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1592  transcription activator effector binding  28.03 
 
 
154 aa  56.2  0.0000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.372363 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2787  transcription activator effector binding  27.39 
 
 
149 aa  55.5  0.0000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.688559 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1563  transcription activator effector binding  28.12 
 
 
154 aa  55.5  0.0000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1952  AraC family transcriptional regulator  28.47 
 
 
271 aa  55.1  0.0000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0598764  normal  0.641899 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2542  transcription activator, effector binding  28.95 
 
 
152 aa  55.1  0.0000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1034  transcription activator effector binding  30.25 
 
 
128 aa  54.7  0.0000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06778  hypothetical protein  31.34 
 
 
149 aa  53.9  0.0000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5600  putative transcriptional regulator  27.85 
 
 
270 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64500  putative transcriptional regulator  30.82 
 
 
270 aa  52.4  0.000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3983  transcriptional regulator, AraC family  30.3 
 
 
291 aa  52  0.000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3427  transcription activator effector binding  31.5 
 
 
129 aa  49.7  0.00002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2446  transcription activator, effector binding  26.76 
 
 
146 aa  48.9  0.00003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.88127  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2293  transcription activator effector binding protein  27.21 
 
 
155 aa  48.1  0.00004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.427424  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1784  AraC family transcriptional regulator  23.57 
 
 
280 aa  47  0.0001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000275244  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1790  transcriptional regulator, AraC family  22.29 
 
 
282 aa  46.6  0.0001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.191731  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1342  CTA2 subfamily 1 protein  32.22 
 
 
125 aa  47  0.0001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4053  AraC family transcriptional regulator  31.07 
 
 
277 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2797  transcription activator effector binding  28.93 
 
 
279 aa  44.7  0.0005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.338998 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2325  hypothetical protein  27.89 
 
 
179 aa  42.7  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0797882  normal  0.650281 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0423  hypothetical protein  30 
 
 
132 aa  40.8  0.007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0058  hypothetical protein  25.96 
 
 
110 aa  40.8  0.008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>