48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SAG0423 on replicon NC_004116
Organism: Streptococcus agalactiae 2603V/R



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004116  SAG0423  hypothetical protein  100 
 
 
132 aa  273  6e-73  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C09  transcription activator effector binding domain-containing protein  31.43 
 
 
154 aa  82.4  0.000000000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0424  transcriptional regulator, AraC family  33.96 
 
 
281 aa  78.2  0.00000000000004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0058  hypothetical protein  34.91 
 
 
110 aa  76.6  0.00000000000009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1784  AraC family transcriptional regulator  33.61 
 
 
280 aa  76.3  0.0000000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000275244  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1790  transcriptional regulator, AraC family  35.56 
 
 
282 aa  75.1  0.0000000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.191731  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1353  transcription activator effector binding  28.83 
 
 
160 aa  67.4  0.00000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.266351  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3174  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 
280 aa  60.5  0.000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.626893  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64500  putative transcriptional regulator  29 
 
 
270 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5600  putative transcriptional regulator  28 
 
 
270 aa  51.2  0.000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3564  transcriptional regulator, AraC family  26.92 
 
 
285 aa  51.2  0.000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1922  transcriptional regulator, AraC family  25 
 
 
291 aa  50.8  0.000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.890213  normal  0.89853 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4053  AraC family transcriptional regulator  29.09 
 
 
277 aa  51.2  0.000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6275  AraC family transcriptional regulator  30.39 
 
 
279 aa  50.8  0.000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2210  transcriptional regulator, AraC family  25.64 
 
 
291 aa  50.4  0.000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4077  transcription activator effector binding  31.73 
 
 
178 aa  50.1  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0011  transcriptional regulator, AraC family  31.13 
 
 
285 aa  48.5  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000871788  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4672  AraC family transcriptional regulator  26.25 
 
 
290 aa  47.8  0.00005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1802  transcriptional regulator, AraC family  31.33 
 
 
286 aa  47.8  0.00006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2759  AraC family transcriptional regulator  26.25 
 
 
292 aa  47  0.00009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0329  transcription activator effector binding protein  23.93 
 
 
288 aa  46.2  0.0002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0236652  normal  0.0105288 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4582  AraC family transcriptional regulator  25 
 
 
290 aa  45.4  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.763033  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0278  transcriptional regulator, AraC family  25 
 
 
290 aa  45.1  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4947  transcriptional regulator, AraC family  25 
 
 
290 aa  44.3  0.0005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4986  AraC family transcriptional regulator  23.75 
 
 
290 aa  43.9  0.0007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7160  transcription activator effector binding protein  23.4 
 
 
155 aa  43.9  0.0007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.46886  normal  0.0205342 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4973  transcriptional regulator, AraC family  23.75 
 
 
290 aa  43.9  0.0007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4566  AraC family transcriptional regulator  23.75 
 
 
290 aa  43.9  0.0008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.017881  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1216  AraC family transcriptional regulator  26.77 
 
 
300 aa  43.5  0.0009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4724  AraC family transcriptional regulator  23.75 
 
 
290 aa  43.1  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.440387  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4660  DNA-binding protein  30 
 
 
158 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0175  hypothetical protein  32.47 
 
 
158 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4749  transcription activator effector binding  30.83 
 
 
158 aa  43.1  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5086  AraC family transcriptional regulator  23.75 
 
 
290 aa  43.1  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5068  DNA-binding protein YobU  30 
 
 
159 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06300  methylphosphotriester-DNA alkyltransferase  28.21 
 
 
302 aa  42.4  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3349  transcription activator, effector binding  27.27 
 
 
160 aa  42.7  0.002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.808619  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5072  hypothetical protein  29.17 
 
 
158 aa  41.6  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2797  transcription activator effector binding  27.62 
 
 
279 aa  42  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.338998 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0261  AraC family transcriptional regulator  29.41 
 
 
281 aa  42  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2938  AraC family transcriptional regulator  27.84 
 
 
279 aa  41.2  0.005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.487848  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1266  AraC family transcriptional regulator  26.09 
 
 
300 aa  41.2  0.005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.23796  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5039  hypothetical protein  30 
 
 
159 aa  40.8  0.006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4799  hypothetical protein  30 
 
 
159 aa  40.8  0.006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5162  hypothetical protein  30 
 
 
159 aa  40.8  0.006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3846  transcriptional regulator, AraC family  22.54 
 
 
287 aa  40.8  0.006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7157  transcriptional regulator, AraC family  29.41 
 
 
277 aa  40.4  0.007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.367426 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3264  transcriptional regulator, AraC family  23.81 
 
 
287 aa  40.4  0.008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>