61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_C09 on replicon NC_008505
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008505  LACR_C09  transcription activator effector binding domain-containing protein  100 
 
 		 154 aa  316  7e-86  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0424  transcriptional regulator, AraC family  52.29 
 
 		 281 aa  186  1e-46  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1784  AraC family transcriptional regulator  51.3 
 
 		 280 aa  177  2.9999999999999997e-44  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000275244  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1790  transcriptional regulator, AraC family  46.79 
 
 		 282 aa  154  5.0000000000000005e-37  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.191731  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0058  hypothetical protein  58.18 
 
 		 110 aa  148  3e-35  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1353  transcription activator effector binding  30.19 
 
 		 160 aa  83.6  9e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.266351  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0423  hypothetical protein  31.43 
 
 		 132 aa  82.4  0.000000000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3174  AraC family transcriptional regulator  28.75 
 
 		 280 aa  73.6  0.0000000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.626893  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3138  AraC family transcriptional regulator  30.25 
 
 		 281 aa  72.8  0.000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3564  transcriptional regulator, AraC family  27.5 
 
 		 285 aa  67  0.0000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2797  transcription activator effector binding  29.87 
 
 		 279 aa  66.6  0.0000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.338998 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1216  AraC family transcriptional regulator  31.18 
 
 		 300 aa  64.3  0.0000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3219  transcription activator effector binding  29.19 
 
 		 160 aa  64.3  0.0000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1021  AraC family transcriptional regulator  30.59 
 
 		 300 aa  62.4  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1170  transcriptional regulator, AraC family  31.18 
 
 		 300 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00906983  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1194  transcriptional regulator, AraC family  30.59 
 
 		 300 aa  61.6  0.000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.926126 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1013  AraC family transcriptional regulator  30.59 
 
 		 300 aa  61.2  0.000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.126228  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1114  AraC family transcriptional regulator  30.59 
 
 		 300 aa  61.6  0.000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1036  AraC family transcriptional regulator  30.59 
 
 		 300 aa  61.6  0.000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.139629  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4171  transcriptional regulator, AraC family  31.18 
 
 		 300 aa  61.2  0.000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4672  AraC family transcriptional regulator  24.55 
 
 		 290 aa  61.2  0.000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1014  AraC family transcriptional regulator  30.59 
 
 		 300 aa  61.2  0.000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.210728  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4947  transcriptional regulator, AraC family  23.95 
 
 		 290 aa  60.8  0.000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1922  transcriptional regulator, AraC family  34.18 
 
 		 291 aa  60.5  0.000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.890213  normal  0.89853 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4957  transcriptional regulator, AraC family  26.06 
 
 		 290 aa  60.1  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1271  transcriptional regulator, AraC family  31.4 
 
 		 300 aa  58.9  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.121916  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0278  transcriptional regulator, AraC family  23.95 
 
 		 290 aa  58.9  0.00000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4566  AraC family transcriptional regulator  23.35 
 
 		 290 aa  58.5  0.00000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.017881  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3846  transcriptional regulator, AraC family  26.22 
 
 		 287 aa  58.9  0.00000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4582  AraC family transcriptional regulator  22.75 
 
 		 290 aa  57.8  0.00000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.763033  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4973  transcriptional regulator, AraC family  25 
 
 		 290 aa  57.8  0.00000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4724  AraC family transcriptional regulator  22.75 
 
 		 290 aa  57.4  0.00000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.440387  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5086  AraC family transcriptional regulator  22.75 
 
 		 290 aa  57.4  0.00000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4986  AraC family transcriptional regulator  23.35 
 
 		 290 aa  57  0.00000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2210  transcriptional regulator, AraC family  29.41 
 
 		 291 aa  55.8  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0261  AraC family transcriptional regulator  29.22 
 
 		 281 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7157  transcriptional regulator, AraC family  29.22 
 
 		 277 aa  53.5  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.367426 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1798  transcriptional regulator, AraC family  46.43 
 
 		 200 aa  53.1  0.000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4053  AraC family transcriptional regulator  27.88 
 
 		 277 aa  52  0.000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2323  transcriptional regulator, AraC family  25 
 
 		 289 aa  51.6  0.000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.614848  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3264  transcriptional regulator, AraC family  25.62 
 
 		 287 aa  50.8  0.000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003322  hypothetical protein  27.71 
 
 		 310 aa  50.4  0.000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.757084  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0165  AraC family transcriptional regulator  30 
 
 		 298 aa  50.1  0.00001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2759  AraC family transcriptional regulator  23.64 
 
 		 292 aa  49.7  0.00001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01850  probable transcriptional regulator  25 
 
 		 165 aa  48.9  0.00002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.153077  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64500  putative transcriptional regulator  26.28 
 
 		 270 aa  47.4  0.00008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2798  transcription activator effector binding  24.32 
 
 		 156 aa  46.6  0.0001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0107  hypothetical protein  28.45 
 
 		 153 aa  46.6  0.0001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.0580328  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5600  putative transcriptional regulator  26.92 
 
 		 270 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1641  transcription activator effector binding protein  22.29 
 
 		 287 aa  45.4  0.0003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2938  AraC family transcriptional regulator  27.18 
 
 		 279 aa  44.7  0.0004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.487848  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4077  transcription activator effector binding  22.15 
 
 		 178 aa  44.3  0.0005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1802  transcriptional regulator, AraC family  30.67 
 
 		 286 aa  44.7  0.0005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2107  AraC family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 313 aa  44.7  0.0005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.342925  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0329  transcription activator effector binding protein  20.25 
 
 		 288 aa  43.5  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0236652  normal  0.0105288 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0011  transcriptional regulator, AraC family  25 
 
 		 285 aa  42.7  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000871788  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2510  hypothetical protein  27.83 
 
 		 157 aa  42.7  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.750988  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2461  hypothetical protein  27.83 
 
 		 157 aa  42.7  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.057736  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1127  transcriptional regulator, AraC family  20.25 
 
 		 288 aa  41.2  0.005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4332  transcription activator, effector binding  30.56 
 
 		 164 aa  41.2  0.005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.500299  normal  0.674901 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0223  transcriptional activator, AraC family  29.81 
 
 		 281 aa  40.4  0.008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000178737 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>