77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_1353 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012793  GWCH70_1353  transcription activator effector binding  100 
 
 		 160 aa  328  1e-89  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.266351  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3174  AraC family transcriptional regulator  41.51 
 
 		 280 aa  127  6e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.626893  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0278  transcriptional regulator, AraC family  35.8 
 
 		 290 aa  109  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4947  transcriptional regulator, AraC family  36.42 
 
 		 290 aa  108  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4582  AraC family transcriptional regulator  35.19 
 
 		 290 aa  108  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.763033  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4566  AraC family transcriptional regulator  35.8 
 
 		 290 aa  106  1e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.017881  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4672  AraC family transcriptional regulator  35.19 
 
 		 290 aa  105  2e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4957  transcriptional regulator, AraC family  34.57 
 
 		 290 aa  105  2e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3219  transcription activator effector binding  32.5 
 
 		 160 aa  105  3e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4724  AraC family transcriptional regulator  34.57 
 
 		 290 aa  103  7e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.440387  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5086  AraC family transcriptional regulator  34.57 
 
 		 290 aa  103  7e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3564  transcriptional regulator, AraC family  31.45 
 
 		 285 aa  103  1e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4986  AraC family transcriptional regulator  33.95 
 
 		 290 aa  102  3e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4973  transcriptional regulator, AraC family  33.95 
 
 		 290 aa  101  5e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3264  transcriptional regulator, AraC family  30 
 
 		 287 aa  100  1e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3846  transcriptional regulator, AraC family  29.38 
 
 		 287 aa  99.8  1e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3181  AraC family transcriptional regulator  33.53 
 
 		 292 aa  93.2  1e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2759  AraC family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 292 aa  90.9  7e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3138  AraC family transcriptional regulator  31.06 
 
 		 281 aa  86.7  1e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2210  transcriptional regulator, AraC family  31.52 
 
 		 291 aa  87  1e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0011  transcriptional regulator, AraC family  32.14 
 
 		 285 aa  86.3  2e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000871788  n/a   
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C09  transcription activator effector binding domain-containing protein  30.19 
 
 		 154 aa  83.6  0.000000000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1922  transcriptional regulator, AraC family  31.52 
 
 		 291 aa  82.8  0.000000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.890213  normal  0.89853 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0223  transcriptional activator, AraC family  30.06 
 
 		 281 aa  79.3  0.00000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000178737 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1784  AraC family transcriptional regulator  23.9 
 
 		 280 aa  79.7  0.00000000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000275244  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2323  transcriptional regulator, AraC family  29.76 
 
 		 289 aa  79  0.00000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.614848  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5265  transcriptional regulator, AraC family  28.48 
 
 		 281 aa  78.2  0.00000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0205  transcriptional activator, AraC family  29.7 
 
 		 281 aa  78.6  0.00000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000524418 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1266  AraC family transcriptional regulator  29.34 
 
 		 300 aa  76.6  0.0000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.23796  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0424  transcriptional regulator, AraC family  27.78 
 
 		 281 aa  76.3  0.0000000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0990  AraC family transcriptional regulator  28.48 
 
 		 281 aa  75.5  0.0000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1802  transcriptional regulator, AraC family  31.14 
 
 		 286 aa  75.1  0.0000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2461  hypothetical protein  28.66 
 
 		 157 aa  74.3  0.0000000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.057736  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2510  hypothetical protein  28.66 
 
 		 157 aa  74.3  0.0000000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.750988  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2556  AraC family transcriptional regulator  30.72 
 
 		 290 aa  73.9  0.0000000000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000000235949  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1021  AraC family transcriptional regulator  28.82 
 
 		 300 aa  73.2  0.000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1013  AraC family transcriptional regulator  28.82 
 
 		 300 aa  72  0.000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.126228  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1271  transcriptional regulator, AraC family  28.82 
 
 		 300 aa  72  0.000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.121916  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2780  transcriptional regulator, AraC family  25.15 
 
 		 285 aa  72.4  0.000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0531003  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1170  transcriptional regulator, AraC family  29.41 
 
 		 300 aa  72.4  0.000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00906983  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1114  AraC family transcriptional regulator  28.82 
 
 		 300 aa  72.4  0.000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1194  transcriptional regulator, AraC family  28.82 
 
 		 300 aa  72  0.000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.926126 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1036  AraC family transcriptional regulator  28.82 
 
 		 300 aa  72.4  0.000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.139629  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1790  transcriptional regulator, AraC family  25.79 
 
 		 282 aa  72.4  0.000000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.191731  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1216  AraC family transcriptional regulator  28.82 
 
 		 300 aa  72.4  0.000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4171  transcriptional regulator, AraC family  29.41 
 
 		 300 aa  71.6  0.000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1014  AraC family transcriptional regulator  28.82 
 
 		 300 aa  71.2  0.000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.210728  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0423  hypothetical protein  28.83 
 
 		 132 aa  67.4  0.00000000008  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2127  transcription activator effector binding protein  26.63 
 
 		 290 aa  65.1  0.0000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2107  AraC family transcriptional regulator  24.85 
 
 		 313 aa  64.7  0.0000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.342925  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2678  transcriptional regulator, AraC family  28.48 
 
 		 284 aa  64.3  0.0000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0058  hypothetical protein  26.36 
 
 		 110 aa  63.5  0.000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2251  transcriptional regulator, AraC family  44.44 
 
 		 287 aa  59.3  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3161  AraC family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 277 aa  56.6  0.0000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3715  transcriptional regulator, AraC family  28.78 
 
 		 279 aa  54.7  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.424878 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3417  transcriptional regulator, AraC family  27.61 
 
 		 279 aa  52.8  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.27768  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4053  AraC family transcriptional regulator  23.42 
 
 		 277 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1127  transcriptional regulator, AraC family  24.7 
 
 		 288 aa  50.8  0.000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6275  AraC family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 279 aa  49.7  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3142  AraC family transcriptional regulator  22.29 
 
 		 301 aa  48.9  0.00003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4077  transcription activator effector binding  25.31 
 
 		 178 aa  48.9  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0261  AraC family transcriptional regulator  26.45 
 
 		 281 aa  47  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0329  transcription activator effector binding protein  31.58 
 
 		 288 aa  46.6  0.0001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0236652  normal  0.0105288 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2178  transcription activator, effector binding  37.93 
 
 		 160 aa  46.6  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.44747  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7157  transcriptional regulator, AraC family  26.32 
 
 		 277 aa  46.2  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.367426 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2797  transcription activator effector binding  25.37 
 
 		 279 aa  46.6  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.338998 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64500  putative transcriptional regulator  23.95 
 
 		 270 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7295  AraC family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 277 aa  45.4  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.158014  normal  0.567517 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0009  helix-turn-helix domain-containing protein  28.25 
 
 		 306 aa  45.4  0.0003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000070115 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1998  transcription activator effector binding protein  24.84 
 
 		 153 aa  45.4  0.0003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000299964  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5600  putative transcriptional regulator  22.75 
 
 		 270 aa  43.5  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1952  AraC family transcriptional regulator  26.42 
 
 		 271 aa  43.1  0.002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0598764  normal  0.641899 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2283  hypothetical protein  37.33 
 
 		 163 aa  42.7  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.539487 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2199  transcription activator, effector binding  24.84 
 
 		 159 aa  42.4  0.003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0771  AraC family transcriptional regulator  30.88 
 
 		 288 aa  42.4  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.472166 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2308  transcription activator effector binding protein  25.19 
 
 		 155 aa  42  0.004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.20456 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4332  transcription activator, effector binding  25.66 
 
 		 164 aa  40.4  0.01  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.500299  normal  0.674901 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>