62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_3219 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_3219  transcription activator effector binding  100 
 
 		 160 aa  331  2e-90  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1353  transcription activator effector binding  32.5 
 
 		 160 aa  105  3e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.266351  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3264  transcriptional regulator, AraC family  30.86 
 
 		 287 aa  91.3  5e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3174  AraC family transcriptional regulator  35.03 
 
 		 280 aa  89  2e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.626893  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3846  transcriptional regulator, AraC family  31.65 
 
 		 287 aa  88.6  3e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2678  transcriptional regulator, AraC family  32.3 
 
 		 284 aa  84.7  5e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3564  transcriptional regulator, AraC family  30.57 
 
 		 285 aa  81.6  0.000000000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1922  transcriptional regulator, AraC family  30 
 
 		 291 aa  79.7  0.00000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.890213  normal  0.89853 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0278  transcriptional regulator, AraC family  31.52 
 
 		 290 aa  79.7  0.00000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3138  AraC family transcriptional regulator  29.94 
 
 		 281 aa  76.3  0.0000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2107  AraC family transcriptional regulator  31.93 
 
 		 313 aa  74.7  0.0000000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.342925  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4582  AraC family transcriptional regulator  29.7 
 
 		 290 aa  75.1  0.0000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.763033  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5265  transcriptional regulator, AraC family  30.63 
 
 		 281 aa  74.7  0.0000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2210  transcriptional regulator, AraC family  28.74 
 
 		 291 aa  74.3  0.0000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4947  transcriptional regulator, AraC family  27.95 
 
 		 290 aa  73.9  0.0000000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0990  AraC family transcriptional regulator  30.25 
 
 		 281 aa  73.9  0.0000000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4566  AraC family transcriptional regulator  29.09 
 
 		 290 aa  73.9  0.0000000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.017881  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4957  transcriptional regulator, AraC family  27.95 
 
 		 290 aa  73.6  0.000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0205  transcriptional activator, AraC family  30.86 
 
 		 281 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000524418 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5086  AraC family transcriptional regulator  28.48 
 
 		 290 aa  71.6  0.000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4672  AraC family transcriptional regulator  29.09 
 
 		 290 aa  71.6  0.000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3715  transcriptional regulator, AraC family  32.59 
 
 		 279 aa  71.6  0.000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.424878 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4724  AraC family transcriptional regulator  28.48 
 
 		 290 aa  71.6  0.000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.440387  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4973  transcriptional regulator, AraC family  29.27 
 
 		 290 aa  71.6  0.000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0011  transcriptional regulator, AraC family  29.34 
 
 		 285 aa  71.6  0.000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000871788  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4986  AraC family transcriptional regulator  29.27 
 
 		 290 aa  71.6  0.000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0223  transcriptional activator, AraC family  30.25 
 
 		 281 aa  70.5  0.000000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000178737 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3181  AraC family transcriptional regulator  29.14 
 
 		 292 aa  68.6  0.00000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2797  transcription activator effector binding  29.63 
 
 		 279 aa  67.8  0.00000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.338998 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1790  transcriptional regulator, AraC family  30.43 
 
 		 282 aa  67.8  0.00000000006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.191731  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2759  AraC family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 292 aa  66.6  0.0000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3417  transcriptional regulator, AraC family  31.11 
 
 		 279 aa  65.9  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.27768  normal  1 
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C09  transcription activator effector binding domain-containing protein  29.19 
 
 		 154 aa  64.3  0.0000000007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2780  transcriptional regulator, AraC family  25.9 
 
 		 285 aa  63.5  0.000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0531003  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2323  transcriptional regulator, AraC family  28.86 
 
 		 289 aa  62.4  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.614848  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1784  AraC family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 280 aa  62.4  0.000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000275244  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1216  AraC family transcriptional regulator  27.71 
 
 		 300 aa  61.6  0.000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1021  AraC family transcriptional regulator  27.11 
 
 		 300 aa  60.8  0.000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1013  AraC family transcriptional regulator  27.11 
 
 		 300 aa  59.7  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.126228  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1036  AraC family transcriptional regulator  27.11 
 
 		 300 aa  59.7  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.139629  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1114  AraC family transcriptional regulator  27.11 
 
 		 300 aa  59.7  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1194  transcriptional regulator, AraC family  27.11 
 
 		 300 aa  58.9  0.00000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.926126 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1014  AraC family transcriptional regulator  27.11 
 
 		 300 aa  57.8  0.00000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.210728  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1271  transcriptional regulator, AraC family  27.11 
 
 		 300 aa  57.4  0.00000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.121916  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1170  transcriptional regulator, AraC family  27.11 
 
 		 300 aa  57.4  0.00000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00906983  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4171  transcriptional regulator, AraC family  27.11 
 
 		 300 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2251  transcriptional regulator, AraC family  26.95 
 
 		 287 aa  54.7  0.0000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0424  transcriptional regulator, AraC family  26.35 
 
 		 281 aa  53.5  0.000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2510  hypothetical protein  21.88 
 
 		 157 aa  51.6  0.000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.750988  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2461  hypothetical protein  21.88 
 
 		 157 aa  51.6  0.000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.057736  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2938  AraC family transcriptional regulator  26.25 
 
 		 279 aa  50.8  0.000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.487848  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2556  AraC family transcriptional regulator  25.3 
 
 		 290 aa  50.4  0.000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000000235949  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06300  methylphosphotriester-DNA alkyltransferase  26.38 
 
 		 302 aa  48.9  0.00003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3142  AraC family transcriptional regulator  22.41 
 
 		 301 aa  48.1  0.00005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1802  transcriptional regulator, AraC family  23.12 
 
 		 286 aa  46.6  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0058  hypothetical protein  32.35 
 
 		 110 aa  44.3  0.0006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2127  transcription activator effector binding protein  24.7 
 
 		 290 aa  43.5  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4053  AraC family transcriptional regulator  24.82 
 
 		 277 aa  41.6  0.004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003322  hypothetical protein  24.12 
 
 		 310 aa  40.8  0.008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.757084  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1266  AraC family transcriptional regulator  24.86 
 
 		 300 aa  40.8  0.008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.23796  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7157  transcriptional regulator, AraC family  23.6 
 
 		 277 aa  40.8  0.008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.367426 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4332  transcription activator, effector binding  27.54 
 
 		 164 aa  40.4  0.009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.500299  normal  0.674901 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>