48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_4332 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_4332  transcription activator, effector binding  100 
 
 		 164 aa  343  7e-94  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.500299  normal  0.674901 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2938  AraC family transcriptional regulator  50.93 
 
 		 279 aa  160  1e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.487848  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0261  AraC family transcriptional regulator  40.12 
 
 		 281 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4053  AraC family transcriptional regulator  41.45 
 
 		 277 aa  134  4e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7157  transcriptional regulator, AraC family  39.13 
 
 		 277 aa  130  6.999999999999999e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.367426 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6275  AraC family transcriptional regulator  38.12 
 
 		 279 aa  128  3e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2797  transcription activator effector binding  37.8 
 
 		 279 aa  120  7e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.338998 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4077  transcription activator effector binding  37.04 
 
 		 178 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3715  transcriptional regulator, AraC family  35.37 
 
 		 279 aa  109  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.424878 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3417  transcriptional regulator, AraC family  34.76 
 
 		 279 aa  106  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.27768  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1952  AraC family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 271 aa  72.4  0.000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0598764  normal  0.641899 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06300  methylphosphotriester-DNA alkyltransferase  28.57 
 
 		 302 aa  63.2  0.000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64500  putative transcriptional regulator  30.16 
 
 		 270 aa  57.8  0.00000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1271  transcriptional regulator, AraC family  29.45 
 
 		 300 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.121916  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1013  AraC family transcriptional regulator  31.33 
 
 		 300 aa  56.2  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.126228  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1036  AraC family transcriptional regulator  31.33 
 
 		 300 aa  56.2  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.139629  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1114  AraC family transcriptional regulator  31.33 
 
 		 300 aa  56.2  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01850  probable transcriptional regulator  22.35 
 
 		 165 aa  56.2  0.0000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.153077  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5600  putative transcriptional regulator  28.57 
 
 		 270 aa  55.8  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1170  transcriptional regulator, AraC family  28.83 
 
 		 300 aa  55.1  0.0000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00906983  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1014  AraC family transcriptional regulator  28.83 
 
 		 300 aa  54.7  0.0000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.210728  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003322  hypothetical protein  23.84 
 
 		 310 aa  54.7  0.0000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.757084  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1194  transcriptional regulator, AraC family  30.72 
 
 		 300 aa  54.3  0.0000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.926126 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4171  transcriptional regulator, AraC family  28.22 
 
 		 300 aa  53.5  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2283  hypothetical protein  25.6 
 
 		 163 aa  50.1  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.539487 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2178  transcription activator, effector binding  25.95 
 
 		 160 aa  47.8  0.00007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.44747  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3983  transcriptional regulator, AraC family  26.06 
 
 		 291 aa  46.6  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4973  transcriptional regulator, AraC family  28.06 
 
 		 290 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4446  putative DNA gyrase inhibitor  39.06 
 
 		 160 aa  43.9  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.823142  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3138  AraC family transcriptional regulator  27.88 
 
 		 281 aa  43.5  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0132  transcription regulator protein  51.28 
 
 		 265 aa  42.7  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1784  AraC family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 280 aa  42.4  0.003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000275244  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0028  transcriptional regulator, AraC family  48.72 
 
 		 279 aa  42  0.004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4986  AraC family transcriptional regulator  27.34 
 
 		 290 aa  41.6  0.004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4566  AraC family transcriptional regulator  25.9 
 
 		 290 aa  41.2  0.006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.017881  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0034  transcriptional regulator, AraC family  48.72 
 
 		 279 aa  41.2  0.007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.255751 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1641  transcription activator effector binding protein  30.43 
 
 		 287 aa  40.8  0.007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C09  transcription activator effector binding domain-containing protein  30.56 
 
 		 154 aa  41.2  0.007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0009  helix-turn-helix domain-containing protein  27.69 
 
 		 306 aa  41.2  0.007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000070115 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2325  hypothetical protein  35 
 
 		 179 aa  40.8  0.008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0797882  normal  0.650281 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4947  transcriptional regulator, AraC family  25.9 
 
 		 290 aa  40.8  0.008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5086  AraC family transcriptional regulator  25.18 
 
 		 290 aa  40.8  0.009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2798  transcription activator effector binding  35.14 
 
 		 156 aa  40.8  0.009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4957  transcriptional regulator, AraC family  25.9 
 
 		 290 aa  40.8  0.009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5072  hypothetical protein  31.52 
 
 		 158 aa  40.8  0.009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4724  AraC family transcriptional regulator  25.18 
 
 		 290 aa  40.8  0.009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.440387  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3219  transcription activator effector binding  27.54 
 
 		 160 aa  40.4  0.009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1353  transcription activator effector binding  25.66 
 
 		 160 aa  40.4  0.01  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.266351  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>