42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_01850 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014230  CA2559_01850  probable transcriptional regulator  100 
 
 		 165 aa  345  2e-94  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.153077  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2178  transcription activator, effector binding  49.07 
 
 		 160 aa  159  2e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.44747  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2283  hypothetical protein  41.25 
 
 		 163 aa  134  6.0000000000000005e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.539487 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64500  putative transcriptional regulator  31.9 
 
 		 270 aa  73.9  0.0000000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5600  putative transcriptional regulator  30.06 
 
 		 270 aa  71.2  0.000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2938  AraC family transcriptional regulator  25.31 
 
 		 279 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.487848  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6275  AraC family transcriptional regulator  22.84 
 
 		 279 aa  63.9  0.0000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4053  AraC family transcriptional regulator  22.29 
 
 		 277 aa  61.6  0.000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3715  transcriptional regulator, AraC family  26.42 
 
 		 279 aa  59.3  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.424878 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3417  transcriptional regulator, AraC family  25.16 
 
 		 279 aa  57  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.27768  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4332  transcription activator, effector binding  22.35 
 
 		 164 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.500299  normal  0.674901 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0261  AraC family transcriptional regulator  24.24 
 
 		 281 aa  55.8  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4077  transcription activator effector binding  23.93 
 
 		 178 aa  55.1  0.0000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7157  transcriptional regulator, AraC family  23.64 
 
 		 277 aa  54.7  0.0000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.367426 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3983  transcriptional regulator, AraC family  25.15 
 
 		 291 aa  52.4  0.000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2797  transcription activator effector binding  23.12 
 
 		 279 aa  52.4  0.000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.338998 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0278  transcriptional regulator, AraC family  25 
 
 		 290 aa  50.4  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4957  transcriptional regulator, AraC family  24.24 
 
 		 290 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3953  AraC family transcriptional regulator  35.53 
 
 		 287 aa  50.4  0.00001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0509927  normal  1 
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C09  transcription activator effector binding domain-containing protein  25 
 
 		 154 aa  48.9  0.00003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4973  transcriptional regulator, AraC family  23.64 
 
 		 290 aa  48.1  0.00005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4986  AraC family transcriptional regulator  23.64 
 
 		 290 aa  48.1  0.00005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2325  hypothetical protein  24.66 
 
 		 179 aa  46.6  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0797882  normal  0.650281 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1802  transcriptional regulator, AraC family  31.33 
 
 		 286 aa  46.6  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1956  transcriptional regulator, AraC family  43.14 
 
 		 283 aa  46.6  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0993473  normal  0.479782 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4672  AraC family transcriptional regulator  23.64 
 
 		 290 aa  44.7  0.0006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1952  AraC family transcriptional regulator  24.54 
 
 		 271 aa  43.9  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0598764  normal  0.641899 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5086  AraC family transcriptional regulator  22.7 
 
 		 290 aa  43.5  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4724  AraC family transcriptional regulator  22.7 
 
 		 290 aa  43.5  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.440387  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06300  methylphosphotriester-DNA alkyltransferase  25 
 
 		 302 aa  42.7  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5265  transcriptional regulator, AraC family  30.59 
 
 		 281 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0946  transcriptional regulator, AraC family  26.6 
 
 		 286 aa  42  0.003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.584518  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2759  AraC family transcriptional regulator  26.47 
 
 		 292 aa  42  0.003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0106  transcription activator effector binding  27.74 
 
 		 149 aa  42.4  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4582  AraC family transcriptional regulator  23.21 
 
 		 290 aa  42.4  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.763033  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3846  transcriptional regulator, AraC family  28.09 
 
 		 287 aa  42.4  0.003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4947  transcriptional regulator, AraC family  22.7 
 
 		 290 aa  41.2  0.006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2210  transcriptional regulator, AraC family  28.57 
 
 		 291 aa  41.2  0.006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2167  transcriptional regulator, AraC family  29.55 
 
 		 283 aa  41.2  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.273156  normal  0.0865176 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1922  transcriptional regulator, AraC family  28.57 
 
 		 291 aa  41.2  0.006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.890213  normal  0.89853 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0205  transcriptional activator, AraC family  31.51 
 
 		 281 aa  40.4  0.01  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000524418 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0418  transcription activator, effector binding  30.51 
 
 		 154 aa  40.4  0.01  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>