32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_2283 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_2283  hypothetical protein  100 
 
 		 163 aa  342  1e-93  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.539487 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2178  transcription activator, effector binding  46.88 
 
 		 160 aa  162  3e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.44747  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01850  probable transcriptional regulator  41.25 
 
 		 165 aa  134  6.0000000000000005e-31  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.153077  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3983  transcriptional regulator, AraC family  29.53 
 
 		 291 aa  65.9  0.0000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5600  putative transcriptional regulator  29.75 
 
 		 270 aa  63.5  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64500  putative transcriptional regulator  29.11 
 
 		 270 aa  62.8  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6275  AraC family transcriptional regulator  26.21 
 
 		 279 aa  56.2  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3715  transcriptional regulator, AraC family  25.64 
 
 		 279 aa  53.9  0.0000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.424878 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4053  AraC family transcriptional regulator  25.19 
 
 		 277 aa  52.4  0.000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3417  transcriptional regulator, AraC family  25.64 
 
 		 279 aa  52.4  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.27768  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2938  AraC family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 279 aa  50.8  0.000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.487848  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4332  transcription activator, effector binding  25.6 
 
 		 164 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.500299  normal  0.674901 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2797  transcription activator effector binding  27.27 
 
 		 279 aa  50.1  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.338998 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2293  transcription activator effector binding protein  32.97 
 
 		 155 aa  49.7  0.00002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.427424  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1802  transcriptional regulator, AraC family  33.33 
 
 		 286 aa  48.5  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3503  transcription activator, effector binding  32.61 
 
 		 294 aa  46.6  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00111619  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3099  AraC family transcriptional regulator  28.72 
 
 		 326 aa  45.1  0.0004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4077  transcription activator effector binding  21.09 
 
 		 178 aa  44.7  0.0006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1266  AraC family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 300 aa  44.3  0.0008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.23796  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0771  AraC family transcriptional regulator  27.96 
 
 		 288 aa  43.5  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.472166 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1216  AraC family transcriptional regulator  23.98 
 
 		 300 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0946  transcriptional regulator, AraC family  33.33 
 
 		 286 aa  43.1  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.584518  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2210  transcriptional regulator, AraC family  33.33 
 
 		 291 aa  43.1  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1353  transcription activator effector binding  37.33 
 
 		 160 aa  42.7  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.266351  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4171  transcriptional regulator, AraC family  23.98 
 
 		 300 aa  42  0.004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2127  transcription activator effector binding protein  32.47 
 
 		 290 aa  42  0.004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4672  AraC family transcriptional regulator  25.61 
 
 		 290 aa  41.6  0.005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3953  AraC family transcriptional regulator  30.16 
 
 		 287 aa  41.6  0.005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0509927  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1127  transcriptional regulator, AraC family  29.41 
 
 		 288 aa  40.8  0.007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1170  transcriptional regulator, AraC family  23.98 
 
 		 300 aa  40.8  0.009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00906983  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3161  AraC family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 277 aa  40.8  0.009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0278  transcriptional regulator, AraC family  25 
 
 		 290 aa  40.4  0.01  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>