More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_1127 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011886  Achl_1127  transcriptional regulator, AraC family  100 
 
 		 288 aa  580  1.0000000000000001e-165  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0329  transcription activator effector binding protein  68.88 
 
 		 288 aa  394  1e-109  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0236652  normal  0.0105288 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1802  transcriptional regulator, AraC family  54.17 
 
 		 286 aa  301  6.000000000000001e-81  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1266  AraC family transcriptional regulator  48.78 
 
 		 300 aa  256  3e-67  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.23796  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2780  transcriptional regulator, AraC family  46.64 
 
 		 285 aa  245  6e-64  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0531003  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2127  transcription activator effector binding protein  48.29 
 
 		 290 aa  243  1.9999999999999999e-63  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2210  transcriptional regulator, AraC family  39.52 
 
 		 291 aa  229  4e-59  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1922  transcriptional regulator, AraC family  38.28 
 
 		 291 aa  217  2e-55  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.890213  normal  0.89853 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2759  AraC family transcriptional regulator  37.11 
 
 		 292 aa  211  1e-53  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3344  helix-turn-helix domain-containing protein  53.97 
 
 		 232 aa  202  4e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.388455  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0137  AraC family transcriptional regulator  50.25 
 
 		 315 aa  202  6e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.10009 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4947  transcriptional regulator, AraC family  35.79 
 
 		 290 aa  202  6e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2251  transcriptional regulator, AraC family  35.42 
 
 		 287 aa  200  1.9999999999999998e-50  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4724  AraC family transcriptional regulator  35.79 
 
 		 290 aa  200  1.9999999999999998e-50  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.440387  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4582  AraC family transcriptional regulator  35.79 
 
 		 290 aa  200  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.763033  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5086  AraC family transcriptional regulator  35.79 
 
 		 290 aa  200  1.9999999999999998e-50  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4957  transcriptional regulator, AraC family  35.79 
 
 		 290 aa  199  6e-50  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4672  AraC family transcriptional regulator  35.09 
 
 		 290 aa  198  9e-50  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4986  AraC family transcriptional regulator  34.98 
 
 		 290 aa  197  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4973  transcriptional regulator, AraC family  34.98 
 
 		 290 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4566  AraC family transcriptional regulator  35.09 
 
 		 290 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.017881  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0278  transcriptional regulator, AraC family  35.09 
 
 		 290 aa  193  3e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3264  transcriptional regulator, AraC family  32.53 
 
 		 287 aa  160  2e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3174  AraC family transcriptional regulator  31.56 
 
 		 280 aa  156  5.0000000000000005e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.626893  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3846  transcriptional regulator, AraC family  29.97 
 
 		 287 aa  152  8e-36  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2323  transcriptional regulator, AraC family  31.45 
 
 		 289 aa  146  4.0000000000000006e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.614848  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3181  AraC family transcriptional regulator  31.29 
 
 		 292 aa  145  6e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3138  AraC family transcriptional regulator  31.12 
 
 		 281 aa  145  8.000000000000001e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2107  AraC family transcriptional regulator  28.97 
 
 		 313 aa  142  8e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.342925  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5265  transcriptional regulator, AraC family  29.21 
 
 		 281 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2678  transcriptional regulator, AraC family  28.87 
 
 		 284 aa  137  1e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3564  transcriptional regulator, AraC family  26.39 
 
 		 285 aa  137  2e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0990  AraC family transcriptional regulator  28.28 
 
 		 281 aa  136  4e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0205  transcriptional activator, AraC family  28.87 
 
 		 281 aa  136  4e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000524418 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0223  transcriptional activator, AraC family  28.62 
 
 		 281 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000178737 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0011  transcriptional regulator, AraC family  26.42 
 
 		 285 aa  131  1.0000000000000001e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000871788  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3142  AraC family transcriptional regulator  27.51 
 
 		 301 aa  120  1.9999999999999998e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1790  transcriptional regulator, AraC family  24.74 
 
 		 282 aa  116  5e-25  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.191731  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2556  AraC family transcriptional regulator  27.14 
 
 		 290 aa  114  1.0000000000000001e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000000235949  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1784  AraC family transcriptional regulator  27.99 
 
 		 280 aa  111  1.0000000000000001e-23  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000275244  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1194  transcriptional regulator, AraC family  27.91 
 
 		 300 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.926126 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0424  transcriptional regulator, AraC family  25.86 
 
 		 281 aa  109  6e-23  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1036  AraC family transcriptional regulator  27.57 
 
 		 300 aa  108  1e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.139629  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1114  AraC family transcriptional regulator  27.57 
 
 		 300 aa  108  1e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1170  transcriptional regulator, AraC family  26.56 
 
 		 300 aa  107  2e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00906983  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1021  AraC family transcriptional regulator  26.89 
 
 		 300 aa  107  3e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1014  AraC family transcriptional regulator  27.24 
 
 		 300 aa  106  4e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.210728  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4171  transcriptional regulator, AraC family  26.23 
 
 		 300 aa  105  6e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1013  AraC family transcriptional regulator  27.24 
 
 		 300 aa  105  8e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.126228  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1216  AraC family transcriptional regulator  26.91 
 
 		 300 aa  105  1e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1271  transcriptional regulator, AraC family  26.25 
 
 		 300 aa  100  2e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.121916  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1069  AraC family transcriptional regulator  25.26 
 
 		 293 aa  97.8  2e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.689445  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0165  AraC family transcriptional regulator  23.77 
 
 		 298 aa  97.1  3e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0674  AraC family transcriptional regulator  35.66 
 
 		 265 aa  90.9  2e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1798  transcriptional regulator, AraC family  30.34 
 
 		 200 aa  89.7  5e-17  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2797  transcription activator effector binding  27.09 
 
 		 279 aa  88.2  1e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.338998 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7157  transcriptional regulator, AraC family  26.95 
 
 		 277 aa  86.7  5e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.367426 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3715  transcriptional regulator, AraC family  25.75 
 
 		 279 aa  86.3  5e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.424878 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6275  AraC family transcriptional regulator  27.96 
 
 		 279 aa  83.6  0.000000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0261  AraC family transcriptional regulator  26.6 
 
 		 281 aa  83.2  0.000000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0086  transcriptional regulator, AraC family  27.8 
 
 		 313 aa  82.8  0.000000000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.353006  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0853  transcriptional regulator, AraC family  27.37 
 
 		 284 aa  82.4  0.000000000000007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3417  transcriptional regulator, AraC family  24.92 
 
 		 279 aa  80.9  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.27768  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0077  HTH-type transcriptional regulator, AraC-family  25.37 
 
 		 289 aa  80.1  0.00000000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1952  AraC family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 271 aa  79.3  0.00000000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0598764  normal  0.641899 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1594  transcription activator effector binding  23.39 
 
 		 297 aa  79.3  0.00000000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.630007  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1563  transcription activator, effector binding  23.39 
 
 		 297 aa  79.3  0.00000000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4053  AraC family transcriptional regulator  26.21 
 
 		 277 aa  78.2  0.0000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06471  hypothetical protein  24.63 
 
 		 289 aa  77.8  0.0000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3983  transcriptional regulator, AraC family  24.82 
 
 		 291 aa  77.8  0.0000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1956  transcriptional regulator, AraC family  26.95 
 
 		 283 aa  77  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0993473  normal  0.479782 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000611  AraC-type DNA-binding domain-containing protein  24.06 
 
 		 289 aa  76.6  0.0000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0208776  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1217  transcription activator, effector binding  26.19 
 
 		 288 aa  77  0.0000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1051  transcriptional regulator, AraC family  35.19 
 
 		 276 aa  76.6  0.0000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2938  AraC family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 279 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.487848  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0009  helix-turn-helix domain-containing protein  24.5 
 
 		 306 aa  75.5  0.000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000070115 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2167  transcriptional regulator, AraC family  26.74 
 
 		 283 aa  74.7  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.273156  normal  0.0865176 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3503  transcription activator, effector binding  28.22 
 
 		 294 aa  73.2  0.000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00111619  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0176  AraC family transcriptional regulator  34 
 
 		 299 aa  72  0.00000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0216  transcriptional regulator, AraC family  33 
 
 		 299 aa  72  0.00000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3431  transcription activator, effector binding  23.88 
 
 		 288 aa  70.9  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3702  transcriptional regulator, AraC type  25.85 
 
 		 308 aa  70.9  0.00000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1224  AraC family transcriptional regulator  24.23 
 
 		 288 aa  71.2  0.00000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0494811  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0019  transcriptional regulator, AraC family  26.9 
 
 		 314 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003322  hypothetical protein  23.26 
 
 		 310 aa  70.5  0.00000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.757084  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3425  transcription activator, effector binding  23.88 
 
 		 288 aa  70.5  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0771  AraC family transcriptional regulator  24.74 
 
 		 288 aa  70.9  0.00000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.472166 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0192  AraC family transcriptional regulator  33 
 
 		 299 aa  70.1  0.00000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0179  AraC family transcriptional regulator  33 
 
 		 299 aa  70.1  0.00000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0147136  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1474  transcriptional regulator, AraC family  26.04 
 
 		 286 aa  70.1  0.00000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1931  AraC family transcriptional regulator  32.29 
 
 		 118 aa  70.5  0.00000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0129269  hitchhiker  0.0018191 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0211  transcriptional regulator, AraC family  33 
 
 		 299 aa  70.1  0.00000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0191  AraC family transcriptional regulator  33 
 
 		 299 aa  70.1  0.00000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0526  transcriptional regulator, AraC family  30.56 
 
 		 129 aa  69.3  0.00000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000198595  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0182  AraC family transcriptional regulator  33 
 
 		 299 aa  69.3  0.00000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3356  transcription activator, effector binding  23.88 
 
 		 288 aa  68.9  0.00000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1523  AraC family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 152 aa  68.6  0.0000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00364512  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06300  methylphosphotriester-DNA alkyltransferase  20.98 
 
 		 302 aa  67.4  0.0000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0186  transcriptional regulator, AraC family  34.34 
 
 		 452 aa  67  0.0000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3526  transcription activator, effector binding  23.53 
 
 		 288 aa  66.2  0.0000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>