More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP1069 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002976  SERP1069  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 293 aa  600  1e-170  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.689445  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1563  transcription activator, effector binding  86.11 
 
 		 297 aa  524  1e-148  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1594  transcription activator effector binding  86.11 
 
 		 297 aa  524  1e-148  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.630007  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4566  AraC family transcriptional regulator  25.17 
 
 		 290 aa  105  6e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.017881  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2210  transcriptional regulator, AraC family  25.43 
 
 		 291 aa  104  2e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1802  transcriptional regulator, AraC family  26.64 
 
 		 286 aa  103  4e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4582  AraC family transcriptional regulator  24.48 
 
 		 290 aa  102  1e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.763033  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2759  AraC family transcriptional regulator  25.76 
 
 		 292 aa  101  1e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4724  AraC family transcriptional regulator  24.48 
 
 		 290 aa  101  2e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.440387  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5086  AraC family transcriptional regulator  24.48 
 
 		 290 aa  101  2e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4973  transcriptional regulator, AraC family  24.83 
 
 		 290 aa  100  2e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5265  transcriptional regulator, AraC family  29.1 
 
 		 281 aa  100  2e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0223  transcriptional activator, AraC family  28.69 
 
 		 281 aa  101  2e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000178737 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4947  transcriptional regulator, AraC family  24.48 
 
 		 290 aa  100  3e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1922  transcriptional regulator, AraC family  25.61 
 
 		 291 aa  100  3e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.890213  normal  0.89853 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4986  AraC family transcriptional regulator  24.48 
 
 		 290 aa  99.4  6e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4957  transcriptional regulator, AraC family  25.17 
 
 		 290 aa  99.4  6e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4672  AraC family transcriptional regulator  24.48 
 
 		 290 aa  98.6  1e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0205  transcriptional activator, AraC family  27.85 
 
 		 281 aa  98.6  1e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000524418 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1127  transcriptional regulator, AraC family  25.26 
 
 		 288 aa  97.8  2e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0990  AraC family transcriptional regulator  28.27 
 
 		 281 aa  96.7  4e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0278  transcriptional regulator, AraC family  24.91 
 
 		 290 aa  96.7  4e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2323  transcriptional regulator, AraC family  25.9 
 
 		 289 aa  92.8  6e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.614848  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1266  AraC family transcriptional regulator  25.6 
 
 		 300 aa  92.4  7e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.23796  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3846  transcriptional regulator, AraC family  26.04 
 
 		 287 aa  92.4  9e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3344  helix-turn-helix domain-containing protein  26.42 
 
 		 232 aa  90.9  3e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.388455  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2107  AraC family transcriptional regulator  24.76 
 
 		 313 aa  90.1  3e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.342925  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1790  transcriptional regulator, AraC family  27.55 
 
 		 282 aa  90.1  4e-17  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.191731  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3181  AraC family transcriptional regulator  26.48 
 
 		 292 aa  88.6  1e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3174  AraC family transcriptional regulator  25.75 
 
 		 280 aa  86.7  5e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.626893  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0011  transcriptional regulator, AraC family  24.58 
 
 		 285 aa  86.3  5e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000871788  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3564  transcriptional regulator, AraC family  23.86 
 
 		 285 aa  84.3  0.000000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0329  transcription activator effector binding protein  25.95 
 
 		 288 aa  84  0.000000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0236652  normal  0.0105288 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3264  transcriptional regulator, AraC family  24.24 
 
 		 287 aa  83.6  0.000000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2780  transcriptional regulator, AraC family  22.46 
 
 		 285 aa  82  0.00000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0531003  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0137  AraC family transcriptional regulator  26.8 
 
 		 315 aa  81.6  0.00000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.10009 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3142  AraC family transcriptional regulator  28.53 
 
 		 301 aa  80.9  0.00000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2556  AraC family transcriptional regulator  25.36 
 
 		 290 aa  77.8  0.0000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000000235949  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1194  transcriptional regulator, AraC family  24.08 
 
 		 300 aa  77.8  0.0000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.926126 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1013  AraC family transcriptional regulator  24.08 
 
 		 300 aa  77.4  0.0000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.126228  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1036  AraC family transcriptional regulator  24.08 
 
 		 300 aa  77  0.0000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.139629  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1114  AraC family transcriptional regulator  24.08 
 
 		 300 aa  77  0.0000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1021  AraC family transcriptional regulator  24.08 
 
 		 300 aa  76.3  0.0000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1014  AraC family transcriptional regulator  23.75 
 
 		 300 aa  75.9  0.0000000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.210728  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1271  transcriptional regulator, AraC family  23.75 
 
 		 300 aa  74.7  0.000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.121916  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4171  transcriptional regulator, AraC family  23.75 
 
 		 300 aa  75.1  0.000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1798  transcriptional regulator, AraC family  32.39 
 
 		 200 aa  75.1  0.000000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2678  transcriptional regulator, AraC family  23.81 
 
 		 284 aa  75.1  0.000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1170  transcriptional regulator, AraC family  23.75 
 
 		 300 aa  75.5  0.000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00906983  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1784  AraC family transcriptional regulator  23.57 
 
 		 280 aa  74.7  0.000000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000275244  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1216  AraC family transcriptional regulator  23.75 
 
 		 300 aa  73.9  0.000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2127  transcription activator effector binding protein  23.68 
 
 		 290 aa  73.9  0.000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2251  transcriptional regulator, AraC family  28.38 
 
 		 287 aa  70.1  0.00000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0424  transcriptional regulator, AraC family  21.53 
 
 		 281 aa  67.4  0.0000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4053  AraC family transcriptional regulator  26.56 
 
 		 277 aa  67.4  0.0000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2797  transcription activator effector binding  32.99 
 
 		 279 aa  67  0.0000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.338998 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3417  transcriptional regulator, AraC family  32.99 
 
 		 279 aa  66.2  0.0000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.27768  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1472  AraC family transcriptional regulator  29.46 
 
 		 294 aa  66.2  0.0000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.102681  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2326  AraC family transcriptional regulator  29.53 
 
 		 367 aa  65.5  0.0000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0674  AraC family transcriptional regulator  30.17 
 
 		 265 aa  65.9  0.0000000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2360  AraC family transcriptional regulator  29.14 
 
 		 367 aa  65.1  0.000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000000000555626  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3138  AraC family transcriptional regulator  22.76 
 
 		 281 aa  65.1  0.000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0165  AraC family transcriptional regulator  32.29 
 
 		 298 aa  65.1  0.000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2772  transcriptional regulator, AraC family  29.53 
 
 		 364 aa  64.3  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.320342  decreased coverage  0.000000000118835 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6275  AraC family transcriptional regulator  29.36 
 
 		 279 aa  63.2  0.000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2406  AraC family transcriptional regulator  29.33 
 
 		 367 aa  63.2  0.000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.280616  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2582  AraC family transcriptional regulator  29.33 
 
 		 364 aa  63.2  0.000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.147074  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3715  transcriptional regulator, AraC family  30.93 
 
 		 279 aa  62  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.424878 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0086  transcriptional regulator, AraC family  26.32 
 
 		 313 aa  60.8  0.00000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.353006  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001047  transcriptional regulator AraC family  27 
 
 		 299 aa  60.8  0.00000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2396  AraC family transcriptional regulator  28.48 
 
 		 358 aa  60.8  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0547551  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3921  AraC family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 311 aa  59.7  0.00000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.892105 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2592  AraC family transcriptional regulator  27.33 
 
 		 364 aa  59.7  0.00000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00912873  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3983  transcriptional regulator, AraC family  27 
 
 		 291 aa  58.9  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1051  transcriptional regulator, AraC family  32.35 
 
 		 276 aa  58.9  0.0000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1683  AraC family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 221 aa  58.5  0.0000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0526  transcriptional regulator, AraC family  30 
 
 		 129 aa  58.2  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000198595  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0345  AraC family transcriptional regulator  30.68 
 
 		 311 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0829  AraC family transcriptional regulator  30.68 
 
 		 311 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0210284  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12670  DNA-binding domain-containing protein, AraC-type  23.88 
 
 		 250 aa  57.8  0.0000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0910  HTH-type transcription regulator, AraC-family  21.86 
 
 		 298 aa  57.4  0.0000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.576456  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3306  AraC family transcriptional regulator  30 
 
 		 292 aa  57  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5215  helix-turn-helix domain-containing protein  29.47 
 
 		 331 aa  57  0.0000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000611  AraC-type DNA-binding domain-containing protein  26.5 
 
 		 289 aa  57.4  0.0000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0208776  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0798  AraC family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 311 aa  56.6  0.0000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1078  AraC family transcriptional regulator  28.71 
 
 		 113 aa  57  0.0000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.531138 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2938  AraC family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 279 aa  56.6  0.0000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.487848  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0140  AraC family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 293 aa  56.2  0.0000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.877598  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2929  AraC family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 293 aa  56.2  0.0000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0126  AraC family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 293 aa  56.2  0.0000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.436666  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0211  transcriptional regulator, AraC family  28.72 
 
 		 299 aa  55.8  0.0000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0179  AraC family transcriptional regulator  28.72 
 
 		 299 aa  55.8  0.0000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0147136  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0192  AraC family transcriptional regulator  28.72 
 
 		 299 aa  55.8  0.0000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0191  AraC family transcriptional regulator  28.72 
 
 		 299 aa  55.8  0.0000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0634  transposon Tn10 TetD protein  27.72 
 
 		 113 aa  55.5  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0932  AraC family transcriptional regulator  29.47 
 
 		 291 aa  55.1  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0568  transcriptional regulator, AraC family  29.35 
 
 		 293 aa  55.5  0.000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.117041  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1952  AraC family transcriptional regulator  26.47 
 
 		 271 aa  55.1  0.000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0598764  normal  0.641899 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3379  transcriptional regulator  25.69 
 
 		 337 aa  55.5  0.000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.949377  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3867  transcriptional regulator, AraC family  28 
 
 		 295 aa  55.5  0.000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.0000535009  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>