More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_II0910 on replicon NC_011313
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011313  VSAL_II0910  HTH-type transcription regulator, AraC-family  100 
 
 
298 aa  609  1e-173  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.576456  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06300  methylphosphotriester-DNA alkyltransferase  43.56 
 
 
302 aa  243  1.9999999999999999e-63  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0009  helix-turn-helix domain-containing protein  41.83 
 
 
306 aa  240  2.9999999999999997e-62  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000070115 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003322  hypothetical protein  41.45 
 
 
310 aa  234  1.0000000000000001e-60  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.757084  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3846  transcriptional regulator, AraC family  25.08 
 
 
287 aa  109  6e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2678  transcriptional regulator, AraC family  25.09 
 
 
284 aa  103  4e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3867  transcriptional regulator, AraC family  27.52 
 
 
295 aa  100  4e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.0000535009  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3174  AraC family transcriptional regulator  24.83 
 
 
280 aa  99.8  5e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.626893  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3673  transcriptional regulator, AraC family  26.17 
 
 
295 aa  98.6  1e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2780  transcriptional regulator, AraC family  24.91 
 
 
285 aa  97.8  2e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0531003  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3138  AraC family transcriptional regulator  26.39 
 
 
281 aa  97.8  2e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3142  AraC family transcriptional regulator  25.91 
 
 
301 aa  96.3  5e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0529  transcriptional regulator, AraC family  26.64 
 
 
288 aa  95.9  8e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2167  transcriptional regulator, AraC family  26.53 
 
 
283 aa  94.4  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.273156  normal  0.0865176 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0261  AraC family transcriptional regulator  26.03 
 
 
281 aa  94  3e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1021  AraC family transcriptional regulator  27.65 
 
 
300 aa  93.6  3e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1217  transcription activator, effector binding  26.38 
 
 
288 aa  93.6  3e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1216  AraC family transcriptional regulator  28.53 
 
 
300 aa  93.2  4e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1013  AraC family transcriptional regulator  27.88 
 
 
300 aa  93.6  4e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.126228  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1036  AraC family transcriptional regulator  27.97 
 
 
300 aa  93.2  5e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.139629  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1014  AraC family transcriptional regulator  28.12 
 
 
300 aa  93.2  5e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.210728  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1194  transcriptional regulator, AraC family  27.97 
 
 
300 aa  93.2  5e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.926126 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1114  AraC family transcriptional regulator  27.97 
 
 
300 aa  93.2  5e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4171  transcriptional regulator, AraC family  28.43 
 
 
300 aa  93.2  5e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0679  AraC family transcriptional regulator  26.42 
 
 
289 aa  93.2  5e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0014238  normal  0.551474 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1271  transcriptional regulator, AraC family  28.12 
 
 
300 aa  92.8  6e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.121916  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1170  transcriptional regulator, AraC family  28.12 
 
 
300 aa  92.4  8e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00906983  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3264  transcriptional regulator, AraC family  22.3 
 
 
287 aa  92.4  9e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4998  right origin-binding protein  26.26 
 
 
289 aa  92  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4944  right origin-binding protein  26.26 
 
 
289 aa  92  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4837  right origin-binding protein  26.26 
 
 
289 aa  92  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4910  right origin-binding protein  26.26 
 
 
289 aa  92  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4996  right origin-binding protein  26.26 
 
 
289 aa  92  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3503  transcription activator, effector binding  26.96 
 
 
294 aa  92  1e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00111619  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2797  transcription activator effector binding  25.95 
 
 
279 aa  91.7  1e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.338998 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04272  DNA-binding transcriptional activator  26.17 
 
 
289 aa  91.3  2e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04237  hypothetical protein  26.17 
 
 
289 aa  91.3  2e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3601  transcriptional regulator, AraC family  26.17 
 
 
289 aa  91.3  2e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5910  right origin-binding protein  26.17 
 
 
289 aa  91.3  2e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3660  AraC family transcriptional regulator  26.17 
 
 
289 aa  91.3  2e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4994  right origin-binding protein  26.17 
 
 
289 aa  91.3  2e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4943  right origin-binding protein  26.17 
 
 
289 aa  91.3  2e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4946  right origin-binding protein  26.17 
 
 
289 aa  91.3  2e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.96055 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4632  right origin-binding protein  26.17 
 
 
289 aa  91.3  2e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0568  transcriptional regulator, AraC family  24.75 
 
 
293 aa  90.1  4e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.117041  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4053  AraC family transcriptional regulator  26.62 
 
 
277 aa  90.1  4e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1790  transcriptional regulator, AraC family  24 
 
 
282 aa  90.1  4e-17  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.191731  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06471  hypothetical protein  25.43 
 
 
289 aa  89.7  6e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4947  transcriptional regulator, AraC family  24.25 
 
 
290 aa  89.4  7e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1784  AraC family transcriptional regulator  26.03 
 
 
280 aa  89  9e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000275244  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7157  transcriptional regulator, AraC family  25 
 
 
277 aa  88.6  1e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.367426 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0019  transcriptional regulator, AraC family  25.71 
 
 
314 aa  88.6  1e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3161  AraC family transcriptional regulator  26.94 
 
 
277 aa  88.6  1e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3344  helix-turn-helix domain-containing protein  31.74 
 
 
232 aa  88.6  1e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.388455  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2556  AraC family transcriptional regulator  22.79 
 
 
290 aa  88.2  1e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000000235949  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4973  transcriptional regulator, AraC family  22.98 
 
 
290 aa  87.4  2e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0077  HTH-type transcriptional regulator, AraC-family  26.37 
 
 
289 aa  87.8  2e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2251  transcriptional regulator, AraC family  22.74 
 
 
287 aa  87.8  2e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6275  AraC family transcriptional regulator  24.38 
 
 
279 aa  87.4  2e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4582  AraC family transcriptional regulator  23.26 
 
 
290 aa  87.4  3e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.763033  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0634  transposon Tn10 TetD protein  37 
 
 
113 aa  87  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0140  AraC family transcriptional regulator  23.78 
 
 
293 aa  87.4  3e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.877598  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0693  transposon Tn10 TetD protein  37 
 
 
113 aa  87  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.808673  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4986  AraC family transcriptional regulator  23.15 
 
 
290 aa  86.7  4e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4724  AraC family transcriptional regulator  23.59 
 
 
290 aa  87  4e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.440387  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5086  AraC family transcriptional regulator  23.59 
 
 
290 aa  87  4e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5265  transcriptional regulator, AraC family  25.76 
 
 
281 aa  87  4e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3086  transcriptional regulator, AraC family  26 
 
 
296 aa  86.3  5e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.164604  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2929  AraC family transcriptional regulator  24.13 
 
 
293 aa  86.3  5e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3715  transcriptional regulator, AraC family  25.09 
 
 
279 aa  86.3  5e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.424878 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0126  AraC family transcriptional regulator  24.13 
 
 
293 aa  86.3  5e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.436666  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000611  AraC-type DNA-binding domain-containing protein  25.09 
 
 
289 aa  86.7  5e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0208776  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1474  transcriptional regulator, AraC family  26.69 
 
 
286 aa  85.9  7e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1956  transcriptional regulator, AraC family  26.96 
 
 
283 aa  85.9  7e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0993473  normal  0.479782 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0990  AraC family transcriptional regulator  24.16 
 
 
281 aa  85.5  9e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0278  transcriptional regulator, AraC family  22.56 
 
 
290 aa  85.5  9e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0771  AraC family transcriptional regulator  23.97 
 
 
288 aa  85.5  0.000000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.472166 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4957  transcriptional regulator, AraC family  23.28 
 
 
290 aa  85.5  0.000000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0739  transposon Tn10 TetD protein  35.64 
 
 
113 aa  85.1  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.899902  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3417  transcriptional regulator, AraC family  24.83 
 
 
279 aa  84.3  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.27768  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0620  transposon Tn10 TetD protein  36 
 
 
113 aa  84.7  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0677  transposon Tn10 TetD protein  36 
 
 
113 aa  84.7  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.198694  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4566  AraC family transcriptional regulator  23.08 
 
 
290 aa  84  0.000000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.017881  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3481  right origin-binding protein  25.34 
 
 
288 aa  84  0.000000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3609  AraC family transcriptional regulator  25.34 
 
 
288 aa  84  0.000000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4021  AraC family transcriptional regulator  27.4 
 
 
288 aa  84  0.000000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.185045  normal  0.0217611 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4672  AraC family transcriptional regulator  22.26 
 
 
290 aa  84  0.000000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0814  right origin-binding protein  25.34 
 
 
288 aa  84  0.000000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2759  AraC family transcriptional regulator  23.86 
 
 
292 aa  84  0.000000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0557  AraC family transcriptional regulator  24.92 
 
 
289 aa  83.6  0.000000000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4046  AraC family transcriptional regulator  26.52 
 
 
289 aa  83.2  0.000000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1078  AraC family transcriptional regulator  36.63 
 
 
113 aa  83.2  0.000000000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.531138 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3306  AraC family transcriptional regulator  23.57 
 
 
292 aa  82.8  0.000000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3088  AraC family transcriptional regulator  26.42 
 
 
296 aa  82  0.00000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.530109  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3564  transcriptional regulator, AraC family  25.15 
 
 
285 aa  81.3  0.00000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3181  AraC family transcriptional regulator  22.3 
 
 
292 aa  81.3  0.00000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0011  transcriptional regulator, AraC family  23.89 
 
 
285 aa  81.3  0.00000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000871788  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0205  transcriptional activator, AraC family  23.81 
 
 
281 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000524418 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1997  DNA-binding transcriptional activator MarA  38.78 
 
 
127 aa  80.9  0.00000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0707519 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4381  transcription activator effector binding  26.06 
 
 
286 aa  80.9  0.00000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.134609  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>