More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_0345 on replicon NC_008060
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008060  Bcen_0345  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 
311 aa  630  1e-179  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0829  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 
311 aa  630  1e-179  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0210284  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0798  AraC family transcriptional regulator  99.36 
 
 
311 aa  628  1e-179  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3921  AraC family transcriptional regulator  97.75 
 
 
311 aa  615  1e-175  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.892105 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2555  AraC family transcriptional regulator  91 
 
 
311 aa  562  1.0000000000000001e-159  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0725  AraC family transcriptional regulator  90.97 
 
 
311 aa  553  1e-156  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.576949 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0708  AraC family transcriptional regulator  90 
 
 
311 aa  546  1e-154  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0867  AraC family transcriptional regulator  83.12 
 
 
315 aa  530  1e-149  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000394258  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2701  AraC family transcriptional regulator  83.12 
 
 
315 aa  530  1e-149  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.137316  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3203  AraC family transcriptional regulator  82.79 
 
 
315 aa  527  1e-149  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.10279  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1909  AraC family transcriptional regulator  83.12 
 
 
315 aa  530  1e-149  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.190572  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3218  AraC family transcriptional regulator  83.06 
 
 
678 aa  526  1e-148  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000051538  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3164  AraC family transcriptional regulator  82.79 
 
 
332 aa  527  1e-148  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0245945  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2046  AraC family transcriptional regulator  85.86 
 
 
291 aa  521  1e-147  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0173792  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4258  AraC family transcriptional regulator  76.11 
 
 
327 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1405  AraC family transcriptional regulator  85.83 
 
 
251 aa  445  1.0000000000000001e-124  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000697123  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6955  transcriptional regulator, AraC family  70.53 
 
 
346 aa  435  1e-121  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.737934  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05428  transcription regulator protein  51.62 
 
 
324 aa  261  8e-69  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0932  AraC family transcriptional regulator  49.27 
 
 
291 aa  259  4e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4214  transcriptional regulator, AraC family  50.53 
 
 
305 aa  259  4e-68  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4324  transcriptional regulator, AraC family  50.53 
 
 
305 aa  259  4e-68  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0282215 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13470  AraC family transcriptional regulator  49.82 
 
 
293 aa  258  1e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0899227  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1207  putative transcriptional regulator  49.47 
 
 
293 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1041  helix-turn-helix, AraC type:Arac protein, arabinose-binding/dimerisation  48.01 
 
 
291 aa  253  4.0000000000000004e-66  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.29946 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5332  AraC family transcriptional regulator  47.6 
 
 
301 aa  248  1e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5804  AraC family transcriptional regulator  45.17 
 
 
305 aa  247  2e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3238  AraC family transcriptional regulator  48.07 
 
 
290 aa  245  6e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.996927 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4587  AraC family transcriptional regulator  47.31 
 
 
291 aa  241  1e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.213128  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4464  helix-turn-helix domain-containing protein  47.29 
 
 
291 aa  239  5e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4605  AraC family transcriptional regulator  45.96 
 
 
291 aa  238  1e-61  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1213  transcriptional regulator, AraC family  45.85 
 
 
291 aa  238  1e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0859  AraC family transcriptional regulator  45.85 
 
 
291 aa  233  3e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.775109  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1732  transcriptional regulator, AraC family  38.87 
 
 
288 aa  199  7e-50  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0803469 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2907  transcriptional regulator, AraC family  37.72 
 
 
289 aa  196  4.0000000000000005e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0560618  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2413  transcriptional regulator, AraC family  38.57 
 
 
322 aa  191  2e-47  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.333457  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1980  AraC family transcriptional regulator  36.88 
 
 
293 aa  187  1e-46  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.949603 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6513  transcriptional regulator, AraC family  39.72 
 
 
306 aa  185  7e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2932  transcriptional regulator, AraC family  40.89 
 
 
293 aa  182  6e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2507  transcriptional regulator, AraC family  38.75 
 
 
291 aa  180  2.9999999999999997e-44  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3318  AraC family transcriptional regulator  34.87 
 
 
287 aa  179  4e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.877504 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3175  helix-turn-helix domain-containing protein  34.87 
 
 
287 aa  179  4e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3174  helix-turn-helix domain-containing protein  34.87 
 
 
287 aa  179  4.999999999999999e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1196  transcriptional regulator, AraC family  34.87 
 
 
287 aa  179  4.999999999999999e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2337  AraC family transcriptional regulator  38.33 
 
 
289 aa  174  1.9999999999999998e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000580503  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2093  AraC family transcriptional regulator  32.97 
 
 
287 aa  171  1e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.369123  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0536  AraC family transcriptional regulator  35.86 
 
 
304 aa  169  4e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5208  AraC family transcriptional regulator  37.32 
 
 
314 aa  161  1e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.360222  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1881  transcriptional regulator, AraC family  36.84 
 
 
305 aa  160  2e-38  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.831794  normal  0.0117859 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2934  helix-turn-helix domain-containing protein  31.47 
 
 
310 aa  147  3e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0219137  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6617  transcriptional regulator, AraC family  33.91 
 
 
287 aa  146  4.0000000000000006e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.131937 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6041  transcriptional regulator, AraC family  39.18 
 
 
303 aa  104  2e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.331066 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1148  transcriptional regulator, AraC family  26.27 
 
 
309 aa  103  4e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0716  AraC family transcriptional regulator  25.76 
 
 
296 aa  101  2e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00193737 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0517  helix-turn-helix domain-containing protein  44.95 
 
 
180 aa  99.8  5e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.970363 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6068  AraC family transcriptional regulator  38.85 
 
 
287 aa  97.1  3e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2274  AraC family transcriptional regulator  38.86 
 
 
307 aa  97.4  3e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.348217  normal  0.470943 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4732  helix-turn-helix domain-containing protein  44.76 
 
 
293 aa  96.3  6e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0052536 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2401  transcriptional regulator, AraC family  45.69 
 
 
202 aa  94.4  2e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0085  transcriptional regulator, AraC family  27.47 
 
 
296 aa  94.4  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0195711 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2855  AraC family substrate binding transcriptional regulator  30.32 
 
 
280 aa  93.6  4e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.222069  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2383  AraC family transcriptional regulator  34.76 
 
 
281 aa  92.4  9e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.499508  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3312  AraC family transcriptional regulator  34.76 
 
 
281 aa  92.4  9e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.403912 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3482  AraC family transcriptional regulator  44.44 
 
 
299 aa  92  1e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.675068  normal  0.589184 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4318  AraC family transcriptional regulator  26.75 
 
 
305 aa  91.3  2e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00219342 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0624  AraC family transcriptional regulator  39.29 
 
 
299 aa  90.5  3e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.401422 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2282  putative transcriptional regulator  37.78 
 
 
294 aa  89.7  5e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0134  AraC family transcriptional regulator  32.56 
 
 
322 aa  89.7  5e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1989  AraC family transcriptional regulator  32.38 
 
 
277 aa  89.7  5e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.753386  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1111  transcriptional regulator, AraC family  40.87 
 
 
312 aa  89.7  6e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2981  AraC family transcriptional regulator  26.34 
 
 
305 aa  89.4  8e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42360  transcriptional regulator, AraC family  39.62 
 
 
318 aa  89.4  8e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0027  AraC family transcriptional regulator  33.82 
 
 
299 aa  89  1e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.618912  normal  0.0626425 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5215  helix-turn-helix domain-containing protein  29.36 
 
 
331 aa  88.6  1e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5000  AraC family transcriptional regulator  26.34 
 
 
305 aa  89  1e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5860  AraC family transcriptional regulator  26.34 
 
 
305 aa  89  1e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.499461  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1268  transcriptional regulator, AraC family  42.31 
 
 
300 aa  89  1e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1472  AraC family transcriptional regulator  30.59 
 
 
292 aa  87.8  2e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.327977  normal  0.780269 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3129  AraC family transcriptional regulator  30 
 
 
299 aa  88.2  2e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3089  helix-turn-helix domain-containing protein  31.47 
 
 
297 aa  88.2  2e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.830597 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1365  AraC family transcriptional regulator  28.82 
 
 
353 aa  88.2  2e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.122979  normal  0.036458 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5475  transcriptional regulator, AraC family  40.37 
 
 
305 aa  87.8  2e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.59164  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1960  AraC family transcriptional regulator  37.31 
 
 
143 aa  87.4  3e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4687  AraC family transcriptional regulator  37.58 
 
 
287 aa  86.7  5e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1895  AraC family transcriptional regulator  32.86 
 
 
277 aa  86.7  5e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1650  AraC family transcriptional regulator  32.56 
 
 
316 aa  86.7  5e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5827  helix-turn-helix domain-containing protein  32.21 
 
 
316 aa  86.3  6e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.112164  normal  0.283627 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3996  helix-turn-helix domain-containing protein  31.47 
 
 
289 aa  86.3  7e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3869  AraC family transcriptional regulator  28.73 
 
 
304 aa  85.9  8e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5093  AraC family transcriptional regulator  27.35 
 
 
301 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.467029 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29260  putative transcriptional regulator  34.59 
 
 
297 aa  85.5  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3971  putative transcriptional regulator  37.27 
 
 
272 aa  85.5  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.347316  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05505  putative transcription regulator protein  32.57 
 
 
270 aa  84.3  0.000000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0810  AraC family transcriptional regulator  35.34 
 
 
306 aa  84.7  0.000000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2736  AraC family transcriptional regulator  37.39 
 
 
154 aa  84.7  0.000000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.66637 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2469  AraC family transcriptional regulator  32.71 
 
 
361 aa  84  0.000000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3740  helix-turn-helix domain-containing protein  31.88 
 
 
301 aa  84  0.000000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.436963  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3976  helix-turn-helix domain-containing protein  38.32 
 
 
336 aa  83.6  0.000000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3359  AraC family transcriptional regulator  33.16 
 
 
285 aa  83.2  0.000000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5008  AraC family transcriptional regulator  33.16 
 
 
285 aa  83.2  0.000000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.896385 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3583  transcriptional regulator AraC family  38.52 
 
 
293 aa  82.8  0.000000000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>