More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1710b_3218 on replicon NC_007434
Organism: Burkholderia pseudomallei 1710b



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007434  BURPS1710b_3218  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 678 aa  1345    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000051538  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1909  AraC family transcriptional regulator  99.68 
 
 		 315 aa  640    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.190572  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0867  AraC family transcriptional regulator  99.68 
 
 		 315 aa  640    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000394258  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2701  AraC family transcriptional regulator  99.68 
 
 		 315 aa  640    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.137316  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3164  AraC family transcriptional regulator  99.1 
 
 		 332 aa  669    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0245945  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3203  AraC family transcriptional regulator  99.37 
 
 		 315 aa  638    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.10279  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2046  AraC family transcriptional regulator  99.31 
 
 		 291 aa  591  1e-167  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0173792  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0345  AraC family transcriptional regulator  83.06 
 
 		 311 aa  526  1e-148  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0798  AraC family transcriptional regulator  83.06 
 
 		 311 aa  527  1e-148  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0829  AraC family transcriptional regulator  83.06 
 
 		 311 aa  526  1e-148  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0210284  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3921  AraC family transcriptional regulator  82.52 
 
 		 311 aa  524  1e-147  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.892105 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2555  AraC family transcriptional regulator  82.2 
 
 		 311 aa  509  1e-143  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0725  AraC family transcriptional regulator  82.08 
 
 		 311 aa  499  1e-140  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.576949 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0708  AraC family transcriptional regulator  82.41 
 
 		 311 aa  498  1e-139  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1405  AraC family transcriptional regulator  95.56 
 
 		 251 aa  483  1e-135  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000697123  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4258  AraC family transcriptional regulator  69.69 
 
 		 327 aa  448  1.0000000000000001e-124  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6955  transcriptional regulator, AraC family  66.67 
 
 		 346 aa  434  1e-120  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.737934  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4324  transcriptional regulator, AraC family  47.28 
 
 		 305 aa  253  6e-66  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0282215 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4214  transcriptional regulator, AraC family  47.28 
 
 		 305 aa  253  6e-66  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05428  transcription regulator protein  49.82 
 
 		 324 aa  249  1e-64  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13470  AraC family transcriptional regulator  47.77 
 
 		 293 aa  245  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0899227  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1207  putative transcriptional regulator  47.39 
 
 		 293 aa  244  3e-63  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0932  AraC family transcriptional regulator  47.45 
 
 		 291 aa  242  1e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5332  AraC family transcriptional regulator  46.64 
 
 		 301 aa  238  2e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1041  helix-turn-helix, AraC type:Arac protein, arabinose-binding/dimerisation  47.45 
 
 		 291 aa  236  8e-61  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.29946 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5804  AraC family transcriptional regulator  45.64 
 
 		 305 aa  235  2.0000000000000002e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3238  AraC family transcriptional regulator  45.96 
 
 		 290 aa  229  1e-58  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.996927 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4464  helix-turn-helix domain-containing protein  46.93 
 
 		 291 aa  226  8e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4587  AraC family transcriptional regulator  46.57 
 
 		 291 aa  226  1e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.213128  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1213  transcriptional regulator, AraC family  45.26 
 
 		 291 aa  225  2e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4605  AraC family transcriptional regulator  46.21 
 
 		 291 aa  224  3e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0859  AraC family transcriptional regulator  46.21 
 
 		 291 aa  221  3e-56  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.775109  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1732  transcriptional regulator, AraC family  37.94 
 
 		 288 aa  189  2e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0803469 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6513  transcriptional regulator, AraC family  39.35 
 
 		 306 aa  183  9.000000000000001e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2907  transcriptional regulator, AraC family  37.37 
 
 		 289 aa  182  1e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0560618  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1196  transcriptional regulator, AraC family  36.33 
 
 		 287 aa  179  2e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3174  helix-turn-helix domain-containing protein  36.33 
 
 		 287 aa  179  2e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3318  AraC family transcriptional regulator  36.33 
 
 		 287 aa  179  2e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.877504 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1980  AraC family transcriptional regulator  36.17 
 
 		 293 aa  179  2e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.949603 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3175  helix-turn-helix domain-containing protein  36.33 
 
 		 287 aa  179  2e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2932  transcriptional regulator, AraC family  37.32 
 
 		 293 aa  171  5e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2413  transcriptional regulator, AraC family  35.84 
 
 		 322 aa  166  1.0000000000000001e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.333457  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0536  AraC family transcriptional regulator  35.46 
 
 		 304 aa  162  2e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2507  transcriptional regulator, AraC family  34.88 
 
 		 291 aa  159  1e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2093  AraC family transcriptional regulator  33.21 
 
 		 287 aa  157  5.0000000000000005e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.369123  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2337  AraC family transcriptional regulator  35.79 
 
 		 289 aa  155  2e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000580503  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1881  transcriptional regulator, AraC family  35.44 
 
 		 305 aa  145  3e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.831794  normal  0.0117859 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5208  AraC family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 314 aa  144  6e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.360222  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6617  transcriptional regulator, AraC family  34.39 
 
 		 287 aa  144  7e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.131937 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2934  helix-turn-helix domain-containing protein  32.57 
 
 		 310 aa  135  3e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0219137  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1148  transcriptional regulator, AraC family  26.29 
 
 		 309 aa  97.4  7e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0085  transcriptional regulator, AraC family  28.57 
 
 		 296 aa  92.8  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0195711 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6041  transcriptional regulator, AraC family  37.79 
 
 		 303 aa  91.3  5e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.331066 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0624  AraC family transcriptional regulator  36.14 
 
 		 299 aa  91.3  5e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.401422 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0517  helix-turn-helix domain-containing protein  42.86 
 
 		 180 aa  89.7  1e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.970363 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2401  transcriptional regulator, AraC family  45.37 
 
 		 202 aa  90.1  1e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2383  AraC family transcriptional regulator  35.41 
 
 		 281 aa  89.4  2e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.499508  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3312  AraC family transcriptional regulator  35.41 
 
 		 281 aa  89.4  2e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.403912 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3482  AraC family transcriptional regulator  41.41 
 
 		 299 aa  89.7  2e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.675068  normal  0.589184 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4732  helix-turn-helix domain-containing protein  41.9 
 
 		 293 aa  89.4  2e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0052536 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4318  AraC family transcriptional regulator  28.21 
 
 		 305 aa  88.6  3e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00219342 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1989  AraC family transcriptional regulator  34.93 
 
 		 277 aa  87.4  8e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.753386  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2274  AraC family transcriptional regulator  38.2 
 
 		 307 aa  87  0.000000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.348217  normal  0.470943 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5000  AraC family transcriptional regulator  27.43 
 
 		 305 aa  86.7  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5860  AraC family transcriptional regulator  27.43 
 
 		 305 aa  86.7  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.499461  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1895  AraC family transcriptional regulator  34.76 
 
 		 277 aa  87  0.000000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0027  AraC family transcriptional regulator  27.83 
 
 		 299 aa  84  0.000000000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.618912  normal  0.0626425 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2981  AraC family transcriptional regulator  27.35 
 
 		 305 aa  84  0.000000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1960  AraC family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 143 aa  83.2  0.00000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3327  AraC family transcriptional regulator  43.3 
 
 		 279 aa  83.6  0.00000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.414693  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3089  helix-turn-helix domain-containing protein  29.65 
 
 		 297 aa  83.6  0.00000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.830597 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3996  helix-turn-helix domain-containing protein  31.9 
 
 		 289 aa  83.6  0.00000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3869  AraC family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 304 aa  82.8  0.00000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4229  transcriptional regulator, AraC family  29.6 
 
 		 278 aa  82.8  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3976  helix-turn-helix domain-containing protein  37.5 
 
 		 336 aa  82  0.00000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2855  AraC family substrate binding transcriptional regulator  29.79 
 
 		 280 aa  82  0.00000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.222069  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5215  helix-turn-helix domain-containing protein  25.59 
 
 		 331 aa  81.6  0.00000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5342  AraC family transcriptional regulator  42.71 
 
 		 276 aa  81.3  0.00000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.975436  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3359  AraC family transcriptional regulator  33.16 
 
 		 285 aa  81.6  0.00000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0716  AraC family transcriptional regulator  28.04 
 
 		 296 aa  81.6  0.00000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00193737 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5093  AraC family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 301 aa  81.3  0.00000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.467029 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1650  AraC family transcriptional regulator  44.79 
 
 		 316 aa  81.6  0.00000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5008  AraC family transcriptional regulator  33.16 
 
 		 285 aa  81.6  0.00000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.896385 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0180  AraC family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 223 aa  81.3  0.00000000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5475  transcriptional regulator, AraC family  39.05 
 
 		 305 aa  80.5  0.00000000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.59164  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42360  transcriptional regulator, AraC family  34.06 
 
 		 318 aa  80.5  0.00000000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5610  AraC family transcriptional regulator  38.53 
 
 		 302 aa  80.5  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.00190409  normal  0.169642 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0589  AraC family transcriptional regulator  35 
 
 		 335 aa  80.1  0.0000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.564804  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5827  AraC family transcriptional regulator  38.53 
 
 		 302 aa  80.1  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2282  putative transcriptional regulator  39.18 
 
 		 294 aa  79.7  0.0000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6068  AraC family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 287 aa  79.7  0.0000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1268  transcriptional regulator, AraC family  38 
 
 		 300 aa  79  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2300  AraC family transcriptional regulator  28.66 
 
 		 274 aa  79.3  0.0000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.457981  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0210  AraC family transcriptional regulator  35.09 
 
 		 274 aa  79.3  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.85611 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1480  AraC family transcriptional regulator  39.81 
 
 		 306 aa  79.7  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.237942  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6349  AraC family transcriptional regulator  39.81 
 
 		 306 aa  79.7  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0502154  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7015  AraC family transcriptional regulator  39.81 
 
 		 306 aa  79.3  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0570551 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21720  AraC family transcriptional regulator  39.81 
 
 		 284 aa  78.6  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5279  AraC family transcriptional regulator  32.63 
 
 		 285 aa  79  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3975  helix-turn-helix domain-containing protein  38 
 
 		 302 aa  79  0.0000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>