More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_0716 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_0716  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 296 aa  611  9.999999999999999e-175  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00193737 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3129  AraC family transcriptional regulator  30.68 
 
 		 299 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2469  AraC family transcriptional regulator  30.96 
 
 		 361 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6513  transcriptional regulator, AraC family  31.29 
 
 		 306 aa  110  3e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2413  transcriptional regulator, AraC family  33.53 
 
 		 322 aa  109  5e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.333457  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6041  transcriptional regulator, AraC family  29.05 
 
 		 303 aa  109  6e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.331066 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2507  transcriptional regulator, AraC family  33.72 
 
 		 291 aa  108  1e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2907  transcriptional regulator, AraC family  30.84 
 
 		 289 aa  107  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0560618  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0536  AraC family transcriptional regulator  31.8 
 
 		 304 aa  105  8e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13470  AraC family transcriptional regulator  29.72 
 
 		 293 aa  103  5e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0899227  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1732  transcriptional regulator, AraC family  30.7 
 
 		 288 aa  102  8e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0803469 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0798  AraC family transcriptional regulator  25.76 
 
 		 311 aa  102  9e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0345  AraC family transcriptional regulator  25.76 
 
 		 311 aa  101  1e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0829  AraC family transcriptional regulator  25.76 
 
 		 311 aa  101  1e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0210284  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3921  AraC family transcriptional regulator  25.76 
 
 		 311 aa  101  2e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.892105 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2274  AraC family transcriptional regulator  27.39 
 
 		 307 aa  101  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.348217  normal  0.470943 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4732  helix-turn-helix domain-containing protein  47.57 
 
 		 293 aa  100  3e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0052536 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3740  helix-turn-helix domain-containing protein  29.37 
 
 		 301 aa  99.8  6e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.436963  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1650  AraC family transcriptional regulator  27.2 
 
 		 316 aa  99.4  7e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5215  helix-turn-helix domain-containing protein  27.93 
 
 		 331 aa  99  8e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0932  AraC family transcriptional regulator  30.7 
 
 		 291 aa  99  9e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4605  AraC family transcriptional regulator  32.76 
 
 		 291 aa  98.6  1e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1980  AraC family transcriptional regulator  28.06 
 
 		 293 aa  98.2  1e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.949603 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1196  transcriptional regulator, AraC family  27.31 
 
 		 287 aa  97.4  2e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1207  putative transcriptional regulator  28.17 
 
 		 293 aa  97.8  2e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3318  AraC family transcriptional regulator  27.31 
 
 		 287 aa  97.4  2e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.877504 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2932  transcriptional regulator, AraC family  29.05 
 
 		 293 aa  97.8  2e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3175  helix-turn-helix domain-containing protein  27.31 
 
 		 287 aa  97.4  2e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3174  helix-turn-helix domain-containing protein  27.31 
 
 		 287 aa  97.4  2e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4258  AraC family transcriptional regulator  26.42 
 
 		 327 aa  97.4  3e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1472  AraC family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 292 aa  97.4  3e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.327977  normal  0.780269 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2337  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 289 aa  96.7  4e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000580503  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1881  transcriptional regulator, AraC family  29.69 
 
 		 305 aa  96.7  4e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.831794  normal  0.0117859 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5827  helix-turn-helix domain-containing protein  29.46 
 
 		 316 aa  96.7  4e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.112164  normal  0.283627 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4464  helix-turn-helix domain-containing protein  32.18 
 
 		 291 aa  96.7  4e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1148  transcriptional regulator, AraC family  28.44 
 
 		 309 aa  96.7  4e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1041  helix-turn-helix, AraC type:Arac protein, arabinose-binding/dimerisation  28.77 
 
 		 291 aa  95.9  6e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.29946 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7634  transcriptional regulator AraC family  29.39 
 
 		 304 aa  95.9  7e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.63081  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3840  Ada regulatory protein/6-O-methylguanine-DNA methyltransferase  38.39 
 
 		 198 aa  95.1  1e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0758  AraC family transcriptional regulator  26.48 
 
 		 299 aa  94.4  2e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6955  transcriptional regulator, AraC family  29.63 
 
 		 346 aa  94.4  2e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.737934  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2555  AraC family transcriptional regulator  26.44 
 
 		 311 aa  94.7  2e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1459  Ada regulatory protein/6-O-methylguanine-DNA methyltransferase  38.39 
 
 		 198 aa  94  3e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000164097 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4587  AraC family transcriptional regulator  27.31 
 
 		 291 aa  94  3e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.213128  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05505  putative transcription regulator protein  41.51 
 
 		 270 aa  93.2  5e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5475  transcriptional regulator, AraC family  26.06 
 
 		 305 aa  92.4  8e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.59164  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0859  AraC family transcriptional regulator  26.51 
 
 		 291 aa  91.7  1e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.775109  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3417  AraC family transcriptional regulator  27.13 
 
 		 299 aa  92  1e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.138414  normal  0.441033 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1213  transcriptional regulator, AraC family  27.31 
 
 		 291 aa  91.3  2e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4632  AraC family transcriptional regulator  24.75 
 
 		 316 aa  91.3  2e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.569454  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1318  AraC family transcriptional regulator  26.8 
 
 		 294 aa  90.9  2e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.761239  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3238  AraC family transcriptional regulator  28.04 
 
 		 290 aa  90.9  2e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.996927 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3497  AraC family transcriptional regulator  36.61 
 
 		 198 aa  90.1  3e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.27794  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0867  AraC family transcriptional regulator  24.07 
 
 		 315 aa  89  8e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000394258  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2701  AraC family transcriptional regulator  24.07 
 
 		 315 aa  89  8e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.137316  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1909  AraC family transcriptional regulator  24.07 
 
 		 315 aa  89  8e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.190572  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3869  AraC family transcriptional regulator  24.6 
 
 		 304 aa  88.2  1e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3164  AraC family transcriptional regulator  24.07 
 
 		 332 aa  88.2  1e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0245945  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3203  AraC family transcriptional regulator  24.07 
 
 		 315 aa  88.2  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.10279  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2282  putative transcriptional regulator  28.02 
 
 		 294 aa  88.2  1e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4098  AraC family transcriptional regulator  39.81 
 
 		 280 aa  88.2  1e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00424275 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5108  AraC family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 316 aa  87.8  2e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.310256  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3361  helix-turn-helix domain-containing protein  44.9 
 
 		 160 aa  87.8  2e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0583  AraC family transcriptional regulator  30.88 
 
 		 312 aa  87.4  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.98908  normal  0.54842 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2453  AraC family transcriptional regulator  27.8 
 
 		 279 aa  88.2  2e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  unclonable  0.00000000000537916  normal  0.591211 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3751  Ada regulatory protein/6-O-methylguanine-DNA methyltransferase  35.71 
 
 		 198 aa  88.2  2e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000128468 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3068  AraC family transcriptional regulator  39.85 
 
 		 276 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.210951  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5332  AraC family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 301 aa  87.4  3e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0971  AraC family transcriptional regulator  35.64 
 
 		 136 aa  87.4  3e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000205729  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2093  AraC family transcriptional regulator  28.22 
 
 		 287 aa  87  3e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.369123  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2719  AraC family transcriptional regulator  36.61 
 
 		 276 aa  87.4  3e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.894112  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2046  AraC family transcriptional regulator  25.19 
 
 		 291 aa  86.7  4e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0173792  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3996  helix-turn-helix domain-containing protein  39.62 
 
 		 289 aa  86.7  5e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4172  AraC family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 295 aa  86.3  6e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0833223  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2388  AraC family transcriptional regulator  43.56 
 
 		 278 aa  85.9  7e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.262251  unclonable  0.0000340178 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3788  Ada regulatory protein/6-O-methylguanine-DNA methyltransferase  34.82 
 
 		 198 aa  85.9  8e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2736  AraC family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 154 aa  85.5  9e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.66637 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3485  AraC family transcriptional regulator  34.82 
 
 		 198 aa  85.5  9e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.781082  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0810  AraC family transcriptional regulator  28.45 
 
 		 306 aa  85.5  9e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05428  transcription regulator protein  28.64 
 
 		 324 aa  84.7  0.000000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3585  Ada regulatory protein/6-O-methylguanine-DNA methyltransferase  34.82 
 
 		 198 aa  85.5  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51400  transcriptional regulator AraC family  28.36 
 
 		 310 aa  85.5  0.000000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3869  Ada regulatory protein/6-O-methylguanine-DNA methyltransferase  34.82 
 
 		 198 aa  85.5  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1357  transcriptional regulator, AraC family  35.98 
 
 		 277 aa  85.1  0.000000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.193095  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1524  transcriptional regulator, AraC family  28.14 
 
 		 301 aa  85.5  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.753144  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5804  AraC family transcriptional regulator  30.06 
 
 		 305 aa  85.1  0.000000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4744  transcriptional regulator, AraC family  42 
 
 		 157 aa  85.5  0.000000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.235772  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5122  transcriptional regulator AraC family  40 
 
 		 314 aa  85.5  0.000000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.962416  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0572  AraC family transcriptional regulator  29.3 
 
 		 300 aa  85.5  0.000000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1111  transcriptional regulator, AraC family  27.88 
 
 		 312 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3772  Ada regulatory protein/6-O-methylguanine-DNA methyltransferase  34.82 
 
 		 198 aa  84.3  0.000000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3305  two component transcriptional regulator, AraC family  37.62 
 
 		 513 aa  84.3  0.000000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2300  AraC family transcriptional regulator  29.7 
 
 		 274 aa  84.3  0.000000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.457981  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0983  helix-turn-helix domain-containing protein  28.92 
 
 		 295 aa  84.3  0.000000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0085  transcriptional regulator, AraC family  26.45 
 
 		 296 aa  84.3  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0195711 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3612  helix-turn-helix domain-containing protein  43.88 
 
 		 144 aa  84.7  0.000000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.812981  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1509  transcriptional regulator AraC family  36.59 
 
 		 284 aa  84.3  0.000000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0719  transcriptional regulator, AraC family  39.81 
 
 		 281 aa  84  0.000000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5694  AraC family transcriptional regulator  23.23 
 
 		 319 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.730665  normal  0.260224 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2139  helix-turn-helix domain-containing protein  27.34 
 
 		 294 aa  83.6  0.000000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.957349  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>