More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_1318 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007802  Jann_1318  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 294 aa  603  9.999999999999999e-173  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.761239  normal  1 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4172  AraC family transcriptional regulator  76.19 
 
 		 295 aa  468  1.0000000000000001e-131  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0833223  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3869  AraC family transcriptional regulator  26.96 
 
 		 304 aa  122  9e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1148  transcriptional regulator, AraC family  27.38 
 
 		 309 aa  121  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0027  AraC family transcriptional regulator  26.86 
 
 		 299 aa  117  3e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.618912  normal  0.0626425 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0085  transcriptional regulator, AraC family  25.89 
 
 		 296 aa  116  3.9999999999999997e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0195711 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1041  helix-turn-helix, AraC type:Arac protein, arabinose-binding/dimerisation  31.36 
 
 		 291 aa  100  2e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.29946 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0082  transcriptional regulator, AraC family  33.17 
 
 		 292 aa  101  2e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.628575  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3417  AraC family transcriptional regulator  32.07 
 
 		 299 aa  100  3e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.138414  normal  0.441033 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2981  AraC family transcriptional regulator  29.5 
 
 		 305 aa  99  8e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0536  AraC family transcriptional regulator  37.76 
 
 		 304 aa  99  8e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7037  AraC family transcriptional regulator  34.18 
 
 		 301 aa  97.8  2e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.283867  normal  0.289972 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2907  transcriptional regulator, AraC family  32.76 
 
 		 289 aa  97.8  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0560618  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2413  transcriptional regulator, AraC family  37.32 
 
 		 322 aa  97.1  3e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.333457  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4318  AraC family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 305 aa  97.4  3e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00219342 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1458  AraC family transcriptional regulator  34.18 
 
 		 301 aa  97.4  3e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1365  AraC family transcriptional regulator  32.59 
 
 		 353 aa  97.1  3e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.122979  normal  0.036458 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6370  AraC family transcriptional regulator  34.18 
 
 		 301 aa  97.4  3e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5000  AraC family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 305 aa  96.3  5e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5860  AraC family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 305 aa  96.3  5e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.499461  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4605  AraC family transcriptional regulator  29.57 
 
 		 291 aa  96.3  6e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6513  transcriptional regulator, AraC family  31.82 
 
 		 306 aa  96.3  6e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5093  AraC family transcriptional regulator  29.21 
 
 		 301 aa  95.9  7e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.467029 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6041  transcriptional regulator, AraC family  28.85 
 
 		 303 aa  95.9  8e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.331066 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4587  AraC family transcriptional regulator  29.57 
 
 		 291 aa  95.5  9e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.213128  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3244  AraC family transcriptional regulator  29.21 
 
 		 301 aa  95.5  1e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.432164 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3089  helix-turn-helix domain-containing protein  27.6 
 
 		 297 aa  94  3e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.830597 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2379  AraC family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 304 aa  92.8  6e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0538221  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2577  transcriptional regulator, AraC family  31.13 
 
 		 298 aa  92.8  6e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.996426  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1213  transcriptional regulator, AraC family  31.78 
 
 		 291 aa  92.4  7e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0932  AraC family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 291 aa  92  1e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4464  helix-turn-helix domain-containing protein  28.7 
 
 		 291 aa  91.7  1e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1472  AraC family transcriptional regulator  36.25 
 
 		 292 aa  91.7  1e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.327977  normal  0.780269 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0716  AraC family transcriptional regulator  26.8 
 
 		 296 aa  90.9  2e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00193737 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4223  transcriptional regulator, AraC family  30.25 
 
 		 299 aa  90.5  3e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4111  transcriptional regulator, AraC family  30.25 
 
 		 299 aa  90.5  3e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.596036  normal  0.240547 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3689  AraC family transcriptional regulator  26.19 
 
 		 303 aa  90.5  3e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1207  putative transcriptional regulator  29.78 
 
 		 293 aa  90.5  3e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1732  transcriptional regulator, AraC family  29.91 
 
 		 288 aa  90.1  4e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0803469 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2139  helix-turn-helix domain-containing protein  30.32 
 
 		 294 aa  89.4  6e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.957349  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4229  transcriptional regulator, AraC family  28.98 
 
 		 278 aa  89.4  7e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0859  AraC family transcriptional regulator  33.1 
 
 		 291 aa  89  9e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.775109  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3996  helix-turn-helix domain-containing protein  27.65 
 
 		 289 aa  88.2  1e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2282  putative transcriptional regulator  25.09 
 
 		 294 aa  87.4  2e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2369  transcriptional regulator  41.67 
 
 		 368 aa  87.8  2e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3162  AraC family transcriptional regulator  31.05 
 
 		 285 aa  87.8  2e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3475  helix-turn-helix domain-containing protein  33.54 
 
 		 292 aa  88.2  2e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5827  helix-turn-helix domain-containing protein  24.1 
 
 		 316 aa  87  3e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.112164  normal  0.283627 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1673  AraC family transcriptional regulator  29.25 
 
 		 314 aa  87  3e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.310754 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1268  transcriptional regulator, AraC family  31.85 
 
 		 300 aa  86.7  4e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0758  AraC family transcriptional regulator  25.95 
 
 		 299 aa  86.3  6e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2507  transcriptional regulator, AraC family  34.56 
 
 		 291 aa  86.3  6e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5245  AraC family transcriptional regulator  29.39 
 
 		 312 aa  86.3  6e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2934  helix-turn-helix domain-containing protein  29.1 
 
 		 310 aa  86.3  6e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0219137  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13470  AraC family transcriptional regulator  39.05 
 
 		 293 aa  85.9  7e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0899227  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2274  AraC family transcriptional regulator  29.25 
 
 		 307 aa  85.9  8e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.348217  normal  0.470943 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3129  AraC family transcriptional regulator  26.75 
 
 		 299 aa  85.9  8e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6285  transcriptional regulator, AraC family  41.12 
 
 		 287 aa  85.5  9e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.671161  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1853  transcriptional regulator, AraC family  31.94 
 
 		 294 aa  85.1  0.000000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.801816 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6068  AraC family transcriptional regulator  31.54 
 
 		 287 aa  84.7  0.000000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3740  helix-turn-helix domain-containing protein  32.12 
 
 		 301 aa  85.1  0.000000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.436963  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4732  helix-turn-helix domain-containing protein  37.21 
 
 		 293 aa  85.1  0.000000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0052536 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1754  transcriptional regulator, AraC family  26.05 
 
 		 308 aa  85.5  0.000000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1047  AraC family transcriptional regulator  36 
 
 		 285 aa  85.5  0.000000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2932  transcriptional regulator, AraC family  33.09 
 
 		 293 aa  84.7  0.000000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3156  AraC family transcriptional regulator  23.38 
 
 		 283 aa  84.3  0.000000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1692  AraC family transcriptional regulator  39.2 
 
 		 351 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000028699  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2719  AraC family transcriptional regulator  29.21 
 
 		 276 aa  84.3  0.000000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.894112  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0033  transcriptional regulator, AraC family  45.16 
 
 		 281 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1980  AraC family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 293 aa  84  0.000000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.949603 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3238  AraC family transcriptional regulator  29.82 
 
 		 290 aa  84  0.000000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.996927 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1524  transcriptional regulator, AraC family  29.01 
 
 		 301 aa  83.6  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.753144  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0125  transcriptional regulator, AraC family  36.46 
 
 		 300 aa  84  0.000000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4978  transcriptional regulator, AraC family  27.21 
 
 		 318 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.327567  normal  0.11746 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1688  AraC family transcriptional regulator  37.07 
 
 		 280 aa  83.2  0.000000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0180  AraC family transcriptional regulator  37.89 
 
 		 223 aa  82.8  0.000000000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3583  transcriptional regulator AraC family  41.9 
 
 		 293 aa  82.8  0.000000000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4258  AraC family transcriptional regulator  29.95 
 
 		 327 aa  82.8  0.000000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3327  AraC family transcriptional regulator  30.51 
 
 		 279 aa  82.4  0.000000000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.414693  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2634  AraC family transcriptional regulator  28.47 
 
 		 204 aa  82.4  0.000000000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2537  AraC family transcriptional regulator  32.68 
 
 		 312 aa  82.4  0.000000000000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3933  AraC family transcriptional regulator  39.8 
 
 		 337 aa  82.4  0.000000000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3361  helix-turn-helix domain-containing protein  39.58 
 
 		 160 aa  82  0.000000000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3975  helix-turn-helix domain-containing protein  32.62 
 
 		 302 aa  82  0.00000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0224  response regulator receiver protein  32.32 
 
 		 537 aa  81.6  0.00000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1089  helix-turn-helix domain-containing protein  29 
 
 		 298 aa  81.6  0.00000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.99301  hitchhiker  0.00294409 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1279  helix-turn-helix domain-containing protein  36.73 
 
 		 306 aa  81.3  0.00000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.665979 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2736  AraC family transcriptional regulator  31.39 
 
 		 154 aa  81.6  0.00000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.66637 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1312  transcriptional regulator, AraC family  33.53 
 
 		 338 aa  80.9  0.00000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00374343  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2212  AraC family transcriptional regulator  35.05 
 
 		 302 aa  80.9  0.00000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2390  AraC family transcriptional regulator  38.6 
 
 		 196 aa  80.9  0.00000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.245348  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0624  AraC family transcriptional regulator  27.1 
 
 		 299 aa  81.3  0.00000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.401422 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2093  AraC family transcriptional regulator  33.09 
 
 		 287 aa  80.9  0.00000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.369123  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6135  transcriptional regulator, AraC family  28.78 
 
 		 305 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1543  transcriptional regulator, AraC family  28.76 
 
 		 300 aa  80.5  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06279  hypothetical protein  31.28 
 
 		 275 aa  80.5  0.00000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6717  transcriptional regulator, AraC family  38.61 
 
 		 296 aa  80.5  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.121518  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1852  putative transcriptional regulator  32.37 
 
 		 284 aa  80.5  0.00000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.687343  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1056  AraC family transcriptional regulator  35.92 
 
 		 306 aa  79.7  0.00000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000221071  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1596  transcriptional regulator, AraC family  25.55 
 
 		 287 aa  79.7  0.00000000000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>