More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_6513 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_6513  transcriptional regulator, AraC family  100 
 
 		 306 aa  619  1e-176  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1732  transcriptional regulator, AraC family  67.72 
 
 		 288 aa  396  1e-109  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0803469 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2907  transcriptional regulator, AraC family  61.54 
 
 		 289 aa  370  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0560618  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1041  helix-turn-helix, AraC type:Arac protein, arabinose-binding/dimerisation  44.81 
 
 		 291 aa  233  3e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.29946 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4605  AraC family transcriptional regulator  44.69 
 
 		 291 aa  229  4e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4464  helix-turn-helix domain-containing protein  44.32 
 
 		 291 aa  228  8e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3238  AraC family transcriptional regulator  44.72 
 
 		 290 aa  226  3e-58  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.996927 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0932  AraC family transcriptional regulator  43.49 
 
 		 291 aa  226  4e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4587  AraC family transcriptional regulator  43.87 
 
 		 291 aa  225  9e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.213128  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1207  putative transcriptional regulator  45.29 
 
 		 293 aa  224  2e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13470  AraC family transcriptional regulator  45.49 
 
 		 293 aa  223  4e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0899227  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1213  transcriptional regulator, AraC family  43.12 
 
 		 291 aa  222  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0859  AraC family transcriptional regulator  42.59 
 
 		 291 aa  222  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.775109  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5804  AraC family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 305 aa  213  2.9999999999999995e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05428  transcription regulator protein  43.25 
 
 		 324 aa  213  4.9999999999999996e-54  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4324  transcriptional regulator, AraC family  43.66 
 
 		 305 aa  211  1e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0282215 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4214  transcriptional regulator, AraC family  43.66 
 
 		 305 aa  211  1e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5332  AraC family transcriptional regulator  42.76 
 
 		 301 aa  208  1e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0536  AraC family transcriptional regulator  44.2 
 
 		 304 aa  206  3e-52  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3164  AraC family transcriptional regulator  39.5 
 
 		 332 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0245945  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2046  AraC family transcriptional regulator  39.5 
 
 		 291 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0173792  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1909  AraC family transcriptional regulator  39.5 
 
 		 315 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.190572  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0867  AraC family transcriptional regulator  39.5 
 
 		 315 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000394258  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2701  AraC family transcriptional regulator  39.5 
 
 		 315 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.137316  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3203  AraC family transcriptional regulator  39.5 
 
 		 315 aa  200  3e-50  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.10279  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1980  AraC family transcriptional regulator  38.93 
 
 		 293 aa  199  3.9999999999999996e-50  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.949603 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3921  AraC family transcriptional regulator  39.72 
 
 		 311 aa  196  3e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.892105 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0345  AraC family transcriptional regulator  39.72 
 
 		 311 aa  195  7e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0829  AraC family transcriptional regulator  39.72 
 
 		 311 aa  195  7e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0210284  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0798  AraC family transcriptional regulator  39.36 
 
 		 311 aa  195  8.000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3218  AraC family transcriptional regulator  39.35 
 
 		 678 aa  194  1e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000051538  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2934  helix-turn-helix domain-containing protein  38.49 
 
 		 310 aa  192  5e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0219137  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6617  transcriptional regulator, AraC family  40.2 
 
 		 287 aa  190  2e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.131937 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2932  transcriptional regulator, AraC family  40.23 
 
 		 293 aa  189  4e-47  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2507  transcriptional regulator, AraC family  37.68 
 
 		 291 aa  189  5.999999999999999e-47  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1405  AraC family transcriptional regulator  40.33 
 
 		 251 aa  186  5e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000697123  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2555  AraC family transcriptional regulator  39.5 
 
 		 311 aa  183  4.0000000000000006e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2413  transcriptional regulator, AraC family  38.25 
 
 		 322 aa  182  5.0000000000000004e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.333457  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1881  transcriptional regulator, AraC family  41.13 
 
 		 305 aa  182  5.0000000000000004e-45  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.831794  normal  0.0117859 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0725  AraC family transcriptional regulator  39.5 
 
 		 311 aa  181  1e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.576949 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0708  AraC family transcriptional regulator  39.5 
 
 		 311 aa  181  1e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6955  transcriptional regulator, AraC family  35.94 
 
 		 346 aa  181  2e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.737934  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4258  AraC family transcriptional regulator  36.3 
 
 		 327 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2337  AraC family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 289 aa  177  2e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000580503  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1196  transcriptional regulator, AraC family  33.21 
 
 		 287 aa  176  3e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3174  helix-turn-helix domain-containing protein  33.21 
 
 		 287 aa  176  4e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3175  helix-turn-helix domain-containing protein  32.85 
 
 		 287 aa  175  7e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3318  AraC family transcriptional regulator  32.85 
 
 		 287 aa  175  7e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.877504 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2093  AraC family transcriptional regulator  33.81 
 
 		 287 aa  161  1e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.369123  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5208  AraC family transcriptional regulator  36.88 
 
 		 314 aa  157  2e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.360222  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0716  AraC family transcriptional regulator  31.66 
 
 		 296 aa  119  7e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00193737 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1148  transcriptional regulator, AraC family  32.08 
 
 		 309 aa  118  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1472  AraC family transcriptional regulator  35.89 
 
 		 292 aa  117  3e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.327977  normal  0.780269 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5827  helix-turn-helix domain-containing protein  33.18 
 
 		 316 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.112164  normal  0.283627 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1111  transcriptional regulator, AraC family  49.53 
 
 		 312 aa  107  3e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1524  transcriptional regulator, AraC family  47.75 
 
 		 301 aa  103  4e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.753144  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4732  helix-turn-helix domain-containing protein  32.97 
 
 		 293 aa  103  5e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0052536 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1318  AraC family transcriptional regulator  31.48 
 
 		 294 aa  102  8e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.761239  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4111  transcriptional regulator, AraC family  35.58 
 
 		 299 aa  100  3e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.596036  normal  0.240547 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4223  transcriptional regulator, AraC family  35.58 
 
 		 299 aa  100  3e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3089  helix-turn-helix domain-containing protein  30.22 
 
 		 297 aa  100  3e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.830597 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4172  AraC family transcriptional regulator  30.7 
 
 		 295 aa  99.8  5e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0833223  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0085  transcriptional regulator, AraC family  41.86 
 
 		 296 aa  98.6  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0195711 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6285  transcriptional regulator, AraC family  48.98 
 
 		 287 aa  97.8  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.671161  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3996  helix-turn-helix domain-containing protein  33.18 
 
 		 289 aa  97.1  3e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42360  transcriptional regulator, AraC family  36.03 
 
 		 318 aa  96.3  5e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0082  transcriptional regulator, AraC family  48.57 
 
 		 292 aa  96.3  6e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.628575  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5108  AraC family transcriptional regulator  44.14 
 
 		 316 aa  95.5  9e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.310256  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0758  AraC family transcriptional regulator  29.07 
 
 		 299 aa  95.5  1e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4318  AraC family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 305 aa  95.1  1e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00219342 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5000  AraC family transcriptional regulator  30 
 
 		 305 aa  94.4  2e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5860  AraC family transcriptional regulator  30 
 
 		 305 aa  94.4  2e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.499461  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6717  transcriptional regulator, AraC family  33.92 
 
 		 296 aa  94  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.121518  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2139  helix-turn-helix domain-containing protein  34.1 
 
 		 294 aa  94  3e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.957349  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4632  AraC family transcriptional regulator  45.71 
 
 		 316 aa  93.6  4e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.569454  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0624  AraC family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 299 aa  93.6  4e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.401422 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3475  helix-turn-helix domain-containing protein  31.78 
 
 		 292 aa  93.2  5e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6068  AraC family transcriptional regulator  44.35 
 
 		 287 aa  92.8  7e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5093  AraC family transcriptional regulator  29.25 
 
 		 301 aa  92.4  7e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.467029 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0983  helix-turn-helix domain-containing protein  30.67 
 
 		 295 aa  92.8  7e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1268  transcriptional regulator, AraC family  39.1 
 
 		 300 aa  92.8  7e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4229  transcriptional regulator, AraC family  33.04 
 
 		 278 aa  92.4  8e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2981  AraC family transcriptional regulator  29.61 
 
 		 305 aa  92.4  9e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3361  helix-turn-helix domain-containing protein  45.69 
 
 		 160 aa  92  1e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7037  AraC family transcriptional regulator  44.34 
 
 		 301 aa  91.7  1e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.283867  normal  0.289972 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7634  transcriptional regulator AraC family  28.77 
 
 		 304 aa  90.9  2e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.63081  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1458  AraC family transcriptional regulator  44.34 
 
 		 301 aa  91.7  2e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3244  AraC family transcriptional regulator  29.61 
 
 		 301 aa  91.7  2e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.432164 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6370  AraC family transcriptional regulator  44.34 
 
 		 301 aa  91.7  2e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2537  AraC family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 312 aa  90.9  2e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1543  transcriptional regulator, AraC family  44.33 
 
 		 300 aa  90.9  3e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1365  AraC family transcriptional regulator  31.33 
 
 		 353 aa  90.5  3e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.122979  normal  0.036458 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2401  transcriptional regulator, AraC family  40.88 
 
 		 202 aa  90.5  3e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1537  transcriptional regulator, AraC family  29.25 
 
 		 282 aa  90.9  3e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.164062  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5245  AraC family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 312 aa  90.1  4e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1960  AraC family transcriptional regulator  41.28 
 
 		 143 aa  90.1  4e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0517  helix-turn-helix domain-containing protein  41.51 
 
 		 180 aa  89  8e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.970363 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3971  putative transcriptional regulator  40.32 
 
 		 272 aa  89  1e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.347316  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2883  AraC family transcriptional regulator  42.64 
 
 		 307 aa  88.2  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.858803 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5475  transcriptional regulator, AraC family  37.41 
 
 		 305 aa  87.8  2e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.59164  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>