More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_0810 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_0810  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 306 aa  617  1e-176  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3971  putative transcriptional regulator  34.94 
 
 		 272 aa  106  4e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.347316  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29260  putative transcriptional regulator  34.94 
 
 		 297 aa  106  5e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2379  AraC family transcriptional regulator  39.26 
 
 		 304 aa  103  3e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0538221  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0624  AraC family transcriptional regulator  31.79 
 
 		 299 aa  103  4e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.401422 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2139  helix-turn-helix domain-containing protein  33.67 
 
 		 294 aa  103  5e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.957349  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6041  transcriptional regulator, AraC family  40.88 
 
 		 303 aa  101  1e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.331066 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1480  AraC family transcriptional regulator  34.18 
 
 		 306 aa  100  2e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.237942  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6349  AraC family transcriptional regulator  34.18 
 
 		 306 aa  100  2e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0502154  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7015  AraC family transcriptional regulator  34.18 
 
 		 306 aa  100  2e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0570551 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1524  transcriptional regulator, AraC family  30.46 
 
 		 301 aa  101  2e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.753144  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4632  AraC family transcriptional regulator  30.41 
 
 		 316 aa  100  3e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.569454  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1980  RC149  32.32 
 
 		 308 aa  100  4e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.421398  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1881  transcriptional regulator, AraC family  34.2 
 
 		 305 aa  100  4e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.831794  normal  0.0117859 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0588  AraC family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 308 aa  100  4e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0536  AraC family transcriptional regulator  32.42 
 
 		 304 aa  99  8e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0681  AraC family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 306 aa  99.4  8e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42360  transcriptional regulator, AraC family  33.74 
 
 		 318 aa  99  1e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5827  AraC family transcriptional regulator  35.4 
 
 		 302 aa  97.4  2e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6135  transcriptional regulator, AraC family  40.6 
 
 		 305 aa  97.1  3e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5610  AraC family transcriptional regulator  34.81 
 
 		 302 aa  96.7  5e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.00190409  normal  0.169642 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3583  transcriptional regulator AraC family  35.18 
 
 		 293 aa  95.5  9e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6717  transcriptional regulator, AraC family  33.33 
 
 		 296 aa  95.1  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.121518  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1213  transcriptional regulator, AraC family  32.88 
 
 		 291 aa  94.7  2e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3238  AraC family transcriptional regulator  30.47 
 
 		 290 aa  94  3e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.996927 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4513  transcriptional regulator, AraC family  43.24 
 
 		 133 aa  93.6  4e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5694  AraC family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 319 aa  93.6  4e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.730665  normal  0.260224 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7037  AraC family transcriptional regulator  31.07 
 
 		 301 aa  93.2  5e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.283867  normal  0.289972 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0027  AraC family transcriptional regulator  33.76 
 
 		 299 aa  93.2  5e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.618912  normal  0.0626425 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1458  AraC family transcriptional regulator  31.07 
 
 		 301 aa  93.2  5e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6370  AraC family transcriptional regulator  31.07 
 
 		 301 aa  93.2  5e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1041  helix-turn-helix, AraC type:Arac protein, arabinose-binding/dimerisation  32.35 
 
 		 291 aa  92.8  6e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.29946 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0210  AraC family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 274 aa  92  1e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.85611 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0758  AraC family transcriptional regulator  27.97 
 
 		 299 aa  92  1e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2274  AraC family transcriptional regulator  32.21 
 
 		 307 aa  92  1e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.348217  normal  0.470943 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3689  AraC family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 303 aa  91.7  1e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4645  transcriptional regulator, AraC family  42.72 
 
 		 112 aa  92  1e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0412729 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1981  AraC family transcriptional regulator  35.54 
 
 		 384 aa  91.7  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.382238  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5716  AraC family transcriptional regulator  34.55 
 
 		 304 aa  91.3  2e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1537  transcriptional regulator, AraC family  30.25 
 
 		 282 aa  91.7  2e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.164062  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0682  AraC family transcriptional regulator  35.54 
 
 		 300 aa  91.3  2e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2413  transcriptional regulator, AraC family  30.41 
 
 		 322 aa  90.9  3e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.333457  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0589  AraC family transcriptional regulator  35.67 
 
 		 300 aa  90.5  3e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2507  transcriptional regulator, AraC family  29.22 
 
 		 291 aa  90.1  4e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0134  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 322 aa  89.7  6e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4732  helix-turn-helix domain-containing protein  38.52 
 
 		 293 aa  88.6  1e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0052536 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0983  helix-turn-helix domain-containing protein  32.37 
 
 		 295 aa  89  1e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1365  AraC family transcriptional regulator  31.06 
 
 		 353 aa  88.6  1e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.122979  normal  0.036458 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1980  AraC family transcriptional regulator  26.04 
 
 		 293 aa  89  1e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.949603 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3975  helix-turn-helix domain-containing protein  36.49 
 
 		 302 aa  89  1e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5332  AraC family transcriptional regulator  30.31 
 
 		 301 aa  88.2  2e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4587  AraC family transcriptional regulator  30.9 
 
 		 291 aa  88.2  2e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.213128  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1279  helix-turn-helix domain-containing protein  34.56 
 
 		 306 aa  87.4  2e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.665979 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0574  AraC family transcriptional regulator  29.21 
 
 		 311 aa  87.8  2e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0798057  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1960  AraC family transcriptional regulator  39.47 
 
 		 143 aa  87.4  3e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5475  transcriptional regulator, AraC family  31.15 
 
 		 305 aa  87.4  3e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.59164  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3482  AraC family transcriptional regulator  28.52 
 
 		 299 aa  87  4e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.675068  normal  0.589184 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0859  AraC family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 291 aa  86.7  5e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.775109  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3869  AraC family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 304 aa  86.3  6e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1549  transcriptional regulator, AraC family  38.89 
 
 		 316 aa  85.9  9e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0143415  hitchhiker  0.00302933 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4464  helix-turn-helix domain-containing protein  31.47 
 
 		 291 aa  85.5  0.000000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7634  transcriptional regulator AraC family  25.27 
 
 		 304 aa  85.5  0.000000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.63081  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0716  AraC family transcriptional regulator  28.45 
 
 		 296 aa  85.5  0.000000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00193737 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0798  AraC family transcriptional regulator  29.05 
 
 		 311 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3740  helix-turn-helix domain-containing protein  32.06 
 
 		 301 aa  85.1  0.000000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.436963  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0085  transcriptional regulator, AraC family  33.59 
 
 		 296 aa  85.5  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0195711 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5827  helix-turn-helix domain-containing protein  27.57 
 
 		 316 aa  85.1  0.000000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.112164  normal  0.283627 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4605  AraC family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 291 aa  84.7  0.000000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3318  AraC family transcriptional regulator  25.75 
 
 		 287 aa  84.3  0.000000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.877504 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3921  AraC family transcriptional regulator  29.05 
 
 		 311 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.892105 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0180  AraC family transcriptional regulator  29.56 
 
 		 223 aa  84.7  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0345  AraC family transcriptional regulator  35.34 
 
 		 311 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1196  transcriptional regulator, AraC family  25.75 
 
 		 287 aa  84.3  0.000000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3174  helix-turn-helix domain-containing protein  25.75 
 
 		 287 aa  84.3  0.000000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0829  AraC family transcriptional regulator  35.34 
 
 		 311 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0210284  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1650  AraC family transcriptional regulator  33.59 
 
 		 316 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3295  transcriptional regulator, AraC family  39.42 
 
 		 285 aa  84.3  0.000000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.196416  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3175  helix-turn-helix domain-containing protein  25.75 
 
 		 287 aa  84.3  0.000000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1754  transcriptional regulator, AraC family  26.14 
 
 		 308 aa  84.3  0.000000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3335  AraC family transcriptional regulator  35.24 
 
 		 150 aa  84  0.000000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.602589  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0228  AraC family transcriptional regulator  39.84 
 
 		 123 aa  84.3  0.000000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.654381 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3397  AraC family transcriptional regulator  35.24 
 
 		 150 aa  84  0.000000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.287817 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4722  AraC family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 285 aa  84  0.000000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3346  AraC family transcriptional regulator  35.24 
 
 		 150 aa  84  0.000000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.143712  normal  0.196941 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5244  AraC family transcriptional regulator  38.05 
 
 		 134 aa  83.6  0.000000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.592893  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5154  helix-turn-helix domain-containing protein  38.05 
 
 		 120 aa  83.6  0.000000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0584  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  35.24 
 
 		 164 aa  83.6  0.000000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3612  helix-turn-helix domain-containing protein  36.19 
 
 		 144 aa  83.6  0.000000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.812981  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2634  AraC family transcriptional regulator  33.98 
 
 		 204 aa  83.2  0.000000000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0804  transcriptional regulator, AraC family  39.58 
 
 		 145 aa  82.8  0.000000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1543  transcriptional regulator, AraC family  29.21 
 
 		 300 aa  82.4  0.000000000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0932  AraC family transcriptional regulator  27.35 
 
 		 291 aa  82.4  0.000000000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0628  AraC family transcriptional regulator  31.34 
 
 		 319 aa  82  0.00000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  decreased coverage  0.000338841  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6068  AraC family transcriptional regulator  31.64 
 
 		 287 aa  81.6  0.00000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1111  transcriptional regulator, AraC family  36.19 
 
 		 312 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2463  transcriptional regulator, AraC family  39.39 
 
 		 162 aa  82  0.00000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.400735  normal  0.926275 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2907  transcriptional regulator, AraC family  29.78 
 
 		 289 aa  82  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0560618  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5494  transcriptional regulator, AraC family  39.39 
 
 		 144 aa  82  0.00000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00194637  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3520  helix-turn-helix domain-containing protein  40.4 
 
 		 322 aa  82  0.00000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2701  AraC family transcriptional regulator  32.85 
 
 		 315 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.137316  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>