More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmul_2555 on replicon NC_010084
Organism: Burkholderia multivorans ATCC 17616



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010084  Bmul_2555  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 
311 aa  626  1e-178  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0798  AraC family transcriptional regulator  91.64 
 
 
311 aa  582  1.0000000000000001e-165  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0345  AraC family transcriptional regulator  91 
 
 
311 aa  580  1e-164  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0829  AraC family transcriptional regulator  91 
 
 
311 aa  580  1e-164  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0210284  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3921  AraC family transcriptional regulator  90.35 
 
 
311 aa  574  1.0000000000000001e-163  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.892105 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0725  AraC family transcriptional regulator  89.03 
 
 
311 aa  546  1e-154  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.576949 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0708  AraC family transcriptional regulator  88.39 
 
 
311 aa  541  1e-153  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1909  AraC family transcriptional regulator  82.52 
 
 
315 aa  531  1e-150  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.190572  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0867  AraC family transcriptional regulator  82.52 
 
 
315 aa  531  1e-150  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000394258  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2701  AraC family transcriptional regulator  82.52 
 
 
315 aa  531  1e-150  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.137316  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3218  AraC family transcriptional regulator  82.2 
 
 
678 aa  528  1e-149  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000051538  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3203  AraC family transcriptional regulator  82.2 
 
 
315 aa  528  1e-149  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.10279  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3164  AraC family transcriptional regulator  81.88 
 
 
332 aa  528  1e-149  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0245945  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2046  AraC family transcriptional regulator  85.47 
 
 
291 aa  523  1e-147  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0173792  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4258  AraC family transcriptional regulator  73.97 
 
 
327 aa  450  1e-125  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1405  AraC family transcriptional regulator  84.55 
 
 
251 aa  441  1e-123  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000697123  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6955  transcriptional regulator, AraC family  70.53 
 
 
346 aa  436  1e-121  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.737934  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4214  transcriptional regulator, AraC family  51.23 
 
 
305 aa  263  3e-69  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4324  transcriptional regulator, AraC family  51.23 
 
 
305 aa  263  3e-69  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0282215 
 
 
-
 
NC_003296  RS05428  transcription regulator protein  52.35 
 
 
324 aa  262  4.999999999999999e-69  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13470  AraC family transcriptional regulator  48.42 
 
 
293 aa  251  1e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0899227  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5332  AraC family transcriptional regulator  48.29 
 
 
301 aa  250  2e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1207  putative transcriptional regulator  47.72 
 
 
293 aa  247  2e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0932  AraC family transcriptional regulator  46.35 
 
 
291 aa  246  3e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1041  helix-turn-helix, AraC type:Arac protein, arabinose-binding/dimerisation  46.57 
 
 
291 aa  244  9.999999999999999e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.29946 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5804  AraC family transcriptional regulator  43.92 
 
 
305 aa  242  5e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3238  AraC family transcriptional regulator  47.37 
 
 
290 aa  239  4e-62  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.996927 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1213  transcriptional regulator, AraC family  45.26 
 
 
291 aa  233  3e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4587  AraC family transcriptional regulator  45.88 
 
 
291 aa  233  3e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.213128  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4464  helix-turn-helix domain-containing protein  45.85 
 
 
291 aa  230  2e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4605  AraC family transcriptional regulator  45.49 
 
 
291 aa  230  3e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0859  AraC family transcriptional regulator  44.04 
 
 
291 aa  222  8e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.775109  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1732  transcriptional regulator, AraC family  39.01 
 
 
288 aa  199  6e-50  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0803469 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2907  transcriptional regulator, AraC family  37.72 
 
 
289 aa  193  3e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0560618  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1980  AraC family transcriptional regulator  37.59 
 
 
293 aa  191  1e-47  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.949603 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2932  transcriptional regulator, AraC family  41.98 
 
 
293 aa  186  4e-46  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6513  transcriptional regulator, AraC family  39.71 
 
 
306 aa  186  6e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3318  AraC family transcriptional regulator  35.63 
 
 
287 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.877504 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1196  transcriptional regulator, AraC family  35.63 
 
 
287 aa  185  1.0000000000000001e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3174  helix-turn-helix domain-containing protein  35.63 
 
 
287 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3175  helix-turn-helix domain-containing protein  35.63 
 
 
287 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2413  transcriptional regulator, AraC family  37.2 
 
 
322 aa  181  1e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.333457  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2507  transcriptional regulator, AraC family  37.55 
 
 
291 aa  177  3e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2337  AraC family transcriptional regulator  39.18 
 
 
289 aa  171  1e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000580503  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2093  AraC family transcriptional regulator  32.97 
 
 
287 aa  170  2e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.369123  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1881  transcriptional regulator, AraC family  37.89 
 
 
305 aa  165  6.9999999999999995e-40  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.831794  normal  0.0117859 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0536  AraC family transcriptional regulator  35.17 
 
 
304 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5208  AraC family transcriptional regulator  36.27 
 
 
314 aa  157  3e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.360222  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6617  transcriptional regulator, AraC family  34.15 
 
 
287 aa  151  2e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.131937 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2934  helix-turn-helix domain-containing protein  30.42 
 
 
310 aa  138  1e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0219137  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1148  transcriptional regulator, AraC family  29.44 
 
 
309 aa  106  5e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0716  AraC family transcriptional regulator  26.44 
 
 
296 aa  104  2e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00193737 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6041  transcriptional regulator, AraC family  39.18 
 
 
303 aa  102  1e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.331066 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4732  helix-turn-helix domain-containing protein  45.37 
 
 
293 aa  100  4e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0052536 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0624  AraC family transcriptional regulator  35.14 
 
 
299 aa  97.1  3e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.401422 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2401  transcriptional regulator, AraC family  47.46 
 
 
202 aa  96.7  5e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5215  helix-turn-helix domain-containing protein  30.23 
 
 
331 aa  95.9  8e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0517  helix-turn-helix domain-containing protein  44.95 
 
 
180 aa  95.5  9e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.970363 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1960  AraC family transcriptional regulator  42.98 
 
 
143 aa  95.1  1e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2274  AraC family transcriptional regulator  37.71 
 
 
307 aa  93.6  4e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.348217  normal  0.470943 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6068  AraC family transcriptional regulator  38.85 
 
 
287 aa  93.2  6e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0085  transcriptional regulator, AraC family  28.47 
 
 
296 aa  92.4  8e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0195711 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2282  putative transcriptional regulator  38.69 
 
 
294 aa  92.4  9e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42360  transcriptional regulator, AraC family  42.34 
 
 
318 aa  92.4  9e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0134  AraC family transcriptional regulator  33.73 
 
 
322 aa  91.7  1e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2383  AraC family transcriptional regulator  33.49 
 
 
281 aa  91.3  2e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.499508  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3312  AraC family transcriptional regulator  33.49 
 
 
281 aa  91.3  2e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.403912 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1365  AraC family transcriptional regulator  29.26 
 
 
353 aa  90.9  2e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.122979  normal  0.036458 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3482  AraC family transcriptional regulator  44.44 
 
 
299 aa  91.3  2e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.675068  normal  0.589184 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4318  AraC family transcriptional regulator  27.57 
 
 
305 aa  90.9  2e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00219342 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0027  AraC family transcriptional regulator  34.31 
 
 
299 aa  90.5  3e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.618912  normal  0.0626425 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1895  AraC family transcriptional regulator  32.06 
 
 
277 aa  89.4  8e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2981  AraC family transcriptional regulator  28.21 
 
 
305 aa  89.4  8e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1989  AraC family transcriptional regulator  32.39 
 
 
277 aa  89  8e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.753386  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1268  transcriptional regulator, AraC family  42.31 
 
 
300 aa  89  9e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3089  helix-turn-helix domain-containing protein  30.5 
 
 
297 aa  88.6  1e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.830597 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5475  transcriptional regulator, AraC family  41.28 
 
 
305 aa  89  1e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.59164  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1111  transcriptional regulator, AraC family  40.87 
 
 
312 aa  88.6  1e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05505  putative transcription regulator protein  36.09 
 
 
270 aa  88.2  2e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0810  AraC family transcriptional regulator  36.5 
 
 
306 aa  88.2  2e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2855  AraC family substrate binding transcriptional regulator  29.02 
 
 
280 aa  87  3e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.222069  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5000  AraC family transcriptional regulator  26.75 
 
 
305 aa  87  3e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5860  AraC family transcriptional regulator  26.75 
 
 
305 aa  87  3e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.499461  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0180  AraC family transcriptional regulator  42.86 
 
 
223 aa  87  4e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3129  AraC family transcriptional regulator  31.25 
 
 
299 aa  87  4e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1650  AraC family transcriptional regulator  45.36 
 
 
316 aa  86.7  5e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3359  AraC family transcriptional regulator  34.21 
 
 
285 aa  86.7  5e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5093  AraC family transcriptional regulator  28.21 
 
 
301 aa  86.7  5e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.467029 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5008  AraC family transcriptional regulator  34.21 
 
 
285 aa  86.7  5e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.896385 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3869  AraC family transcriptional regulator  27.82 
 
 
304 aa  86.3  6e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3971  putative transcriptional regulator  38.18 
 
 
272 aa  85.9  7e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.347316  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3996  helix-turn-helix domain-containing protein  30.28 
 
 
289 aa  85.9  7e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2469  AraC family transcriptional regulator  34.58 
 
 
361 aa  85.9  8e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29260  putative transcriptional regulator  34.59 
 
 
297 aa  85.1  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3740  helix-turn-helix domain-containing protein  32.37 
 
 
301 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.436963  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1472  AraC family transcriptional regulator  31.22 
 
 
292 aa  85.1  0.000000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.327977  normal  0.780269 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2736  AraC family transcriptional regulator  37.39 
 
 
154 aa  84  0.000000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.66637 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7634  transcriptional regulator AraC family  31.47 
 
 
304 aa  83.6  0.000000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.63081  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3583  transcriptional regulator AraC family  42.59 
 
 
293 aa  83.2  0.000000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3244  AraC family transcriptional regulator  27.78 
 
 
301 aa  82.8  0.000000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.432164 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>