More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ent638_1980 on replicon NC_009436
Organism: Enterobacter sp. 638



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009436  Ent638_1980  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 
293 aa  615  1e-175  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.949603 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2337  AraC family transcriptional regulator  60.63 
 
 
289 aa  369  1e-101  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000580503  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2932  transcriptional regulator, AraC family  58.95 
 
 
293 aa  357  9.999999999999999e-98  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2507  transcriptional regulator, AraC family  55.48 
 
 
291 aa  343  1e-93  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2413  transcriptional regulator, AraC family  54.77 
 
 
322 aa  338  5.9999999999999996e-92  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.333457  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0932  AraC family transcriptional regulator  40.36 
 
 
291 aa  219  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13470  AraC family transcriptional regulator  38.83 
 
 
293 aa  213  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0899227  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1041  helix-turn-helix, AraC type:Arac protein, arabinose-binding/dimerisation  37.82 
 
 
291 aa  213  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.29946 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1207  putative transcriptional regulator  38.83 
 
 
293 aa  213  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4587  AraC family transcriptional regulator  37.82 
 
 
291 aa  206  5e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.213128  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4605  AraC family transcriptional regulator  37.82 
 
 
291 aa  203  3e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4464  helix-turn-helix domain-containing protein  37.82 
 
 
291 aa  203  3e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0859  AraC family transcriptional regulator  37.45 
 
 
291 aa  202  4e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.775109  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3238  AraC family transcriptional regulator  38.03 
 
 
290 aa  202  8e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.996927 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1213  transcriptional regulator, AraC family  36.73 
 
 
291 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5804  AraC family transcriptional regulator  38.62 
 
 
305 aa  196  3e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1732  transcriptional regulator, AraC family  37.55 
 
 
288 aa  193  3e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0803469 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2907  transcriptional regulator, AraC family  37.86 
 
 
289 aa  188  9e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0560618  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5332  AraC family transcriptional regulator  37.76 
 
 
301 aa  188  9e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05428  transcription regulator protein  36.97 
 
 
324 aa  187  1e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0798  AraC family transcriptional regulator  36.88 
 
 
311 aa  188  1e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0345  AraC family transcriptional regulator  36.88 
 
 
311 aa  187  1e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0829  AraC family transcriptional regulator  36.88 
 
 
311 aa  187  1e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0210284  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3921  AraC family transcriptional regulator  36.88 
 
 
311 aa  187  2e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.892105 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6513  transcriptional regulator, AraC family  38.93 
 
 
306 aa  185  7e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2046  AraC family transcriptional regulator  36.17 
 
 
291 aa  185  8e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0173792  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2701  AraC family transcriptional regulator  36.17 
 
 
315 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.137316  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1909  AraC family transcriptional regulator  36.17 
 
 
315 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.190572  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4258  AraC family transcriptional regulator  37.1 
 
 
327 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0867  AraC family transcriptional regulator  36.17 
 
 
315 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000394258  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3164  AraC family transcriptional regulator  35.69 
 
 
332 aa  183  3e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0245945  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3203  AraC family transcriptional regulator  35.82 
 
 
315 aa  182  4.0000000000000006e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.10279  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4324  transcriptional regulator, AraC family  36.97 
 
 
305 aa  183  4.0000000000000006e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0282215 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4214  transcriptional regulator, AraC family  36.97 
 
 
305 aa  183  4.0000000000000006e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1196  transcriptional regulator, AraC family  33.68 
 
 
287 aa  182  8.000000000000001e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3174  helix-turn-helix domain-containing protein  36.97 
 
 
287 aa  181  1e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3318  AraC family transcriptional regulator  36.97 
 
 
287 aa  181  1e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.877504 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3175  helix-turn-helix domain-containing protein  36.97 
 
 
287 aa  181  1e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2555  AraC family transcriptional regulator  37.59 
 
 
311 aa  180  2e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0708  AraC family transcriptional regulator  37.23 
 
 
311 aa  181  2e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0725  AraC family transcriptional regulator  36.88 
 
 
311 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.576949 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3218  AraC family transcriptional regulator  36.17 
 
 
678 aa  179  7e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000051538  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6955  transcriptional regulator, AraC family  36.88 
 
 
346 aa  176  3e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.737934  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1405  AraC family transcriptional regulator  36.84 
 
 
251 aa  176  5e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000697123  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1881  transcriptional regulator, AraC family  34.98 
 
 
305 aa  174  9.999999999999999e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.831794  normal  0.0117859 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2934  helix-turn-helix domain-containing protein  35.34 
 
 
310 aa  173  2.9999999999999996e-42  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0219137  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0536  AraC family transcriptional regulator  31.49 
 
 
304 aa  168  8e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2093  AraC family transcriptional regulator  33.73 
 
 
287 aa  166  5e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.369123  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6617  transcriptional regulator, AraC family  34.8 
 
 
287 aa  165  8e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.131937 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5208  AraC family transcriptional regulator  35.34 
 
 
314 aa  144  2e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.360222  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1148  transcriptional regulator, AraC family  29.36 
 
 
309 aa  125  6e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0085  transcriptional regulator, AraC family  40.14 
 
 
296 aa  106  6e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0195711 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2469  AraC family transcriptional regulator  30.3 
 
 
361 aa  104  2e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7634  transcriptional regulator AraC family  34.09 
 
 
304 aa  104  2e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.63081  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1650  AraC family transcriptional regulator  29.67 
 
 
316 aa  102  5e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0134  AraC family transcriptional regulator  33.68 
 
 
322 aa  102  8e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2274  AraC family transcriptional regulator  33.97 
 
 
307 aa  102  9e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.348217  normal  0.470943 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6041  transcriptional regulator, AraC family  34.63 
 
 
303 aa  100  4e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.331066 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5245  AraC family transcriptional regulator  28.85 
 
 
312 aa  99.4  6e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42360  transcriptional regulator, AraC family  33.92 
 
 
318 aa  99  8e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6068  AraC family transcriptional regulator  44.86 
 
 
287 aa  99  9e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29260  putative transcriptional regulator  32.07 
 
 
297 aa  99  9e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3869  AraC family transcriptional regulator  32.77 
 
 
304 aa  98.2  1e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0716  AraC family transcriptional regulator  28.06 
 
 
296 aa  98.2  1e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00193737 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5694  AraC family transcriptional regulator  26.6 
 
 
319 aa  98.6  1e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.730665  normal  0.260224 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1472  AraC family transcriptional regulator  31.07 
 
 
292 aa  98.2  1e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.327977  normal  0.780269 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3996  helix-turn-helix domain-containing protein  28.24 
 
 
289 aa  97.8  2e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0583  AraC family transcriptional regulator  30.77 
 
 
312 aa  97.1  3e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.98908  normal  0.54842 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5215  helix-turn-helix domain-containing protein  28.64 
 
 
331 aa  97.4  3e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1268  transcriptional regulator, AraC family  30.56 
 
 
300 aa  95.9  7e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4632  AraC family transcriptional regulator  29.14 
 
 
316 aa  95.5  9e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.569454  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3971  putative transcriptional regulator  36.43 
 
 
272 aa  95.1  1e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.347316  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2855  AraC family substrate binding transcriptional regulator  31.75 
 
 
280 aa  94.4  2e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.222069  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0027  AraC family transcriptional regulator  35.82 
 
 
299 aa  94.7  2e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.618912  normal  0.0626425 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2981  AraC family transcriptional regulator  26.92 
 
 
305 aa  94.4  2e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3482  AraC family transcriptional regulator  38.85 
 
 
299 aa  93.2  4e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.675068  normal  0.589184 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5827  helix-turn-helix domain-containing protein  27.82 
 
 
316 aa  92.8  6e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.112164  normal  0.283627 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3129  AraC family transcriptional regulator  27.32 
 
 
299 aa  92.8  6e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3089  helix-turn-helix domain-containing protein  35.15 
 
 
297 aa  92.8  6e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.830597 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3975  helix-turn-helix domain-containing protein  32.9 
 
 
302 aa  92.4  7e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2282  putative transcriptional regulator  24.65 
 
 
294 aa  92.4  7e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4172  AraC family transcriptional regulator  36.92 
 
 
295 aa  92.4  8e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0833223  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3417  AraC family transcriptional regulator  30 
 
 
299 aa  92.4  8e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.138414  normal  0.441033 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4732  helix-turn-helix domain-containing protein  42.45 
 
 
293 aa  92  9e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0052536 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2401  transcriptional regulator, AraC family  36.69 
 
 
202 aa  91.7  1e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1537  transcriptional regulator, AraC family  37.7 
 
 
282 aa  92  1e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.164062  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5475  transcriptional regulator, AraC family  30.91 
 
 
305 aa  91.7  1e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.59164  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1365  AraC family transcriptional regulator  31.21 
 
 
353 aa  92  1e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.122979  normal  0.036458 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0624  AraC family transcriptional regulator  34.31 
 
 
299 aa  90.9  2e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.401422 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4236  AraC family transcriptional regulator  36.64 
 
 
285 aa  90.9  2e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.457979 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4318  AraC family transcriptional regulator  25.48 
 
 
305 aa  91.3  2e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00219342 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5000  AraC family transcriptional regulator  25.96 
 
 
305 aa  91.3  2e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5860  AraC family transcriptional regulator  25.96 
 
 
305 aa  91.3  2e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.499461  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1794  AraC family transcriptional regulator  39.39 
 
 
338 aa  89.4  7e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.112719  hitchhiker  0.00342809 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0810  AraC family transcriptional regulator  26.04 
 
 
306 aa  89  1e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0816  AraC family transcriptional regulator  42.2 
 
 
319 aa  88.6  1e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0210  AraC family transcriptional regulator  39.81 
 
 
274 aa  88.6  1e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.85611 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1250  AraC family transcriptional regulator  38.53 
 
 
263 aa  88.6  1e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3244  AraC family transcriptional regulator  25.48 
 
 
301 aa  88.6  1e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.432164 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1279  helix-turn-helix domain-containing protein  31.95 
 
 
306 aa  88.2  2e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.665979 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>