More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_1794 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_1794  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 338 aa  700    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.112719  hitchhiker  0.00342809 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2152  transcriptional regulator, AraC family  84.13 
 
 		 340 aa  601  1.0000000000000001e-171  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.49496 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2406  transcriptional regulator, AraC family  83.53 
 
 		 339 aa  598  1e-170  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0277312 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2590  transcriptional regulator AraC family  82.62 
 
 		 337 aa  577  1e-164  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1865  AraC family transcriptional regulator  78.02 
 
 		 332 aa  544  1e-154  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1319  AraC family transcriptional regulator  77.88 
 
 		 332 aa  540  9.999999999999999e-153  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1270  transcriptional regulator  44.06 
 
 		 334 aa  299  5e-80  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.314543  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1100  AraC family transcriptional regulator  44.58 
 
 		 334 aa  297  2e-79  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0397278 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2922  transcriptional regulator  44.34 
 
 		 337 aa  295  8e-79  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1567  AraC family transcriptional regulator  44.34 
 
 		 337 aa  295  8e-79  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.226821  normal  0.377129 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3735  helix-turn-helix domain-containing protein  45.86 
 
 		 343 aa  293  4e-78  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.43988 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4030  transcriptional regulator, AraC family  45.86 
 
 		 343 aa  292  5e-78  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.364388 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2488  AraC family transcriptional regulator  44.97 
 
 		 344 aa  291  1e-77  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2444  transcriptional regulator  43.48 
 
 		 331 aa  288  1e-76  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0668048  hitchhiker  0.000772272 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3394  transcriptional regulator, AraC family  44.79 
 
 		 334 aa  287  2e-76  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1525  HTH-type transcriptional regulator  43.65 
 
 		 339 aa  286  2.9999999999999996e-76  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.199497 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3933  AraC family transcriptional regulator  45.83 
 
 		 337 aa  286  2.9999999999999996e-76  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3990  transcriptional regulator, AraC family  45.22 
 
 		 344 aa  286  2.9999999999999996e-76  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0987  transcriptional regulator  42.6 
 
 		 375 aa  273  4.0000000000000004e-72  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2664  AraC family transcriptional regulator  42.04 
 
 		 368 aa  272  5.000000000000001e-72  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0165303  normal  0.567946 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001535  transcriptional regulator AraC family  41.67 
 
 		 318 aa  270  2.9999999999999997e-71  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0490  transcriptional regulator  41.43 
 
 		 364 aa  266  4e-70  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4910  AraC family transcriptional regulator  40.61 
 
 		 368 aa  266  5e-70  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00942326 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6166  putative transcriptional regulator  41.3 
 
 		 367 aa  265  1e-69  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.165565  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0298  AraC family transcriptional regulator  40 
 
 		 368 aa  263  2e-69  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000218642 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4021  AraC family transcriptional regulator  41.01 
 
 		 353 aa  264  2e-69  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.322888  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0323  AraC family transcriptional regulator  40 
 
 		 368 aa  263  2e-69  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0318  AraC family transcriptional regulator  40 
 
 		 368 aa  263  4e-69  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.120478 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71070  AraC family transcriptional regulator  40.99 
 
 		 367 aa  262  4.999999999999999e-69  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5236  transcriptional regulator  40.06 
 
 		 367 aa  262  6e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.59007  normal  0.0230056 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0465  transcriptional regulator, AraC family  40 
 
 		 367 aa  262  8e-69  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4708  helix-turn-helix, AraC type:ThiJ/PfpI  40.92 
 
 		 367 aa  259  7e-68  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02029  transcriptional regulator transcription regulator protein  42.81 
 
 		 343 aa  256  3e-67  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.130887 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5229  transcriptional regulator  42.12 
 
 		 314 aa  256  4e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.35662  normal  0.0289181 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0457  transcriptional regulator  39.25 
 
 		 332 aa  256  4e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.99008  normal  0.0292699 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5090  AraC family transcriptional regulator  39.25 
 
 		 332 aa  255  8e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.893585 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4565  AraC family transcriptional regulator  39.25 
 
 		 332 aa  255  8e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.644708 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3487  AraC family transcriptional regulator  38.94 
 
 		 332 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.1866 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1111  AraC family transcriptional regulator  40.58 
 
 		 339 aa  254  2.0000000000000002e-66  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000893396  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5109  AraC family transcriptional regulator  38.63 
 
 		 332 aa  253  3e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.771046  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5170  AraC family transcriptional regulator  38.63 
 
 		 355 aa  253  3e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0119945  normal  0.398909 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1869  AraC family transcriptional regulator  44.41 
 
 		 341 aa  253  3e-66  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3197  AraC family transcriptional regulator  38.63 
 
 		 355 aa  253  3e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02043  transcriptional regulator transcription regulator protein  40.84 
 
 		 334 aa  253  4.0000000000000004e-66  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0469  AraC family transcriptional regulator  43.38 
 
 		 369 aa  252  5.000000000000001e-66  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2915  helix-turn-helix, AraC type:ThiJ/PfpI  40.57 
 
 		 325 aa  252  5.000000000000001e-66  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.904255  normal  0.163293 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0739  AraC family transcriptional regulator  43.38 
 
 		 365 aa  252  5.000000000000001e-66  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1007  AraC family transcriptional regulator  43.38 
 
 		 365 aa  252  5.000000000000001e-66  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.809611  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0711  AraC family transcriptional regulator  44.41 
 
 		 341 aa  252  8.000000000000001e-66  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1980  AraC family transcriptional regulator  44.41 
 
 		 341 aa  252  8.000000000000001e-66  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.433985  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4823  transcriptional regulator  44.09 
 
 		 338 aa  251  1e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2105  AraC family transcriptional regulator  43.38 
 
 		 421 aa  251  1e-65  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2253  AraC family transcriptional regulator  39.75 
 
 		 321 aa  251  1e-65  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3282  AraC family transcriptional regulator  42.77 
 
 		 371 aa  249  3e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5086  AraC family transcriptional regulator  42.77 
 
 		 371 aa  249  3e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.754601 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0329  AraC family transcriptional regulator  41.77 
 
 		 314 aa  249  4e-65  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5199  AraC family transcriptional regulator  43.77 
 
 		 341 aa  249  4e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0968  AraC family transcriptional regulator  38.32 
 
 		 332 aa  249  5e-65  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4809  transcriptional regulator  38.32 
 
 		 331 aa  249  6e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.193614  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3545  AraC family transcriptional regulator  43.77 
 
 		 341 aa  249  7e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0827  AraC family transcriptional regulator  43.08 
 
 		 365 aa  249  7e-65  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0570  transcriptional regulator  42.77 
 
 		 371 aa  249  7e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6176  putative transcriptional regulator  41.35 
 
 		 336 aa  248  1e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0566  AraC family transcriptional regulator  38.01 
 
 		 332 aa  248  1e-64  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.207783  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1868  AraC family transcriptional regulator  38.01 
 
 		 332 aa  248  1e-64  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0901  AraC family transcriptional regulator  38.01 
 
 		 332 aa  248  1e-64  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2025  AraC family transcriptional regulator  38.01 
 
 		 332 aa  248  1e-64  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0448  AraC family transcriptional regulator  38.01 
 
 		 332 aa  247  2e-64  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3277  AraC family transcriptional regulator  38.68 
 
 		 339 aa  247  2e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71170  AraC family transcriptional regulator  41.35 
 
 		 336 aa  247  2e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1931  AraC family transcriptional regulator  38.01 
 
 		 332 aa  247  2e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.746291  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0498  transcriptional regulator  41.51 
 
 		 316 aa  246  4.9999999999999997e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3304  AraC family transcriptional regulator  43.13 
 
 		 338 aa  245  6.999999999999999e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.176571  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4498  AraC family transcriptional regulator  42.81 
 
 		 340 aa  245  9e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5023  AraC family transcriptional regulator  42.81 
 
 		 341 aa  245  9e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5693  transcriptional regulator, AraC family  36.81 
 
 		 336 aa  244  9.999999999999999e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.114959 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0305  AraC family transcriptional regulator  40.51 
 
 		 319 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00276318 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4903  AraC family transcriptional regulator  40.95 
 
 		 315 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.208419 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0325  AraC family transcriptional regulator  40.51 
 
 		 315 aa  243  3e-63  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.416285 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5062  transcriptional regulator, AraC family  40.94 
 
 		 331 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.652687  normal  0.0215007 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1586  transcriptional regulator  41.49 
 
 		 333 aa  242  6e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4061  AraC family transcriptional regulator  40.84 
 
 		 401 aa  242  7e-63  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.135508  normal  0.429541 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1850  AraC family transcriptional regulator  41.03 
 
 		 314 aa  241  1e-62  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.999636  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1140  AraC family transcriptional regulator  38.75 
 
 		 322 aa  241  1e-62  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0567003 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5042  transcriptional regulator, AraC family  38.44 
 
 		 332 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.363358  normal  0.505144 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4893  AraC family transcriptional regulator  40.19 
 
 		 340 aa  239  5e-62  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7695  transcriptional regulator  37.46 
 
 		 324 aa  238  6.999999999999999e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.529732 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0347  transcriptional regulator, AraC family  38.85 
 
 		 322 aa  238  1e-61  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0988  AraC family transcriptional regulator  40.71 
 
 		 314 aa  236  3e-61  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2126  AraC family transcriptional regulator  40.71 
 
 		 361 aa  236  3e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0759  AraC family transcriptional regulator  40.71 
 
 		 314 aa  236  3e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0692  AraC family transcriptional regulator  40.71 
 
 		 314 aa  236  3e-61  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1960  AraC family transcriptional regulator  40.71 
 
 		 314 aa  236  3e-61  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0848  AraC family transcriptional regulator  40.71 
 
 		 361 aa  236  4e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0489  AraC family transcriptional regulator  40.71 
 
 		 336 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3170  transcriptional regulator  39.62 
 
 		 327 aa  234  1.0000000000000001e-60  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3578  AraC family transcriptional regulator  40.06 
 
 		 314 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.54425 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1614  transcriptional regulator  37.38 
 
 		 332 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5064  AraC family transcriptional regulator  40.06 
 
 		 314 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3303  AraC family transcriptional regulator  40.06 
 
 		 314 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>