More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_4061 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_4061  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 
401 aa  822    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.135508  normal  0.429541 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3487  AraC family transcriptional regulator  52.92 
 
 
332 aa  329  4e-89  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.1866 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5170  AraC family transcriptional regulator  52.6 
 
 
355 aa  327  3e-88  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0119945  normal  0.398909 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3197  AraC family transcriptional regulator  52.6 
 
 
355 aa  327  3e-88  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5090  AraC family transcriptional regulator  52.6 
 
 
332 aa  326  4.0000000000000003e-88  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.893585 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5109  AraC family transcriptional regulator  52.6 
 
 
332 aa  326  4.0000000000000003e-88  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.771046  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4565  AraC family transcriptional regulator  52.6 
 
 
332 aa  326  4.0000000000000003e-88  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.644708 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0457  transcriptional regulator  52.27 
 
 
332 aa  325  6e-88  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.99008  normal  0.0292699 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0968  AraC family transcriptional regulator  52.06 
 
 
332 aa  325  7e-88  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0566  AraC family transcriptional regulator  52.6 
 
 
332 aa  324  1e-87  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.207783  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0448  AraC family transcriptional regulator  52.6 
 
 
332 aa  325  1e-87  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0901  AraC family transcriptional regulator  52.6 
 
 
332 aa  324  1e-87  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2025  AraC family transcriptional regulator  52.6 
 
 
332 aa  324  1e-87  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1931  AraC family transcriptional regulator  52.6 
 
 
332 aa  325  1e-87  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.746291  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1868  AraC family transcriptional regulator  52.6 
 
 
332 aa  324  1e-87  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3448  AraC family transcriptional regulator  53.9 
 
 
325 aa  321  9.999999999999999e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5042  transcriptional regulator, AraC family  51.67 
 
 
332 aa  320  3.9999999999999996e-86  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.363358  normal  0.505144 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5199  AraC family transcriptional regulator  50.58 
 
 
341 aa  319  5e-86  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3282  AraC family transcriptional regulator  51.84 
 
 
371 aa  318  7.999999999999999e-86  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5086  AraC family transcriptional regulator  51.84 
 
 
371 aa  318  7.999999999999999e-86  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.754601 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4809  transcriptional regulator  49.38 
 
 
331 aa  318  1e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.193614  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0570  transcriptional regulator  51.55 
 
 
371 aa  318  1e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3545  AraC family transcriptional regulator  51.84 
 
 
341 aa  318  1e-85  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1869  AraC family transcriptional regulator  50.58 
 
 
341 aa  317  2e-85  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1614  transcriptional regulator  51.37 
 
 
332 aa  316  4e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4498  AraC family transcriptional regulator  50.93 
 
 
340 aa  316  4e-85  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5023  AraC family transcriptional regulator  50.93 
 
 
341 aa  316  5e-85  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0469  AraC family transcriptional regulator  51.84 
 
 
369 aa  315  6e-85  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1980  AraC family transcriptional regulator  51.84 
 
 
341 aa  315  6e-85  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.433985  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0711  AraC family transcriptional regulator  51.84 
 
 
341 aa  315  6e-85  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1007  AraC family transcriptional regulator  51.84 
 
 
365 aa  315  7e-85  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.809611  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0739  AraC family transcriptional regulator  51.84 
 
 
365 aa  315  7e-85  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2105  AraC family transcriptional regulator  51.84 
 
 
421 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7695  transcriptional regulator  48.41 
 
 
324 aa  314  9.999999999999999e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.529732 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3304  AraC family transcriptional regulator  50.92 
 
 
338 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.176571  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0827  AraC family transcriptional regulator  50.29 
 
 
365 aa  312  4.999999999999999e-84  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02043  transcriptional regulator transcription regulator protein  48.1 
 
 
334 aa  307  2.0000000000000002e-82  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4823  transcriptional regulator  51.3 
 
 
338 aa  307  2.0000000000000002e-82  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02029  transcriptional regulator transcription regulator protein  50.32 
 
 
343 aa  307  3e-82  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.130887 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1586  transcriptional regulator  49.36 
 
 
333 aa  303  4.0000000000000003e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5062  transcriptional regulator, AraC family  49.04 
 
 
331 aa  302  5.000000000000001e-81  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.652687  normal  0.0215007 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4021  AraC family transcriptional regulator  43.87 
 
 
353 aa  295  8e-79  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.322888  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71070  AraC family transcriptional regulator  45.65 
 
 
367 aa  287  2e-76  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0490  transcriptional regulator  46.41 
 
 
364 aa  287  2e-76  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6166  putative transcriptional regulator  45.65 
 
 
367 aa  286  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.165565  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0465  transcriptional regulator, AraC family  42.39 
 
 
367 aa  286  5e-76  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4708  helix-turn-helix, AraC type:ThiJ/PfpI  43.18 
 
 
367 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5236  transcriptional regulator  44.69 
 
 
367 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.59007  normal  0.0230056 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0318  AraC family transcriptional regulator  45.75 
 
 
368 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.120478 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0987  transcriptional regulator  45.37 
 
 
375 aa  283  5.000000000000001e-75  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0298  AraC family transcriptional regulator  45.42 
 
 
368 aa  282  6.000000000000001e-75  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000218642 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0323  AraC family transcriptional regulator  45.42 
 
 
368 aa  282  6.000000000000001e-75  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4910  AraC family transcriptional regulator  45.42 
 
 
368 aa  281  1e-74  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00942326 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2664  AraC family transcriptional regulator  42.34 
 
 
368 aa  281  1e-74  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0165303  normal  0.567946 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1100  AraC family transcriptional regulator  42.09 
 
 
334 aa  272  7e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0397278 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2922  transcriptional regulator  43.09 
 
 
337 aa  270  2.9999999999999997e-71  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1567  AraC family transcriptional regulator  43.09 
 
 
337 aa  270  2.9999999999999997e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.226821  normal  0.377129 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1111  AraC family transcriptional regulator  43.71 
 
 
339 aa  270  5e-71  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000893396  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1001  AraC family transcriptional regulator  44.23 
 
 
324 aa  265  8e-70  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0569552  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4030  transcriptional regulator, AraC family  42.67 
 
 
343 aa  265  1e-69  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.364388 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2488  AraC family transcriptional regulator  42.41 
 
 
344 aa  263  3e-69  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3735  helix-turn-helix domain-containing protein  42.35 
 
 
343 aa  262  8e-69  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.43988 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3394  transcriptional regulator, AraC family  41.43 
 
 
334 aa  261  1e-68  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2444  transcriptional regulator  39.58 
 
 
331 aa  258  1e-67  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0668048  hitchhiker  0.000772272 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3990  transcriptional regulator, AraC family  41.69 
 
 
344 aa  256  6e-67  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3933  AraC family transcriptional regulator  41.69 
 
 
337 aa  255  8e-67  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1865  AraC family transcriptional regulator  43.45 
 
 
332 aa  253  3e-66  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1319  AraC family transcriptional regulator  43.13 
 
 
332 aa  252  7e-66  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1270  transcriptional regulator  37.54 
 
 
334 aa  251  1e-65  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.314543  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3665  AraC family transcriptional regulator  42.07 
 
 
401 aa  251  2e-65  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.747363  normal  0.253179 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2064  AraC family transcriptional regulator  42.07 
 
 
335 aa  251  2e-65  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.405224  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3277  AraC family transcriptional regulator  39.94 
 
 
339 aa  250  3e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4903  AraC family transcriptional regulator  41.69 
 
 
315 aa  250  4e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.208419 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1525  HTH-type transcriptional regulator  39.1 
 
 
339 aa  249  5e-65  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.199497 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2238  AraC family transcriptional regulator  44.19 
 
 
330 aa  249  5e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.390455  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2406  transcriptional regulator, AraC family  40.19 
 
 
339 aa  248  2e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0277312 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2152  transcriptional regulator, AraC family  41.16 
 
 
340 aa  246  4e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.49496 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2234  AraC family transcriptional regulator  43.23 
 
 
335 aa  246  4.9999999999999997e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.498713 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0325  AraC family transcriptional regulator  41.37 
 
 
315 aa  246  6e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.416285 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0305  AraC family transcriptional regulator  41.37 
 
 
319 aa  246  6.999999999999999e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00276318 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1794  AraC family transcriptional regulator  40.84 
 
 
338 aa  242  9e-63  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.112719  hitchhiker  0.00342809 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2590  transcriptional regulator AraC family  39.17 
 
 
337 aa  241  2e-62  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2915  helix-turn-helix, AraC type:ThiJ/PfpI  40.07 
 
 
325 aa  240  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.904255  normal  0.163293 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5229  transcriptional regulator  39.09 
 
 
314 aa  239  6.999999999999999e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.35662  normal  0.0289181 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2253  AraC family transcriptional regulator  37.86 
 
 
321 aa  237  2e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3303  AraC family transcriptional regulator  42.48 
 
 
314 aa  237  3e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5064  AraC family transcriptional regulator  42.48 
 
 
314 aa  237  3e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6176  putative transcriptional regulator  39.81 
 
 
336 aa  236  5.0000000000000005e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71170  AraC family transcriptional regulator  39.81 
 
 
336 aa  236  5.0000000000000005e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3578  AraC family transcriptional regulator  42.3 
 
 
314 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.54425 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3997  transcriptional regulator  40.51 
 
 
316 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.564896  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5220  AraC family transcriptional regulator  42.48 
 
 
314 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.974611 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0599  transcriptional regulator  42.16 
 
 
326 aa  229  5e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.703076 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4893  AraC family transcriptional regulator  40.26 
 
 
340 aa  229  6e-59  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4999  AraC family transcriptional regulator  41.83 
 
 
314 aa  229  6e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.258482  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4474  AraC family transcriptional regulator  41.83 
 
 
314 aa  229  6e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0829  transcriptional regulator  41.64 
 
 
317 aa  229  7e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.351289 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0329  AraC family transcriptional regulator  39.54 
 
 
314 aa  229  8e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001535  transcriptional regulator AraC family  38.31 
 
 
318 aa  228  1e-58  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4511  transcriptional regulator, AraC family  40.91 
 
 
341 aa  228  2e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.88084  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>