More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_2915 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_2915  helix-turn-helix, AraC type:ThiJ/PfpI  100 
 
 		 325 aa  668    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.904255  normal  0.163293 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5229  transcriptional regulator  87.58 
 
 		 314 aa  573  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.35662  normal  0.0289181 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6176  putative transcriptional regulator  78.32 
 
 		 336 aa  507  1e-143  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71170  AraC family transcriptional regulator  78.32 
 
 		 336 aa  508  1e-143  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0329  AraC family transcriptional regulator  77.35 
 
 		 314 aa  492  9.999999999999999e-139  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4903  AraC family transcriptional regulator  73.55 
 
 		 315 aa  473  1e-132  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.208419 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0305  AraC family transcriptional regulator  73.16 
 
 		 319 aa  468  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00276318 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0325  AraC family transcriptional regulator  73.16 
 
 		 315 aa  468  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.416285 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0498  transcriptional regulator  66.99 
 
 		 316 aa  408  1e-113  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5064  AraC family transcriptional regulator  62.06 
 
 		 314 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3578  AraC family transcriptional regulator  61.94 
 
 		 314 aa  398  9.999999999999999e-111  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.54425 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3303  AraC family transcriptional regulator  62.06 
 
 		 314 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4999  AraC family transcriptional regulator  62.7 
 
 		 314 aa  395  1e-109  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.258482  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3287  AraC family transcriptional regulator  60.97 
 
 		 331 aa  395  1e-109  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.242748  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5220  AraC family transcriptional regulator  62.06 
 
 		 314 aa  397  1e-109  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.974611 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4474  AraC family transcriptional regulator  62.7 
 
 		 314 aa  395  1e-109  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0848  AraC family transcriptional regulator  60.76 
 
 		 361 aa  392  1e-108  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2126  AraC family transcriptional regulator  60.76 
 
 		 361 aa  392  1e-108  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0599  transcriptional regulator  61.01 
 
 		 326 aa  391  1e-108  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.703076 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0489  AraC family transcriptional regulator  60.44 
 
 		 336 aa  390  1e-107  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0692  AraC family transcriptional regulator  60.97 
 
 		 314 aa  390  1e-107  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0988  AraC family transcriptional regulator  60.97 
 
 		 314 aa  390  1e-107  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0759  AraC family transcriptional regulator  60.97 
 
 		 314 aa  390  1e-107  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4511  transcriptional regulator, AraC family  61.15 
 
 		 341 aa  390  1e-107  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.88084  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0829  transcriptional regulator  61.74 
 
 		 317 aa  391  1e-107  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.351289 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1960  AraC family transcriptional regulator  60.97 
 
 		 314 aa  390  1e-107  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1850  AraC family transcriptional regulator  60 
 
 		 314 aa  387  1e-106  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.999636  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1100  AraC family transcriptional regulator  44.19 
 
 		 334 aa  276  4e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0397278 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3170  transcriptional regulator  44.9 
 
 		 327 aa  275  5e-73  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2922  transcriptional regulator  44.44 
 
 		 337 aa  271  8.000000000000001e-72  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1567  AraC family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 337 aa  271  8.000000000000001e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.226821  normal  0.377129 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2488  AraC family transcriptional regulator  43.17 
 
 		 344 aa  268  8.999999999999999e-71  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1270  transcriptional regulator  42.77 
 
 		 334 aa  268  1e-70  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.314543  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0490  transcriptional regulator  43.23 
 
 		 364 aa  265  1e-69  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0323  AraC family transcriptional regulator  42.36 
 
 		 368 aa  262  6e-69  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2444  transcriptional regulator  43.83 
 
 		 331 aa  262  6e-69  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0668048  hitchhiker  0.000772272 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0298  AraC family transcriptional regulator  42.36 
 
 		 368 aa  262  6.999999999999999e-69  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000218642 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1950  transcriptional regulator  44.26 
 
 		 341 aa  261  1e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0318  AraC family transcriptional regulator  42.36 
 
 		 368 aa  261  1e-68  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.120478 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3487  AraC family transcriptional regulator  42.9 
 
 		 332 aa  261  2e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.1866 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001535  transcriptional regulator AraC family  41.5 
 
 		 318 aa  260  3e-68  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4021  AraC family transcriptional regulator  40.38 
 
 		 353 aa  260  3e-68  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.322888  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2664  AraC family transcriptional regulator  41.04 
 
 		 368 aa  260  3e-68  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0165303  normal  0.567946 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4910  AraC family transcriptional regulator  42.36 
 
 		 368 aa  259  3e-68  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00942326 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0457  transcriptional regulator  42.58 
 
 		 332 aa  260  3e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.99008  normal  0.0292699 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5090  AraC family transcriptional regulator  42.58 
 
 		 332 aa  259  6e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.893585 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4565  AraC family transcriptional regulator  42.58 
 
 		 332 aa  259  6e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.644708 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3933  AraC family transcriptional regulator  43.13 
 
 		 337 aa  258  8e-68  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5109  AraC family transcriptional regulator  42.26 
 
 		 332 aa  258  1e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.771046  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71070  AraC family transcriptional regulator  42.72 
 
 		 367 aa  258  1e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6166  putative transcriptional regulator  42.72 
 
 		 367 aa  258  1e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.165565  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0347  transcriptional regulator, AraC family  43.56 
 
 		 322 aa  258  1e-67  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2253  AraC family transcriptional regulator  41.16 
 
 		 321 aa  257  2e-67  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5170  AraC family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 355 aa  256  3e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0119945  normal  0.398909 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3197  AraC family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 355 aa  256  3e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4708  helix-turn-helix, AraC type:ThiJ/PfpI  42.53 
 
 		 367 aa  256  5e-67  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5236  transcriptional regulator  42.21 
 
 		 367 aa  255  6e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.59007  normal  0.0230056 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0465  transcriptional regulator, AraC family  42.21 
 
 		 367 aa  255  8e-67  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5086  AraC family transcriptional regulator  43.71 
 
 		 371 aa  255  8e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.754601 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3282  AraC family transcriptional regulator  43.71 
 
 		 371 aa  255  8e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5199  AraC family transcriptional regulator  43.71 
 
 		 341 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0570  transcriptional regulator  43.71 
 
 		 371 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3545  AraC family transcriptional regulator  43.71 
 
 		 341 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0987  transcriptional regulator  42.76 
 
 		 375 aa  254  2.0000000000000002e-66  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1865  AraC family transcriptional regulator  38.94 
 
 		 332 aa  253  3e-66  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2590  transcriptional regulator AraC family  39.05 
 
 		 337 aa  253  4.0000000000000004e-66  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1319  AraC family transcriptional regulator  38.23 
 
 		 332 aa  252  5.000000000000001e-66  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1794  AraC family transcriptional regulator  40.57 
 
 		 338 aa  252  5.000000000000001e-66  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.112719  hitchhiker  0.00342809 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0968  AraC family transcriptional regulator  42.07 
 
 		 332 aa  252  6e-66  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5023  AraC family transcriptional regulator  43.08 
 
 		 341 aa  251  1e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3304  AraC family transcriptional regulator  43.08 
 
 		 338 aa  251  1e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.176571  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3735  helix-turn-helix domain-containing protein  42.95 
 
 		 343 aa  250  3e-65  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.43988 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1931  AraC family transcriptional regulator  40.95 
 
 		 332 aa  249  4e-65  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.746291  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0448  AraC family transcriptional regulator  40.95 
 
 		 332 aa  249  4e-65  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5062  transcriptional regulator, AraC family  42.19 
 
 		 331 aa  249  4e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.652687  normal  0.0215007 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1868  AraC family transcriptional regulator  40.95 
 
 		 332 aa  249  5e-65  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2025  AraC family transcriptional regulator  40.95 
 
 		 332 aa  249  5e-65  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0901  AraC family transcriptional regulator  40.95 
 
 		 332 aa  249  5e-65  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0566  AraC family transcriptional regulator  40.95 
 
 		 332 aa  249  5e-65  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.207783  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1869  AraC family transcriptional regulator  42.45 
 
 		 341 aa  248  7e-65  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1140  AraC family transcriptional regulator  43.28 
 
 		 322 aa  249  7e-65  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0567003 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4030  transcriptional regulator, AraC family  42.62 
 
 		 343 aa  248  7e-65  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.364388 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4498  AraC family transcriptional regulator  42.77 
 
 		 340 aa  248  1e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02029  transcriptional regulator transcription regulator protein  42.27 
 
 		 343 aa  247  2e-64  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.130887 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4809  transcriptional regulator  39.69 
 
 		 331 aa  247  2e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.193614  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3394  transcriptional regulator, AraC family  41.97 
 
 		 334 aa  247  2e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2406  transcriptional regulator, AraC family  38.91 
 
 		 339 aa  247  2e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0277312 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2152  transcriptional regulator, AraC family  38.41 
 
 		 340 aa  247  2e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.49496 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0469  AraC family transcriptional regulator  42.45 
 
 		 369 aa  246  3e-64  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2105  AraC family transcriptional regulator  42.45 
 
 		 421 aa  246  3e-64  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1980  AraC family transcriptional regulator  42.45 
 
 		 341 aa  246  3e-64  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.433985  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0711  AraC family transcriptional regulator  42.45 
 
 		 341 aa  246  3e-64  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1007  AraC family transcriptional regulator  42.45 
 
 		 365 aa  246  4e-64  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.809611  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3990  transcriptional regulator, AraC family  42.62 
 
 		 344 aa  246  4e-64  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0739  AraC family transcriptional regulator  42.45 
 
 		 365 aa  246  4e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1586  transcriptional regulator  42.01 
 
 		 333 aa  245  6.999999999999999e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02043  transcriptional regulator transcription regulator protein  40.13 
 
 		 334 aa  243  1.9999999999999999e-63  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1525  HTH-type transcriptional regulator  41.83 
 
 		 339 aa  244  1.9999999999999999e-63  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.199497 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0827  AraC family transcriptional regulator  42.14 
 
 		 365 aa  243  3e-63  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1937  transcriptional regulator, AraC family  44.15 
 
 		 331 aa  243  3e-63  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>