More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_4498 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007511  Bcep18194_B0570  transcriptional regulator  96.18 
 
 		 371 aa  648    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5199  AraC family transcriptional regulator  95.59 
 
 		 341 aa  644    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5023  AraC family transcriptional regulator  98.24 
 
 		 341 aa  662    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3545  AraC family transcriptional regulator  95 
 
 		 341 aa  638    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3282  AraC family transcriptional regulator  95.29 
 
 		 371 aa  642    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5086  AraC family transcriptional regulator  95.29 
 
 		 371 aa  642    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.754601 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4498  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 340 aa  704    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0739  AraC family transcriptional regulator  90.59 
 
 		 365 aa  614  1e-175  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0469  AraC family transcriptional regulator  90.59 
 
 		 369 aa  614  1e-175  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1007  AraC family transcriptional regulator  90.59 
 
 		 365 aa  614  1e-175  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.809611  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1869  AraC family transcriptional regulator  90.59 
 
 		 341 aa  615  1e-175  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1980  AraC family transcriptional regulator  90.59 
 
 		 341 aa  614  1e-175  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.433985  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0711  AraC family transcriptional regulator  90.59 
 
 		 341 aa  614  1e-175  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2105  AraC family transcriptional regulator  90.59 
 
 		 421 aa  613  9.999999999999999e-175  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3304  AraC family transcriptional regulator  92.58 
 
 		 338 aa  613  9.999999999999999e-175  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.176571  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0827  AraC family transcriptional regulator  90 
 
 		 365 aa  608  1e-173  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1586  transcriptional regulator  91.1 
 
 		 333 aa  595  1e-169  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5062  transcriptional regulator, AraC family  91.41 
 
 		 331 aa  596  1e-169  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.652687  normal  0.0215007 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4823  transcriptional regulator  87.65 
 
 		 338 aa  582  1.0000000000000001e-165  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02029  transcriptional regulator transcription regulator protein  89.91 
 
 		 343 aa  571  1.0000000000000001e-162  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.130887 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0968  AraC family transcriptional regulator  56.87 
 
 		 332 aa  374  1e-102  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0566  AraC family transcriptional regulator  56.59 
 
 		 332 aa  369  1e-101  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.207783  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2025  AraC family transcriptional regulator  56.59 
 
 		 332 aa  369  1e-101  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0448  AraC family transcriptional regulator  56.59 
 
 		 332 aa  369  1e-101  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1931  AraC family transcriptional regulator  56.59 
 
 		 332 aa  369  1e-101  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.746291  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3487  AraC family transcriptional regulator  55.91 
 
 		 332 aa  369  1e-101  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.1866 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1868  AraC family transcriptional regulator  56.59 
 
 		 332 aa  369  1e-101  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0901  AraC family transcriptional regulator  56.59 
 
 		 332 aa  369  1e-101  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0457  transcriptional regulator  55.59 
 
 		 332 aa  367  1e-100  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.99008  normal  0.0292699 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5090  AraC family transcriptional regulator  55.27 
 
 		 332 aa  365  1e-100  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.893585 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4565  AraC family transcriptional regulator  55.27 
 
 		 332 aa  365  1e-100  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.644708 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5170  AraC family transcriptional regulator  55.27 
 
 		 355 aa  363  2e-99  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0119945  normal  0.398909 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5109  AraC family transcriptional regulator  54.95 
 
 		 332 aa  363  2e-99  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.771046  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3197  AraC family transcriptional regulator  55.27 
 
 		 355 aa  363  2e-99  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02043  transcriptional regulator transcription regulator protein  55.45 
 
 		 334 aa  362  6e-99  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4809  transcriptional regulator  53.53 
 
 		 331 aa  353  2e-96  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.193614  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3448  AraC family transcriptional regulator  55.77 
 
 		 325 aa  345  5e-94  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1614  transcriptional regulator  56.87 
 
 		 332 aa  344  1e-93  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5042  transcriptional regulator, AraC family  56.23 
 
 		 332 aa  342  5e-93  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.363358  normal  0.505144 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4061  AraC family transcriptional regulator  50.93 
 
 		 401 aa  335  7e-91  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.135508  normal  0.429541 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7695  transcriptional regulator  50.79 
 
 		 324 aa  325  6e-88  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.529732 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4021  AraC family transcriptional regulator  48.87 
 
 		 353 aa  317  2e-85  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.322888  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0490  transcriptional regulator  48.06 
 
 		 364 aa  301  9e-81  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2664  AraC family transcriptional regulator  46.33 
 
 		 368 aa  299  4e-80  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0165303  normal  0.567946 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6166  putative transcriptional regulator  46.44 
 
 		 367 aa  299  5e-80  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.165565  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71070  AraC family transcriptional regulator  46.44 
 
 		 367 aa  299  5e-80  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0987  transcriptional regulator  49.03 
 
 		 375 aa  299  5e-80  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2922  transcriptional regulator  46.84 
 
 		 337 aa  297  2e-79  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1567  AraC family transcriptional regulator  46.84 
 
 		 337 aa  297  2e-79  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.226821  normal  0.377129 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0323  AraC family transcriptional regulator  47.13 
 
 		 368 aa  295  1e-78  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1100  AraC family transcriptional regulator  45.79 
 
 		 334 aa  293  2e-78  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0397278 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4910  AraC family transcriptional regulator  47.13 
 
 		 368 aa  293  2e-78  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00942326 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0298  AraC family transcriptional regulator  47.06 
 
 		 368 aa  292  5e-78  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000218642 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4708  helix-turn-helix, AraC type:ThiJ/PfpI  47.56 
 
 		 367 aa  291  1e-77  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0318  AraC family transcriptional regulator  47.06 
 
 		 368 aa  291  1e-77  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.120478 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0465  transcriptional regulator, AraC family  47.06 
 
 		 367 aa  290  2e-77  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5236  transcriptional regulator  47.23 
 
 		 367 aa  290  2e-77  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.59007  normal  0.0230056 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2488  AraC family transcriptional regulator  45.22 
 
 		 344 aa  278  8e-74  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1270  transcriptional regulator  43.71 
 
 		 334 aa  276  3e-73  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.314543  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3933  AraC family transcriptional regulator  46.25 
 
 		 337 aa  275  9e-73  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3394  transcriptional regulator, AraC family  43.65 
 
 		 334 aa  275  1.0000000000000001e-72  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3990  transcriptional regulator, AraC family  45.42 
 
 		 344 aa  274  1.0000000000000001e-72  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3735  helix-turn-helix domain-containing protein  45.25 
 
 		 343 aa  274  1.0000000000000001e-72  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.43988 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4030  transcriptional regulator, AraC family  45.25 
 
 		 343 aa  274  2.0000000000000002e-72  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.364388 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2444  transcriptional regulator  44.59 
 
 		 331 aa  272  5.000000000000001e-72  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0668048  hitchhiker  0.000772272 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1001  AraC family transcriptional regulator  45.48 
 
 		 324 aa  271  2e-71  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0569552  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1865  AraC family transcriptional regulator  43.73 
 
 		 332 aa  271  2e-71  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1111  AraC family transcriptional regulator  42.07 
 
 		 339 aa  271  2e-71  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000893396  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0829  transcriptional regulator  44.55 
 
 		 317 aa  270  2e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.351289 
 
 
-
 
NC_004310  BR1319  AraC family transcriptional regulator  43.41 
 
 		 332 aa  270  2.9999999999999997e-71  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71170  AraC family transcriptional regulator  43.14 
 
 		 336 aa  270  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6176  putative transcriptional regulator  43.14 
 
 		 336 aa  269  4e-71  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2406  transcriptional regulator, AraC family  41.07 
 
 		 339 aa  266  2.9999999999999995e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0277312 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2152  transcriptional regulator, AraC family  40.81 
 
 		 340 aa  266  2.9999999999999995e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.49496 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2590  transcriptional regulator AraC family  41.4 
 
 		 337 aa  265  5.999999999999999e-70  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2915  helix-turn-helix, AraC type:ThiJ/PfpI  42.77 
 
 		 325 aa  265  8e-70  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.904255  normal  0.163293 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1794  AraC family transcriptional regulator  42.81 
 
 		 338 aa  265  1e-69  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.112719  hitchhiker  0.00342809 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5229  transcriptional regulator  43.37 
 
 		 314 aa  265  1e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.35662  normal  0.0289181 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2238  AraC family transcriptional regulator  47.1 
 
 		 330 aa  264  2e-69  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.390455  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5064  AraC family transcriptional regulator  45.63 
 
 		 314 aa  263  3e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3303  AraC family transcriptional regulator  45.63 
 
 		 314 aa  263  3e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0329  AraC family transcriptional regulator  43.09 
 
 		 314 aa  263  4e-69  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4999  AraC family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 314 aa  263  4e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.258482  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4474  AraC family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 314 aa  263  4e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4511  transcriptional regulator, AraC family  44.34 
 
 		 341 aa  262  4.999999999999999e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.88084  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0599  transcriptional regulator  45.45 
 
 		 326 aa  262  4.999999999999999e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.703076 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0305  AraC family transcriptional regulator  43.32 
 
 		 319 aa  262  6.999999999999999e-69  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00276318 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0325  AraC family transcriptional regulator  43.32 
 
 		 315 aa  262  6.999999999999999e-69  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.416285 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3665  AraC family transcriptional regulator  45.34 
 
 		 401 aa  261  8e-69  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.747363  normal  0.253179 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2064  AraC family transcriptional regulator  44.82 
 
 		 335 aa  260  2e-68  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.405224  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3277  AraC family transcriptional regulator  43.04 
 
 		 339 aa  259  3e-68  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1525  HTH-type transcriptional regulator  42.99 
 
 		 339 aa  260  3e-68  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.199497 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2234  AraC family transcriptional regulator  45.91 
 
 		 335 aa  259  4e-68  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.498713 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3287  AraC family transcriptional regulator  44.63 
 
 		 331 aa  259  4e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.242748  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5220  AraC family transcriptional regulator  45.31 
 
 		 314 aa  258  8e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.974611 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1850  AraC family transcriptional regulator  43.73 
 
 		 314 aa  257  3e-67  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.999636  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0692  AraC family transcriptional regulator  42.67 
 
 		 314 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0988  AraC family transcriptional regulator  42.67 
 
 		 314 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1960  AraC family transcriptional regulator  42.67 
 
 		 314 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4903  AraC family transcriptional regulator  42.02 
 
 		 315 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.208419 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>