More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_6617 on replicon NC_012858
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012858  Rleg_6617  transcriptional regulator, AraC family  100 
 
 		 287 aa  593  1e-168  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.131937 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1041  helix-turn-helix, AraC type:Arac protein, arabinose-binding/dimerisation  39.15 
 
 		 291 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.29946 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0932  AraC family transcriptional regulator  40 
 
 		 291 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4587  AraC family transcriptional regulator  40.14 
 
 		 291 aa  195  8.000000000000001e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.213128  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4464  helix-turn-helix domain-containing protein  38.93 
 
 		 291 aa  193  2e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4605  AraC family transcriptional regulator  38.93 
 
 		 291 aa  192  5e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0859  AraC family transcriptional regulator  39.78 
 
 		 291 aa  191  1e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.775109  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1213  transcriptional regulator, AraC family  37.63 
 
 		 291 aa  187  1e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6513  transcriptional regulator, AraC family  40.48 
 
 		 306 aa  187  2e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1732  transcriptional regulator, AraC family  39.1 
 
 		 288 aa  186  5e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0803469 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3238  AraC family transcriptional regulator  37.76 
 
 		 290 aa  178  8e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.996927 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2907  transcriptional regulator, AraC family  39.03 
 
 		 289 aa  177  2e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0560618  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4324  transcriptional regulator, AraC family  39.15 
 
 		 305 aa  176  3e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0282215 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4214  transcriptional regulator, AraC family  39.15 
 
 		 305 aa  176  3e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05428  transcription regulator protein  37.76 
 
 		 324 aa  175  7e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1207  putative transcriptional regulator  37.1 
 
 		 293 aa  169  5e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3174  helix-turn-helix domain-containing protein  35.91 
 
 		 287 aa  168  9e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3175  helix-turn-helix domain-containing protein  35.91 
 
 		 287 aa  168  1e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1196  transcriptional regulator, AraC family  35.91 
 
 		 287 aa  168  1e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3318  AraC family transcriptional regulator  35.91 
 
 		 287 aa  168  1e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.877504 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13470  AraC family transcriptional regulator  36.3 
 
 		 293 aa  167  2e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0899227  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1980  AraC family transcriptional regulator  34.8 
 
 		 293 aa  165  6.9999999999999995e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.949603 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0536  AraC family transcriptional regulator  37.73 
 
 		 304 aa  162  7e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5332  AraC family transcriptional regulator  35.23 
 
 		 301 aa  161  1e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2093  AraC family transcriptional regulator  35.52 
 
 		 287 aa  160  2e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.369123  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2507  transcriptional regulator, AraC family  35.74 
 
 		 291 aa  157  2e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2932  transcriptional regulator, AraC family  35.97 
 
 		 293 aa  155  6e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4258  AraC family transcriptional regulator  33.8 
 
 		 327 aa  155  7e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2413  transcriptional regulator, AraC family  36.79 
 
 		 322 aa  154  1e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.333457  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5804  AraC family transcriptional regulator  33.92 
 
 		 305 aa  154  2e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6955  transcriptional regulator, AraC family  32.97 
 
 		 346 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.737934  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2337  AraC family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 289 aa  152  8e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000580503  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2046  AraC family transcriptional regulator  33.1 
 
 		 291 aa  151  1e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0173792  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1909  AraC family transcriptional regulator  33.45 
 
 		 315 aa  150  2e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.190572  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0867  AraC family transcriptional regulator  33.45 
 
 		 315 aa  150  2e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000394258  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2701  AraC family transcriptional regulator  33.45 
 
 		 315 aa  150  2e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.137316  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3203  AraC family transcriptional regulator  33.45 
 
 		 315 aa  149  4e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.10279  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3164  AraC family transcriptional regulator  33.45 
 
 		 332 aa  149  4e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0245945  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0798  AraC family transcriptional regulator  33.91 
 
 		 311 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0345  AraC family transcriptional regulator  33.91 
 
 		 311 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0829  AraC family transcriptional regulator  33.91 
 
 		 311 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0210284  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3921  AraC family transcriptional regulator  33.91 
 
 		 311 aa  146  5e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.892105 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1405  AraC family transcriptional regulator  35.66 
 
 		 251 aa  145  1e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000697123  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3218  AraC family transcriptional regulator  33.1 
 
 		 678 aa  144  2e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000051538  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2934  helix-turn-helix domain-containing protein  32.45 
 
 		 310 aa  142  8e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0219137  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2555  AraC family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 311 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0708  AraC family transcriptional regulator  31.72 
 
 		 311 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0725  AraC family transcriptional regulator  31.72 
 
 		 311 aa  139  6e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.576949 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5208  AraC family transcriptional regulator  35.74 
 
 		 314 aa  138  1e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.360222  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1881  transcriptional regulator, AraC family  33.45 
 
 		 305 aa  134  3e-30  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.831794  normal  0.0117859 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7634  transcriptional regulator AraC family  31.06 
 
 		 304 aa  100  4e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.63081  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0624  AraC family transcriptional regulator  37.35 
 
 		 299 aa  100  4e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.401422 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4229  transcriptional regulator, AraC family  33.33 
 
 		 278 aa  99.8  5e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2401  transcriptional regulator, AraC family  46.67 
 
 		 202 aa  98.2  1e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1111  transcriptional regulator, AraC family  47.17 
 
 		 312 aa  98.2  1e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5827  helix-turn-helix domain-containing protein  32.03 
 
 		 316 aa  97.8  2e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.112164  normal  0.283627 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1365  AraC family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 353 aa  96.7  4e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.122979  normal  0.036458 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3971  putative transcriptional regulator  35.03 
 
 		 272 aa  95.9  6e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.347316  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0082  transcriptional regulator, AraC family  31.8 
 
 		 292 aa  95.9  6e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.628575  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5475  transcriptional regulator, AraC family  31.94 
 
 		 305 aa  95.9  7e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.59164  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29260  putative transcriptional regulator  34.46 
 
 		 297 aa  95.9  7e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3402  AraC protein, arabinose-binding/dimerisation  33.94 
 
 		 281 aa  94.4  2e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3089  helix-turn-helix domain-containing protein  30.13 
 
 		 297 aa  94.7  2e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.830597 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5108  AraC family transcriptional regulator  43.12 
 
 		 316 aa  92.4  8e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.310256  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0091  AraC family transcriptional regulator  39.32 
 
 		 278 aa  92  9e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1148  transcriptional regulator, AraC family  27.78 
 
 		 309 aa  91.7  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05505  putative transcription regulator protein  35.98 
 
 		 270 aa  90.9  2e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0517  helix-turn-helix domain-containing protein  38.22 
 
 		 180 aa  90.9  2e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.970363 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3482  AraC family transcriptional regulator  36.48 
 
 		 299 aa  90.9  2e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.675068  normal  0.589184 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3976  helix-turn-helix domain-containing protein  39.32 
 
 		 336 aa  90.5  3e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2383  AraC family transcriptional regulator  39.83 
 
 		 281 aa  89.4  6e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.499508  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2139  helix-turn-helix domain-containing protein  36.03 
 
 		 294 aa  89.4  6e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.957349  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3475  helix-turn-helix domain-containing protein  29.86 
 
 		 292 aa  89.4  6e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3312  AraC family transcriptional regulator  39.83 
 
 		 281 aa  89.4  6e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.403912 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0180  AraC family transcriptional regulator  40 
 
 		 223 aa  89.4  7e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4645  transcriptional regulator, AraC family  45.74 
 
 		 112 aa  89  9e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0412729 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4513  transcriptional regulator, AraC family  44.44 
 
 		 133 aa  89  9e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2669  AraC family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 188 aa  88.2  1e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.588575  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3417  AraC family transcriptional regulator  28.68 
 
 		 299 aa  88.2  1e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.138414  normal  0.441033 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1279  helix-turn-helix domain-containing protein  35.05 
 
 		 306 aa  88.2  1e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.665979 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4732  helix-turn-helix domain-containing protein  29.81 
 
 		 293 aa  87.4  2e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0052536 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1509  transcriptional regulator AraC family  36.36 
 
 		 284 aa  88.2  2e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1472  AraC family transcriptional regulator  29.76 
 
 		 292 aa  87.8  2e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.327977  normal  0.780269 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3996  helix-turn-helix domain-containing protein  27.44 
 
 		 289 aa  87.8  2e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1477  transcriptional regulator, AraC family  28.33 
 
 		 278 aa  87.8  2e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.000537918  unclonable  0.00000296813 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1989  AraC family transcriptional regulator  39.32 
 
 		 277 aa  87  3e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.753386  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6717  transcriptional regulator, AraC family  28.63 
 
 		 296 aa  86.7  4e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.121518  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42360  transcriptional regulator, AraC family  34.18 
 
 		 318 aa  86.7  4e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1458  AraC family transcriptional regulator  42.37 
 
 		 301 aa  86.7  4e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7037  AraC family transcriptional regulator  42.37 
 
 		 301 aa  86.7  4e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.283867  normal  0.289972 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0085  transcriptional regulator, AraC family  41.9 
 
 		 296 aa  86.7  4e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0195711 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2300  AraC family transcriptional regulator  40.43 
 
 		 274 aa  86.7  4e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.457981  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6370  AraC family transcriptional regulator  42.37 
 
 		 301 aa  86.7  4e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6068  AraC family transcriptional regulator  43.48 
 
 		 287 aa  86.3  5e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3162  AraC family transcriptional regulator  32.29 
 
 		 285 aa  86.3  6e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1472  transcriptional regulator, AraC family  30.28 
 
 		 269 aa  85.5  8e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.462639  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2855  AraC family substrate binding transcriptional regulator  32.5 
 
 		 280 aa  85.1  0.000000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.222069  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1895  AraC family transcriptional regulator  39.32 
 
 		 277 aa  85.1  0.000000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4111  transcriptional regulator, AraC family  40.3 
 
 		 299 aa  85.5  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.596036  normal  0.240547 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4223  transcriptional regulator, AraC family  40.3 
 
 		 299 aa  85.5  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>