More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_5208 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_5208  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 314 aa  636    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.360222  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4214  transcriptional regulator, AraC family  42.91 
 
 		 305 aa  215  9e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4324  transcriptional regulator, AraC family  42.91 
 
 		 305 aa  215  9e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0282215 
 
 
-
 
NC_003296  RS05428  transcription regulator protein  42.14 
 
 		 324 aa  214  1.9999999999999998e-54  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4587  AraC family transcriptional regulator  41.39 
 
 		 291 aa  203  3e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.213128  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4464  helix-turn-helix domain-containing protein  41.24 
 
 		 291 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4605  AraC family transcriptional regulator  40.88 
 
 		 291 aa  200  3e-50  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1207  putative transcriptional regulator  43.12 
 
 		 293 aa  199  7e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5804  AraC family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 305 aa  197  1.0000000000000001e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13470  AraC family transcriptional regulator  43.12 
 
 		 293 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0899227  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3238  AraC family transcriptional regulator  41.99 
 
 		 290 aa  196  5.000000000000001e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.996927 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5332  AraC family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 301 aa  195  7e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0859  AraC family transcriptional regulator  38.57 
 
 		 291 aa  193  3e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.775109  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6955  transcriptional regulator, AraC family  38.87 
 
 		 346 aa  190  2e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.737934  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1041  helix-turn-helix, AraC type:Arac protein, arabinose-binding/dimerisation  37.5 
 
 		 291 aa  187  2e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.29946 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0932  AraC family transcriptional regulator  38.08 
 
 		 291 aa  186  5e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4258  AraC family transcriptional regulator  36.89 
 
 		 327 aa  186  5e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1213  transcriptional regulator, AraC family  36.55 
 
 		 291 aa  185  8e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3921  AraC family transcriptional regulator  36.79 
 
 		 311 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.892105 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0798  AraC family transcriptional regulator  36.97 
 
 		 311 aa  179  7e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0345  AraC family transcriptional regulator  37.32 
 
 		 311 aa  178  1e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0829  AraC family transcriptional regulator  37.32 
 
 		 311 aa  178  1e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0210284  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6513  transcriptional regulator, AraC family  36.77 
 
 		 306 aa  172  1e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1732  transcriptional regulator, AraC family  36.73 
 
 		 288 aa  169  6e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0803469 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2046  AraC family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 291 aa  167  2e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0173792  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1909  AraC family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 315 aa  167  2e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.190572  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0867  AraC family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 315 aa  167  2e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000394258  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2701  AraC family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 315 aa  167  2e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.137316  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2907  transcriptional regulator, AraC family  35.94 
 
 		 289 aa  167  2.9999999999999998e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0560618  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3203  AraC family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 315 aa  166  4e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.10279  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3164  AraC family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 332 aa  166  4e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0245945  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2507  transcriptional regulator, AraC family  39.44 
 
 		 291 aa  164  2.0000000000000002e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0708  AraC family transcriptional regulator  37.32 
 
 		 311 aa  161  1e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0725  AraC family transcriptional regulator  37.32 
 
 		 311 aa  160  2e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.576949 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3218  AraC family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 678 aa  160  3e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000051538  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2555  AraC family transcriptional regulator  36.27 
 
 		 311 aa  160  3e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2413  transcriptional regulator, AraC family  37.88 
 
 		 322 aa  160  3e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.333457  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2932  transcriptional regulator, AraC family  38.55 
 
 		 293 aa  159  4e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1980  AraC family transcriptional regulator  36.04 
 
 		 293 aa  158  1e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.949603 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2337  AraC family transcriptional regulator  37.81 
 
 		 289 aa  154  2e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000580503  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1405  AraC family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 251 aa  153  4e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000697123  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6617  transcriptional regulator, AraC family  35.74 
 
 		 287 aa  151  1e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.131937 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2934  helix-turn-helix domain-containing protein  33.58 
 
 		 310 aa  149  8e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0219137  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0536  AraC family transcriptional regulator  34.23 
 
 		 304 aa  146  3e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1881  transcriptional regulator, AraC family  35.35 
 
 		 305 aa  145  9e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.831794  normal  0.0117859 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2093  AraC family transcriptional regulator  28.89 
 
 		 287 aa  129  4.0000000000000003e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.369123  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3174  helix-turn-helix domain-containing protein  28.32 
 
 		 287 aa  126  4.0000000000000003e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1196  transcriptional regulator, AraC family  28.32 
 
 		 287 aa  126  6e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3318  AraC family transcriptional regulator  28.32 
 
 		 287 aa  125  7e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.877504 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3175  helix-turn-helix domain-containing protein  28.32 
 
 		 287 aa  125  7e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3996  helix-turn-helix domain-containing protein  32.44 
 
 		 289 aa  87.4  3e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1472  AraC family transcriptional regulator  29.12 
 
 		 292 aa  84.7  0.000000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.327977  normal  0.780269 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7634  transcriptional regulator AraC family  28.97 
 
 		 304 aa  83.2  0.000000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.63081  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2282  putative transcriptional regulator  29.2 
 
 		 294 aa  80.9  0.00000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1148  transcriptional regulator, AraC family  34.51 
 
 		 309 aa  78.6  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4229  transcriptional regulator, AraC family  31.6 
 
 		 278 aa  77.4  0.0000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3417  AraC family transcriptional regulator  29.76 
 
 		 299 aa  77  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.138414  normal  0.441033 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1268  transcriptional regulator, AraC family  34.12 
 
 		 300 aa  75.9  0.0000000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2981  AraC family transcriptional regulator  28.29 
 
 		 305 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5475  transcriptional regulator, AraC family  41.51 
 
 		 305 aa  75.5  0.000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.59164  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5215  helix-turn-helix domain-containing protein  28.5 
 
 		 331 aa  74.7  0.000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2348  AraC family transcriptional regulator  46.43 
 
 		 277 aa  75.1  0.000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0624  AraC family transcriptional regulator  41.35 
 
 		 299 aa  74.3  0.000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.401422 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6068  AraC family transcriptional regulator  41.59 
 
 		 287 aa  73.9  0.000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4978  transcriptional regulator, AraC family  28.29 
 
 		 318 aa  73.6  0.000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.327567  normal  0.11746 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2638  transcriptional regulator, AraC family  35.42 
 
 		 282 aa  73.2  0.000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0091  AraC family transcriptional regulator  43.82 
 
 		 278 aa  72.8  0.000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3231  transcriptional regulator, AraC family  35.71 
 
 		 250 aa  72.4  0.000000000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0517  helix-turn-helix domain-containing protein  40.19 
 
 		 180 aa  72.4  0.000000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.970363 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2469  AraC family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 361 aa  72  0.00000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5000  AraC family transcriptional regulator  27.09 
 
 		 305 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5860  AraC family transcriptional regulator  27.09 
 
 		 305 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.499461  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2383  AraC family transcriptional regulator  47.56 
 
 		 281 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.499508  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4318  AraC family transcriptional regulator  27.09 
 
 		 305 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00219342 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2799  AraC family transcriptional regulator  43.81 
 
 		 269 aa  70.9  0.00000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0653395  normal  0.0991111 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3312  AraC family transcriptional regulator  47.56 
 
 		 281 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.403912 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1650  AraC family transcriptional regulator  34.53 
 
 		 316 aa  70.9  0.00000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3129  AraC family transcriptional regulator  35.51 
 
 		 299 aa  70.5  0.00000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1673  AraC family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 314 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.310754 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2401  transcriptional regulator, AraC family  40.68 
 
 		 202 aa  70.9  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1989  AraC family transcriptional regulator  47.56 
 
 		 277 aa  70.5  0.00000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.753386  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42360  transcriptional regulator, AraC family  33.33 
 
 		 318 aa  70.1  0.00000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4172  AraC family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 295 aa  70.5  0.00000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0833223  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3740  helix-turn-helix domain-containing protein  39.05 
 
 		 301 aa  70.5  0.00000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.436963  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2723  AraC family transcriptional regulator  40.59 
 
 		 273 aa  70.5  0.00000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0671245 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0479  AraC family transcriptional regulator  28.46 
 
 		 279 aa  70.5  0.00000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00109362 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4223  transcriptional regulator, AraC family  35.71 
 
 		 299 aa  69.7  0.00000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0577  AraC family transcriptional regulator  32.68 
 
 		 313 aa  69.7  0.00000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54190  proline utilization regulator  30.83 
 
 		 250 aa  69.7  0.00000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2736  AraC family transcriptional regulator  37.61 
 
 		 154 aa  69.7  0.00000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.66637 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4111  transcriptional regulator, AraC family  35.71 
 
 		 299 aa  69.7  0.00000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.596036  normal  0.240547 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0180  AraC family transcriptional regulator  39.42 
 
 		 223 aa  69.3  0.00000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5093  AraC family transcriptional regulator  27.09 
 
 		 301 aa  69.3  0.00000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.467029 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4739  proline utilization regulator  30.83 
 
 		 250 aa  69.3  0.00000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.284133  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3244  AraC family transcriptional regulator  27.09 
 
 		 301 aa  69.3  0.00000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.432164 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1225  AraC family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 249 aa  68.9  0.00000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.615855  normal  0.0441463 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0716  AraC family transcriptional regulator  35.24 
 
 		 296 aa  68.9  0.0000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00193737 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2224  AraC family transcriptional regulator  30.41 
 
 		 278 aa  68.6  0.0000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000575993  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0085  transcriptional regulator, AraC family  38.95 
 
 		 296 aa  68.9  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0195711 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4687  AraC family transcriptional regulator  37.19 
 
 		 287 aa  68.9  0.0000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>