More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_0577 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008254  Meso_0577  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 
313 aa  644    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3327  AraC family transcriptional regulator  34.02 
 
 
279 aa  144  2e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.414693  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2935  transcriptional regulator, AraC family  33.76 
 
 
276 aa  136  4e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000000465121  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2383  AraC family transcriptional regulator  34.3 
 
 
281 aa  136  5e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.499508  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3312  AraC family transcriptional regulator  34.3 
 
 
281 aa  136  5e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.403912 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1895  AraC family transcriptional regulator  33.88 
 
 
277 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5342  AraC family transcriptional regulator  33.47 
 
 
276 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.975436  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1989  AraC family transcriptional regulator  34.44 
 
 
277 aa  133  3e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.753386  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001441  L-rhamnose operon transcriptional activator RhaR  31.84 
 
 
275 aa  133  5e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0236  AraC/XylS family transcriptional regulator  32.58 
 
 
277 aa  130  2.0000000000000002e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3138  AraC family transcriptional regulator  30.65 
 
 
279 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.606385 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06279  hypothetical protein  30.45 
 
 
275 aa  127  3e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2300  AraC family transcriptional regulator  29.96 
 
 
274 aa  126  4.0000000000000003e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.457981  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1049  AraC family transcriptional regulator  33.61 
 
 
276 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000110999  normal  0.626735 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2855  AraC family substrate binding transcriptional regulator  29.5 
 
 
280 aa  126  5e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.222069  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2537  AraC family transcriptional regulator  29.81 
 
 
312 aa  126  5e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2527  AraC family transcriptional regulator  32.24 
 
 
278 aa  125  9e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1568  AraC family transcriptional regulator  33.06 
 
 
278 aa  125  9e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2693  AraC family transcriptional regulator  31.93 
 
 
278 aa  124  2e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1460  AraC family transcriptional regulator  32.92 
 
 
278 aa  123  3e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2781  transcriptional regulator, AraC family  32.65 
 
 
271 aa  123  3e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.109963 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1762  AraC/XylS family transcriptional regulator  31.93 
 
 
278 aa  123  4e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2594  AraC family transcriptional regulator  32.08 
 
 
278 aa  123  4e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0918  transcriptional regulator, AraC family  36.8 
 
 
283 aa  123  5e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.473523  normal  0.595819 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1599  AraC family transcriptional regulator  32.65 
 
 
278 aa  122  6e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000366861  normal  0.399443 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1562  AraC family transcriptional regulator  32.65 
 
 
278 aa  122  6e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0731  AraC family transcriptional regulator  34.58 
 
 
285 aa  121  9.999999999999999e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0743378  normal  0.147127 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0977  AraC family transcriptional regulator  30.68 
 
 
300 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00000786642  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0973  AraC family transcriptional regulator  30.68 
 
 
300 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000577914  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21720  AraC family transcriptional regulator  29.92 
 
 
284 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2206  AraC family transcriptional regulator  29.06 
 
 
303 aa  120  3e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000287978  normal  0.709471 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1852  putative transcriptional regulator  30.08 
 
 
284 aa  120  3e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.687343  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1212  transcriptional regulator, AraC-family  29.18 
 
 
280 aa  119  6e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1047  transcriptional regulator, AraC family  32.08 
 
 
273 aa  119  7.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.859066 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1509  transcriptional regulator AraC family  30.33 
 
 
284 aa  118  1.9999999999999998e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0479  AraC family transcriptional regulator  32.27 
 
 
279 aa  117  1.9999999999999998e-25  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00109362 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1463  AraC family transcriptional regulator  31.4 
 
 
279 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2887  transcriptional regulator, AraC family  32.53 
 
 
264 aa  115  1.0000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.700128 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0805  AraC family transcriptional regulator  32.07 
 
 
275 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000161693  normal  0.19096 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1187  transcriptional regulator, AraC-family  30.2 
 
 
278 aa  114  2.0000000000000002e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0806  transcriptional regulator, AraC family  33.46 
 
 
355 aa  112  7.000000000000001e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.311156 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0618  AraC family transcriptional regulator  27.61 
 
 
306 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0105124  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1097  AraC family transcriptional regulator  27.61 
 
 
306 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000000022105  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0091  AraC family transcriptional regulator  34.31 
 
 
278 aa  110  2.0000000000000002e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4210  AraC family transcriptional regulator  29.5 
 
 
299 aa  109  5e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000259018  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1056  AraC family transcriptional regulator  27.61 
 
 
306 aa  108  1e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000221071  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1357  transcriptional regulator, AraC family  32.08 
 
 
277 aa  107  2e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.193095  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1148  transcriptional regulator, AraC family  32.64 
 
 
309 aa  103  5e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1477  transcriptional regulator, AraC family  32.05 
 
 
278 aa  102  9e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.000537918  unclonable  0.00000296813 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2237  putative transcriptional regulator  31.45 
 
 
278 aa  102  1e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5582  transcriptional regulator, AraC family  28.06 
 
 
272 aa  101  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1614  transcriptional regulator, AraC family  27.44 
 
 
366 aa  100  3e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3801  transcriptional regulator, AraC family  27.31 
 
 
278 aa  100  3e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3654  putative transcriptional regulator  33.07 
 
 
274 aa  100  3e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.232111  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2442  AraC family transcriptional regulator  30.17 
 
 
278 aa  99.4  7e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.314191 
 
 
-
 
NC_003296  RS05505  putative transcription regulator protein  29.75 
 
 
270 aa  99  1e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1692  AraC family transcriptional regulator  39.23 
 
 
351 aa  98.6  1e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000028699  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2453  AraC family transcriptional regulator  30.36 
 
 
279 aa  98.6  1e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  unclonable  0.00000000000537916  normal  0.591211 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0085  transcriptional regulator, AraC family  36.97 
 
 
296 aa  97.4  3e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0195711 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26330  AraC family transcriptional regulator  30.92 
 
 
278 aa  97.1  3e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.643276  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4098  AraC family transcriptional regulator  31.02 
 
 
280 aa  96.7  5e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00424275 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7070  transcriptional regulator AraC family  29.83 
 
 
283 aa  96.3  6e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2540  AraC family transcriptional regulator  30.51 
 
 
275 aa  95.9  7e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3646  AraC family transcriptional regulator  32.77 
 
 
275 aa  96.3  7e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00346  AraC family transcriptional regulator  29.88 
 
 
279 aa  95.1  1e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0766  AraC/XylS family transcriptional regulator  30.35 
 
 
273 aa  94.7  2e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1801  AraC family transcriptional regulator  31.45 
 
 
278 aa  94.4  2e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1551  AraC/XylS family transcriptional regulator  31.39 
 
 
275 aa  94.4  2e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0639275  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3855  AraC family transcriptional regulator  29.04 
 
 
285 aa  94.7  2e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2388  AraC family transcriptional regulator  28.68 
 
 
278 aa  94  3e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.262251  unclonable  0.0000340178 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1472  transcriptional regulator, AraC family  29.69 
 
 
269 aa  93.6  4e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.462639  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0382  AraC family transcriptional regulator  31.09 
 
 
274 aa  93.6  4e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1757  transcriptional regulator, AraC family  24.05 
 
 
278 aa  93.6  4e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000137432  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2462  AraC family transcriptional regulator  30.89 
 
 
267 aa  93.2  5e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.177963  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0586  AraC family transcriptional regulator  30.77 
 
 
276 aa  93.2  5e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6409  AraC family transcriptional regulator  28.57 
 
 
258 aa  93.2  5e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.586073  normal  0.525784 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3415  AraC family transcriptional regulator  31.8 
 
 
266 aa  92.8  6e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002090  transcriptional regulator AraC/XylS family  29.88 
 
 
265 aa  93.2  6e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1393  transcriptional regulator, AraC family  31.36 
 
 
277 aa  92  1e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1137  transcriptional regulator, AraC family  29.15 
 
 
270 aa  91.7  1e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3367  AraC family transcriptional regulator  30.38 
 
 
276 aa  92.4  1e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3537  AraC family transcriptional regulator  30.38 
 
 
276 aa  92.4  1e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2795  AraC family transcriptional regulator  25.97 
 
 
275 aa  91.3  2e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1840  AraC family transcriptional regulator  30.92 
 
 
271 aa  89.7  5e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000248404 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2326  transcriptional regulator, AraC family  34.47 
 
 
295 aa  90.1  5e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0937352 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0027  AraC family transcriptional regulator  39.13 
 
 
299 aa  89.7  6e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.618912  normal  0.0626425 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2287  transcriptional regulator, AraC family  31.54 
 
 
300 aa  89.4  7e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6120  transcriptional regulator, AraC family  29.51 
 
 
284 aa  89.4  8e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0719  transcriptional regulator, AraC family  27.69 
 
 
281 aa  88.6  1e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1791  transcriptional regulator, AraC family  31.51 
 
 
277 aa  88.6  1e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0698  AraC family transcriptional regulator  29.12 
 
 
280 aa  88.2  2e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6717  transcriptional regulator, AraC family  32.77 
 
 
296 aa  87.8  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.121518  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3361  helix-turn-helix domain-containing protein  43.81 
 
 
160 aa  87.8  2e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0667  AraC family transcriptional regulator  29.12 
 
 
280 aa  87.4  3e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43580  putative transcriptional regulator  31.08 
 
 
274 aa  87.4  3e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.417491  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3689  AraC family transcriptional regulator  29.12 
 
 
280 aa  87.4  3e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2348  AraC family transcriptional regulator  29.83 
 
 
277 aa  86.7  4e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0688  transcriptional regulator, AraC family  29.28 
 
 
280 aa  86.3  6e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5279  AraC family transcriptional regulator  44.09 
 
 
285 aa  85.9  7e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3402  AraC protein, arabinose-binding/dimerisation  30.71 
 
 
281 aa  85.5  0.000000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>