More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ent638_2348 on replicon NC_009436
Organism: Enterobacter sp. 638



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009436  Ent638_2348  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 
277 aa  571  1.0000000000000001e-162  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1477  transcriptional regulator, AraC family  37.21 
 
 
278 aa  160  3e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.000537918  unclonable  0.00000296813 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2383  AraC family transcriptional regulator  32.59 
 
 
281 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.499508  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3312  AraC family transcriptional regulator  32.59 
 
 
281 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.403912 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2935  transcriptional regulator, AraC family  34.21 
 
 
276 aa  150  2e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000000465121  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3801  transcriptional regulator, AraC family  31.66 
 
 
278 aa  148  7e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0918  transcriptional regulator, AraC family  34.85 
 
 
283 aa  147  1.0000000000000001e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.473523  normal  0.595819 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1049  AraC family transcriptional regulator  34.67 
 
 
276 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000110999  normal  0.626735 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1989  AraC family transcriptional regulator  32.23 
 
 
277 aa  146  3e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.753386  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1357  transcriptional regulator, AraC family  32.55 
 
 
277 aa  146  4.0000000000000006e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.193095  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21720  AraC family transcriptional regulator  31.88 
 
 
284 aa  145  5e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6120  transcriptional regulator, AraC family  34.3 
 
 
284 aa  145  7.0000000000000006e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0805  AraC family transcriptional regulator  33.58 
 
 
275 aa  144  2e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000161693  normal  0.19096 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1895  AraC family transcriptional regulator  31.5 
 
 
277 aa  142  6e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2317  AraC family transcriptional regulator  35.59 
 
 
284 aa  139  6e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3327  AraC family transcriptional regulator  34.22 
 
 
279 aa  138  1e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.414693  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1852  putative transcriptional regulator  31.52 
 
 
284 aa  138  1e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.687343  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2855  AraC family substrate binding transcriptional regulator  31.66 
 
 
280 aa  136  4e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.222069  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5342  AraC family transcriptional regulator  32.74 
 
 
276 aa  135  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.975436  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2527  AraC family transcriptional regulator  31.42 
 
 
278 aa  135  6.0000000000000005e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0973  AraC family transcriptional regulator  34.32 
 
 
300 aa  135  6.0000000000000005e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000577914  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0236  AraC/XylS family transcriptional regulator  32.42 
 
 
277 aa  135  9.999999999999999e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3613  transcriptional regulator, AraC family  31.66 
 
 
278 aa  134  9.999999999999999e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.522508  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0977  AraC family transcriptional regulator  34.45 
 
 
300 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00000786642  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2594  AraC family transcriptional regulator  31.42 
 
 
278 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2693  AraC family transcriptional regulator  31.42 
 
 
278 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1562  AraC family transcriptional regulator  30.47 
 
 
278 aa  133  3e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1599  AraC family transcriptional regulator  30.47 
 
 
278 aa  133  3e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000366861  normal  0.399443 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1762  AraC/XylS family transcriptional regulator  31.03 
 
 
278 aa  132  5e-30  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06279  hypothetical protein  29.2 
 
 
275 aa  131  9e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1568  AraC family transcriptional regulator  30.08 
 
 
278 aa  132  9e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001441  L-rhamnose operon transcriptional activator RhaR  28.99 
 
 
275 aa  130  2.0000000000000002e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1460  AraC family transcriptional regulator  29.3 
 
 
278 aa  129  4.0000000000000003e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0731  AraC family transcriptional regulator  34.18 
 
 
285 aa  129  4.0000000000000003e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0743378  normal  0.147127 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2781  transcriptional regulator, AraC family  30.08 
 
 
271 aa  129  4.0000000000000003e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.109963 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0091  AraC family transcriptional regulator  30.6 
 
 
278 aa  129  4.0000000000000003e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2206  AraC family transcriptional regulator  31.02 
 
 
303 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000287978  normal  0.709471 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3138  AraC family transcriptional regulator  30.35 
 
 
279 aa  128  9.000000000000001e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.606385 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0382  AraC family transcriptional regulator  33.07 
 
 
274 aa  128  1.0000000000000001e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2887  transcriptional regulator, AraC family  33.2 
 
 
264 aa  127  2.0000000000000002e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.700128 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2442  AraC family transcriptional regulator  30.74 
 
 
278 aa  125  6e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.314191 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1047  transcriptional regulator, AraC family  32.96 
 
 
273 aa  124  1e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.859066 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0479  AraC family transcriptional regulator  32.86 
 
 
279 aa  125  1e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00109362 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2537  AraC family transcriptional regulator  31.01 
 
 
312 aa  124  2e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0954  AraC family transcriptional regulator  29.72 
 
 
290 aa  123  3e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.809333  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1383  AraC family transcriptional regulator  29.72 
 
 
290 aa  123  3e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.108127  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1187  transcriptional regulator, AraC-family  28.19 
 
 
278 aa  123  4e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1393  transcriptional regulator, AraC family  31.35 
 
 
277 aa  122  6e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1793  AraC family transcriptional regulator  29.68 
 
 
432 aa  122  7e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1878  AraC family transcriptional regulator  29.68 
 
 
432 aa  122  7e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0305888  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0424  AraC family transcriptional regulator  29.68 
 
 
432 aa  122  7e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0220  AraC family transcriptional regulator  29.68 
 
 
432 aa  122  8e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.15358  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0342  transcriptional regulatory protein  29.68 
 
 
432 aa  122  9e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.606755  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2453  AraC family transcriptional regulator  30.23 
 
 
279 aa  121  9.999999999999999e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  unclonable  0.00000000000537916  normal  0.591211 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0618  AraC family transcriptional regulator  30.19 
 
 
306 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0105124  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1097  AraC family transcriptional regulator  30.19 
 
 
306 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000000022105  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4210  AraC family transcriptional regulator  30.41 
 
 
299 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000259018  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1056  AraC family transcriptional regulator  30.52 
 
 
306 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000221071  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2237  putative transcriptional regulator  32.6 
 
 
278 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3802  AraC family transcriptional regulator  33.47 
 
 
264 aa  119  6e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00614706 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1509  transcriptional regulator AraC family  29.15 
 
 
284 aa  118  9.999999999999999e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2388  AraC family transcriptional regulator  28.21 
 
 
278 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.262251  unclonable  0.0000340178 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2540  AraC family transcriptional regulator  30.95 
 
 
275 aa  117  1.9999999999999998e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3646  AraC family transcriptional regulator  31.44 
 
 
275 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26330  AraC family transcriptional regulator  31.87 
 
 
278 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.643276  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3359  AraC family transcriptional regulator  33.72 
 
 
285 aa  113  3e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3402  AraC protein, arabinose-binding/dimerisation  33.33 
 
 
281 aa  113  3e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5008  AraC family transcriptional regulator  33.72 
 
 
285 aa  113  3e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.896385 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3634  AraC family transcriptional regulator  32.68 
 
 
300 aa  112  5e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.480226  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5279  AraC family transcriptional regulator  33.72 
 
 
285 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2300  AraC family transcriptional regulator  26.09 
 
 
274 aa  111  1.0000000000000001e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.457981  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5582  transcriptional regulator, AraC family  30.74 
 
 
272 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2749  putative transcriptional regulator  30.59 
 
 
271 aa  108  6e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5480  AraC family transcriptional regulator  32.53 
 
 
264 aa  108  1e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.280485 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3564  AraC family transcriptional regulator  32.53 
 
 
264 aa  108  1e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.682974  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4803  AraC family transcriptional regulator  32.53 
 
 
264 aa  108  1e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0066  AraC family transcriptional regulator  32.73 
 
 
290 aa  107  2e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1791  transcriptional regulator, AraC family  30.86 
 
 
277 aa  107  2e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1262  AraC family transcriptional regulator  30.71 
 
 
290 aa  107  2e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0806  transcriptional regulator, AraC family  32.2 
 
 
355 aa  107  3e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.311156 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0719  transcriptional regulator, AraC family  28.46 
 
 
281 aa  107  3e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2430  AraC family transcriptional regulator  30.74 
 
 
276 aa  106  4e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3265  AraC family transcriptional regulator  30.74 
 
 
276 aa  106  4e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.60832  normal  0.647045 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4315  AraC family transcriptional regulator  29.39 
 
 
270 aa  105  6e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.627035  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1472  transcriptional regulator, AraC family  27.41 
 
 
269 aa  105  8e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.462639  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1137  transcriptional regulator, AraC family  30.29 
 
 
270 aa  105  1e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4183  AraC family transcriptional regulator  34.01 
 
 
264 aa  104  1e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.928352  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2287  transcriptional regulator, AraC family  30.62 
 
 
300 aa  103  2e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2075  AraC family transcriptional regulator  30.08 
 
 
278 aa  103  2e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3439  AraC family transcriptional regulator  30.37 
 
 
282 aa  103  3e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS01763  transcription regulator protein  32.26 
 
 
274 aa  103  3e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.246898 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7070  transcriptional regulator AraC family  29.41 
 
 
283 aa  103  3e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2505  transcriptional regulator, AraC family  28.25 
 
 
277 aa  103  3e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.470919  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0320  AraC family transcriptional regulator  27.31 
 
 
281 aa  102  5e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.996721  hitchhiker  0.0000353353 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4705  AraC family transcriptional regulator  34.01 
 
 
264 aa  102  5e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.974796  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0901  AraC family transcriptional regulator  34.54 
 
 
264 aa  102  6e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0516  putative transcriptional regulator  30.08 
 
 
264 aa  102  8e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32450  AraC family transcriptional regulator  30.86 
 
 
271 aa  102  8e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.288191  normal  0.469508 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05420  putative transcriptional regulator  29.8 
 
 
264 aa  102  9e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3654  putative transcriptional regulator  30 
 
 
274 aa  100  2e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.232111  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>