More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_3231 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013517  Sterm_3231  transcriptional regulator, AraC family  100 
 
 		 250 aa  506  9.999999999999999e-143  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1187  transcriptional regulator, AraC-family  38.06 
 
 		 278 aa  96.7  3e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001441  L-rhamnose operon transcriptional activator RhaR  31.02 
 
 		 275 aa  93.6  3e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06279  hypothetical protein  36.52 
 
 		 275 aa  92.8  5e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1840  AraC family transcriptional regulator  26.37 
 
 		 271 aa  90.9  2e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000248404 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6118  putative transcriptional regulator  25.65 
 
 		 266 aa  90.5  3e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3844  helix-turn-helix domain-containing protein  29.25 
 
 		 257 aa  89.4  5e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.290293  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1665  transcriptional regulator, AraC family  42.31 
 
 		 271 aa  89.4  5e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.127281  normal  0.0761778 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2693  AraC family transcriptional regulator  34.68 
 
 		 278 aa  88.6  9e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1357  transcriptional regulator, AraC family  25.93 
 
 		 277 aa  88.6  9e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.193095  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70530  AraC family transcriptional regulator  25.28 
 
 		 266 aa  88.2  1e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.204165  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2537  AraC family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 312 aa  87  2e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6717  transcriptional regulator, AraC family  42.57 
 
 		 296 aa  87  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.121518  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0236  AraC/XylS family transcriptional regulator  37.89 
 
 		 277 aa  87.4  2e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2300  AraC family transcriptional regulator  42.53 
 
 		 274 aa  87.8  2e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.457981  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1477  transcriptional regulator, AraC family  23.97 
 
 		 278 aa  87.4  2e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.000537918  unclonable  0.00000296813 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3138  AraC family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 279 aa  86.3  4e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.606385 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2723  AraC family transcriptional regulator  38.38 
 
 		 273 aa  85.9  6e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0671245 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6439  AraC family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 143 aa  85.9  6e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.937218  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6062  AraC family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 151 aa  85.9  6e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6674  AraC family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 143 aa  85.9  6e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.424049  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2462  AraC family transcriptional regulator  23.11 
 
 		 267 aa  85.9  6e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.177963  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4202  transcriptional regulator, AraC family  23.38 
 
 		 247 aa  85.1  0.000000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.30723 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1762  AraC/XylS family transcriptional regulator  25.46 
 
 		 278 aa  85.1  0.000000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0091  AraC family transcriptional regulator  40.48 
 
 		 278 aa  84.3  0.000000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3415  AraC family transcriptional regulator  24.07 
 
 		 266 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2527  AraC family transcriptional regulator  33.83 
 
 		 278 aa  84.3  0.000000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2594  AraC family transcriptional regulator  23.4 
 
 		 278 aa  84.3  0.000000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6272  AraC family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 143 aa  83.6  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0908996 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0043  AraC family transcriptional regulator  25.49 
 
 		 266 aa  83.2  0.000000000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2139  helix-turn-helix domain-containing protein  39.6 
 
 		 294 aa  83.2  0.000000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.957349  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0479  AraC family transcriptional regulator  25.88 
 
 		 279 aa  82.8  0.000000000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00109362 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6285  transcriptional regulator, AraC family  33.02 
 
 		 287 aa  82.8  0.000000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.671161  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3801  transcriptional regulator, AraC family  33.98 
 
 		 278 aa  82.8  0.000000000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6135  transcriptional regulator, AraC family  33.59 
 
 		 305 aa  82.8  0.000000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6359  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 151 aa  82.8  0.000000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05420  putative transcriptional regulator  34.95 
 
 		 264 aa  82  0.000000000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4210  AraC family transcriptional regulator  29.93 
 
 		 299 aa  82  0.000000000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000259018  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01763  transcription regulator protein  33.66 
 
 		 274 aa  81.3  0.00000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.246898 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1568  AraC family transcriptional regulator  35 
 
 		 278 aa  81.6  0.00000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1460  AraC family transcriptional regulator  35 
 
 		 278 aa  81.3  0.00000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2692  transcriptional regulator, AraC family  25.37 
 
 		 268 aa  81.3  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1599  AraC family transcriptional regulator  35 
 
 		 278 aa  81.6  0.00000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000366861  normal  0.399443 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1562  AraC family transcriptional regulator  35 
 
 		 278 aa  81.6  0.00000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2781  transcriptional regulator, AraC family  35 
 
 		 271 aa  81.6  0.00000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.109963 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1112  transcriptional regulator, AraC family  25.3 
 
 		 296 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7015  AraC family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 306 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0570551 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2442  AraC family transcriptional regulator  32.11 
 
 		 278 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.314191 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1480  AraC family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 306 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.237942  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0516  putative transcriptional regulator  34.95 
 
 		 264 aa  80.9  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6349  AraC family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 306 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0502154  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2855  AraC family substrate binding transcriptional regulator  38.95 
 
 		 280 aa  80.1  0.00000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.222069  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2950  transcriptional regulator, AraC family  33.65 
 
 		 268 aa  80.1  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0105763  normal  0.912836 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0085  transcriptional regulator, AraC family  27.73 
 
 		 296 aa  80.1  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0195711 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4209  transcriptional regulator, AraC family  24.21 
 
 		 275 aa  80.1  0.00000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0776695  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2657  AraC family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 269 aa  80.1  0.00000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4319  transcriptional regulator, AraC family  24.21 
 
 		 259 aa  80.1  0.00000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.15706 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1906  AraC family transcriptional regulator  25.65 
 
 		 308 aa  80.1  0.00000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3022  AraC family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 269 aa  79.7  0.00000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.179069 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3557  AraC family transcriptional regulator  31.48 
 
 		 269 aa  79.7  0.00000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1212  transcriptional regulator, AraC-family  26.57 
 
 		 280 aa  79.7  0.00000000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2719  AraC family transcriptional regulator  41.46 
 
 		 276 aa  79.3  0.00000000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.894112  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3583  transcriptional regulator AraC family  38 
 
 		 293 aa  79.3  0.00000000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2165  transcriptional regulator, AraC family  25 
 
 		 318 aa  78.6  0.00000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1757  transcriptional regulator, AraC family  28.63 
 
 		 278 aa  78.6  0.00000000000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000137432  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0973  AraC family transcriptional regulator  28.89 
 
 		 300 aa  78.6  0.00000000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000577914  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1047  transcriptional regulator, AraC family  25 
 
 		 273 aa  78.6  0.00000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.859066 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2070  AraC family transcriptional regulator  23.65 
 
 		 236 aa  77.8  0.0000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.527007 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0810  AraC family transcriptional regulator  31.07 
 
 		 306 aa  78.2  0.0000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2206  AraC family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 303 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000287978  normal  0.709471 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1472  transcriptional regulator, AraC family  25.49 
 
 		 269 aa  78.2  0.0000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.462639  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1056  AraC family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 306 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000221071  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3066  AraC family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 275 aa  77.8  0.0000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.324544  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1279  helix-turn-helix domain-containing protein  32.67 
 
 		 306 aa  78.2  0.0000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.665979 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1385  AraC family transcriptional regulator  25.51 
 
 		 272 aa  78.2  0.0000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.791872  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0758  AraC family transcriptional regulator  35.78 
 
 		 299 aa  78.2  0.0000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0977  AraC family transcriptional regulator  28.89 
 
 		 300 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00000786642  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5827  AraC family transcriptional regulator  34.02 
 
 		 302 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3802  AraC family transcriptional regulator  24.49 
 
 		 264 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00614706 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43580  putative transcriptional regulator  22.3 
 
 		 274 aa  77.8  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.417491  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5610  AraC family transcriptional regulator  34.02 
 
 		 302 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.00190409  normal  0.169642 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2799  AraC family transcriptional regulator  34.02 
 
 		 269 aa  78.2  0.0000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0653395  normal  0.0991111 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2383  AraC family transcriptional regulator  30.33 
 
 		 281 aa  77.4  0.0000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.499508  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3673  helix-turn-helix domain-containing protein  24.14 
 
 		 236 aa  77.4  0.0000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3312  AraC family transcriptional regulator  30.33 
 
 		 281 aa  77.4  0.0000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.403912 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4452  AraC family transcriptional regulator  26.5 
 
 		 275 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.686924 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1614  transcriptional regulator, AraC family  35.71 
 
 		 366 aa  77  0.0000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1268  transcriptional regulator, AraC family  34.06 
 
 		 300 aa  76.6  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2379  AraC family transcriptional regulator  36.9 
 
 		 304 aa  76.3  0.0000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0538221  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0618  AraC family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 306 aa  75.9  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0105124  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1097  AraC family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 306 aa  75.9  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000000022105  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2887  transcriptional regulator, AraC family  27.97 
 
 		 264 aa  75.9  0.0000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.700128 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1549  transcriptional regulator, AraC family  32.28 
 
 		 311 aa  75.9  0.0000000000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00923391  normal  0.0459445 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5999  AraC family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 179 aa  75.5  0.0000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0583  AraC family transcriptional regulator  26.72 
 
 		 312 aa  75.5  0.0000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.98908  normal  0.54842 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3654  putative transcriptional regulator  21.93 
 
 		 274 aa  75.5  0.0000000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.232111  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0774  AraC family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 278 aa  75.1  0.000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000960474 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1989  AraC family transcriptional regulator  30.33 
 
 		 277 aa  75.1  0.000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.753386  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2167  AraC family transcriptional regulator  24.43 
 
 		 261 aa  75.1  0.000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.241927  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2453  AraC family transcriptional regulator  30.08 
 
 		 279 aa  75.1  0.000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  unclonable  0.00000000000537916  normal  0.591211 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>